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嗜热链球菌c-di-AMP合成酶的结构预测
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作者 范艺周 骆思羽 +3 位作者 朱浩伟 薛珍 艾连中 熊智强 《工业微生物》 CAS 2024年第1期171-176,共6页
作为一种新兴第二信使分子,c-di-AMP具有全局调控胞内渗透压平衡、DNA损伤和生物膜形成等生理功能。本实验室在实验前期筛选出了一株高产胞外多糖的嗜热链球菌菌株S-3,但未对其进行c-di-AMP信号通路研究。本研究在嗜热链球菌S-3全基因... 作为一种新兴第二信使分子,c-di-AMP具有全局调控胞内渗透压平衡、DNA损伤和生物膜形成等生理功能。本实验室在实验前期筛选出了一株高产胞外多糖的嗜热链球菌菌株S-3,但未对其进行c-di-AMP信号通路研究。本研究在嗜热链球菌S-3全基因组中筛选出c-di-AMP合成酶(StDAC),对其二级结构进行预测,结果显示St DAC二级结构包含42.98%α-螺旋、15.32%β-折叠和38.30%无规则卷曲。利用SWISS-MODEL和Modeller对StDAC进行单模板和多模板同源建模,由SWISS-MODEL建立的模型通过了Ramachandran、Errat和Verify-3D评估,表明其结构较为合理;而Modeller建立的模型仅通过了Ramachandran评估,总体结构评分较低。本研究预测的嗜热链球菌StDAC三维模型为解析其结构和功能奠定了基础。 展开更多
关键词 嗜热链球菌 c-di-AMP 生物信息学 二级结构 同源建模
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乳酸菌第二信使分子c-di-AMP研究进展
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作者 范艺周 李欢欢 +3 位作者 喻林兵 曹佳尧 艾连中 熊智强 《工业微生物》 CAS 2024年第2期79-84,共6页
微生物依赖信号识别和信号传递来感知并响应外界环境变化。c-di-AMP作为第二信使分子在信号传导过程中发挥着关键作用,其通过酶、转录调控因子和核糖开关等受体靶标来调控细胞生长、生物膜形成、K^(+)稳态、DNA完整性、细胞壁合成和脂... 微生物依赖信号识别和信号传递来感知并响应外界环境变化。c-di-AMP作为第二信使分子在信号传导过程中发挥着关键作用,其通过酶、转录调控因子和核糖开关等受体靶标来调控细胞生长、生物膜形成、K^(+)稳态、DNA完整性、细胞壁合成和脂肪酸合成等与生理功能相关的基因和蛋白的表达。尽管对于c-di-AMP代谢调控在枯草芽孢杆菌、单增李斯特氏菌和金黄色葡萄球菌等细菌中的研究较为深入,但对其在乳酸菌中的研究却相对较少。基于此,文章重点关注乳酸菌中cdi-AMP的代谢及其在K^(+)稳态和抑制甘氨酸甜菜碱转运中的信号传导作用;同时,通过总结现有研究中的乳酸菌c-di-AMP代谢调控,深化对乳酸菌第二信使分子信号调控的认知。 展开更多
关键词 乳酸菌 第二信使分子 环二腺苷酸
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TpbA通过调节c-di-GMP抑制鲍曼不动杆菌ATCC17978生物膜的形成
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作者 张玉英 黄菱 +1 位作者 赵建宁 师志云 《宁夏医学杂志》 CAS 2023年第1期1-4,共4页
目的分析生物膜形成相关的酪氨酸磷酸酶A(TpbA)经调节3,5-环鸟苷二磷酸(c-di-GMP)影响鲍曼不动杆菌ATCC17978生物膜的形成。方法通过上海生工合成TpbA基因序列,构建pET-28a-TpbA载体,原核重组表达目的蛋白TpbA经亲和层析纯化后并用weste... 目的分析生物膜形成相关的酪氨酸磷酸酶A(TpbA)经调节3,5-环鸟苷二磷酸(c-di-GMP)影响鲍曼不动杆菌ATCC17978生物膜的形成。方法通过上海生工合成TpbA基因序列,构建pET-28a-TpbA载体,原核重组表达目的蛋白TpbA经亲和层析纯化后并用western blot验证,将该载体转入鲍曼不动杆菌ATCC17978,采用western blot和磷酸酶活性实验鉴定TpbA表达及活性,分析c-di-GMP表达水平及生物膜形成情况。结果在成功构建pET-28a-TpbA载体并证实表达TpbA的基础上,将该载体转入鲍曼不动杆菌ATCC17978,western blot表明TpbA过表达(P<0.05),磷酸酶活性实验证实过表达的TpbA具有酶活性(P<0.05)。进一步分析发现,ATCC17978中TpbA过表达能够降低c-di-GMP的水平(P<0.05),表明TpbA能够有效调节鲍曼不动杆菌的c-di-GMP。ATCC17978中c-di-GMP相关的生物膜形成在TpbA过表达作用下能够被显著抑制(P<0.05)。结论本研究初步证实了TpbA通过调节c-di-GMP,可以抑制ATCC17978生物膜形成,为抑制鲍曼不动杆菌生物膜的形成提供了新的潜在靶点和实验数据。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 TpbA C-di-GMP 生物膜
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病原细菌受体介导的c-di-GMP信号传导及其调控机制 被引量:3
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作者 杨凤环 田芳 +1 位作者 陈华民 何晨阳 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期9-14,共6页
细菌第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)信号网络系统主要涉及信号代谢、识别、接受、传递、功能表达和调控。c-di-GMP胞内水平受到鸟苷酸环化酶(DGC)和磷酸二酯酶(PDE)的控制。c-di-GMP信号受体类型多样,包括转录调控因子、PilZ结构域蛋白... 细菌第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)信号网络系统主要涉及信号代谢、识别、接受、传递、功能表达和调控。c-di-GMP胞内水平受到鸟苷酸环化酶(DGC)和磷酸二酯酶(PDE)的控制。c-di-GMP信号受体类型多样,包括转录调控因子、PilZ结构域蛋白、退化的GGDEF和EAL结构域蛋白、核糖体开关、多核苷酸磷酸化酶和新发现的蛋白激酶等。c-di-GMP受体接受信号后,可以在转录、翻译以及翻译后水平上对下游靶标进行调控,从而影响细菌的毒性、运动性、生物膜形成、细胞分裂等生理生化过程。本文结合本实验室对水稻白叶枯病菌的研究结果,综述了近年来国内外在c-di-GMP信号受体介导的调控机制等方面的研究进展。 展开更多
关键词 C-di-GMP 信号代谢 受体 传导 调控
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Effect of Temperature on the Reaction of 2-(N-acetylamine)-3-(3,5-di-<i>tert</i>-butyl-4-hydroxyphenyl)-propionic Acid with Oxygen in an Alkaline Condition
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作者 A. A. Volodkin G. E. Zaikov +3 位作者 L. N. Kurkovskaja S. M. Lomakin I. M. Levina E. V. Koverzanova 《Advances in Chemical Engineering and Science》 2015年第3期262-269,共8页
Results of oxidation 2-(N-acetylamine)-3-(3,5-di-tert-butyl-4-hydroxyphenyl)-propionic acid oxygen depend on temperature. At 55℃?- 60℃, 2,4-di-tert-butylbicyclo(4,3,1)deca-4,6-dien-8-(N-acetylamine)-3,9-dion-1-oxa i... Results of oxidation 2-(N-acetylamine)-3-(3,5-di-tert-butyl-4-hydroxyphenyl)-propionic acid oxygen depend on temperature. At 55℃?- 60℃, 2,4-di-tert-butylbicyclo(4,3,1)deca-4,6-dien-8-(N-acetylamine)-3,9-dion-1-oxa is formed. The constitution is based on dates of spectrums 1Н and 13С NMR. At 95℃?- 97℃, mixtures of 2,4-di-tert-butylbicyclo(4,3,1)deca-4,6-dien-8-(N-acetylamine)-3,9-dion-1-oxa and of 6,8-di-tert-butyl-3-(N-acetylamine)spiro(4,5)deca-1-oxa-5,8-dien-2,7-dione are produced. Structures are calculated by the method of Hartrii-Foka. Values of enthalpies and of entropies allow to assume dynamic isomerism. 展开更多
关键词 2-(N-acetylamine)-3-(3 5-di-tert-butyl-4-hydroxyphenyl)-propionic Acid 6 8-di-tert-butyl-3-(N-acetylamine)spiro(4 5)deca-1-oxa-5 8-dien-2 7-dione Oxidation by OXYGEN 2 4-di-tert-butylbicyclo(4 3 1)deca-4 6-dien-8-(N-acetylamine)-3 9-dion-1-oxa NMR-Spectroscopy
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美罗培南对胞内不同c-di-GMP浓度表型铜绿假单胞菌生物被膜形成的影响 被引量:5
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作者 谢杰鹏 孔晋亮 +4 位作者 陈一强 王可 罗劲 张真强 刘冬梅 《广西医科大学学报》 CAS 2020年第6期1001-1006,共6页
目的:探究美罗培南对胞内不同环二鸟苷酸(c-di-GMP)浓度表型铜绿假单胞菌(PA)生物被膜形成的影响。方法:两倍稀释法测定美罗培南对各菌株的抑菌浓度(MIC);设阴性对照组和3个美罗培南干预组(1/2MIC、1/4MIC、1/8MIC)。用1/2MIC、1/4MIC、... 目的:探究美罗培南对胞内不同环二鸟苷酸(c-di-GMP)浓度表型铜绿假单胞菌(PA)生物被膜形成的影响。方法:两倍稀释法测定美罗培南对各菌株的抑菌浓度(MIC);设阴性对照组和3个美罗培南干预组(1/2MIC、1/4MIC、1/8MIC)。用1/2MIC、1/4MIC、1/8MIC的美罗培南分别干预野生株PAO1、PA胞内c-di-GMP高表达株(PAO1ΔwspF)、PA胞内c-di-GMP低表达株(PAO1/Plac-yhjH),观察美罗培南对其运动能力的影响,用结晶紫染色法测定美罗培南对PAO1、PAO1ΔwspF、PAO1/Plac-yhjH菌株的生物被膜形成以及对生物被膜清除能力的影响。结果:在美罗培南的干预下,PAO1、PAO1ΔwspF、PAO1/Plac-yhjH的运动区域直径均比阴性对照组小(P<0.05),所形成的的生物被膜也均比阴性对照组少(P<0. 05),而破坏的生物被膜均比阴性对照组多(P<0. 05)。结论:美罗培南能抑制PAO1、PAO1ΔwspF、PAO1/Plac-yhjH的运动能力以及生物被膜形成,美罗培南能破坏PAO1、PAO1ΔwspF、PAO1/Plac-yhjH形成的生物被膜,美罗培南对PAO1、PAO1ΔwspF、PAO1/Plac-yhjH的抑制效果不同。 展开更多
关键词 美罗培南 C-di-GMP 铜绿假单胞菌 生物被膜
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Oxidation of 2,2'-Dihydroxy-3,3'-di-tert-buty-5,5'-dimethoxyl-biphenyl to 3,3'-Di-tert-butylbiphenyl-2,5,2',5'-diquinone with Copper(Ⅱ)Chloride as Catalyst:Synthesis,Structure and Spectral Properties of Diquinone
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作者 李俊霞 王建革 黄唯平 《Chinese Journal of Structural Chemistry》 SCIE CAS CSCD 2011年第10期1469-1476,共8页
Use of free air as oxidant and copper(II)chloride as catalyst,3,3'-di-tert-butylbi-phenyl-2,5,2',5'-diquinone(BBDQ)was prepared via catalytic oxidation of 2,2'-dihydroxy-3,3'-di-tert-butyl-5,5'-dimethoxy-bip... Use of free air as oxidant and copper(II)chloride as catalyst,3,3'-di-tert-butylbi-phenyl-2,5,2',5'-diquinone(BBDQ)was prepared via catalytic oxidation of 2,2'-dihydroxy-3,3'-di-tert-butyl-5,5'-dimethoxy-biphenyl(di-BHA).The yield of reaction attained 95% and the selectivity for BBDQ was 100%.The single-crystal X-ray diffraction analysis reveals that the dihedral angle between two rings(benzene rings for di-BHA and quinone rings for BBDQ)changes from 89.8 to 45.3o,indicating the steric hindrance effects of methyl disappear in the oxidation process.The crystal structures of di-BHA and BBDQ are further confirmed by their spectral characterizations.The probable mechanism for this oxidation process is also discussed. 展开更多
关键词 catalytic oxidation 3 3'-di-tert-butylbiphenyl-2 5 2' 5'-diquinone 2 2'-dihydroxy-3 3'-di-tert-butyl-5 5'-dimethoxybiphenyl copper(II)chloride
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牙龈卟啉单胞菌c-di-AMP代谢相关基因的克隆及表达纯化 被引量:3
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作者 邱伟 程兴群 +1 位作者 周学东 李雨庆 《华西口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期607-612,共6页
目的克隆牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis)中负责c-di-AMP代谢的相关基因,并使其在大肠杆菌中正确表达及高效纯化。方法通过聚合酶链反应(PCR)克隆牙龈卟啉单胞菌ATCC33277的pgn0523、pgn1187和pgn2003三个基因,经过酶切后将... 目的克隆牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis)中负责c-di-AMP代谢的相关基因,并使其在大肠杆菌中正确表达及高效纯化。方法通过聚合酶链反应(PCR)克隆牙龈卟啉单胞菌ATCC33277的pgn0523、pgn1187和pgn2003三个基因,经过酶切后将目的基因片段与大肠杆菌表达质粒p ET28a连接,分别构建出重组表达质粒p ETpgn0523、p ET-pgn1187和p ET-pgn2003。将重组表达质粒转化到大肠杆菌BL21(DE3)中,用异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达重组蛋白,通过十二烷基磺酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析和鉴定。用镍离子金属亲和层析法对重组蛋白进行分离纯化,BCA法检测目的蛋白的浓度。结果目的基因pgn0523、pgn1187和pgn2003扩增产物条带与预期大小一致。重组表达质粒p ET-pgn0523、p ET-pgn1187和p ET-pgn2003及其PCR产物琼脂糖凝胶电泳验证与预期大小相符,测序结果与Gen Bank中牙龈卟啉单胞菌ATCC33277国际标准菌株的基因序列100%一致。IPTG诱导后的菌体经SDS-PAGE检测得到3个大小分别为19.5×103、39.9×103、66.0×103的蛋白质增强条带,与预期大小相符。镍离子金属亲和层析柱纯化得到的蛋白与预期目的蛋白分子量一致,BCA法测定目的蛋白的浓度分别为0.708、0.523和0.861 mg·m L-1。结论本研究成功克隆并表达纯化了牙龈卟啉单胞菌c-di-AMP代谢相关蛋白,得到了较高浓度和纯度的目的蛋白,为进一步探究牙龈卟啉单胞菌c-di-AMP的生理功能及体内代谢途径奠定了基础。 展开更多
关键词 牙龈卟啉单胞菌 c-di-AMP 代谢基因 表达纯化
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水稻白叶枯病菌第二信使c-di-GMP代谢酶基因的预测和分析 被引量:3
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作者 薛丁榕 田芳 +3 位作者 李海云 杨凤环 陈华民 何晨阳 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期131-138,共8页
旨在从水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)中鉴定出含有GGDEF结构域的鸟苷酸环化酶(DGC)和含有EAL或HD-GYP结构域的磷酸二酯酶(PDE)编码基因。预测分析了Xoo已测序菌株中的GGDEF、EAL和HD-GYP结构域蛋白的种类、数量及... 旨在从水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)中鉴定出含有GGDEF结构域的鸟苷酸环化酶(DGC)和含有EAL或HD-GYP结构域的磷酸二酯酶(PDE)编码基因。预测分析了Xoo已测序菌株中的GGDEF、EAL和HD-GYP结构域蛋白的种类、数量及其序列特征,鉴别了基序保守的DGC或PDE、基序退化的信号受体以及信号输入结构域,验证了部分不同类型结构域蛋白作为DGC/PDE、信号受体以及在细菌毒性调控等方面的功能。 展开更多
关键词 水稻白叶枯病菌 c-di-GMP信号途径 鸟苷酸环化酶 磷酸二酯酶
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c-di-AMP——细菌中第二信使的研究进展 被引量:3
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作者 金华 马春骥 +3 位作者 韩杨 罗海霞 李敏 郝秀静 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2019年第6期109-116,共8页
环二腺苷酸(cyclic diadenylate monophosphate,c-di-AMP)是新发现的在细菌中广泛存在的一类重要的第二信使。c-di-AMP不仅与细菌的生长、细胞壁的代谢平衡、生物被膜的形成等密切相关,还在真核宿主细胞抗感染的固有免疫中发挥重要作用... 环二腺苷酸(cyclic diadenylate monophosphate,c-di-AMP)是新发现的在细菌中广泛存在的一类重要的第二信使。c-di-AMP不仅与细菌的生长、细胞壁的代谢平衡、生物被膜的形成等密切相关,还在真核宿主细胞抗感染的固有免疫中发挥重要作用。主要从c-di-AMP的合成酶与降解酶、c-di-AMP在病原菌中的结合蛋白以及c-di-AMP与宿主细胞互作过程中的相关受体蛋白等几方面进行综述。 展开更多
关键词 环二腺苷酸(c-di-AMP) 固有免疫 结合蛋白 受体蛋白
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Spontaneous Changes of Solid 5,7-di-<i>tert</i>-butylspiro(2,5)octa-4,7-diene-6-one in Storage Conditions at Room Temperature
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作者 Alexandre A. Volodkin Gennady E. Zaikov +3 位作者 Lydia N. Kurkovskaja Sergey M. Lomakin Irina M. Levina Elena V. Koverzanova 《Advances in Chemical Engineering and Science》 2015年第3期299-304,共6页
On an example of spontaneous changes 5,7-di-tert-butylspiro (2,5) octa-4,7-diene-6-one at room temperature, a new example of condensations in a solid station is opened. The single crystal of 2-(3’, 5'-di-tert-but... On an example of spontaneous changes 5,7-di-tert-butylspiro (2,5) octa-4,7-diene-6-one at room temperature, a new example of condensations in a solid station is opened. The single crystal of 2-(3’, 5'-di-tert-butyl-4'-hydroxy-phenyl)-ethyloxy-p-cresole is produced as result of a structure transformation 5,7-di-tert-butylspiro (2,5) octa-4,7-diene-6-one in a solid phase at room temperature except a single crystal at transformation 5,7-di-tert-butylspiro (2,5) octa-4,7-diene-6-one a new substance is formed too. Spectrums 1Н and 13С NMR differ from similar spectrums of initial compound and the single crystal. New substance represents an admixture of isomeric compounds, capable reversible to be transformed in initial 5,7-di-tert-butylspiro(2,5) octa-4,7-diene-6-one and 2-(3’, 5'-di-tert-butyl-4'-hydroxyphenyl)-ethyloxy-p-cresole. 展开更多
关键词 Solid-Phase Reactions 5 7-di-tert-butylspiro(2 5)octa-4 7-diene-6-one 2-(3’ 5'-di-tert-butyl-4'-hydroxyphenyl)-ethyloxy-p-cresole NMR and IR Spectroscopy
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论哈萨克语{动干-态-体-肯定/否定-AdI-谓人称}中“-dI-”附加成分 被引量:1
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作者 邱新霞 张定京 《语言与翻译》 CSSCI 2017年第4期26-30,共5页
哈萨克语中通过{动干-态-体-肯定/否定-Ad I-谓人称}表示现在-将来时,但这一形式中的"-d I-"只出现在主语为第三人称时。一些语法作品认为,主语为第三人称时,谓语后出现的"-d I-"附加成分为谓语性人称词尾。但若从&... 哈萨克语中通过{动干-态-体-肯定/否定-Ad I-谓人称}表示现在-将来时,但这一形式中的"-d I-"只出现在主语为第三人称时。一些语法作品认为,主语为第三人称时,谓语后出现的"-d I-"附加成分为谓语性人称词尾。但若从"eken"的用法、和田方言和罗布方言中使用的句子及{动干-态-体-肯定/否定-Ad I-谓人称}中"-d I"的演变过程来看,当主语为第三人称时,谓语后面出现的"-d I"只是"turur"的残留,不是谓语性人称词尾。 展开更多
关键词 {动干-态-体-肯定/否定-AdI-谓人称} 谓语性人称词尾 -di-
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外源性C-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响 被引量:3
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作者 闫文娟 吴补领 +4 位作者 屈铁军 高杰 赵红萍 苏凌云 余擎 《牙体牙髓牙周病学杂志》 CAS 北大核心 2009年第9期510-512,共3页
目的:初步探讨外源性c-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。方法:外源性c-di-GMP与生理盐水分别加入至含变形链球菌UA159菌液的BHI培养基中,比较两组对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。结果:c-di-GMP处理组与生理盐水组相比,产... 目的:初步探讨外源性c-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。方法:外源性c-di-GMP与生理盐水分别加入至含变形链球菌UA159菌液的BHI培养基中,比较两组对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。结果:c-di-GMP处理组与生理盐水组相比,产酸、耐酸能力明显下降,差异有统计学意义,经t检验,P<0.05。结论:c-di-GMP可以抑制变形链球菌的产酸、耐酸能力,可以单独也可以与其它的抗龋制剂联合应用控制龋病。 展开更多
关键词 c—dj—GMP 变形链球菌 产酸 耐酸
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基于RNA适配体检测体外酶促合成的c-di-GMP和cGAMP
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作者 朱彦策 孔江南 +2 位作者 陈慧心 钟凯 张超 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期2145-2153,共9页
旨在建立简单、快速的检测体外酶促合成的c-di-GMP和cGAMP的方法。本研究以含有T7启动子、VC2GEMM-1核糖开关序列或其突变序列VC2/g20a、spinach2和tRNA序列的双链DNA为模板,利用T7RNA聚合酶体外转录体系制备VC2、VC2/g20aRNA适配体。... 旨在建立简单、快速的检测体外酶促合成的c-di-GMP和cGAMP的方法。本研究以含有T7启动子、VC2GEMM-1核糖开关序列或其突变序列VC2/g20a、spinach2和tRNA序列的双链DNA为模板,利用T7RNA聚合酶体外转录体系制备VC2、VC2/g20aRNA适配体。通过检测绿色荧光强度分析RNA适配体对c-di-GMP和cGAMP的结合能力。结果表明,转录得到的RNA经过加热变性、缓慢退火后得到VC2RNA适配体和VC2/g20a RNA适配体,在125mmol·L^(-1 )KCl和30mmol·L^(-1 )MgCl_2溶液中孵育180min的优化结合条件下,VC2适配体与c-di-GMP特异性结合,VC2/g20a适配体与cGAMP特异性结合;c-di-GMP对VC2适配体的半数效应浓度(EC50)为(89±1.7)nmol·L^(-1),cGAMP对VC2/g20a适配体的半数效应浓度为(309±4.5)nmol·L^(-1);VC2和VC2/g20a能够分别检测低至5nmol·L^(-1)和20nmol·L^(-1)的c-di-GMP和cGAMP;并且发现转录的RNA混合物在未纯化的情况下同样能够检测VC0179体外酶促合成的c-di-GMP和cGAMP。这种方法可以简单快速的检测VC0179体外酶促合成的c-di-GMP和cGAMP,并且为研究其他c-di-GMP和cGAMP合成酶活性提供潜在可能。 展开更多
关键词 RNA适配体 C-di-GMP cGAMP 荧光检测
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水稻白叶枯病菌c-di-GMP受体Clpxoo关键结合功能位点的确定
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作者 李建宇 李波 +3 位作者 陈华民 杨凤环 何晨阳 田芳 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期124-129,共6页
旨在确定水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)c-di-GMP信号受体Clpxoo的关键功能位点。通过对Clpxoo蛋白氨基酸位点基因突变,表达载体构建、蛋白诱导表达及其Ni-NTA Resin亲和层析,进行了Clpxoo及其点突变蛋白的原核表达... 旨在确定水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)c-di-GMP信号受体Clpxoo的关键功能位点。通过对Clpxoo蛋白氨基酸位点基因突变,表达载体构建、蛋白诱导表达及其Ni-NTA Resin亲和层析,进行了Clpxoo及其点突变蛋白的原核表达和产物纯化;通过等温滴定量热法(ITC),检测了Clpxoo及其点突变蛋白与c-di-GMP的结合作用。利用基因定点突变和桥接PCR方法,在优化的诱导表达和纯化条件下,成功地获得了Clpxoo点突变蛋白和与c-di-GMP不发生结合的Clpxoo点突变体。结果表明,Clpxoo蛋白第70位天冬氨酸和第99位谷氨酸是与c-di-GMP结合的关键功能位点。 展开更多
关键词 水稻白叶枯病菌 C-di-GMP 信号受体蛋白 点突变体 结合作用
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WspR在大肠杆菌中的表达及其对c-di-GMP合成的影响
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作者 凡责艳 木佳 +1 位作者 毛自朝 官会林 《云南师范大学学报(自然科学版)》 2014年第5期68-73,共6页
可得胶是土壤农杆菌ATCC31749分泌的一种胞外多糖,大多数细菌胞外多糖的合成受控于新近发现的第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP).细胞内c-di-GMP的产生受二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)合成和磷酸二酯酶(phosphodiesterase,PDE)... 可得胶是土壤农杆菌ATCC31749分泌的一种胞外多糖,大多数细菌胞外多糖的合成受控于新近发现的第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP).细胞内c-di-GMP的产生受二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)合成和磷酸二酯酶(phosphodiesterase,PDE)降解两条途径调控.在结构上,通常DGC含有GGDEF结构域,PDE含有EAL结构域.研究表明从绿脓杆菌(P.aeruginosa)中得到的类趋化系统蛋白WspR具有GGDEF结构域,具有DGC活性.本实验将WspR转入大肠杆菌中得到了表达,并用颜色反应得到证实c-di-GMP在E.coli大量合成.为进一步研究ATCC31749中WspR的作用机制,促进可得胶的合成提供切实可行的依据. 展开更多
关键词 土壤农杆菌ATCC31749 C-di-GMP WspR表达
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c-di-GMP在低温好氧颗粒污泥形成过程中的作用
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作者 支丽玲 王玉莹 +3 位作者 马鑫欣 衣雪松 王硕 李激 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第4期1560-1567,共8页
在低温条件下运行好氧颗粒污泥反应器,絮状污泥颗粒化过程中信号分子可通过传导作用引起各层物质之间的组分变化,通过研究胞外聚合物及污泥相关疏水性的变化规律,并观察此过程中微生物菌群的群落演替特点,揭示环二鸟苷酸(c-di-GMP)在低... 在低温条件下运行好氧颗粒污泥反应器,絮状污泥颗粒化过程中信号分子可通过传导作用引起各层物质之间的组分变化,通过研究胞外聚合物及污泥相关疏水性的变化规律,并观察此过程中微生物菌群的群落演替特点,揭示环二鸟苷酸(c-di-GMP)在低温好氧颗粒污泥形成过程中的变化规律与影响作用.结果表明:接种污泥在颗粒化过程中,胞外聚合物含量从48mg/gMLVSS增长至139mg/gMLVSS,其中以TB层蛋白质增长为主,在颗粒化过程中,c-di-GMP含量由62?g/gMLVSS增至600?g/gMLVSS,始终影响微生物运动及生物膜形成,促使具备胞外聚合物分泌功能的菌群加快分泌胞外聚合物,促进好氧颗粒污泥的形成.各个阶段污泥中微生物种群存在较大差异,在反应器运行初始阶段与c-di-GMP合成相关的菌群占据优势,同时在后期表现出较好的脱氮除磷能力,在低温条件下好氧颗粒污泥微生物菌群发生演替并最终形成稳定的菌群结构. 展开更多
关键词 C-di-GMP 低温 好氧颗粒污泥 胞外聚合物 群落演替
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环二鸟苷酸(c-di-GMP)作为潜在免疫佐剂的研究进展 被引量:1
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作者 丛晓燕 时建立 +6 位作者 孙文博 李俊 杜以军 吴家强 陈蕾 陈智 王金宝 《中国兽药杂志》 2014年第2期59-62,共4页
环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,近年来研究发现环二鸟苷酸作为免疫调节剂作用于真核细胞可产生良好的免疫调节作用,实验研究表明其有可能成为具有潜力的疫苗佐剂。本... 环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,近年来研究发现环二鸟苷酸作为免疫调节剂作用于真核细胞可产生良好的免疫调节作用,实验研究表明其有可能成为具有潜力的疫苗佐剂。本文综述了c-di-GMP的结构,生物学功能、免疫特性和作为疫苗佐剂研究等方面的最新研究进展。 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 疫苗 佐剂 免疫
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Treatment of 2-phenylamino-3-methyl-6-di-n-butylaminofluoran production effluent by combination of biological treatments and Fenton's oxidation 被引量:4
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作者 DING Wei GAO Ying-xin +2 位作者 YANG Min DING Ran ZHANG Yu 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2007年第10期1178-1182,共5页
High strength refractory organic stream is produced during the production of 2-phenylamino-3-methyl-6-di-n-butylaminofluoran (One Dye Black 2, abbr. ODB 2), a novel heat-sensitive material with a promising market. I... High strength refractory organic stream is produced during the production of 2-phenylamino-3-methyl-6-di-n-butylaminofluoran (One Dye Black 2, abbr. ODB 2), a novel heat-sensitive material with a promising market. In this study, a combination of acidificationprecipitation, primary biological treatment, Fenton's oxidation and another biological treatment was successfully used for the removal of COD from 18000-25000 mg/L to below 200 mg/L from the ODB 2 production wastewater in a pilot experiment. A COD removal of 70%-80% was achieved by acidification-precipitation under a pH of 2.5-3.0. The first step biodegradafion permitted an average COD removal of 70% under an hydraulic residence time (HRT) of 30 h. By batch tests, the optimum conditions of Fenton's oxidation were acquired as: Fe^2+ dose 6.0 mmol/L; H2O2 dose 3000 mg/L; and reaction time 6 h. The second step biological treatment could ensure an effluent COD below 200 mg/L under an HRT of 10 h following the Fenton's treatment. 展开更多
关键词 2-phenylamino-3-methyl-6-di-n-butylaminofluoran ODB 2 wastewater Fenton's oxidation activated sludge heatsensitive material
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Degradation of 2,6-di-tert-butylphenol by an isolated high-efficiency bacterium strain 被引量:1
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作者 ZHANGYa-lei FANGZhen-weit +3 位作者 XUDe-qiang XIAOYi-ping ZHAOJian-fu QIANGZhi-min 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2005年第2期271-275,共5页
An aerobic bacterium strain, F-3-4, capable of effectively degrading 2,6-di-tert-butylphenol(2,6-DTBP), was isolated and screened out from an acrylic fiber wastewater and the biofilm in the wastewater treatment facili... An aerobic bacterium strain, F-3-4, capable of effectively degrading 2,6-di-tert-butylphenol(2,6-DTBP), was isolated and screened out from an acrylic fiber wastewater and the biofilm in the wastewater treatment facilities. This strain was identified as Alcaligenes sp. through morphological, physiological and biochemical examinations. After cultivation, the strain was enhanced by 26.3% in its degradation capacity for 2,6-DTBP. Results indicated that the strain was able to utilize 2,6-DTBP, lysine, lactamine, citrate, n-utenedioic acid and malic acid as the sole carbon and energy source, alkalinize acetamide, asparagine, L-histidine, acetate, citrate and propionate, but failed to utilize glucose, D-fructose, D-seminose, D-xylose, serine and phenylalanine as the sole carbon and energy source. The optimal growth conditions were determined to be: temperature 37℃, pH 7.0, inoculum size 0.1% and shaker rotary speed 250 r/min. Under the optimal conditions, the degradation kinetics of 2,6-DTBP with an initial concentration of 100 mg/L was studied. Results indicated that 62.4% of 2,6-DTBP was removed after 11 d. The degradation kinetics could be expressed by Eckenfelder equation with a half life of 9.38 d. In addition, the initial concentration of 2,6-DTBP played an important role on the degradation ability of the strain. The maximum initial concentration of 2,6-DTBP was determined to be 200 mg/L. Above this level, the strain was overloaded and exhibited significant inhibition. 展开更多
关键词 2 6-di-TERT-BUTYLPHENOL bacterium strain Alcaligenes sp. ISOLATION
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