将生物芯片技术和滚环扩增(rolling circle amplification,RCA)技术结合,建立一种在片RCA检测食源致病性菌新方法.依据待检测致病菌的基因组序列设计捕获探针(capture probe,CP)、检测探针(detect probe,DP)和滚环探针(rolling circle p...将生物芯片技术和滚环扩增(rolling circle amplification,RCA)技术结合,建立一种在片RCA检测食源致病性菌新方法.依据待检测致病菌的基因组序列设计捕获探针(capture probe,CP)、检测探针(detect probe,DP)和滚环探针(rolling circle probe,RCP),其中捕获探针、检测探针与待检测致病菌基因组序互补,RCP不含任何待检菌基因组DNA序列,CP的5′末端修饰氨基,将其点样制备成CP微阵列,DP、RCP与待检菌gDNA混合后变性,将其与CP微阵列杂交并连接, RCA扩增反应体系中加入链亲和素进行在片扩增反应,分析检测结果.研究表明,该方法能灵敏、特异性地检测单一和混合靶标分子,以金黄色葡萄球菌为检测对象,其最低检测限可到达50 fg/μL,其线性范围是400 ~50 fg/μL, R 2 达到0.97,证实了该方法的可行性和可靠性,为食源性致病菌检测提供了新的技术方法.展开更多
针对珠江口藻类生长受泥沙遮光限制明显的问题,对RCA(row and column of Aesop)三维水质模型进行改进,加入泥沙模块及悬沙遮光对藻类生长的限制作用。应用改进的RCA水质模型,对珠江口的营养盐、浮游植物及溶解氧进行模拟研究,结果显示,...针对珠江口藻类生长受泥沙遮光限制明显的问题,对RCA(row and column of Aesop)三维水质模型进行改进,加入泥沙模块及悬沙遮光对藻类生长的限制作用。应用改进的RCA水质模型,对珠江口的营养盐、浮游植物及溶解氧进行模拟研究,结果显示,改进的RCA水质模型较好地再现了洪季珠江口营养盐、浮游植物和溶解氧在水平及垂向上的空间分布,这表明该水质模型能较好地反映珠江河口中生态因子的关键过程。珠江口的缺氧现象在物理和生化过程的共同作用下,被限制在伶仃洋的西滩和中滩及磨刀门海域。在洪季,大量冲淡水进入珠江口形成锋面,颗粒态有机物(particulate organic matter,POM)在锋面的影响下,大量集中沉降在伶仃洋的西滩及中滩特定区域及磨刀门外,产生较高的底泥耗氧率(sediment oxygen demand,SOD)。而在高SOD的区域,水体分层通常也较明显,因而产生缺氧现象。另一方面,伶仃洋水体中磷的限制作用明显,加上悬浮泥沙的遮光作用,不利于浮游植物生长,使得初级生产力低;而在陆架上,悬沙浓度减少使初级生产力增加,但由于海源颗粒有机碳(particulate organic carbon,POC)的沉积分散于整个陆架上,无法产生伶仃洋内的高SOD区域,加上水体分层不明显,并没有产生缺氧现象。展开更多
文摘三维超快成像是超声技术发展的重要方向.基于二维全采样阵列的传统三维成像方法需要较多成像阵元和采样通道,其紧密的阵元排列设计也客观上限制了阵列孔径大小和成像分辨率.行列寻址(row-column addressing,RCA)探头以行列检索的方式将通道数自N×N减少为N+N,从而极大地降低了阵列的硬件实现成本.本文仿真了中心频率为6MHz的128行+128列的RCA阵列,结合多角度平面波正交复合成像方法,通过延时叠加(delay and sum,DAS)波束合成、基于特征值分解(singular value decomposition,SVD)的杂波滤除和自相关多普勒速度求解算法,实现了血流仿体的多普勒成像,并分析了不同复合角度序列对成像效果的影响.定量分析表明,当角度数从5个增至33个时,-6 dB分辨率从0.986 mm提升至0.493 mm;当复合角度为17个时,功率多普勒图像的SNR可达30 dB,彩色多普勒沿直径方向的速度分布和真实值的平均误差约为26.0%.以上结果表明,基于RCA阵列的三维成像技术能够获得三维B-mode、功率多普勒和彩色多普勒图像,增大复合平面波角度数和角度范围可显著提高成像质量.本研究对于三维超快超声多普勒成像技术发展具有借鉴意义,相关方法有应用于血流血管成像,并进一步实现基于神经-血管耦合的组织功能监测与成像的潜力和前景.
文摘将生物芯片技术和滚环扩增(rolling circle amplification,RCA)技术结合,建立一种在片RCA检测食源致病性菌新方法.依据待检测致病菌的基因组序列设计捕获探针(capture probe,CP)、检测探针(detect probe,DP)和滚环探针(rolling circle probe,RCP),其中捕获探针、检测探针与待检测致病菌基因组序互补,RCP不含任何待检菌基因组DNA序列,CP的5′末端修饰氨基,将其点样制备成CP微阵列,DP、RCP与待检菌gDNA混合后变性,将其与CP微阵列杂交并连接, RCA扩增反应体系中加入链亲和素进行在片扩增反应,分析检测结果.研究表明,该方法能灵敏、特异性地检测单一和混合靶标分子,以金黄色葡萄球菌为检测对象,其最低检测限可到达50 fg/μL,其线性范围是400 ~50 fg/μL, R 2 达到0.97,证实了该方法的可行性和可靠性,为食源性致病菌检测提供了新的技术方法.