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基于UPLC-Zone TOF-MS/MS联合网络药理学探讨脉复生防治NAFLD作用
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作者 胡涛 王冰钰 +5 位作者 苏薇薇 彭维 黎建华 李常青 周毅业 郭洁文 《中山大学学报(自然科学版)(中英文)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期73-82,共10页
依据脉复生的化学成分,采用网络药理学、分子对接技术、构建NAFLD小鼠模型,探究脉复生防治NAFLD的作用机制。通过UPLC-Zone TOF-MS/MS对脉复生全成分进行检测;借助Swiss生物信息学研究平台获取活性成分和靶点,在OMIM、Disgenet数据库筛... 依据脉复生的化学成分,采用网络药理学、分子对接技术、构建NAFLD小鼠模型,探究脉复生防治NAFLD的作用机制。通过UPLC-Zone TOF-MS/MS对脉复生全成分进行检测;借助Swiss生物信息学研究平台获取活性成分和靶点,在OMIM、Disgenet数据库筛选NAFLD疾病靶点,对交集靶点进行PPI分析;在Metascape网站进行GO与KEGG富集分析,对核心靶点与活性成分展开分子对接;采用HFD诱导C57BL/6J小鼠构建NAFLD模型进行核心靶点验证;指认得到130个化学成分,筛选得到54个活性成分与176个可能作用于NAFLD的潜在靶点;根据Degree值对排名前10的成分与靶点进行分子对接实验,对结合能最优的对接模型TNF与Quercetin、IL-17与Asiatic acid、IL-1β与Quercetin进行可视化分析;筛选炎症因子和脂肪代谢相关基因进行qPCR测序。富集分析表明脉复生治疗NAFLD与脂肪酸转化、脂质代谢正向调节等生物过程相关,涉及AGE-RAGE、HIF-1、IL-17等信号通路;与对照组相比,模型组血清学检测ALT、TG、LDL-C指标上升并且HDL-C指标下降(P<0.05);与模型组相比,脉复生给药组和辛伐他汀组能够降低小鼠体质量、肝脏和脂肪质量占比(P<0.05),降低血清中TNF-α、IL-1β和IL-17的含量和mRNA表达,在高剂量时具有显著性差异(P<0.01);与对照组相比,脉复生给药组能够通过调节脂质代谢相关基因的表达,降低肝脏脂质堆积,缓解肝脏脂肪变性。 展开更多
关键词 UPLC-Zone tof-ms/MS 脉复生 非酒精性脂肪肝 网络药理学 实验验证
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基于MPI和OpenMP混合编程的高分三号数据分布式并行转换算法 被引量:3
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作者 陈云 《测绘与空间地理信息》 2024年第2期43-45,49,共4页
高分三号是我国C波段多极化合成孔径雷达卫星。PolSARpro是欧空局支持下的一款极化SAR影像处理的开源软件,为了便于利用该软件处理高分三号数据,本文提出了一种基于MPI和OpenMP并以PolSARpro软件的数据格式要求进行分布式并行转换算法,... 高分三号是我国C波段多极化合成孔径雷达卫星。PolSARpro是欧空局支持下的一款极化SAR影像处理的开源软件,为了便于利用该软件处理高分三号数据,本文提出了一种基于MPI和OpenMP并以PolSARpro软件的数据格式要求进行分布式并行转换算法,实现将高分三号极化数据快速精确转化为复数散射矩阵S2数据格式,通过KingMap V8.0平台实现了算法并在实际数据中进行测试,验证了算法的可行性、正确性和高效性。 展开更多
关键词 高分三号 合成孔径雷达 复数散射矩阵 OPENMP mpi KingMap
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基于UFLC-Triple TOF-MS/MS的活心丸全成分分析 被引量:4
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作者 郑苏楠 刘玉铃 +1 位作者 吴灏 王永刚 《中南药学》 CAS 2023年第4期924-932,共9页
目的应用超快速高效液相色谱串联三重四极杆飞行时间质谱(UFLC-Triple TOF-MS/MS)对中药活心丸的化学成分进行分析。方法以Waters HSS T3(2.1 mm×100 mm,1.8μm)为色谱柱,乙腈-0.1%甲酸为流动相,梯度洗脱,流速0.3 mL·min^(-1)... 目的应用超快速高效液相色谱串联三重四极杆飞行时间质谱(UFLC-Triple TOF-MS/MS)对中药活心丸的化学成分进行分析。方法以Waters HSS T3(2.1 mm×100 mm,1.8μm)为色谱柱,乙腈-0.1%甲酸为流动相,梯度洗脱,流速0.3 mL·min^(-1),采用配有ESI电喷雾源的高分辨三重四极杆飞行时间质谱,分别在正、负离子模式下进样检测。结果通过准确分子量及碎片离子分析、对照品比对、相关文献查阅,共确证和指认出96个化学成分,其中三萜类化合物25个、皂苷类化合物12个、胆汁酸类化合物11个、黄酮类化合物11个、生物碱类化合物10个、蟾毒内酯类化合物12个、有机酸类化合物7个、氨基酸类化合物4个、核苷类化合物1个、甾酮类化合物1个、其他类化合物2个,并解释了代表性成分的裂解规律。结论本研究阐明了活心丸的化学物质基础,为评价其质量及后续药理机制研究提供了科学依据。 展开更多
关键词 中成药 活心丸 化学成分 UFLC-Triple tof-ms/MS
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UPLC-Q/TOF-MS法快速分析天麻醒脑胶囊的化学成分及血中移行成分 被引量:1
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作者 孙元芳 甘雨 +5 位作者 陈关祥 李莎莎 肖雪 者从章 严诗楷 金慧子 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2023年第11期3478-3496,共19页
目的采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱联用技术对天麻醒脑胶囊化学物质组和入血成分进行辨识研究,初步阐明其可能的药效物质基础。方法本研究建立了一种超高效液相色谱-四级杆-飞行时间质谱联用方法鉴别天麻醒脑胶囊的化学成分... 目的采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱联用技术对天麻醒脑胶囊化学物质组和入血成分进行辨识研究,初步阐明其可能的药效物质基础。方法本研究建立了一种超高效液相色谱-四级杆-飞行时间质谱联用方法鉴别天麻醒脑胶囊的化学成分。采集并分析大鼠给药后的血浆样品,探究天麻醒脑胶囊在大鼠体内暴露成分。结果通过UPLC-Q/TOF-MS分析,共鉴别出天麻醒脑胶囊组方中195种化学成分,分为苯酚类、三萜皂苷类、苯乙醇苷类、环烯醚萜类、脂质类和苯丙素类等,包含了天麻、地龙、肉苁蓉、熟地黄、远志、石菖蒲的特征性成分。在给药大鼠血浆样品中鉴定出37个天麻醒脑胶囊原型成分和3个代谢产物。结论该方法简便高效、灵敏准确,初步阐明了天麻醒脑胶囊的药效物质基础,对天麻醒脑胶囊及其入血成分进行了较全面地研究。本研究为天麻醒脑胶囊的药效物质基础的阐明提供了依据,对揭示天麻醒脑胶囊的药理作用机制具有一定参考意义。 展开更多
关键词 天麻醒脑胶囊 化学成分 血中移行成分 UPLC-Q/tof-ms
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基于UPLC-Q/TOF-MS技术结合多元统计学方法分析乳香醋炙前后化学成分 被引量:1
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作者 朱徐东 朱娜 +4 位作者 严斐霞 王松 姚伟 颜干明 吴毅 《中药材》 CAS 北大核心 2023年第12期2980-2988,共9页
目的:对乳香及醋乳香的化学成分进行快速分析,并找到醋炙前后差异成分。方法:采用UPLC-Q/TOFMS技术对乳香及醋乳香的化学成分进行数据采集,UNIFI Protal软件结合自建乳香化学成分数据库对乳香及醋乳香化学成分进行定性分析;Progenesis Q... 目的:对乳香及醋乳香的化学成分进行快速分析,并找到醋炙前后差异成分。方法:采用UPLC-Q/TOFMS技术对乳香及醋乳香的化学成分进行数据采集,UNIFI Protal软件结合自建乳香化学成分数据库对乳香及醋乳香化学成分进行定性分析;Progenesis QI软件和EZinfo 2.0软件对采集得到的谱图进行峰标准化、峰提取、峰对齐、峰匹配校正等处理,得到包含化合物保留时间和质荷比信息。利用SIMCA-P 14.0软件进行主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA),探讨乳香醋炙前后的差异成分。结果:从乳香和醋乳香中共鉴定出98个成分;通过PCA和OPLS-DA结果表明乳香醋炙前后化学成分含量存在明显差异,通过VIP>1筛选得到27个差异成分,包括15个二萜类、1个酚类、11个三萜类化合物。结论:醋炙可以使乳香中的化学成分发生明显变化。 展开更多
关键词 乳香 醋乳香 UPLC-Q/tof-ms 差异成分
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基于CGA的MPI程序分支覆盖测试套件生成
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作者 袁剑锋 刘佳 郭建卫 《计算机技术与发展》 2024年第7期78-86,共9页
针对程序的分支覆盖测试,元启发式搜索技术已经被广泛应用于测试数据生成中。然而,当前的研究成果主要适用于串行程序。因此,为覆盖消息传递接口(Message Passing Interface,MPI)程序的分支,该文研究基于协同进化遗传算法(Co-evolutiona... 针对程序的分支覆盖测试,元启发式搜索技术已经被广泛应用于测试数据生成中。然而,当前的研究成果主要适用于串行程序。因此,为覆盖消息传递接口(Message Passing Interface,MPI)程序的分支,该文研究基于协同进化遗传算法(Co-evolutionary Genetic Algorithm,CGA)的测试套件生成方法(简称为:CGA生成法),该方法具有不受不可行分支影响的优势。首先,基于收集覆盖信息的探针,定义最小归一化分支距离,并以此设计出相应的适应度值函数;然后,使用CGA生成进化个体,并基于设计的适应度值函数,计算这些个体的适应值;最后,基于计算的适应值,选择子种群中代表个体,以构成合作种群。所提CGA生成法应用于7个基准MPI程序,并与其他多种方法进行比较。实验结果表明,CGA生成法的覆盖率通常高于其他搜索算法。 展开更多
关键词 消息传递接口程序 协同进化遗传算法 分支覆盖测试 测试套件生成 适应度值函数
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基于UPLC-Q/TOF-MS研究广西甜茶在大鼠体内的入血成分 被引量:1
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作者 石一彤 樊兰兰 《壮瑶药研究》 2023年第1期195-197,共3页
目的:采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间质谱(UPLC-Q/TOF-MS)法分析大鼠口服广西甜茶后的入血成分,为阐明其活性成分在机体转化和代谢情况提供基础。方法:超声法提取药物;大鼠灌胃给予广西甜茶提取物后,采用眼球后静脉丛取血;收集不... 目的:采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间质谱(UPLC-Q/TOF-MS)法分析大鼠口服广西甜茶后的入血成分,为阐明其活性成分在机体转化和代谢情况提供基础。方法:超声法提取药物;大鼠灌胃给予广西甜茶提取物后,采用眼球后静脉丛取血;收集不同时间段的血浆,通过超高效液相色谱-四级杆-飞行时间质谱(UPLC-Q/TOF-MS)法,比较广西甜茶提取物、大鼠空白血浆、灌胃给予广西甜茶的大鼠血浆,初步鉴定和推测灌胃给予广西甜茶后大鼠血浆中的入血成分。结果:本实验共鉴定出50个原型入血成分,主要包括10个多酚类成分,13个黄酮类成分,20个二萜类成分,7个三萜类成分。结论:本实验初步阐明了广西甜茶中的入血成分,为其活性成分在机体转化和代谢情况提供基础,且为广西甜茶的后续开发利用提供了理论依据。 展开更多
关键词 广西甜茶 入血成分 UPLC-Q/tof-ms
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基于MPI+CUDA的DSMC/PIC耦合模拟异构并行及性能优化研究
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作者 林拥真 徐传福 +4 位作者 邱昊中 汪青松 王正华 杨富翔 李洁 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2024年第9期31-39,共9页
DSMC/PIC耦合模拟是一类重要的高性能计算应用,大规模DSMC/PIC耦合模拟计算量巨大,需要实现高效并行计算。由于粒子动态注入、迁移等操作,基于MPI并行的DSMC/PIC耦合模拟往往通信开销较大且难以实现负载均衡。针对自主研发的DSMC/PIC耦... DSMC/PIC耦合模拟是一类重要的高性能计算应用,大规模DSMC/PIC耦合模拟计算量巨大,需要实现高效并行计算。由于粒子动态注入、迁移等操作,基于MPI并行的DSMC/PIC耦合模拟往往通信开销较大且难以实现负载均衡。针对自主研发的DSMC/PIC耦合模拟软件,在原有MPI并行优化版本上设计实现了高效的MPI+CUDA异构并行算法,结合GPU体系结构和DSMC/PIC计算特点,开展了GPU访存优化、GPU线程工作负载优化、CPU-GPU数据传输优化及DSMC/PIC数据冲突优化等一系列性能优化。在北京北龙超级云HPC系统的NVIDIA V100和A100 GPU上,针对数亿粒子规模的脉冲真空弧等离子体羽流应用,开展了大规模DSMC/PIC耦合异构并行模拟,相比原有纯MPI并行,GPU异构并行大幅缩短了模拟时间,两块GPU卡较192核的CPU加速比达到550%,同时具有更好的强可扩展性。 展开更多
关键词 DSMC/PIC耦合 粒子模拟 异构并行 mpi+CUDA
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利用MPI实现点云SAC-IA并行配准
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作者 崔家武 曾波 +2 位作者 李海军 甄兆聪 梁建青 《工程勘察》 2024年第4期61-67,共7页
采样一致性初始配准算法(SAC-IA)是点云的一种粗配准算法。针对大规模点云SAC-IA配准效率低、实时性差等问题,本文提出利用消息传递接口MPI实现点云SAC-IA多进程并行配准,主要包括法向量并行估计、SPFH特征及FPFH特征并行计算和SAC-IA... 采样一致性初始配准算法(SAC-IA)是点云的一种粗配准算法。针对大规模点云SAC-IA配准效率低、实时性差等问题,本文提出利用消息传递接口MPI实现点云SAC-IA多进程并行配准,主要包括法向量并行估计、SPFH特征及FPFH特征并行计算和SAC-IA并行配准。实验结果表明,MPI多进程并行算法可显著提高点云SAC-IA配准速度。 展开更多
关键词 SAC-IA mpi 法向量 SPFH特征 FPFH特征
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基于UPLC-Q/TOF-MS的甘草酸单铵和甘草酸二铵在大鼠体内移行成分表征
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作者 虞娉 庄让笑 +1 位作者 席建军 何亮亮 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期2148-2155,共8页
目的采用超高效液相色谱-四极杆/飞行时间高分辨质谱技术(UPLC-Q/TOF-MS)对甘草酸单铵和甘草酸二铵在大鼠体内的代谢轮廓进行表征,探讨两者可能的代谢途径。方法大鼠分别灌胃给予甘草酸单铵和甘草酸二铵后,收集不同时间点大鼠脑组织、... 目的采用超高效液相色谱-四极杆/飞行时间高分辨质谱技术(UPLC-Q/TOF-MS)对甘草酸单铵和甘草酸二铵在大鼠体内的代谢轮廓进行表征,探讨两者可能的代谢途径。方法大鼠分别灌胃给予甘草酸单铵和甘草酸二铵后,收集不同时间点大鼠脑组织、血浆、尿液、粪样等生物样本。经沉淀蛋白后,采用UPLC-Q/TOF-MS技术,以含0.1%甲酸的水-乙腈为流动相进行梯度洗脱;在正离子模式下采集生物样本的质谱数据。采用质量残差亏损过滤技术并结合原型成分的质谱裂解规律,预测代谢物类型,对两者相关的体内代谢产物进行鉴定。结果甘草酸单铵和甘草酸二铵在大鼠体内主要以代谢物形式存在,共鉴定得到20个代谢产物,两者主要通过肠道排泄,在体内原型化合物脱糖基形成的甘草次酸基础上发生一系列的Ⅰ相氧化还原反应是主要代谢类型;甘草次酸是在生物样本中主要暴露成分,提示了其可能是甘草酸单铵及甘草酸二铵在体内发挥药效的关键药效成分。结论首次阐明了甘草酸单铵及甘草酸二铵在大鼠体内的代谢轮廓,为进一步对两者发挥功效作用的物质基础及药效作用机制揭示和开发利用提供参考。 展开更多
关键词 甘草酸单铵 甘草酸二铵 UPLC-Q/tof-ms 代谢产物 移行成分 甘草次酸
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2D-UPLC-Q/TOF-MS法对替考拉宁未知杂质结构鉴定 被引量:1
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作者 邵伍军 和燕玲 +5 位作者 袁红露 周雪飞 陈延安 覃玉梅 金美春 杨荷友 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期419-425,共7页
目的建立一种在线二维超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(2D-UPLC-Q/TOF-MS)分析方法对替考拉宁未知杂质进行结构分析。方法采用在线二维超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱法,一维液相进行分离,二维液相脱盐后进行质谱分析,根据杂质... 目的建立一种在线二维超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(2D-UPLC-Q/TOF-MS)分析方法对替考拉宁未知杂质进行结构分析。方法采用在线二维超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱法,一维液相进行分离,二维液相脱盐后进行质谱分析,根据杂质精确分子量及其二级质谱碎片离子与已知主成分结构碎片离子对比,推导其结构。结果该方法采用2D-UPLC-Q/TOF-MS法对替考拉宁未知杂质进行鉴定,鉴定杂质1为A_(3-1)脱N-乙酰基葡萄糖降解物,杂质2为A_(2-2)脱甘露糖降解物。结论该方法可以快速地对替考拉宁未知杂质进行结构鉴定,很好地解决了杂质难以制备进行结构解析的难题。 展开更多
关键词 在线二维超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(2D-UPLC-Q/tof-ms) 替考拉宁 未知杂质 结构鉴定
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压电陶瓷作动器的MPI动态迟滞建模与控制
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作者 周子希 王贞艳 《振动与冲击》 EI CSCD 北大核心 2024年第18期131-136,共6页
压电陶瓷是一种具有迟滞非线性的智能材料。为了实现系统的精密跟踪控制,提出一种基于MPI(modified Prandtl-Ishlinskii)的Hammerstein动态迟滞模型,并基于该模型设计了滑模跟踪控制方案。在play算子的上升边沿和下降边沿阈值处引入了... 压电陶瓷是一种具有迟滞非线性的智能材料。为了实现系统的精密跟踪控制,提出一种基于MPI(modified Prandtl-Ishlinskii)的Hammerstein动态迟滞模型,并基于该模型设计了滑模跟踪控制方案。在play算子的上升边沿和下降边沿阈值处引入了延时系数,并串联死区算子构成改进的非对称PI(Prandtl-Ishlinskii)模型,基于MPI的Hammerstein动态迟滞非线性模型可以描述压电陶瓷作动器的率相关迟滞特性。通过采集在单频率10 Hz,40 Hz,80 Hz和复合频率10~90 Hz正弦输入电压信号下的压电陶瓷作动器的位移数据,并采用粒子群算法和最小二乘递推方法辨识MPI模型参数和ARX(auto regressive model with exogenous input)模型参数,验证了模型的可行性,相较于基于经典PI的Hammerstein动态迟滞模型,模型误差分别降低了37%,42%,35%和24%。最后,构建迟滞补偿器,利用Hammerstein模型的模块化特点,提出一种可以实现对系统动态跟踪控制的滑模控制方案,并搭建了滑模控制压电系统试验平台,对单频率1 Hz,40 Hz,80 Hz和复合频率10~90 Hz的正弦输入电压信号进行了微位移实时跟踪控制试验,试验中的相对误差在7.62%以内,均方根最大误差为1.8573μm,表明所提出的滑模控制器有较强的跟踪性能。 展开更多
关键词 压电陶瓷作动器 迟滞非线性 Hammerstein动态迟滞模型 mpi模型 滑模跟踪控制
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一种基于HDFS的分布式文件系统MPIFS 被引量:2
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作者 陈卓航 陈雅琴 郭志勇 《黑龙江工程学院学报》 CAS 2024年第1期9-14,共6页
传统的MPI(Message Passing Interface)计算特点是数据向计算迁移,对于数据量庞大的计算任务具有先天的不足。文中提出一种支持MPI的分布式文件系统MPIFS的架构及实现。该文件系统基于HDFS(Hadoop Distributed File System),使得MPI在MP... 传统的MPI(Message Passing Interface)计算特点是数据向计算迁移,对于数据量庞大的计算任务具有先天的不足。文中提出一种支持MPI的分布式文件系统MPIFS的架构及实现。该文件系统基于HDFS(Hadoop Distributed File System),使得MPI在MPIFS上能同时支持计算密集型和数据密集型计算,设置两个类型的批处理词频统计实验,所需数据都分布式存储在MPIFS分布式文件系统中,通过调用系统提供的统一数据接口实现数据访问。1个计算节点在本地计算大小为m的文件,n个计算节点分布式并行计算大小为n×m的文件,两者计算时间相同,MPIFS中文件总量不变,计算节点数量减少,计算时间t变长,可得出MPIFS文件系统架构可行,能够支持MPI实现计算向数据迁移的并行计算。 展开更多
关键词 mpi 分布式文件系统 分布式并行计算 计算迁移
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基于MPI的鲲鹏CPU核间通信研究
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作者 周岩 王鹏 王琨予 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第3期328-335,共8页
核间通信延时是影响高性能计算系统整体运行效率的重要因素.国产鲲鹏CPU在高性能计算领域应用日益广泛,针对鲲鹏CPU的缓存架构及多核间接口互联进行分析,研究影响鲲鹏CPU核间通信延时的因素.在消息传递接口(MPI)环境下进行节点内核间通... 核间通信延时是影响高性能计算系统整体运行效率的重要因素.国产鲲鹏CPU在高性能计算领域应用日益广泛,针对鲲鹏CPU的缓存架构及多核间接口互联进行分析,研究影响鲲鹏CPU核间通信延时的因素.在消息传递接口(MPI)环境下进行节点内核间通信实验,对包括跨三级缓存、跨物理CPU通信等不同模式下通信延时进行对比,发现通信数据包大于500 KB后,跨L3 Cache TAG的通信延时反优于共享L3 Cache TAG的通信延时.针对通信数据包在64 KB大小时的通信延迟异常,分析得出是MPI的Eager模式和Rendezvous模式的默认切换阈值所造成.对这两种模式进行实验对比,验证不同大小的通信数据包在不同模式下和跨核通信时的延时特征,Eager模式更适合低延时的小消息发送.在实际应用中可根据通信数据包大小调整两种模式的默认切换阈值,以达到更好的传输效果.实验结果表明由于鲲鹏CPU存在复杂的多核结构,在并行计算程序设计时可以进行针对性优化,以提升程序的运行效率. 展开更多
关键词 鲲鹏CPU 核间通信 消息传递接口 高性能计算 共享缓存
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An MPI parallel DEM-IMB-LBM framework for simulating fluid-solid interaction problems 被引量:2
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作者 Ming Xia Liuhong Deng +3 位作者 Fengqiang Gong Tongming Qu Y.T.Feng Jin Yu 《Journal of Rock Mechanics and Geotechnical Engineering》 SCIE CSCD 2024年第6期2219-2231,共13页
The high-resolution DEM-IMB-LBM model can accurately describe pore-scale fluid-solid interactions,but its potential for use in geotechnical engineering analysis has not been fully unleashed due to its prohibitive comp... The high-resolution DEM-IMB-LBM model can accurately describe pore-scale fluid-solid interactions,but its potential for use in geotechnical engineering analysis has not been fully unleashed due to its prohibitive computational costs.To overcome this limitation,a message passing interface(MPI)parallel DEM-IMB-LBM framework is proposed aimed at enhancing computation efficiency.This framework utilises a static domain decomposition scheme,with the entire computation domain being decomposed into multiple subdomains according to predefined processors.A detailed parallel strategy is employed for both contact detection and hydrodynamic force calculation.In particular,a particle ID re-numbering scheme is proposed to handle particle transitions across sub-domain interfaces.Two benchmarks are conducted to validate the accuracy and overall performance of the proposed framework.Subsequently,the framework is applied to simulate scenarios involving multi-particle sedimentation and submarine landslides.The numerical examples effectively demonstrate the robustness and applicability of the MPI parallel DEM-IMB-LBM framework. 展开更多
关键词 Discrete element method(DEM) Lattice Boltzmann method(LBM) Immersed moving boundary(IMB) Multi-cores parallelization Message passing interface(mpi) CPU Submarine landslides
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MPI+CUDA联合加速重力场反演的并行算法
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作者 赵锴坤 朱炬波 +1 位作者 谷德峰 韦春博 《大地测量与地球动力学》 CSCD 北大核心 2024年第4期423-428,共6页
针对重力场解算过程中数据量巨大的问题,联合MPI(massage passing interface)与CUDA(compute unified device architecture)提出基于最小二乘法的重力场解算过程的并行加速算法。使用MPI完成复杂过程的任务分配,实现全局层面的并行加速... 针对重力场解算过程中数据量巨大的问题,联合MPI(massage passing interface)与CUDA(compute unified device architecture)提出基于最小二乘法的重力场解算过程的并行加速算法。使用MPI完成复杂过程的任务分配,实现全局层面的并行加速;基于CUDA编写大规模矩阵相乘的并行加速程序,并针对不同类型的矩阵进行适配,同时联合MPI将法矩阵的计算过程进一步细分,实现对分进程内存峰值的压缩。在单机上完成30阶与120阶重力场仿真解算任务,结果表明,反演30阶重力场时加速比可达180;反演120阶重力场时,并行计算单次迭代仅耗时2 h,而串行模式下无法计算。 展开更多
关键词 重力场 并行计算 CUDA mpi
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MPI/OpenMP-Based Parallel Solver for Imprint Forming Simulation
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作者 Yang Li Jiangping Xu +2 位作者 Yun Liu Wen Zhong Fei Wang 《Computer Modeling in Engineering & Sciences》 SCIE EI 2024年第7期461-483,共23页
In this research,we present the pure open multi-processing(OpenMP),pure message passing interface(MPI),and hybrid MPI/OpenMP parallel solvers within the dynamic explicit central difference algorithm for the coining pr... In this research,we present the pure open multi-processing(OpenMP),pure message passing interface(MPI),and hybrid MPI/OpenMP parallel solvers within the dynamic explicit central difference algorithm for the coining process to address the challenge of capturing fine relief features of approximately 50 microns.Achieving such precision demands the utilization of at least 7 million tetrahedron elements,surpassing the capabilities of traditional serial programs previously developed.To mitigate data races when calculating internal forces,intermediate arrays are introduced within the OpenMP directive.This helps ensure proper synchronization and avoid conflicts during parallel execution.Additionally,in the MPI implementation,the coins are partitioned into the desired number of regions.This division allows for efficient distribution of computational tasks across multiple processes.Numerical simulation examples are conducted to compare the three solvers with serial programs,evaluating correctness,acceleration ratio,and parallel efficiency.The results reveal a relative error of approximately 0.3%in forming force among the parallel and serial solvers,while the predicted insufficient material zones align with experimental observations.Additionally,speedup ratio and parallel efficiency are assessed for the coining process simulation.The pureMPI parallel solver achieves a maximum acceleration of 9.5 on a single computer(utilizing 12 cores)and the hybrid solver exhibits a speedup ratio of 136 in a cluster(using 6 compute nodes and 12 cores per compute node),showing the strong scalability of the hybrid MPI/OpenMP programming model.This approach effectively meets the simulation requirements for commemorative coins with intricate relief patterns. 展开更多
关键词 Hybrid mpi/OpenMP parallel computing mpi OPENMP imprint forming
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计及需求响应的MPIES多时空尺度鲁棒随机优化调度 被引量:1
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作者 黄海涛 田胜轩 +1 位作者 余文昶 曹俊波 《电力系统及其自动化学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期38-49,58,共13页
针对多园区综合能源系统多时间尺度优化调度问题,结合各时间尺度源、荷不确定性特征与响应特性、园区数目对计算规模的影响,提出一种计及需求响应的多园区综合能源系统多时空尺度鲁棒随机优化调度架构。日前调度建立计及可中断负荷的多... 针对多园区综合能源系统多时间尺度优化调度问题,结合各时间尺度源、荷不确定性特征与响应特性、园区数目对计算规模的影响,提出一种计及需求响应的多园区综合能源系统多时空尺度鲁棒随机优化调度架构。日前调度建立计及可中断负荷的多园区多能流系统鲁棒优化调度模型,确定系统最恶劣运行场景下基本调度策略;日内调度建立计及可中断负荷和替代型需求响应的单园区多能流系统随机优化调度模型,细化并调整调度策略;实时调度建立计及直接负荷控制的单园区电气系统随机优化调度模型,削弱调度策略受源、荷出力波动的影响。最后,通过算例验证了该架构能有效提高系统运行的经济性和稳定性。 展开更多
关键词 多园区综合能源系统 多时空尺度 不确定性 需求响应
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QuEChERS-TOF-MS/MS检测食品农产品中残留的未知农药 被引量:9
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作者 林立毅 杨黎忠 +3 位作者 严丽娟 陈鹭平 周昱 徐敦明 《食品安全质量检测学报》 CAS 2013年第3期899-904,共6页
目的利用LC-Triple TOF仪器建立筛查食品/农产品中未知农药的分析方法。方法采用QuEChERS法对多种食品/农产品中残留的农药进行提取,PeakView软件全智能分析,对照每个化合物的TOF-MS质量精度及同位素分布情况,以及对照化合物TOF-MS/MS... 目的利用LC-Triple TOF仪器建立筛查食品/农产品中未知农药的分析方法。方法采用QuEChERS法对多种食品/农产品中残留的农药进行提取,PeakView软件全智能分析,对照每个化合物的TOF-MS质量精度及同位素分布情况,以及对照化合物TOF-MS/MS与标准品谱库,给出匹配度,对照化合物与标准品的保留时间,对化合物作出定性判断。同时利用MultiQuant软件对检出的化合物含量结果进行定量分析。结果该方法通过自动校正系统,能自动进行批校正,长时间内系统的准确质量数稳定,且该系统的质量准确度小于1 mg/kg。结论该方法满足对食品/农产品中农药残留的筛查检测要求,适用于检测部门的日常筛查工作。 展开更多
关键词 未知农药 食品 QuEChERS方法 tof-ms/MS
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基于UPLC-Triple TOF-MS/MS技术的不同产地太子参水提物化学组成分析 被引量:8
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作者 侯娅 马阳 +5 位作者 邹立思 刘训红 罗益远 刘娟秀 兰才武 袁济端 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2015年第15期275-280,共6页
基于超高效液相色谱-串联四极杆飞行时间高分辨质谱(UPLC-Triple TOF-MS/MS)结合多元统计分析技术对不同产地太子参水提物化学组成进行比较分析。通过多级串联质谱分析,对其质谱数据进行峰匹配、峰对齐、滤噪处理等进行特征峰提取;根据... 基于超高效液相色谱-串联四极杆飞行时间高分辨质谱(UPLC-Triple TOF-MS/MS)结合多元统计分析技术对不同产地太子参水提物化学组成进行比较分析。通过多级串联质谱分析,对其质谱数据进行峰匹配、峰对齐、滤噪处理等进行特征峰提取;根据一级质谱精确质荷比和二级质谱碎片信息,结合软件数据库搜索及相关文献进行成分鉴别;用PCA和PLS-DA进行数据处理,找出不同产地太子参水提物的差异化学成分。结果显示,太子参水提物中主要含有氨基酸、核苷、糖、有机酸等17种化学成分,其主成分为精氨酸;4个不同产地太子参水提物中化学成分差异明显,福建柘荣太子参水提物中异丁酰基甘氨酸、鸟嘌呤、腺苷含量较高,贵州施秉太子参水提物中含有较多的尿苷-5'-单磷酸、异麦芽糖,安徽宣城太子参水提物中精氨酸、月桂酸、5-甲基胞苷、谷氨酸、组氨酸和苯丙氨酸含量较高,江苏句容太子参水提物中含有较多的N-乙酰-5-甲氧基色胺。 展开更多
关键词 太子参 UPL C-Triple tof-ms/MS 水溶性化学成分
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