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NDM-5-C208A突变大肠埃希菌的构建及大蒜辣素与NDM-5相互作用位点分析
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作者 叶志滨 王晓明 +5 位作者 吕茜 刘雨桐 金季赜晓 朱馨艺 黄金虎 王丽平 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期61-68,共8页
[目的]产新德里金属β-内酰胺酶5(NDM-5)的革兰阴性耐药菌对人畜健康产生巨大威胁。本文旨在初步探究大蒜辣素对NDM-5的抑制作用及其相关作用位点,为临床开发新型β-内酰胺酶抑制剂提供理论支持。[方法]通过AutoDock模拟分子对接,预测... [目的]产新德里金属β-内酰胺酶5(NDM-5)的革兰阴性耐药菌对人畜健康产生巨大威胁。本文旨在初步探究大蒜辣素对NDM-5的抑制作用及其相关作用位点,为临床开发新型β-内酰胺酶抑制剂提供理论支持。[方法]通过AutoDock模拟分子对接,预测大蒜辣素与NDM-5的结合位点;构建突变型载体pET21a-NDM-5-C208A,测序验证无误后转入感受态大肠埃希菌BL21(DE3),通过药敏试验进行突变表型确认;采用微量肉汤棋盘法和时间杀菌曲线测定大蒜辣素与美罗培南对NDM-5突变型细菌的联合抑菌效果。通过体外表达突变蛋白NDM-5-C208A,建立酶活性测定体系,比较大蒜辣素对C208突变型NDM-5和野生型NDM-5酶活性的抑制效果。[结果]经测序证实NDM-5的C208A突变株BL21(DE3)pET21a-NDM-5-C208A构建成功,C208A突变株恢复了对头孢类和碳青霉烯类抗生素的敏感性,且大蒜辣素与美罗培南联用的联合抑菌指数由0.375增加至2,联用表现为独立作用而非协同作用;体外酶活测定结果显示NDM-5-C208A突变不仅使酶活性下降约85%,而且该位点突变导致大蒜辣素对NDM-5失去抑制作用。[结论]Cys208位点是维持NDM-5水解酶活性的关键位点,且大蒜辣素可通过与该位点结合发挥抑制酶活性的作用。该结果为大蒜辣素作为新型β-内酰胺酶抑制剂的开发和应用提供试验依据。 展开更多
关键词 大蒜辣素 ndm-5 美罗培南 酶抑制剂
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同时产碳青霉烯酶NDM-1和NDM-5的猪源大肠埃希氏菌的鉴定及耐药性研究 被引量:1
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作者 李海利 郎利敏 +5 位作者 张青娴 游一 朱文豪 王治方 张立宪 王克领 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期106-115,共10页
为了解携带碳青霉烯酶NDM-1及其亚型在猪场的流行情况,对来自猪场产房仔猪腹泻病例分离鉴定的87株大肠杆菌进行了碳青霉烯酶NDM-1和NDM-5的耐药基因扩增及测序。从87株大肠杆菌中分离鉴定出一株同时携带碳青霉烯酶NDM-1和NDM-5的大肠埃... 为了解携带碳青霉烯酶NDM-1及其亚型在猪场的流行情况,对来自猪场产房仔猪腹泻病例分离鉴定的87株大肠杆菌进行了碳青霉烯酶NDM-1和NDM-5的耐药基因扩增及测序。从87株大肠杆菌中分离鉴定出一株同时携带碳青霉烯酶NDM-1和NDM-5的大肠埃希菌(Escherichia coli),并命名为HN2106。为深入了解HN2106全基因组及其携带的质粒和耐药基因情况,对NH2106进行了16S rRNA菌种鉴定,bla耐药基因确认,全基因组测序,应用BLAST和MEGA软件对序列进行生物信息学分析、系统进化树分析。结果显示,该菌株含有7个质粒(plasmid A、plasmid B、plasmid C、plasmid D、plasmid E、plasmid F 和plasmid G),3种类型,分别为Col、IncFII、IncQ1。同时携带NDM-1和NDM-5基因,属B族β-内酰胺酶,其中bla位于质粒pNDM-HN2106(plasmid C)上,bla位于质粒pNDM5-HN2106(plasmid B)上,分别介导bla和bla耐药基因,是耐药菌传播的重要载体。全基因组耐药基因预测HN2106同时还携带21种类型的抗生素耐药基因。对HN2106菌株进行了85种抗菌药物敏感性测试,结果显示,HN2106菌株对亚胺培南、青霉素G等均耐药,对磺胺甲恶唑、头孢美唑等敏感。研究结果表明,养殖场NDM-1耐药质粒是NDM-1及其亚型耐药基因的重要载体,对养殖产业健康养殖和公共卫生安全带来较大隐患和威胁,应加强抗菌药物的合理应用和感染的防控措施,重视细菌耐药性的监测工作,以期为临床耐药菌株感染的防治提供理论参考。 展开更多
关键词 碳青霉烯酶 ndm-1 ndm-5 大肠埃希氏菌 细菌耐药
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NDM-5阳性大肠杆菌裂解性噬菌体的生物学特性 被引量:3
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作者 葛展霞 钟希娜 +3 位作者 朱炳海 何涛 魏瑞成 王冉 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第3期699-705,共7页
NDM-5基因是在动物源细菌尤其是鸡源大肠杆菌中主要流行的碳青霉烯类耐药基因,携带该基因的菌株呈现多重耐药性,传播能力强,被称为"超级细菌"。本研究以携带NDM-5基因的鸡源大肠杆菌SQ-C-E5为宿主菌,从污水中分离了对该细菌... NDM-5基因是在动物源细菌尤其是鸡源大肠杆菌中主要流行的碳青霉烯类耐药基因,携带该基因的菌株呈现多重耐药性,传播能力强,被称为"超级细菌"。本研究以携带NDM-5基因的鸡源大肠杆菌SQ-C-E5为宿主菌,从污水中分离了对该细菌具有裂解作用的噬菌体,命名为vB_EcoM_Bp5。通过透射电镜观察,最佳感染复数测定,一步生长曲线绘制,杀菌试验,热稳定性及酸碱稳定性测定等试验分析该噬菌体的生物学特性。结果表明,该噬菌体为肌尾病毒科,其噬菌斑透亮,无晕圈,最佳感染复数为10,潜伏期为5 min,爆发期为65 min,该噬菌体在温度为30~60℃和pH为5~10时较稳定,并且噬菌体vB_EcoM_Bp5的裂解谱较广,对多株NDM-5阳性和阴性大肠杆菌都具有裂解作用。因此,噬菌体vB_EcoM_Bp5在防治携带NDM-5基因的大肠杆菌方面具有潜在应用价值。 展开更多
关键词 ndm-5阳性大肠杆菌 噬菌体 生物学特性
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1株可裂解bla_(NDM-5)及mcr-1阳性大肠杆菌噬菌体的分离与生物学特性 被引量:3
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作者 刘畅 刘教 +3 位作者 陈进 王勉之 熊文广 曾振灵 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期857-866,共10页
旨在分离1株可裂解bla_(NDM-5)及mcr-1阳性大肠杆菌的噬菌体,探究该噬菌体的生物学特性,为防控bla_(NDM-5)及mcr-1阳性大肠杆菌感染提供新的技术思路。对分离出的噬菌体进行透射电镜观察、最佳感染复数、一步生长曲线等生物学特性试验... 旨在分离1株可裂解bla_(NDM-5)及mcr-1阳性大肠杆菌的噬菌体,探究该噬菌体的生物学特性,为防控bla_(NDM-5)及mcr-1阳性大肠杆菌感染提供新的技术思路。对分离出的噬菌体进行透射电镜观察、最佳感染复数、一步生长曲线等生物学特性试验及全基因组测序分析。结果显示:成功分离出1株大肠杆菌噬菌体vB_EcoM-ZQ1,该噬菌体属于有尾病毒目,肌尾病毒科,其最佳感染复数为0.1,潜伏期为20 min,裂解期为10 min,裂解量为92 PFU·cell^(-1)。在温度4~55℃、pH4~10条件下,该噬菌体都有较高的活性。其对多重耐药大肠杆菌有一定裂解作用,裂解率为25.5%。该噬菌体基因全长149112 bp,GC含量为49.1%,共有184个ORF,其中70个ORF编码功能蛋白,有2个ORF编码tRNA,并未发现含有耐药基因与毒力因子;经BLAST比对发现,噬菌体与Shigella phage phiSboM-AG3有92.37%的相似性,基于噬菌体末端酶大亚基构建的同源进化树结果可得结论,噬菌体vB_EcoM-ZQ1和与沙门菌噬菌体pSal-SNUABM-02的亲缘关系最近。综上提示,噬菌体vB_EcoM-ZQ1,生物学特性稳定,基因结构完整,为后续bla_(NDM-5)及mcr-1阳性大肠杆菌感染的防控奠定了一定前期基础。 展开更多
关键词 噬菌体 生物学特性 大肠杆菌 bla_(ndm-5) mcr-1
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山东省携带bla_(NDM-5)基因大肠埃希菌的分子流行病学研究 被引量:2
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作者 李宜雷 赵辉 +3 位作者 贾楠 董丹丹 刘真真 朱元祺 《中国实验诊断学》 2018年第4期601-605,共5页
目的调查山东省携带bla_(NDM-5)基因大肠埃希菌医院分离株的分子流行病学特点,为医院感染预防和控制提供理论依据。方法收集山东省3家医院2015年3月-2016年12月临床分离的20株对亚胺培南耐药的大肠埃希菌。菌株的鉴定和药敏通过法国梅里... 目的调查山东省携带bla_(NDM-5)基因大肠埃希菌医院分离株的分子流行病学特点,为医院感染预防和控制提供理论依据。方法收集山东省3家医院2015年3月-2016年12月临床分离的20株对亚胺培南耐药的大肠埃希菌。菌株的鉴定和药敏通过法国梅里埃Vitek-2 Compact系统重新进行。PCR筛选携带bla_(NDM-5)基因的大肠埃希菌,然后对菌株携带的其他碳青霉烯酶、超广谱β-内酰胺酶、氨基糖苷和喹诺酮类耐药相关基因进行扩增,并测序确认。多位点序列分型和脉冲场凝胶电泳分析菌株间的同源性。结果经扩增和测序确认,11株大肠埃希菌携带bla_(NDM-5)基因,对临床常用的抗菌药物呈现多重耐药,同时每株菌还携带多个其他耐药相关基因。多位点序列分型显示以ST167型为主,共4株(36.4%,4/11),其他分别为ST617型2株(18.2%,2/11),ST46、ST453、ST448、ST6388和ST410型各1株。这11株大肠埃希菌的脉冲场凝胶电泳带型各不相同,没有呈现克隆聚集性。结论研究表明山东省3家医院都检测到携带bla_(NDM-5)基因的大肠埃希菌,以ST167型为主,且脉冲场凝胶电泳没有呈现克隆聚集性,属于散发病例。经检索,携带bla_(NDM-5)基因的ST617、ST46、ST453、ST6388和ST410型大肠埃希菌为国内外首次报道。公共卫生部门有必要加强对碳青霉烯类耐药肠杆菌的监控。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 新德里金属β-内酰胺酶-5型(ndm-5) 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳
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Characterization of NDM-5-producing Enterobacteriaceae isolates from retail grass carp(Ctenopharyngodon idella) and evidence of blaNDM-5-bearing IncHI2 plasmid transfer between ducks and fish 被引量:2
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作者 Lu-Chao Lv Yao-Yao Lu +4 位作者 Xun Gao Wan-Yun He Ming-Yi Gao Kai-Bin Mo Jian-Hua Liu 《Zoological Research》 SCIE CAS CSCD 2022年第2期255-264,共10页
We aimed to characterize NDM-5-producing Enterobacteriaceae from aquatic products in Guangzhou,China.A total of 196 intestinal samples of grass carp collected in 2019 were screened for carbapenemase genes.Characteriza... We aimed to characterize NDM-5-producing Enterobacteriaceae from aquatic products in Guangzhou,China.A total of 196 intestinal samples of grass carp collected in 2019 were screened for carbapenemase genes.Characterization of bla_(NDM-5) positive isolates and plasmids was determined by antimicrobial susceptibility testing,conjugation experiments,Illumina HiSeq,and Nanopore sequencing.One Citrobacter freundii and six Escherichia coli strains recovered from seven intestinal samples were verified as bla_(NDM-5) carriers(3.57%,7/196).The bla_(NDM-5) genes were located on the lncX3(n=5),lncHI2(n=1),or lncHI2-lncF(n=1)plasmids.All bla_(NDM-5)-bearing plasmids were transferred by conjugation at frequencies of~10^(-4)-10^(-6).Based on sequence analysis,the lncHI2 plasmid pHNBYF33-1 was similar to other bla_(NDM-5)-carrying lncHI2 plasmids deposited in GenBank from Guangdong ducks.In all lncHI2 plasmids,bla_(NDM-5)was embedded in a novel transposon,Tn7057(IS3000-△ISAba125-IS5-△ISAba125-bla_(NDM-5)-bleMBL-trpF-tat-△dct-IS26-△umuD-△ISKox3-IS3000),which was identical to the genetic structure surrounding bla_(NDM-5)found in some IncX3 plasmids.The lncHI2-lncF hybrid plasmid pHNTH9F11-1 was formed by homologous recombination of the bla_(NDM-5)-carrying lncHI2 plasmid and a heavy-metal-resistant IncF plasmid through△Tn1721 To the best of our knowledge,this is the first report on the characterization of bla_(NDM-5)-bearing plasmids in fish in China.The lncHI2 plasmid pHNBYF33-1 may be transmitted from ducks,considering the common duck-fish freshwater aquaculture system in Guangdong.Tn7051 is likely responsible for the transfer of bla_(NDM-5) from lncX3 to lncHI2 plasmids in Enterobacteriaceae,resulting in the expansion of transmission vectors of bla_(NDM-5). 展开更多
关键词 bla_(ndm-5) ENTEROBACTERIACEAE PLASMID FISH CARBAPENEMASE
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抗菌药物联合治疗产NDM-5型金属酶肺炎克雷伯菌血流感染1例 被引量:1
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作者 丁丽 郑永贵 +1 位作者 吴湜 胡付品 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期336-338,共3页
血流感染是血液病患者最常见的并发症之一[1],由于前期抗菌药物的使用、静脉导管的留置、以及化疗后机体免疫功能的抑制,碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)在血液病患者中的检出率不断增加,严重危及患者生命[2]。研究显示,相较于碳青霉... 血流感染是血液病患者最常见的并发症之一[1],由于前期抗菌药物的使用、静脉导管的留置、以及化疗后机体免疫功能的抑制,碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)在血液病患者中的检出率不断增加,严重危及患者生命[2]。研究显示,相较于碳青霉烯类敏感肺炎克雷伯菌血流感染患者14.9%的死亡率,CRKP所致血流感染患者的死亡率高达43.9%[2]。 展开更多
关键词 碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌 ndm-5型金属酶 血流感染 头孢他啶-阿维巴坦 氨曲南 阿米卡星
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动物源碳青霉烯耐药基因blaNDM-1阳性IncHI5质粒的发现
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作者 Zhu Yao Liu Wen-yu Schwarz Stefan 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期423-423,共1页
碳青霉烯类抗生素因其具有良好的抗菌活性和稳定性,被认为是治疗多重耐药革兰氏阴性菌感染的"最后一道防线"。虽然碳青霉烯类药物禁止用于畜牧养殖业,但碳青霉烯耐药菌株已在我国动物源细菌中出现。作为耐药基因重要的储存库... 碳青霉烯类抗生素因其具有良好的抗菌活性和稳定性,被认为是治疗多重耐药革兰氏阴性菌感染的"最后一道防线"。虽然碳青霉烯类药物禁止用于畜牧养殖业,但碳青霉烯耐药菌株已在我国动物源细菌中出现。作为耐药基因重要的储存库之一,动物源耐药菌的产生和流行不仅阻碍了畜牧养殖业的健康发展. 展开更多
关键词 动物源 碳青霉烯耐药 ndm-1 IncHI5 BLA 耐药基因
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儿童感染ST2735型产NDM-5碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌分子流行病学和耐药机制 被引量:1
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作者 周佳佳 吕艳关 康海全 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第22期3471-3475,共5页
目的探讨儿童感染ST2735型产NDM-5碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)流行病学特征及耐药机制.方法收集徐州医科大学附属医院2018年3月-2022年3月临床首次分离的儿童感染的亚胺培南耐药肺炎克雷伯菌24株,改良碳青霉烯灭活试验(mCIM)和乙二... 目的探讨儿童感染ST2735型产NDM-5碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)流行病学特征及耐药机制.方法收集徐州医科大学附属医院2018年3月-2022年3月临床首次分离的儿童感染的亚胺培南耐药肺炎克雷伯菌24株,改良碳青霉烯灭活试验(mCIM)和乙二胺四乙酸碳青霉烯灭活试验(eCIM)检测碳青霉烯酶,聚合酶链式反应(PCR)检测碳青霉烯酶基因,多位点序列分型(MLST)技术和脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法检测其同源性.结果2018年3月-2022年3月分离出24株亚胺培南耐药肺炎克雷伯菌,其中发现NDM-5型CRKP 15株,检出率62.50%,这15株CRKP感染患儿均有基础疾病和抗菌药物使用史;15株NDM-5型CRKP菌株对头孢菌素类、碳青霉烯类和头孢他啶/阿维巴坦均耐药.MLST分型以ST2735型(25.00%)为主,PFGE分析显示6株ST2735型CRKP具有高度同源性,且均来自于新生儿重症监护室(NICU).结论医院NICU存在ST2735型产NDM-5 CRKP的克隆流行,应当加强院感监测及预防,防止其产生新的流行危害. 展开更多
关键词 ST2735 肺炎克雷伯菌 ndm-5 碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌 儿童 耐药机制
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耐碳青霉烯鼠伤寒沙门菌的药敏及分子特征分析
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作者 王燕 王云英 +3 位作者 蒋敏 张雨虹 任艳丽 孙滨 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期813-819,共7页
目的分析鼠伤寒沙门菌的耐药情况及分子特征,为临床治疗和感染防控提供依据。方法对我院分离的鼠伤寒沙门菌CYEY-S001,采用VITEK2-Compact全自动微生物分析系统和K-B纸片法对药敏结果进行检测。通过全基因组测序分析其基因和分子特征,... 目的分析鼠伤寒沙门菌的耐药情况及分子特征,为临床治疗和感染防控提供依据。方法对我院分离的鼠伤寒沙门菌CYEY-S001,采用VITEK2-Compact全自动微生物分析系统和K-B纸片法对药敏结果进行检测。通过全基因组测序分析其基因和分子特征,并进行质粒接合试验,研究质粒的可转移性。利用碳青霉烯酶表型试验检测其实所含的碳青霉烯酶类型,PCR确认其携带的耐药基因,质粒复制子分型确定质粒类型。结果该鼠伤寒沙门菌CYEY-S001对除氨曲南之外的青霉素类、头孢菌素类和碳青霉烯类抗生素全部耐药,全基因组测序分析表明其为ST34型鼠伤寒沙门菌,含有bla_(NDM-5)、aac(6’)-Iaa、floR、cmlA1、sul3和tet(A)等多种耐药基因。携带的质粒类型为IncHI2,bla_(NDM-5)位于该质粒上,可通过水平转移,结合子获得了与鼠伤寒沙门菌完全一致的耐药结果。3种碳青霉烯酶表型试验均正确识别出了其携带碳青霉烯酶的类型为金属β-内酰胺酶。结论碳青霉烯耐药鼠伤寒沙门菌对感染治疗和预防控制带来了新的挑战。新发现的IncHI2-bla_(NDM-5)质粒存在向其他细菌物种横向传播的风险。 展开更多
关键词 鼠伤寒沙门菌 碳青霉烯耐药 表型检测 质粒复制子分型 IncHI2-bla_(ndm-5)
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广东地区黄羽肉鸡肠杆菌中碳青霉烯耐药基因的流行病学调查 被引量:1
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作者 马振报 庞虹 +4 位作者 许娃丽 王建丽 丁焕中 吴保庆 田浪 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2023年第4期19-26,共8页
为了调查广东地区黄羽肉鸡肠杆菌的耐药性以及碳青霉烯耐药基因的流行病学特征,本研究于2020年8—10月从广东省4个黄羽肉鸡养殖场累计收集的248份样品中分离肠杆菌,利用大肠杆菌基因phoA和细菌16S rRNA进行菌种鉴定,采用琼脂扩散法和微... 为了调查广东地区黄羽肉鸡肠杆菌的耐药性以及碳青霉烯耐药基因的流行病学特征,本研究于2020年8—10月从广东省4个黄羽肉鸡养殖场累计收集的248份样品中分离肠杆菌,利用大肠杆菌基因phoA和细菌16S rRNA进行菌种鉴定,采用琼脂扩散法和微量肉汤稀释法测定肠杆菌对13种药物的敏感性,通过PCR方法检测bla_(NDM)、bla_(KPC)、bla_(OXA)和bla_(IMP)四种常见碳青霉烯类耐药基因,并对耐碳青霉烯肠杆菌进行全基因组测序分析,通过接合转移试验探究碳青霉烯耐药基因的水平传播特征。细菌分离和鉴定结果显示,共计分离肠杆菌206株,分离率为83.06%,其中包括186株大肠杆菌、18株肺炎克雷伯菌和2株阴沟肠杆菌。药物敏感性试验结果显示,肠杆菌对氨苄西林钠(94.66%)、复方新诺明(94.66%)、氟苯尼考(86.89%)、盐酸多西环素(70.87%)和硫酸新霉素(61.17%)的耐药性较高,对硫酸阿米卡星(5.83%)、美罗培南(3.40%)和硫酸黏菌素(1.46%)的敏感性较高。PCR结果显示,共有7株肠杆菌检测到碳青霉烯耐药基因,检出率为3.40%,包括5株bla_(NDM-5)基因阳性和2株bla_(OXA-181)基因阳性菌株。全基因组分析结果显示,7株耐碳青霉烯肠杆菌分别为3株大肠杆菌(携带bla_(NDM-5)基因)、2株拟肺炎克雷伯菌(携带bla_(NDM-5)基因)和2株阴沟肠杆菌(携带bla_(OXA-181)基因);7株耐碳青霉烯肠杆菌均携带有大量的耐药基因,且3株大肠杆菌可分为2个序列型(ST)。接合转移试验结果显示,7株耐碳青霉烯菌株均可通过质粒将携带的碳青霉烯耐药基因传播至工程菌C600。结果表明,广东地区黄羽肉鸡肠杆菌耐药状况严峻,耐碳青霉烯基因在肠杆菌的流行率较低,但可通过质粒接合方式发生水平传播,亟需加强监测。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯肠杆菌 流行病学 黄羽肉鸡 耐药性 bla_(ndm-5)基因 bla_(OXA-181)基因
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尿路感染产NDM-5大肠埃希菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药机制研究 被引量:2
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作者 王爱华 蔡峥 +3 位作者 朱永泽 谢印容 马强 陈伟 《中国卫生检验杂志》 CAS 2021年第23期2870-2873,共4页
目的探讨尿路感染大肠埃希菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药机制及流行特点,为其治疗提供实验依据。方法收集浙江省人民医院2018年6月-2020年6月门诊及住院患者尿路感染大肠埃希菌1574株,应用法国梅里埃VITEK 2 Compact检测大肠埃希菌药物敏... 目的探讨尿路感染大肠埃希菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药机制及流行特点,为其治疗提供实验依据。方法收集浙江省人民医院2018年6月-2020年6月门诊及住院患者尿路感染大肠埃希菌1574株,应用法国梅里埃VITEK 2 Compact检测大肠埃希菌药物敏性;通过WHONET 5.6软件统计药敏结果;应用PCR法检测相关碳青霉烯酶耐药基因(bla_(KPC)、bla_(NDM)、bla_(VIM)和bla_(IMP));应用多克隆序列位点测定(MLST)方法检测菌株克隆型别;通过接合转移试验验证耐药基因转移。结果共分离尿路感染大肠埃希菌1574株,CRE菌株分离率为1.65%,PCR鉴定出7株携带、bla_(NDM-5)基因菌株,MLST数据显示这些菌株属于不同克隆型别。此外,7株携带bla_(NDM-5)基因菌株可以成功地将其对碳青霉烯类耐药的表型转移到受体菌大肠埃希菌C600菌株中。结论本院尿路感染大肠埃希菌对碳青霉烯类抗菌药物的耐药机制主要是产NDM-5型碳青霉烯酶。bla(NDM-5)耐药基因主要定位于质粒进行水平播散,应引起临床高度重视,迫切需要密切监测携带bla(NDM-5)基因的菌株的进一步传播。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 碳青霉烯耐药 ndm-5 质粒
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一株同时产KPC-2和NDM-5碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌耐药基因特征分析 被引量:1
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作者 肖伟强 屈元晔 +4 位作者 王小昆 孙明月 常彦敏 许青霞 毕利军 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期669-675,共7页
目的分析一株同时产KPC-2和NDM-5碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌耐药基因特征。方法肺炎克雷伯菌KPN-hnqyy分离自我院血液科一位患者的粪便标本,使用仪器BD Phenix-M50鉴定菌株并测定最小抑菌浓度;酶联免疫层析试验和PCR方法检测碳青霉烯酶... 目的分析一株同时产KPC-2和NDM-5碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌耐药基因特征。方法肺炎克雷伯菌KPN-hnqyy分离自我院血液科一位患者的粪便标本,使用仪器BD Phenix-M50鉴定菌株并测定最小抑菌浓度;酶联免疫层析试验和PCR方法检测碳青霉烯酶基因型;接合试验检测相关质粒的转移性;PacBio和Illumina平台对菌株全基因组测序,并在BacWGSTdb数据库中检索菌株MLST分型、耐药基因和质粒类型,使用软件Easyfig_2.2.3比对基因组和开放读码框序列,BRIG v0.95生成可视化质粒圈图。结果肺炎克雷伯菌KPN-hnqyy对碳青霉烯类抗生素耐药,MLST分型为ST11型,bla_(KPC-2)和blaNDM-5碳青霉烯酶基因阳性;接合子bla_(KPC-2)基因阳性,blaNDM-5阴性;全基因组测序显示菌株含有1个染色体和3个质粒;肺炎克雷伯菌KP69和KP19-2029等与本研究菌株染色体基因组相似性大于99.9%,且其各自携带的不同种类的质粒上含有相似的IncR和IncFⅠ耐药基因融合区,bla_(KPC-2)基因位于此融合区中一个由Tn3-△Tn4401-Tn1721/Tn1722序列演化而来的两端插入IS26转座酶基因的结构中;blaNDM-5基因位于一种含有噬菌体插入片段特殊质粒的Ⅰ型转座子上,两端也插入了IS26转座酶基因。结论ST11型肺炎克雷伯菌携带bla_(KPC-2)的IncR和IncFⅡ耐药基因融合区与染色体基因组可能一起广泛存在,特殊质粒携带的blaNDM-5基因可能是通过IS26转座元件介导的基因重组方式偶然获得;携带bla_(KPC-2)基因的ST11型肺炎克雷伯菌在中国广泛传播并能通过IS26转座元件获得其他碳青霉烯酶基因的能力应引起重视。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 KPC-2 ndm-5 Β-内酰胺酶
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Dihydroartemisinin inhibits plasmid transfer in drug-resistant Escherichia coli via limiting energy supply
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作者 Xue-Yang Wang Huang-Wei Song +7 位作者 Tian Yi Ying-Bo Shen Chong-Shan Dai Cheng-Tao Sun De-Jun Liu Jian-Zhong Shen Cong-Ming Wu Yang Wang 《Zoological Research》 SCIE CSCD 2023年第5期894-904,共11页
Conjugative transfer of antibiotic resistance genes(ARGs)by plasmids is an important route for ARG dissemination.An increasing number of antibiotic and nonantibiotic compounds have been reported to aid the spread of A... Conjugative transfer of antibiotic resistance genes(ARGs)by plasmids is an important route for ARG dissemination.An increasing number of antibiotic and nonantibiotic compounds have been reported to aid the spread of ARGs,highlighting potential challenges for controlling this type of horizontal transfer.Development of conjugation inhibitors that block or delay the transfer of ARG-bearing plasmids is a promising strategy to control the propagation of antibiotic resistance.Although such inhibitors are rare,they typically exhibit relatively high toxicity and low efficacy in vivo and their mechanisms of action are inadequately understood.Here,we studied the effects of dihydroartemisinin(DHA),an artemisinin derivative used to treat malaria,on conjugation.DHA inhibited the conjugation of the IncI2 and IncX4 plasmids carrying the mobile colistin resistance gene(mcr-1)by more than 160-fold in vitro in Escherichia coli,and more than two-fold(IncI2 plasmid)in vivo in a mouse model.It also suppressed the transfer of the IncX3 plasmid carrying the carbapenem resistance gene bla_(NDM-5)by more than twofold in vitro.Detection of intracellular adenosine triphosphate(ATP)and proton motive force(PMF),in combination with transcriptomic and metabolomic analyses,revealed that DHA impaired the function of the electron transport chain(ETC)by inhibiting the tricarboxylic acid(TCA)cycle pathway,thereby disrupting PMF and limiting the availability of intracellular ATP for plasmid conjugative transfer.Furthermore,expression levels of genes related to conjugation and pilus generation were significantly down-regulated during DHA exposure,indicating that the transfer apparatus for conjugation may be inhibited.Our findings provide new insights into the control of antibiotic resistance and the potential use of DHA. 展开更多
关键词 DIHYDROARTEMISININ PLASMID mcr-1 bla_(ndm-5) Conjugation inhibitors TCA cycle
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碳青霉烯耐药大肠埃希菌的基因组学特点分析
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作者 曹小利 张葵 +4 位作者 周辉 郑洁 周万青 张之烽 沈瀚 《临床检验杂志》 CAS 2021年第11期810-816,共7页
目的分析碳青霉烯耐药大肠埃希菌(CREC)的基因组流行病学特征,调查共携带blaNDM和blaKPC的大肠埃希菌在南京鼓楼医院的流行情况,并分析该类细菌的播散特点。方法对2015年从南京6家医院收集的11株CREC菌株,进行全基因组测序组装后,分析... 目的分析碳青霉烯耐药大肠埃希菌(CREC)的基因组流行病学特征,调查共携带blaNDM和blaKPC的大肠埃希菌在南京鼓楼医院的流行情况,并分析该类细菌的播散特点。方法对2015年从南京6家医院收集的11株CREC菌株,进行全基因组测序组装后,分析耐药基因、毒力因子、多位点序列分型(MLST)、血清型和FimH型的分布并构建系统发育树。对于从南京鼓楼医院2013—2017年收集的CREC菌,使用PCR和DNA测序法筛选共携带blaNDM和blaKPC的菌株,脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)进行遗传相关性分析;接合试验分析基因的可转移性。结果所有的CREC都携带了至少1种碳青霉烯酶编码基因,其中,9株CREC细菌携带blaNDM-5,3株携带blaKPC-2,2株携带blaNDM-1,3株同时携带blaNDM-5和blaKPC-2。MLST分析发现7种不同的序列分型(ST),2株细菌为ST410,其余的6种ST型依次为ST3489、ST156、ST683、ST297、ST167和ST361;其次,11株细菌中鉴定出6种不同的血清型和8种Fim型;11株细菌的质粒图谱虽然呈多样性,但每株细菌都含有质粒复制子IncX3。系统发育分析表明,11个CREC分离株之间有很大的遗传多样性;PFGE显示6株共携带blaNDM和blaKPC的分离株之间也存在较大的遗传多样性。接合试验表明blaNDM可转移,但与blaKPC基因不在同一质粒。结论blaNDM是CREC中主要的碳青霉烯酶基因,blaNDM-5是主要的blaNDM基因,可能通过IncX3质粒水平传播。MLST、Fim分型、血清分型和进化树发育表明CREC呈遗传多样性。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 碳青霉烯耐药 ndm-5 IncX3 KPC-2
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耐碳青霉烯类抗菌药物肠杆菌科细菌的耐药基因分析 被引量:6
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作者 何建业 曹在秋 代志峰 《检验医学》 CAS 2017年第11期985-989,共5页
目的分析郑州大学第一附属医院耐碳青霉烯类抗菌药物肠杆菌科细菌耐药基因的携带和分布情况。方法采用Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统筛选2014年6月—2015年12月临床分离的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌,根据美国临床实验室标准化协会... 目的分析郑州大学第一附属医院耐碳青霉烯类抗菌药物肠杆菌科细菌耐药基因的携带和分布情况。方法采用Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统筛选2014年6月—2015年12月临床分离的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌,根据美国临床实验室标准化协会(CLSI)2013年文件判读,排除重复分离菌株,选出对亚胺培南/美罗培南耐药菌株共29株;采用聚合酶链反应(PCR)对KPC、NDM、VIM、SPM、GIM、IMP、OXA23、OXA24、OXA51和OXA58等相关基因进行检测。结果在分离的29株耐药菌株中共检出KPC阳性11株,其中肺炎克雷伯菌10株、大肠埃希菌1株;检出NDM阳性7株,其中肺炎克雷伯菌3株、大肠埃希菌4株,并有2株检测出变异基因NDM-5。结论郑州大学第一附属医院耐碳青霉烯类抗菌药物肠杆菌科细菌的主要耐药机制为携带KPC和NDM型碳青霉烯酶基因。 展开更多
关键词 碳青霉烯类抗菌药物 肠杆菌科细菌 KPC ndm-5 三维结构
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