NLR与MSI对急性NSTEMI短期预后判断价值

目的本研究旨在探讨校正休克指数(MSI)和中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)在判断急性非ST段抬高型心肌梗死(NSTEMI)患者短期内可能出现不良预后的预测能力。方法研究组选择2020年3月到2021年9月期间,首次就诊急诊科明确诊断为急性非ST段抬高型心肌梗死的276例患者。通过快速急诊绿道监测血压与心率,并于急诊科10 min内抽取血常规、床旁心脏彩超等相关化验检查,依据监测及化验结果,研究小组计算了校正休克指数(MSI)和中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR),然后根据统计结果将患者分为2组:NLR≥5.0组(n=75)与NLR﹤5.0组(n=201);(2)MSI≥1.2组(n=57)与MSI<1.2组(n=219)。比较2组一般资料情况,发生不良心血管事件的比例,采用受试者ROC曲线下面积来评估NLR值和MSI值对NSTEMI院内不良心血管事件的预测能力。结果连续入选的276例NSTEMI患者中,发生不良心血管事件52例,占18.8%,心源性休克患者15例,占5.4%,恶性心律失常患者24例,占8.7%,死亡13例,占4.7%。NLR≥5.0与MSI≥1.2值组的心功能、收缩压(SBP)、舒张压(DBP)及心率(HR)分别与NLR<5.0与MSI<1.2组比较,差异有统计学意义(P<0.05);NLR≥5.0与MSI≥1.2组MACE发生率分别高于NLR<5.0组与MSI<1.2组(P<0.05)。此外,NLR和MSI的ROC曲线下面积分别为0.734和0.703,提示NLR和MSI均具有评价急性非ST段抬高型心肌梗死患者短期不良心血管事件发生能力。结论MSI与NLR是评估NSTEMI短期不良预后的两个简单的重要的易获得指标。

纳武利尤单抗联合伊匹木单抗治疗MSI-H晚期结肠癌1例报道

本文报告1例晚期结肠癌患者,既往术后标本免疫组化结果提示错配修复完整(proficient mismatch repair, pMMR),予术后化疗等全身治疗后病情进展。随后行二代测序(next-generation sequencing, NGS)提示该患者微卫星高度不稳定(microsatellite instability-high, MSI-H)以及高水平的肿瘤突变负荷值(tumor mutation burden, TMB)。

晚期dMMR/MSI-H肝内胆管细胞癌1例报告

胆道恶性肿瘤(biliary tract cancer,BTC)占所有消化系肿瘤的3%[1],在原发性肝胆恶性肿瘤发病率中占据第二位[2],肝内胆管癌(intrahepatic cholangiocarcinoma,ICCA)属于BTC的一种,我国BTC中仅有1.3%至10.0%患者表现为MSI-H,32.3%至42.86%患者表现为PD-L1阳性[3],因此MSI-H、PD-L1阳性的ICCA患者极具讨论价值。

基于MLWE和MSIS的可验证解密方案

两方安全计算中涉及的可验证解密技术可以应用在医疗研究数据共享、机构间合作进行模型训练等有隐私保护需求的现实场景中,有助于进一步打破数据孤岛、保障数据安全。但是目前已有的为基于格密码或其他后量子加密方案正确解密所构造的零知识证明的效率不高。面对这一现状,文中针对Kyber提出了一个基于模容错学习问题(MLWE)和模小整数解问题(MSIS)的可验证解密方案。首先,根据Kyber的加解密特性,在利用证明者和验证者所持数据构造相等关系时存在差异,该方案提出了一种利用误差估计结合Kyber的压缩函数,使证明者提供给验证者一部分所持数据的信息,从而消除差异的方法,进而提供可以用于验证的相等关系,把该关系与Dilithium签名方案无公钥压缩版本的框架相结合,构造非交互式零知识证明,将可验证解密问题转变为证明环中短向量满足的线性关系。其次,在理论上分析了方案的正确性、安全性、通信开销和计算复杂度,将方案的合理性和零知识性规约到MSIS困难假设,并提供了2组不同安全等级的建议参数设置。最后,通过编写C语言程序测试了所提方案的正确性和效率。实验结果与理论分析结果基本一致,与现有方案相比,所提方案在对单个密文的证明大小和证明时间上有显著优势,更加简洁、高效。

多队列MSI-X引擎设计与实现

智能网卡是业界和学术界的研究热点之一,Corundum基于FPGA提供了一种开源的智能网卡软件,获得了广泛应用,但存在着队列管理不够灵活,中断处理逻辑可伸缩性较差的问题。为此,该文在Corundum基础上实现了一种支持中断、轮询混合模式的MSI-X引擎,大幅提高了Corun⁃dum的多队列管理能力,并同时具备高性能吞吐能力。该文给出了MSI-X中断申请至中断事件处理的整个流程,实验表明,该设计在不影响吞吐性能的基础上,可支持2048个中断向量,支持中断向量和传输队列的多对多绑定,支持直接中断和间接中断,同时可通过动态缓冲区监测的方式降低中断触发频率。该设计在Xilinx FPGA平台上实现了MSI-X引擎,在智能网络虚拟化中具有广泛的应用前景。

Sentinel-2-MSI和Sentinel-3-OLCI离水反射率产品在黄河口的适用性评估

近岸高浊度二类水体具有复杂的海洋光学特性,不同影像源反射率产品在该类水体的适用性尚待充分论证。以黄河口水体为典型研究对象,以适用于黄河口的ACOLITEDSF算法校正的Landsat离水反射率产品为参考,通过星星匹配,对基于不同大气校正算法的Sentinel-2-MSI(S2-MSI)和Sentinel-3-OLCI(S3-OLCI)离水反射率产品在黄河口的适用性进行了评估。结果表明,在黄河口高浑浊-极度浑浊水体,iCOR算法校正的S2-MSI和S3-OLCI的离水反射率产品与参考产品的一致性高于其他算法,其次为FLAASH和Sen2Cor算法,C2RCC算法表现相对较差。iCOR、FLAASH和Sen2Cor算法除在高浑浊水体的近红外波段平均百分比相对误差EMARD超过34%外,在绿、红波段的EMARD均小于24%,Sen2Cor算法结果整体上与FLAASH的相似。iCOR、FLAASH和Sen2Cor算法随着水体浑浊程度增加,误差越小;而C2RCC算法则随着水体浑浊程度的增加,误差越大,且整体存在低估。研究结果可为高浊度二类水体大气校正的选择提供有效借鉴,并为黄河口悬沙高分辨率动态监测打下基础。

基于UPLC-Q-TOF-MS、DESI-MSI法实时监测附子生长过程中不同部位多效唑变化

目的建立UPLC-Q-TOF-MS、DESI-MSI法实时监测附子生长过程中不同部位多效唑的变化,考察DESI-MSI法在分析多效唑过程中的优势。方法不同生长期、不同部位48批附子经QuEChERS提取后,采用UPLC-Q-TOF-MS和DESI-MSI法进行多效唑检测。DESI-MSI法技术参数为以90%甲醇-甲酸(1000∶0.5)为喷雾溶剂,体积流量2μL/min;扫描范围100~600 Da;空间分辨率120μm;锥孔电压80 V;喷雾器(N_(2))压力0.45 MPa;毛细管电压4.5 kV;离子源温度150℃;正离子扫描样本。结果种植附子的土壤中均含有多效唑,地上、地下部分分别发现有6、9批附子含有多效唑,DESI-MSI和UPLC-Q-TOF-MS法均能对其进行半定量分析,分析结果基本一致。同时,DESI-MSI法所用流动相体积和测试时间要明显少于UPLC-Q-TOF-MS法,并能对相对含量进行直观呈现。结论附子在种植过程中存在喷施多效唑的可能。本研究开发了一种结合DESI-MSI和UPLC-Q-TOF-MS技术快速检测附子不同部位多效唑的方法,为附子生长过程中多效唑的快速检测提供了参考。

MALDI MSI技术在缺血性卒中研究中的应用

基质辅助激光解吸/电离质谱成像(MALDI MSI)技术是新兴的分子成像技术,具有免标记、高空间分辨、高检测特异性等优势,在捕捉、分辨和鉴定各种疾病相关代谢物的组织分布与变化方面具有明显的优势,为揭示多种目标分子在生理/病理条件下的组织空间分布特征及其时空动态变化提供了便利和直观的研究手段。综述了近年来MALDI MSI技术在缺血性卒中研究中的应用,重点阐述了运用MALDI MSI技术研究缺血性卒中发生发展过程中,多种结构与功能各异的内源性小分子在脑中的时空动态变化规律,以期为揭示缺血性卒中发病的分子机制提供科学依据。

Sentinel-2 MSI和Landsat 8 OLI数据在玉米秸秆覆盖度遥感估算应用中的比较研究

秸秆覆盖度(Crop residue cover, CRC)的遥感估算可以在短时间内获取大范围耕地秸秆覆盖度数据,对于政府部门监测保护性耕作的实施情况有重要的现实意义。本研究基于Sentinel-2 MSI和Landsat 8 OLI数据,分别计算了多种光谱指数,并与野外实测的秸秆覆盖度数据进行相关性分析,挑选出极显著性相关的光谱指数。在此基础上,构建其与秸秆覆盖度之间的相关模型,并通过决定系数(R2)和均方根误差(RMSE)所表征模型的精度比较Sentinel-2 MSI和Landsat 8OLI数据由于光谱和空间尺度的差异对秸秆覆盖度反演模型的影响。结果表明:6种光谱指数与CRC的相关性系数均大于0.4,相关性较高的是Sentinel-2 MSI 20 m分辨率数据获取的NDTI和STI,相关系数分别为0.878、0.894,相关性最低的为Sentinel-2 MSI 10 m分辨率数据获取的NDSVI,相关系数为0.476;利用一元线性回归法构建模型时,Sentinel-2 MSI 20 m分辨率数据构建的光谱指数STI和NDTI,模型精度最高,R^(2)分别为0.810和0.800,RMSE分别为6.84%和7.01%,而30 m重采样数据的R^(2)分别为0.770和0.771,RMSE分别为7.52%和7.50%,随着空间分辨率的降低呈现出下降趋势;Sentinel-2MSI 30 m重采样数据获取的光谱指数构建的所有模型精度均略大于Landsat 8 OLI数据构建的模型。因此,Sentinel-2 MSI数据获取NDTI和STI这两个光谱指数更加适合本研究区域秸秆覆盖度的估算。

质谱成像技术在环境污染物分析及毒性研究中的应用进展

环境污染暴露与人类健康和疾病发生发展密切相关。污染物进入生物体内会被代谢和蓄积,通过与多种生物分子相互作用产生毒性效应。阐明污染物在生物体内的分布特征,明确其引发的毒性效应并发现关键毒性生物标志物,是环境毒理学研究的重要内容。外源性污染物在不同组织和器官中的代谢程度和累积情况存在差异,内源性生物分子合成和累积也具有精准的空间分布,因此对它们在生物体内的空间分布进行原位可视化分析具有重要意义。质谱因出色的定性和定量能力成为化合物分析的关键技术,以它为基础的质谱成像技术(MSI)是一种新兴分子影像技术,单次分析可提供组织切片上数百种内源性和外源性化合物的结构、含量和空间分布信息。该技术具有免标记、无需复杂样品前处理、高灵敏和高通量等优点,已被用于生物学、药学和临床研究中。近年来,MSI技术已成为环境分析和毒理学研究中最具前景的新技术之一,不仅可表征环境污染物在生物体整体和特定器官内的时空分布特征,还可通过开展空间代谢组学解析内源性代谢物对暴露的应答情况。本文介绍了常见MSI技术电离源的原理和特点、常用质量分析器及分析流程,对其在环境污染物分析和毒理学研究方面的应用进行了全面综述,并对未来发展方向进行了展望。

多光谱技术在食品无损检测中的应用进展

食品检测技术在确保食品安全方面发挥着至关重要的作用,传统的食品检测方法具有一定的破坏性且费时、低效、操作繁琐和不客观,因此探究无损、快速、高效的检测技术,对保障食品安全和质量评估具有十分重要的意义。多光谱成像(Multispectral Imaging,MSI)技术是一种新兴的无损检测技术,具有快速、无损、客观等特点,为食品领域快速、无损检测提供了新的方法和手段。论文介绍了MSI成像技术的原理、优缺点以及多光谱成像技术的数据分析方法,对国内外多光谱技术在水果的品质评估、蔬菜分级、肉制品掺假和水产品的腐败变质检测等领域应用研究进展进行了综述,最后对多光谱技术在未来食品的内部品质和外部品质无损检测中的发展进行总结展望。

根据临床病理学特征鉴别无家族史MSI-H大肠癌

目的根据修订的Bethesda指南,分析无家族史大肠癌患者的病理学特征和微卫星不稳定检测结果的关系,探讨无家族史高度微卫星不稳定(MSI-H)大肠癌的临床病理学特征。方法纳入150例无家族史大肠癌患者,选取5个标准位点(BAT25、BAT26、D2S123、D5S346、D17S250)进行免疫荧光PCR,以GeneMapper软件分析PCR产物;收集患者年龄、性别及肿瘤部位信息;光学显微镜观察多种病理特征(分化程度、黏蛋白分化、组织学异质性及类Crohn反应);免疫组化方法检测肿瘤浸润淋巴细胞CD4+和CD8+的表达。Logistic逐步回归分析产生回归方程,依据病理特征计算MSI-H表型的概率。结果无家族史大肠癌中MSI-H表型为13.33%;低分化、组织学异质性、类Crohn反应和TILs是MSI-H表型大肠癌的独立鉴别因子,Logistic回归方程鉴别MSI-H表型大肠癌的敏感性为70.0%,特异性为99.2%,总准确率为95.3%。结论MSI-H表型构成了一个病理学特异的无家族史大肠癌类型,根据临床病理学特征能够有效地检出MSI-H表型大肠癌。

MSI结直肠癌的研究进展

结直肠癌是最常见的恶性肿瘤之一,随着生活水平的提高以及饮食习惯的西化,我国结直肠癌的发病率和死亡率均有上升趋势。结直肠癌的发生发展是一个多步骤、多基因参与的过程,目前认为染色体不稳定(Chromosomal instability,CIN)和微卫星不稳定(Microsatellite instability,MSI)是其发生的主要基因途径,本文就MSI结直肠癌在临床病理及分子特征方面的研究进展进行综述。

多组学质谱分析技术在化学暴露组研究中的应用

暴露组定义为从受孕开始人类环境(即所有非遗传)暴露的总和,旨在全面了解人类健康与环境化学品暴露之间的关联。因此,对暴露组的全面测量至关重要,包括准确可靠地测量外部环境中的暴露及内部环境中的生物反应。化学暴露组既包括个体受外源性化学物质暴露的总和(外暴露),也包括因外部压力而产生或改变的内源性化学物质暴露的总和(内暴露)。随着新一代高通量、高分辨质谱技术的发展,以质谱分析驱动的多组学研究技术将为暴露组内、外源污染物的鉴定分析带来新的范式。本文主要综述了化学暴露组学的研究策略及现有的化学暴露测量方法,重点介绍了代谢组学、蛋白质组学以及基于质谱成像的空间组学技术在化学暴露组研究中的应用现状及未来发展前景。当前,质谱技术因其灵敏度高、特异性强和动态范围宽的优势已成为检测外暴露的主要方法,基于低分辨质谱的针对性分析以及基于高分辨质谱的可疑筛查和未知筛查技术已广泛应用于测量人类对各种化学品的暴露。此外,代谢组学、蛋白质组学和基于质谱成像的空间组学技术作为内暴露的有效检测方法,在预测潜在的不良健康结果和揭示内在分子机制中发挥了重要的作用。同时我们讨论了本课题组在化学暴露组学领域所取得的研究进展,并提出了实现化学暴露组测量所面临的主要挑战。

深度学习在质谱成像数据分析中的应用研究进展

质谱成像(MSI)是一种用于表征化合物空间分布特征的方法。随着采集方式的多样化发展和灵敏度等的不断提高,该方法产生的数据总量和分析复杂度呈指数增长,给数据后处理带来了诸多挑战。深度学习(DL)是一种在数据分析和图像识别中广泛应用的强大工具,对于质谱成像数据分析具有巨大潜力。本文综述了深度学习在质谱成像数据分析中的研究现状、应用进展和面临的挑战,重点涵盖数据预处理、图像重构、聚类分析和多模式融合4个核心阶段;还列举说明了深度学习与质谱成像技术相结合在肿瘤区域划分和亚型诊断等研究中的高效应用。本综述对该研究方向未来的发展趋势进行了展望,旨在促进人工智能与质谱分析更好的结合。

结直肠癌微卫星不稳定(MSI)与其发病及预后的关系

抑癌基因及癌基因之间的相互作用是结直肠癌发病主要发病原因,近年研究发现微卫星不稳定成为结直肠癌发病另一重要机制,尤其是遗传性非息肉病性结直肠癌(hereditary non-polyposis colorectal cancer,HNPCC)及部分散发性结直肠癌发生的重要原因。微卫星不稳定的结直肠患者具有独特的临床病理特征,如低分化、黏液腺癌、多位于右半结肠、淋巴细胞浸润明显等。化疗是结直肠癌患者手术后重要治疗手段,氟尿嘧啶类药物为结直肠癌患者化疗的基本药物,因此结直肠癌患者对于氟尿嘧啶类药物敏感性成为患者能否从化疗中获益的重要因素,也成为各位学者的研究热点。近年来有学者提出微卫星不稳定及其他分子标记物可预测结直肠癌患者化疗敏感性,同时也可成为判断预后的指标。微卫星不稳定将来可成为结直肠癌患者的预后及化疗敏感性的判断因素,也可为个体化治疗提供理论依据,但目前尚需大样本的前瞻性临床试验进一步证实。结直肠癌目前在国内外发病率均逐渐升高,成为危害人类生命的重要疾病,且遗传倾向明显,是目前人类恶性肿瘤中遗传变化最明显的肿瘤。对于结直肠癌的发病研究表明,染色体不稳定(chromosomeinstability)为结直肠癌发病的主要原因,其机制仍未完全阐明。近年的研究发现微卫星不稳定(microsatelite instability)为结直肠癌发病的另一重要机制,是遗传性非息肉病性结直肠癌(hereditarynon-polyposis colorectal cancer,HNPCC)及部分散发性结直肠癌发生的重要原因。目前关于微卫星不稳定的研究不仅于发病机制上,与结直肠癌预后的关系也成为目前研究的热点。

FHIT基因的MSI、LOH及甲基化修饰与胃癌关系的研究

目的检测胃癌脆性组氨酸三联体(FHIT)基因的微卫星不稳定(MSI)、杂合性缺失(LOH)以及甲基化状态,探讨FHIT基因在胃癌发生、发展中的作用。方法采用D3S1300作为微卫星标记,应用聚合酶链反应(PCR)以及非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Native-PAGE)检测胃癌组织和正常胃黏膜FHIT基因MSI和LOH;应用甲基化特异性PCR(MSP)检测胃癌组织和正常胃黏膜FHIT基因的甲基化状态。结果胃癌组织中FHIT基因D3S1300位点MSI和LOH发生率分别为23.7%和28.8%,MSI和LOH存在明显正相关(P<0.05,r=0.76);胃癌组织中FHIT基因甲基化阳性率为51.4%,FHIT基因MSI、LOH与甲基化均与胃癌患者的年龄、性别、Lauren分型、Borrmann分型、淋巴结转移以及TNM分期无关(P>0.05),但LOH与浸润程度有关(P<0.05),胃癌FHIT基因甲基化与MSI和LOH均不存在明显正相关(P>0.05,r=0.12和0.13)。结论 FHIT基因MSI、LOH及甲基化修饰在胃癌发生、发展中均起重要作用。

空间分辨代谢组学在疾病诊断研究中的应用进展

基于质谱成像技术发展而来的空间分辨代谢组学,能够直接对动植物组织或细胞中的代谢产物进行原位定性、定量,以及借力图像整体或局部特征对代谢物进行结构、含量、时空动态变化及其空间分布定位分析,识别潜在可靠的生物标志物。该技术具有高灵敏度、高分辨率、高可视化性以及无需标记等优点,已被越来越广泛地运用在临床疾病诊断与研究中。本文主要总结了近年来空间分辨代谢组学的技术发展,阐述其在肿瘤、神经精神疾病、糖尿病等疾病中的应用进展,旨在为空间分辨代谢组学在疾病诊断中的应用提供借鉴和参考。

MSI-H单发性肠癌中hMLHI基因启动区甲基化测定在癌症临床诊断和早期治疗中的作用和意义

目的探讨MSI,MMR和hMLHI基因启动区甲基化之间的关系以及可能存在的致癌机制。强调甲基化测定在癌症的早期诊断与跟踪治疗中所应引起的重视。方法详细阐述了从病人肿瘤组织样品中基因组DNA的粹取以及MSP的具体测定方法步骤,以及引物的选用。结果90%的MSI-H单发性肠癌病人存在着hMLHI基因启动区甲基化现象。结论在MSI-H型的单发性肠癌中,hMLHI基因启动区甲基化是造成MMR缺损的原因。在这个背景下,一个非遗传性的后生环境也许会导致在肿瘤中多种遗传性变化。该结论将为抗癌药物的设计提供重要信息。DNA甲基化测定是一个很有潜力的癌症生化诊断标志,它不但在临床诊断与跟踪治疗过程中发挥着作用,同时也将一步步揭示致癌的机制。

免疫检查点抑制剂治疗错配修复缺陷/微卫星高度不稳定型胃癌的研究进展

错配修复缺陷/微卫星高度不稳定型(mismatch repair-deficient/microsatellite instability-high,dMMR/MSI-H)胃癌是胃癌的一个特殊分子亚型,其因独特的免疫微环境和高突变负荷对免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs)高度敏感。ICIs治疗dMMR/MSI-H胃癌在多项临床研究中展现出较好的效果,但仍存在原发耐药与继发耐药的挑战。如何在这一特殊分子亚型的胃癌中选择合适的ICIs和克服耐药性是临床上亟需解决的问题。本文对ICIs的作用机制,及其治疗dMMR/MSI-H胃癌的研究进展和存在的耐药性挑战进行综述,以期为临床治疗提供参考。