茯苓多糖合成途径磷酸葡萄糖变位酶和UDP-葡萄糖焦磷酸化酶基因鉴定

采用已报道的灵芝磷酸葡萄糖变位酶(PGM)和UDP-葡萄糖焦磷酸化酶(UGPP)基因序列对茯苓基因组进行搜索比对,获得茯苓WcPGM和WcUGPP候选基因序列;以茯苓的cDNA为模板,成功克隆获得WcPGM和WcUGPP基因;随后利用pPIC9K构建2个基因的表达载体,并转化至毕赤酵母进行异源表达。序列分析表明WcPGM和WcUGPP基因全长分别为2021 bp和2144 bp,其中WcPGM基因含有5个外显子和4个内含子,编码564个氨基酸;WcUGPP基因含有11个外显子和10个内含子,编码502个氨基酸。氨基酸序列比对表明,WcPGM和WcUGPP与来源于绣球菌的ScPGM和ScUGPP的同源性分别为87%和91%。酶活测定表明,重组酶WcPGM可转化葡萄糖-1-磷酸(G1P)为葡萄糖-6-磷酸(G6P),酶活达1540 U·mL^(-1);重组酶WcUGPP可催化G1P和尿苷三磷酸(UTP)合成UDP-葡萄糖(UDP-Glc),酶活达660 U·mL^(-1),表明从茯苓中筛选到的2个酶WcPGM和WcUGPP具有PGM和UGPP活性。分子模拟表明,WcPGM在催化可逆反应过程中S114为磷酸供体和受体,R24和K379作为催化酸和碱实现底物的磷酸化和去磷酸化,而E366和S368可实现底物的2种朝向,保障了中间产物葡萄糖-1,6-二磷酸的翻转,确保了WcPGM的可逆反应;而WcUGPP活性中心的核苷酸结合Loop和糖结合Loop保障了底物的正确朝向,K390作为催化碱实现了底物UTP/G1P与UDP-Glc的可逆反应。该研究为茯苓多糖合成途径的解析和代谢工程提升茯苓多糖产量奠定了基础。

基于主被动结合的新型UDP反射放大协议识别方法

反射放大攻击因具有优质的流量倍增能力和反追踪溯源能力正逐步成为主流的DDoS攻击手段。近年来不断涌现以OpenVPN等物联网协议为代表的新型UDP反射放大攻击方法,并且呈现出多协议组合反射放大的趋势。然而,当前UDP反射放大检测方法存在检测结果不准确、检测效率不足等问题。针对上述问题,为提升UDP反射放大检测能力,提出了一种基于主被动结合的新型UDP反射放大协议识别方法。首先,通过主动探测的方法获取已知的物联网反射放大协议流量,并将其作为实验数据集;其次,在流量自动化分析过程中使用双重阈值判定和多元特征匹配方法捕获未知的反射放大协议和触发方式;最后,通过重放的方式进行验证。实验结果表明,该方法可有效检测UDP反射放大流量,精度达到99.88%,并且发现了QUIC协议潜在的反射放大能力,有效提升了反射放大攻击的防护能力。

植物花青素修饰相关UDP-糖基转移酶研究进展

糖基化在植物天然产物的结构多样性和稳定性中起着重要的作用。植物体内游离的花青素不稳定,通常会在尿苷二磷酸依赖的糖基转移酶(UGTs)的催化下形成稳定的花青苷。近年来,关于花青素糖基化修饰的报道越来越多,在不同植物中均发现了参与花青素糖基化修饰的各种酶。本文主要综述了植物中花青素修饰相关UGT的结构特点、代谢途径作用节点、生化作用过程、分子鉴定与转录调控等方面的研究进展,以期为植物花青素糖基化修饰及其调控过程研究提供参考。

黄芩素在人及不同种属肝微粒体中的UDP-glucuronosyltransferase代谢差异

目的研究黄芩素在不同种属肝微粒体中的UDP-葡萄糖醛酸转移酶(UDP-glucuronosyltransferase,UDPGA)代谢差异特性。方法使用肝微粒体体外代谢孵育法、HPLC-UV分析方法,选用不同种属的肝微粒体进行黄芩素UDPGA体外代谢研究。结果黄芩素在人肝微粒体及不同种属的肝微粒中,加入UDPGA进行37℃恒温孵育,孵育结束后离心,取上清液,经HPLC-UV分离检测得到3个代谢产物,分别是:黄芩素-7-O-β-葡萄糖醛酸结合物、黄芩素-6-O-β-葡萄糖醛酸结合物和黄芩素-6-O-葡萄糖醛酸结合物-7-O-β-葡萄糖醛酸结合物;通过与标准品对照确定黄芩素的三个代谢产物都是葡萄糖醛酸化的代谢产物。同时,不同种属间UGT代谢物的活性表现出较大差异,黄芩素-7-O-β-葡萄糖醛酸结合物在人肝微粒体中的代谢活性最强,Km=1.61,Vmax=0.77(BG在人肝微粒体中的代谢活性是SD雌鼠的25.2倍);黄芩素-6-O-β-葡萄糖醛酸结合物在比格犬肝微粒体中代谢活性最强,Km=3.05,Vmax=3.51(雄性比格犬肝微粒体的活性是雄性恒河猴肝微粒体的2.6倍);黄芩素-6-O-葡萄糖醛酸-7-O-β-葡萄糖醛酸结合物在猪肝微粒体中代谢活性最强,Km=5.38,Vmax=0.17(猪肝微粒体的活性是人肝微粒体的13.6倍),其他依次是犬、恒河猴、鼠和人。结论黄芩素在人及不同种属肝微粒体UGT代谢中均生成上述三种葡萄糖醛酸化代谢产物,但是不同种属间的代谢表现出酶动力学的差异。

基于Fins/UDP通信协议的采煤机远程监控系统研究

为推进采煤机自动化水平的提升,研究了基于Fins/UDP通信协议的采煤机远程监控系统。详细阐述了Fins/UDP通信协议的报文构成,并构建了适用于煤矿井下采煤机的远程监控系统架构。借助开源的VUE和Flask框架,展开了系统软件的开发。最后,通过一系列实验,对系统的数据采集和指令下发等关键功能进行了验证。实验结果表明,所设计的系统可以实现对采煤机的有效远程监控。

列车UDP数据传输可靠性快速分析方法

用户数据报协议(User Datagram Protocol,UDP)不采用重传机制,在链路受接触不良、电磁干扰影响下可能会丢包。研究Wireshark软件自带的统计功能和排序功能,实现单个数据文件的快速分析。基于排序思想,进一步研究使用软件算法的Auto-Array方法。通过实测对比,Auto-Array方法能实现多个数据文件的快速分析,并输出UDP数据文件中的详细的丢包信息,为评价UDP传输可靠性提供依据。

UDP-糖基转移酶GmSGT2催化金盏花苷E的半乳糖基修饰

通过qPCR从大豆cDNA文库克隆得到UDP-糖基转移酶GmSGT2的基因,构建工程菌株E.coli BL21/pET28a-GmSGT2,通过His-tag标签法得到纯化的GmSGT2,探究GmSGT2底物特异性,考察pH、温度对GmSGT2的影响,测定其催化金盏花苷E的动力学常数,通过分子对接阐明GmSGT2的底物识别机制。结果表明:GmSGT2可将1分子半乳糖转移到金盏花苷E糖上的C2位置,实现糖上加糖。除UDP-半乳糖外,GmSGT2还可识别UDP-葡萄糖、UDP-木糖和UDP-阿拉伯糖,相对酶活为24.67%~37.60%。GmSGT2催化金盏花苷E的最适温度为40℃,最适pH为7.5,催化效率k_(cat)/K_m为2.71 L/(mmol·s)。分子对接结果表明,His20是GmSGT2的催化氨基酸,Ser19、Ala146、Arg260、Tyr262、Ser291、Leu353、Trp370、Asn371、Thr372和Glu391参与识别底物。GmSGT2催化金盏花苷E半乳糖苷化的研究为酶法合成半乳糖苷衍生物提供指导意义。

人参UDP-阿拉伯糖变位酶基因电子克隆及分析

UDP-阿拉伯糖变位酶是阿拉伯糖合成过程的关键酶,在植物形态建成和逆境胁迫响应过程中起着重要的作用.UDP-阿拉伯糖变位酶可使UDP-Araf和UDP-Arap相互转换,参与包括阿拉伯糖在内的多糖合成.以玉米UDP-阿拉伯糖变位酶氨基酸序列作为探针,通过电子克隆的方式,对人参EST数据库进行检索,获得具有高度同源性的cDNA序列,采用DNAMAN软件对其进行拼接和组装,最终获得一条长为1445 bp的cDNA序列.利用相关软件对人参UDP-阿拉伯糖变位酶基因进行生物信息学分析.结果表明:人参UDP-阿拉伯糖变位酶蛋白为稳定的亲水性蛋白,该蛋白上的磷酸化修饰有33处,无跨膜螺旋区,不存在信号肽,为非分泌蛋白.该蛋白含有无规则卷曲、α螺旋、延伸链、β折叠二级结构,其中无规则卷曲结构最多.人参UDP-阿拉伯糖变位酶的氨基酸序列与凤仙花同源性较高,与石榴花同源性较低.分析结果能为人参后续相关研究提供一定的参考依据.

千兆级以太网中基于FPGA的UDP/IP协议研究

千兆级以太网是当前应用频次较高的新型网络技术,在系统兼容、交互操作、长距离传输、资源共享等各个层面具有明显优势。各行业企业应结合高质量发展主题扩大对该技术的配置比例,为其实践赋能。本文以此为背景概述了千兆级以太网,并在剖析基于FPGA的UDP/IP协议基础上,分别从背景技术、系统架构、功能模块、实验测试4个方面对一种千兆级以太网图像传输系统进行了具体探讨。

基于STM32的EtherCAT转UDP通信转换系统设计与实现

工业以太网总线技术EtherCAT是一种基于以太网的高性能、低成本的实时通信技术,它可以实现分布式控制系统的高速、低延迟、同步和确定性的通信。EtherCAT在工业自动化领域有着广泛的应用,如机器人、数控机床、汽车制造等。然而,EtherCAT与工控机端的通信网络一般采用TCP/IP协议,由于其非实时性通信方式,不能直接与EtherCAT从站交换数据,需先进行通信协议转换。通信转换需要借用硬件介质来实现。为了实现EtherCAT与工控机端的TCP/IP协议的互通,本文设计了一种基于STM32单片机的通信转换系统,该系统利用FPGA开发的高速、低延迟、同步和确定性的TCP/IP通信模块,实现了EtherCAT与TCP/IP协议的转换。本文介绍了系统的硬件结构和软件设计,验证了系统的通信性能和效率。

基于UDP的混动商用车巡航控制器OTA系统开发

为实现混动商用车巡航控制器软件及时更新和远程调试,并保障系统的安全性,设计开发一种基于用户数据报协议(user datagram protocol,UDP)的空中下载技术(over the air technology,OTA)升级系统。设计OTA系统的通信模块、握手模块、命令行调试模块、文件下载模块、备份升级模块和服务器端界面,并进行测试验证。结果表明:基于UDP协议的混动商用车巡航控制器OTA系统能够完成报文传输、通信加密、系统调试、软件包传输、软件升级及备份的功能,实现了软件升级的安全性、可靠性、便捷性。

基于UDP的FPGA远程升级系统设计

设计并实现了基于UDP的FPGA远程升级系统,包括完整的FPGA工程和整套计算机上位机GUI程序。FPGA运行时,通过有线网络与计算机相连,在计算机上简单地操作上位机GUI程序即可实现FPGA的在线升级烧写、热启动等功能。实际上,在没有网口只有串口的情况下,这套远程升级系统通过模式选择开关可以切换为串口模式,而计算机上位机GUI程序也相应切换为串口模式,通过串口实现FPGA远程升级等功能。

基于FPGA的UDP_IP协议栈的设计与实现

工业控制现场复杂性的提升增加了对数据传输性能的要求,为了提高工业控制现场设备之间数据传输的实时性和确定性,本文对TCP/IP协议的基础架构进行研究,设计了一种UDP_IP网络通信协议栈,支持ARP协议、ICMP协议以及UDP协议通信;通过使用Cyclone IV系列FPGA芯片和以太网PHY芯片RTL8201CP实现了各种网络协议通信。经过测试,验证本文设计的UDP_IP协议栈能够正确的发送和接收各种协议报文数据,设计灵活,具有较好的稳定性和较强的可移植性。

Matlab与EDPF-NT+DCS平台的UDP通讯研究与应用

EDPF-NT+平台是国产DCS系统之一,本文以EDPF-NT+平台为例来研究DCS与Matlab的UDP实时通讯。EDPF-NT+平台通过接口站读取电厂生产过程中的实时信息,通过局域网发送给Matlab端的数据接收方;Matlab端通过udp函数创建UDP目标,按EDPF-NT+平台的数据包规范进行数据解析以得到DCS系统的实时数据,实现Matlab与EDPF-NT+平台的UDP实时通讯。所得数据可用于生产过程的建模、实时监控与控制算法研究,从而推进电厂的智能化发展。本文详细分析了EDPF-NT+平台的数据包结构、发送方式与接口站配置规范,在此基础上编写了Matlab端通讯接口,实现了Matlab与EDPF-NT+DCS系统之间的实时通讯。

利用网络缓存队列长度预测UDP拥塞程度研究

由于缺乏拥塞控制机制,利用UDP协议传输流媒体业务时会带来网络拥塞问题,导致流媒体在播放时出现不连续、卡顿甚至凝固的现象。阐述了UDP协议的传输特性,深入分析了网络报文拥塞控制机制和拥塞控制算法,并提出了一种预测UDP拥塞程度的方法。该方法首先建立流媒体数据包发送缓存队列,发送端将要发送的报文存入缓存队列;然后根据当前流媒体数据包发送缓存队列的长度与缓存队列的最佳长度的偏差程度定义拥塞级别;最后,根据拥塞级别和拥塞判断方法,采用和式增加和和式减少的速率控制算法对流媒体进行拥塞控制。

一种基于UDP和FTP协议的远程浏览系统的设计

SCADA系统主要部署在控制系统的操控室,由专业人员进行操作,对于管理人员,如果在办公室就可以实时监视机组运行图和数据曲线将给管理和决策带来极大便利。设计了一种基于UDP和FTP协议的远程浏览系统的实现方法,分别介绍了系统体系结构、软件地位、系统模块划分、总体处理流程、进程间的数据交互技术,以及FTP文件下载系统设计、客户端共享显示内存设计等。该系统信息获取便捷、快速、准确,使用方法简单易操作,已经得到广泛应用。

UDP-糖生物合成的研究进展

尿苷二磷酸(UDP)-糖是糖基化修饰利用的一类重要糖供体,从合酶途径、磷酸化酶途径和激酶途径总结UDP-糖的体内合成过程,由于关键酶的缺乏,只有UDP-葡萄糖(UDP-Glc)能从以上3种途径快速合成。通过特定功能酶能够实现UDP-糖之间快速转化,这种转化以UDP-葡萄糖为起始物,以UDP-葡萄糖醛酸(UDP-GlcA)为中间体,在此基础上,概述特定功能酶催化UDP-糖合成的最新进展,探讨脱氢酶、脱羧酶、异构酶和还原酶在UDP-糖转化中的重要作用。最后,剖析UDP-糖合成的现存问题,展望UDP-糖合成的未来研究方向,旨在为更快地挖掘UDP-糖基供体的作用潜能和实现更加高效低成本的糖基化修饰提供新思路。

基于STM32的EtherCAT与UDP实时通信转换的设计与实现

由于EtherCAT现场总线的开源性,在国内工业自动化领域应用越来越广。EtherCAT现场总线具有很强的实时性要求,通信抖动小,周期短。工控机端的通信网络一般为TCP/IP通信协议,该协议为非实时性通信方式,不能与EtherCAT直接完成数据交互,两者之间需要进行通信协议的转换。设计了一种基于STM32的EtherCAT从站和FPGA的UDP的通信方式,通过借助硬件介质来实现,硬件开发采用LAN9252 (EtherCAT从站控制器)、STM32F103、FPGA和88EE1111为主要芯片。在STM32F103中执行EtherCat从站协议栈,FPGA实现UDP与EtherCAT协议的转换,实现实时通信的转换及传输。

基于以太网技术的光电信号检测系统

针对光信号检测传输速率低、传输距离短及检测成本高等问题,结合EP4CE115F29C7N型芯片,设计基于以太网的光电信号检测系统。该系统将光电信号采集模块采集到的信号通过AD7606采样并进行预处理后存储到片外SDRAM,同时在UDP/IP协议基础上设计以太网通信模块,将数据通过数据包的方式发送到上位机,并基于LabVIEW设计光信号采集监控系统,实现对上传数据的滤波和实时检测。通过对比输入信号和LabVIEW监控系统显示信号的一致性,验证了系统的正确性。实验结果表明:该系统可以减少光检测信号远距离传输的数据损耗,提高光电信号的检测效率,有较好的实时性和可读性,且程序移植灵活,节约并缩短了光电检测成本和系统开发时间。

自驱动关节臂坐标测量机可视化监控平台设计与仿真

针对传统坐标测量机人工测量模式误差大、运动仿真平台三维可视化效果差的缺陷,以六自由度自驱动关节臂坐标测量机为研究对象,基于Unity 3D软件设计了一款自驱动关节臂坐标测量机三维可视化监控平台。利用SolidWorks软件建立测量机三维模型,联合3ds Max软件完成了三维模型的优化处理与导入,采用Unity 3D自带的UI组件搭建了可视化界面框架,编写C#脚本绑定模型零件,实现虚拟坐标测量机自驱动控制。研究内容包括三维建模与轻量化处理、模型加载、可视化监控平台界面设计、测量机运动仿真以及UDP通信实现数据实时传输。通过对自驱动关节臂坐标测量机虚拟可视化仿真平台的研究,实现测量机自驱动控制与动态测量实时监测,研究成果对三维可视化监控在测量机领域的应用具有重要意义。