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转录因子7-like 2在宫颈癌中表达水平及其与顺铂化疗敏感性关系研究
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作者 冯敏娟 蔡东阁 李虹 《陕西医学杂志》 CAS 2024年第10期1335-1339,共5页
目的:探究转录因子7-like 2(TCF7L2)在宫颈癌患者中表达水平及其与顺铂化疗敏感性的相关性。方法:收集68例宫颈癌患者(观察组)和68例体检正常者(对照组)为研究对象。留取两组晨起静脉血样用于血清TCF7L2和β-catenin表达水平测定。分析... 目的:探究转录因子7-like 2(TCF7L2)在宫颈癌患者中表达水平及其与顺铂化疗敏感性的相关性。方法:收集68例宫颈癌患者(观察组)和68例体检正常者(对照组)为研究对象。留取两组晨起静脉血样用于血清TCF7L2和β-catenin表达水平测定。分析血清中TCF7L2和β-catenin与患者临床特征及顺铂化疗敏感性的关系。结果:观察组患者血清TCF7L2和β-catenin表达水平显著高于对照组(均P<0.05)。观察组患者FIGO分期Ⅳa期、肿瘤低分化者血清中TCF7L2、β-catenin表达水平明显高于FIGO分期Ⅱb期、Ⅲ期和肿瘤高分化者,FIGO分期Ⅲ期明显高于FIGO分期Ⅱb期,出现淋巴转移者高于无淋巴转移者(均P<0.05);同时顺铂化疗不敏感者血清TCF7L2、β-catenin表达水平明显高于敏感者(均P<0.05)。Logistic回归分析显示,血清中TCF7L2、β-catenin高表达是顺铂化疗不敏感的危险因素(均P<0.05)。结论:宫颈癌患者中TCF7L2异常高表达,且其高表达可能是导致患者顺铂化疗耐药的原因之一。 展开更多
关键词 宫颈癌 化疗 顺铂 转录因子7-like 2 预后 耐药性
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王族海棠Alfin-like家族基因的鉴定及盐胁迫下的表达分析
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作者 杨艳 孙瑜 +2 位作者 施伯宁 田治国 王飞 《山东农业科学》 北大核心 2024年第6期16-24,共9页
Alfin-like(AL)转录因子家族对非生物胁迫反应具有重要的调控作用。本研究采用同源比对的方法检索鉴定王族海棠AL转录因子家族基因,系统分析其生物信息学特性,并采用qRT-PCR方法分析其在盐胁迫下的表达模式,以期为揭示AL家族在王族海棠... Alfin-like(AL)转录因子家族对非生物胁迫反应具有重要的调控作用。本研究采用同源比对的方法检索鉴定王族海棠AL转录因子家族基因,系统分析其生物信息学特性,并采用qRT-PCR方法分析其在盐胁迫下的表达模式,以期为揭示AL家族在王族海棠响应盐胁迫中的生理功能提供理论依据。结果表明,从王族海棠基因组中共鉴定出11个MdALs基因,分布在6条染色体上,分别命名为MdAL1—MdAL11。MdALs转录因子具有高度保守的Alfin结构域和PHD锌指结构域,含4~10个内含子;上游启动子区域有大量与植物激素和非生物胁迫响应相关的顺式作用元件,且基因片段复制事件在MdAL基因家族的扩展中起着至关重要的作用。转录组分析显示MdALs基因主要在王族海棠生育后期高表达。qRT-PCR分析进一步表明,MdALs基因在王族海棠遭受盐胁迫下的表达模式不同,盐胁迫下,MdAL3、MdAL4、MdAL6基因的表达量整体上调,尤其MdAL4基因,其表达水平随着盐胁迫处理时间的延长呈显著增加趋势。综上,王族海棠AL转录因子家族与植物响应激素变化和非生物胁迫密切相关,尤其是MdAL4基因,强烈响应盐胁迫,这可为利用基因工程技术改良王族海棠种质奠定基础。 展开更多
关键词 王族海棠 Alfin-like家族基因 生物信息学分析 功能鉴定 盐胁迫 基因表达
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苹果PRE6-like基因的克隆及在花青素合成中的功能分析
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作者 黄娟娟 黄亚萍 +2 位作者 李文芳 毛娟 陈佰鸿 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期812-823,共12页
【目的】通过验证苹果非典型成员多效唑抗性蛋白基因(PRE6-like)的功能,探索其在花青素生物合成中的调控作用。【方法】基于俄矮2号芽变枝条果皮转录组测序结果,筛选获得花青素合成相关调节基因MdPRE6-like,对其进行生物信息学分析,克隆... 【目的】通过验证苹果非典型成员多效唑抗性蛋白基因(PRE6-like)的功能,探索其在花青素生物合成中的调控作用。【方法】基于俄矮2号芽变枝条果皮转录组测序结果,筛选获得花青素合成相关调节基因MdPRE6-like,对其进行生物信息学分析,克隆CDS并构建过表达载体,瞬时表达金冠苹果果实,遗传转化苹果愈伤和拟南芥进行功能验证。【结果】MdPRE6-like cDNA全长279 bp,编码92个氨基酸,相对分子质量10450.75 Da,理论等电点(pI)为6.41,含有HLH结构域,亚细胞定位预测结果为细胞核。组织特异性表达分析表明,MdPRE6-like基因在花、果皮中的表达量显著高于根和叶。瞬时表达金冠苹果表明,MdPRE6-like显著促进了金冠苹果果皮注射部位花青素的积累,并显著提高了花青素合成通路相关结构基因的表达水平。MdPRE6-like基因在苹果愈伤组织和拟南芥过表达表明,转基因苹果愈伤组织和拟南芥叶脉中的花青素含量显著高于野生型,且花青素合成通路结构基因表达水平上调。【结论】MdPRE6-like基因能够正向调控花青素的合成和积累,为后续MdPRE6-like基因参与改良苹果果实品质提供理论参考。 展开更多
关键词 苹果 MdPRE6-like 花青素合成 遗传转化 表达水平
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油菜素内酯对低温胁迫下冬小麦Rab15-like基因表达的影响
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作者 张军保 陈宇姝 +7 位作者 田诗 于梦迪 王雪松 曹佳昂 邵庆一 杨森 金忠民 刘丽杰 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期28-34,45,共8页
探索低温胁迫下油菜素内酯(Brassinosteroid,BR)对冬小麦叶片和分蘖节中Rab15-like基因表达的影响,以寒地冬小麦品种“东农冬麦1号”为试验材料,利用RT-PCR法克隆Rab15-like基因CDS序列,运用生物信息学方法分析该序列基本理化性质、二... 探索低温胁迫下油菜素内酯(Brassinosteroid,BR)对冬小麦叶片和分蘖节中Rab15-like基因表达的影响,以寒地冬小麦品种“东农冬麦1号”为试验材料,利用RT-PCR法克隆Rab15-like基因CDS序列,运用生物信息学方法分析该序列基本理化性质、二级结构和三级结构特征、Rab15-like蛋白保守性,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测BR处理对不同温度条件下冬小麦分蘖节和叶片中Rab15-like基因表达的影响。结果表明,Rab15-like基因编码区序列长度为1 265 bp,Rab15-like基因含有一个453 bp开放阅读框,编码150个氨基酸序列,Rab15-like蛋白为LEA家族第二大类蛋白,主要分布在细胞膜上,为稳定亲水性蛋白。RT-qPCR分析结果表明,Rab15-like基因表达量与温度变化相关,在叶片中,随着环境温度降低,Rab15-like基因表达先上调后下调,当环境温度达-10℃时表达量最高;在分蘖节中,随着温度降低,Rab15-like基因表达持续上调,-25℃时表达量最高。BR处理促进低温条件下该基因在叶片中表达,对5、0和-10℃条件下分蘖节中该基因表达影响较小,但显著促进-25℃条件下该基因表达(P<0.05)。Rab15-like基因表达受温度影响,说明Rab15-like基因可能参与冬小麦响应低温胁迫的信号途径。外源BR处理促进低温条件下该基因在冬小麦叶片和分蘖节中表达。 展开更多
关键词 油菜素内酯 低温胁迫 冬小麦 Rab15-like基因
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香猪ZNF805-like基因结构变异与皮肤皱褶性状的关联研究
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作者 梁才康 黄世会 +2 位作者 牛熙 王嘉福 冉雪琴 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期282-289,共8页
基于比较基因组学分析,从皱皮香猪锌指蛋白805-like(Zinc Finger Protein 805-like,ZNF805-like)基因外显子4中检测到一个81 bp的结构变异(Structure Variant,SV),缺失型基因产生的转录本是NCBI记录的转录本变异体X2(XM_021097285.1)。... 基于比较基因组学分析,从皱皮香猪锌指蛋白805-like(Zinc Finger Protein 805-like,ZNF805-like)基因外显子4中检测到一个81 bp的结构变异(Structure Variant,SV),缺失型基因产生的转录本是NCBI记录的转录本变异体X2(XM_021097285.1)。为解析该SV对香猪皮肤皱褶形成的影响,本研究首先建立特异性PCR检测方法,明确普通香猪和皱皮香猪群体中该SV的分布;采用RT-qPCR方法分析了ZNF805-like基因在不同组织中的表达水平,并比较了具有不同基因型的皮肤组织中该基因的表达差异,进一步克隆出香猪ZNF805-like基因的CDS区;在此基础上,采用生物信息学方法分析SV对编码蛋白的理化性质、三维结构和对靶基因的影响。结果显示,在皱皮香猪和普通香猪群体中,ZNF805-like基因的E4-sv81位点存在2种基因型:Ⅱ型和ID型(D为缺失基因,Ⅰ与参考基因一致),皱皮香猪的D等位基因频率显著高于普通香猪,且皮肤组织中ID型的基因表达量显著高于Ⅱ型。基因克隆结果显示,野生型蛋白由725个氨基酸组成,突变型蛋白异构体2的肽链较短,由698个氨基酸组成。SV导致突变型蛋白异构体2的极性氨基酸减少,丢失了一个磷酸化位点,第1个锌指结构与其他锌指的间距拉大。本文研究结果提示,皱皮香猪的缺失型SV可上调皮肤ZNF805-like基因转录本X2的表达,产生较短的蛋白异构体2,可能通过改变蛋白异构体的高级结构和靶基因谱,参与香猪皱皮的形成过程。本研究将有助于在香猪群体中识别并淘汰携带皱皮基因的个体,从而为优质香猪的选择性育种提供科学依据和技术支持。 展开更多
关键词 香猪 皱皮 ZNF805-like 结构变异 转录本
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蓖麻RcNAC100-like基因克隆及表达特性分析
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作者 李艳肖 王丽娜 +2 位作者 朱贵爽 刘鹏 向殿军 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第3期67-76,共10页
NAC(NAM,ATAF1/2,CUC2)基因是胁迫信号转导网络中重要的调节因子,克隆蓖麻NAC基因,研究其分子特征及表达特性,旨在为研究蓖麻NAC基因的潜在功能提供数据支持。采取RT-PCR技术克隆通篦5号的RcNAC100-like基因并分析其分子特征,包括生物... NAC(NAM,ATAF1/2,CUC2)基因是胁迫信号转导网络中重要的调节因子,克隆蓖麻NAC基因,研究其分子特征及表达特性,旨在为研究蓖麻NAC基因的潜在功能提供数据支持。采取RT-PCR技术克隆通篦5号的RcNAC100-like基因并分析其分子特征,包括生物信息学、亚细胞定位、表达模式和转录激活域分析。结果表明,RcNAC100-like基因的cDNA全长1 244 bp,包含1 086 bp的CDS,共推导361个氨基酸,该蛋白质的不规则卷曲和α-螺旋结构较多,是1个亲水的、非分泌性蛋白质;系统进化分析结果表明,RcNAC100-like蛋白质与木薯和橡胶树NAC蛋白质的亲缘关系最近,且motif组成及位置高度相似;RcNAC100-like蛋白的亚细胞定位结果与预测结果一致,定位在细胞核;RcNAC100-like启动子的顺式作用元件预测结果显示,该区域有多个环境响应类元件和生长发育类相关元件;基因表达模式分析结果表明,RcNAC100-like基因有组织表达特异性,在根中的相对表达量最高;另外,该基因能够对不利环境(干旱、盐、冷和ABA胁迫)迅速做出反应并积极地表达,说明RcNAC100-like基因可能是蓖麻对逆境响应的关键基因;转录激活试验结果表明,RcNAC100-like转录因子在酵母中具有转录激活活性。综上,RcNAC100-like基因可能在蓖麻的抗逆境过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 蓖麻 RcNAC100-like基因 生物信息学 克隆 表达
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舞毒蛾Methuselah-like分子模拟及靶向小分子抑制剂研究
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作者 吴元旺 谢佳铭 +2 位作者 丛培娟 曹传旺 孙丽丽 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2024年第4期12-23,共12页
[目的]旨在通过虚拟筛选技术筛选Methuselah-like(Ldmthl1)蛋白潜在的小分子抑制剂,并通过分子动力学模拟、MM-PBSA及生物测定,探究潜在化合物对Ldmthl1蛋白的抑制能力,为针对舞毒蛾Ldmthl1研发新型靶向杀虫剂奠定理论基础。[方法]以舞... [目的]旨在通过虚拟筛选技术筛选Methuselah-like(Ldmthl1)蛋白潜在的小分子抑制剂,并通过分子动力学模拟、MM-PBSA及生物测定,探究潜在化合物对Ldmthl1蛋白的抑制能力,为针对舞毒蛾Ldmthl1研发新型靶向杀虫剂奠定理论基础。[方法]以舞毒蛾为研究对象,构建Ldmthl1同源模型,虚拟筛选Ldmthl1受体小分子抑制剂,并采用分子动力学和MM-PBSA计算结合自由能分析6种潜在小分子抑制剂与Ldmthl1受体的结合强度;通过生物测定分析6种潜在小分子抑制剂的毒力,同时将6种潜在小分子抑制剂与溴氰菊酯进行联合使用,探究6种潜在化合物的增效作用。[结果]Ldmthl1含7个跨膜结构,符合G蛋白偶联受体结构特点,评估后符合蛋白模型评估标准;分子对接获得20个候选化合物,根据结合方式及结合能确定6种小分子化合物为潜在的抑制剂;分子动力学模拟显示,6种潜在小分子抑制剂通过氢键和疏水作用力与Ldmthl1受体稳定结合;MM-PBSA计算结合自由能发现6种潜在小分子抑制剂与Ldmthl1受体结合紧密;致死浓度LC30溴氰菊酯与6种抑制剂按照1:1、1:2和2:1的比例联合使用饲喂舞毒蛾3龄幼虫,6种抑制剂与溴氰菊酯具有协同增效作用,且当混合比例为1:2时,增效作用最显著,但溴氰菊酯浓度过高时,导致抑制剂无增效作用。[结论]虚拟筛选得到6种可与Ldmthl1受体稳定结合且具有杀虫活性潜在小分子抑制剂,与溴氰菊酯联用后呈现增效作用,本研究可为研发Ldmthl1靶向新型杀虫剂奠定理论基础。 展开更多
关键词 舞毒蛾 Methuselah-like 分子对接 虚拟筛选 小分子抑制剂
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Einstein-Bumblebee引力理论中的Kerr-Sen-like黑洞玻色子隧穿辐射
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作者 谭霞 杨树政 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2024年第4期60-68,共9页
Lorentz-breaking理论不仅对弯曲时空背景有影响,而且对于在弯曲时空中的玻色子和费米子的动力学方程都有一定的修正.因此,我们需要在不同的黑洞时空中对玻色子和费米子的量子隧穿辐射进行适当的修正.从而得到经过Lorentz-breaking理论... Lorentz-breaking理论不仅对弯曲时空背景有影响,而且对于在弯曲时空中的玻色子和费米子的动力学方程都有一定的修正.因此,我们需要在不同的黑洞时空中对玻色子和费米子的量子隧穿辐射进行适当的修正.从而得到经过Lorentz-breaking理论修正后的黑洞Hawking温度等物理量的新表达式及其物理意义.本文根据Einstein-Bumblebee引力理论中得到的Kerr-Sen-like(KSL)黑洞时空度规,在标量场作用量中引入aether-like场矢量修正项和弯曲时空中的d’Alembert算符并应用弯曲时空中的变分原理,研究了此时空度规中的Lorentz-breaking修正项及KSL时空中自旋为零的含有Lorentz-breaking修正项的玻色子动力学方程的新形式.通过正确选择与KSL时空度规相对应的aether-like场矢量,求解修正的玻色子动力学方程,得到了修正的量子隧穿率,并在此基础上研究了含有Lorentz-breaking修正项的此黑洞的Hawking温度和Bekenstein-Hawking熵.此外,还研究了Lorentz-breaking效应对玻色子正、负能级分布及其能级交错的最大值的影响,从而得出此黑洞时空中的量子非热辐射的条件.最后对所得到的一系列结果的物理意义进行了深入的讨论. 展开更多
关键词 Lorentz-breaking Einstein-Bumblebee引力理论 Kerr-Sen-like黑洞 Bekenstein-Hawking熵
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CmMYB3-like negatively regulates anthocyanin biosynthesis and flower color formation during the post-flowering stage in Chrysanthemum morifolium
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作者 Lijie Zhou Shenhui Liu +6 位作者 Yiguang Wang Yuxi Wang Aiping Song Jiafu Jiang Sumei Chen Zhiyong Guan Fadi Chen 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2024年第1期194-204,共11页
Color fading caused by a decrease in anthocyanin accumulation during the post-flowering stage significantly affects postharvest quality of chrysanthemum.However,the underlying mechanism by which anthocyanin accumulati... Color fading caused by a decrease in anthocyanin accumulation during the post-flowering stage significantly affects postharvest quality of chrysanthemum.However,the underlying mechanism by which anthocyanin accumulation decreases during the post-flowering stage still unclear,which greatly restricts design of molecular breeding in chrysanthemum.Here,a chrysanthemum SG7 R2R3 MYB transcription factor(TF),CmMYB3-like,was identified to have a function in regulating anthocyanin biosynthesis during the post-flowering stage.Quantitative real time PCR(qRT-PCR)assays showed that the expression of CmMYB3-like was gradually downregulated when anthocyanin content increased during the flowering stage and was significantly upregulated during the post-flowering stage.Genetic transformation of chrysanthemum and dual-luciferase assays in N.benthamiana leaves showed that CmMYB3-like suppressed anthocyanin accumulation by inhibiting the transcription of CmCHS and CmANS directly and that of CmF3H indirectly.However,overexpression or suppression of CmMYB3-like did not affect the biosynthesis of flavones or flavonols.Genetic transformation of chrysanthemum revealed that the overexpression of CmMYB3-like inhibited anthocyanin accumulation,but its suppression prevented the decrease in anthocyanin accumulation during the post-flowering stage.Our results revealed a crucial role of CmMYB3-like in regulating the color of petals during the post-flowering stage and provided a target gene for molecular design breeding to improve the postharvest quality of chrysanthemum. 展开更多
关键词 Post-flowering stage Color fading Anthocyanins CmMYB3-like CHRYSANTHEMUM Molecular breeding
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The BEL1-like transcription factor GhBLH5-A05 participates in cotton response to drought stress
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作者 Jing-Bo Zhang Yao Wang +4 位作者 Shi-Peng Zhang Fan Cheng Yong Zheng Yang Li Xue-Bao Li 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2024年第1期177-187,共11页
Drought stress impairs crop growth and development.BEL1-like family transcription factors may be involved in plant response to drought stress,but little is known of the molecular mechanism by which these proteins regu... Drought stress impairs crop growth and development.BEL1-like family transcription factors may be involved in plant response to drought stress,but little is known of the molecular mechanism by which these proteins regulate plant response and defense to drought stress.Here we show that the BEL1-like transcription factor GhBLH5-A05 functions in cotton(Gossypium hirsutum)response and defense to drought stress.Expression of GhBLH5-A05 in cotton was induced by drought stress.Overexpression of GhBLH5-A05 in both Arabidopsis and cotton increased drought tolerance,whereas silencing GhBLH5-A05 in cotton resulted in elevated sensitivity to drought stress.GhBLH5-A05 binds to cis elements in the promoters of GhRD20-A09 and GhDREB2C-D05 to activate the expression of these genes.GhBLH5-A05 interacted with the KNOX transcription factor GhKNAT6-A03.Co-expression of GhBLH5-A05 and GhKNAT6-A03 increased the transcription of GhRD20-A09 and GhDREB2C-D05.We conclude that GhBLH5-A05 acts as a regulatory factor with GhKNAT6-A03 functioning in cotton response to drought stress by activating the expression of the drought-responsive genes GhRD20-A09 and GhDREB2C-D05. 展开更多
关键词 Cotton(Gossypium hirsutum) BEL1-like transcription factor Drought stress Transcriptional regulation Drought tolerance
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猪繁殖与呼吸综合征病毒NADC30-like株的分离鉴定及基因组分析
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作者 毛丽萍 潘晓梅 +5 位作者 曹剑 李俊辉 周涛 侯红娟 郑学功 贺笋 《动物医学进展》 北大核心 2024年第7期11-17,共7页
猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)呈现全球流行,对养猪行业造成巨大的经济损失。为增加PRRSV分离细胞种类的多样性,同时了解新疆地区猪繁殖与呼吸综合症病毒(PRRSV)遗传变异的现状,采用新鲜制备猪骨髓细胞诱导分化成猪骨髓源巨噬细胞,对新疆地... 猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)呈现全球流行,对养猪行业造成巨大的经济损失。为增加PRRSV分离细胞种类的多样性,同时了解新疆地区猪繁殖与呼吸综合症病毒(PRRSV)遗传变异的现状,采用新鲜制备猪骨髓细胞诱导分化成猪骨髓源巨噬细胞,对新疆地区某猪场疑似患有PRRS的肺脏,接种至猪骨髓源巨噬细胞,分离获得1株PRRSV毒株,命名为XJYQ-2021。通过测序得到全基因组序列,对该毒株NSP2氨基酸序列缺失、ORF5及全基因组序列进行同源性、遗传进化及重组分析;利用间接免疫荧光试验进行鉴定,同时对第10、15、20代病毒液绘制生长曲线。结果显示,诱导分化的猪骨髓源巨噬细胞纯度高达90%以上,XJYQ-2021分离株在该细胞生长良好,可见明显细胞病变;通过生长曲线可观察到病毒含量随代次增加而递增,感染48 h左右病毒滴度达到峰值;该分离株基因组全长15030 nt,与美洲型NADC30同源性为90%;XJYQ-2021分离株与VR2332相比,NSP2氨基酸序列与美洲型NADC30具有相同不连续缺失(111+1+19);全基因重组分析结果表明,XJYQ-2021分离株是重组病毒,有一个重组片段,其中NADC30是亲本毒株,与JXA1之间发生重组获得。研究结果可为PRRSV的病毒分离提供优选细胞种类,同时掌握了新疆地区PRRSV流行毒株的遗传进化现状。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 类NADC30 猪骨髓源巨噬细胞 NSP2 重组分析
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一种基于GHZ-like态的量子匿名投票协议
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作者 秦加奇 《空天预警研究学报》 CSCD 2024年第3期209-214,共6页
针对现有量子分配式投票协议中存在投票效率普遍偏低的情况,利用三粒子GHZ-like态的纠缠特性提出一种量子匿名投票协议;结合实例,阐述量子投票协议整个过程的步骤;最后对该协议的安全性和效率进行分析.该协议采用GHZ-like态作为投票协... 针对现有量子分配式投票协议中存在投票效率普遍偏低的情况,利用三粒子GHZ-like态的纠缠特性提出一种量子匿名投票协议;结合实例,阐述量子投票协议整个过程的步骤;最后对该协议的安全性和效率进行分析.该协议采用GHZ-like态作为投票协议所需的量子纠缠态,投票者只需要对单粒子进行酉操作,降低了对参与者设备和能力的要求;且整个投票过程都在第三方监督者的监督下,实现了匿名投票.研究结果表明,该协议能够同时抵御外部窃听攻击和不诚实投票者的多次投票行为,且投票效率显著提高. 展开更多
关键词 量子匿名投票 受控量子安全直接通信 GHZ-like 量子密码 量子通信安全
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The Role of Toll-Like Receptors and Nuclear Factor κB p65 Protein in the Pathogenesis of Otitis Media
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作者 Qingchen He Yongbo Zhu Bi Qiang 《Journal of Biosciences and Medicines》 2024年第10期246-257,共12页
The role of Toll-like receptor 4 (TLR4) and nuclear factor κB p65 (NF-κB p65) proteins in the pathogenesis of otitis media is explored. In recent years, the incidence of otitis media has been rising globally, becomi... The role of Toll-like receptor 4 (TLR4) and nuclear factor κB p65 (NF-κB p65) proteins in the pathogenesis of otitis media is explored. In recent years, the incidence of otitis media has been rising globally, becoming a significant threat to human health. More and more studies have found that Toll-like receptor 4 (TLR4), as a member of the Toll-like receptor family, can promote the generation of inflammatory factors and is closely related to the body’s immune response and inflammatory response. Nuclear factor-κB p65 (NF-κB p65) is a nuclear transcription factor that can interact with various cytokines, growth factors, and apoptotic factors, participating in processes such as oxidative stress, apoptosis, and inflammation in the body [1]. This article elaborates on the structure, function, and signaling pathways of TLR4 and NF-κB p65 proteins in the pathogenesis of otitis media, aiming to provide more precise targets and better therapeutic efficacy for the diagnosis and treatment of otitis media. The role of inflammation in disease. 展开更多
关键词 Otitis Media Toll-like Receptors Nuclear Factor κB p65 Signaling Pathway
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On the Impairment of Stress-Induced Changes in Triglyceride Levels via a Sub-Toxic Dose of Unmethylated Cytidine Phosphate Guanosine Oligodinucleotide (a Toll-Like Receptor 9 Ligand)
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作者 Reiko Seki Kazuhisa Nishizawa 《Journal of Biosciences and Medicines》 2024年第9期95-112,共18页
Changes in lipid metabolism have been implicated in protection against infectious diseases. In the first experiment of this study, we measured clinical lipid parameters in a murine model where the unmethylated cytidin... Changes in lipid metabolism have been implicated in protection against infectious diseases. In the first experiment of this study, we measured clinical lipid parameters in a murine model where the unmethylated cytidine phosphate guanosine (CpG) oligodinucleotide (ODN1826), a Toll-like receptor 9 (TLR9) agonist was administered in combination with D-galactosamine (GalN) that caused relatively liver-specific inflammation and toxicity. In the control mice group injected with phosphate-buffered saline (PBS) (acute psychological stress model associated with blood sampling), the serum triglyceride (TG) levels showed a rapid decrease followed by a rebound at 24 h as we have recently reported. However, such a TG rebound was impaired in the CpG/GalN- and solely CpG-treated groups of mice despite an absence of liver injury based on serum alanine aminotransferase levels in the latter group. Thus, the stress-associated serum TG rebound was abrogated by the injection of a sub-hepatotoxic CpG dose. In the second experiment, we simply measured the hepatic CD36 and SACRB1 (the gene for scavenger receptor B1 (SR-B1)) transcripts after the i.p. administration of PBS, CpG or CpG/GalN. There was a remarkable elevation of hepatic CD36 transcript expression in both the CpG- and CpG/GalN-treated mice at 8 h post-CpG injection whereas the increase in the PBS-treated mice was slower than the former two groups, suggesting that hepatic CD36 transcript expression is more pronounced in the combined stress models than under psychological stress alone. The individual mice data showed that the increase in CD36 expression was accompanied by a reduction in SCARB1 mRNA, showing reciprocal regulation between these two genes. Together with our previously reported findings, these data suggest that, in a murine model combining psychological stress with TLR-triggered hepatic inflammation, the psychological stress facilitates liver uptake of plasma TG (and its components fatty acids), but the subsequent re-esterification and/or release of TG-rich lipoproteins from the liver is impaired due to the concomitant TLR-signaling. We hypothesize that lipid metabolism during acute stress shifts toward an elevated hepatic uptake of lipids due to concomitant TLR signaling, facilitating the clearance of bacterial lipids by the liver. 展开更多
关键词 Toll-like Receptor 9 Cytidine Phosphate Guanosine Oligodinucleotide Scavenger Receptor B1 TRIGLYCERIDE Hepatic Inflammation
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A Retrospective Analysis of Glucagon-Like Peptide 1 Receptor Agonists in Treating Type 2 Diabetes Mellitus Complicated by Nonalcoholic Fatty Liver Disease
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作者 Jiaqian Chen Hongyan Wu 《Journal of Biosciences and Medicines》 2024年第3期16-24,共9页
Background: The objective of this study was to compare and analyze the variations in clinical indices before and after treatment of type 2 mellitus (T2DM) combined with nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) that we... Background: The objective of this study was to compare and analyze the variations in clinical indices before and after treatment of type 2 mellitus (T2DM) combined with nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) that were treated with glucagon-like peptide 1 receptor agonists (GLP-1RAs). Methods: The electronic medical record system was utilized to search for a total of 16 patients with type 2 diabetes complicated by NAFLD who were hospitalized at the First Affiliated Hospital of Yangtze University from October 2022 to April 2023 and treated with GLP-1RA for the first time. The clinical indices were compared before and after 12 weeks of treatment with GLP-1RA. Results: The liver-spleen CT ratio (L/S), alanine aminotransferase (ALT), gamma-glutamyltransferase (GGT), total cholesterol (TC), triglyceride (TG), and low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C) in all patients treated with GLP-1RA after 12 weeks were significantly different (P 0.05). The patients were categorized into two groups based on the types of GLP-1RAs. The changes in L/S, TC, TG, and LDL-C in the long-acting group after treatment were statistically significant (P Conclusions: GLP-1RAs can improve liver function, regulate lipid metabolism, and reduce the severity of fatty liver in patients with T2DM complicated by NAFLD, which demonstrates the importance of clinical applications. 展开更多
关键词 Glucagon-like Peptide 1 Receptor Agonists Nonalcoholic Fatty Liver Disease Type 2 Diabetes Mellitus
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陆地棉2-酮戊二酸依赖型氧化酶GhAOP2-like基因的克隆和功能分析
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作者 李丹 赵存鹏 +5 位作者 刘素恩 王凯辉 张晓慧 赵丽英 郭宝生 耿军义 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期49-54,共6页
为了研究棉花中AOP2-like(GhAOP2-like)与抗旱耐盐的相关性,根据河北省农林科学院棉花研究所遗传育种研究室前期获得的蛋白质组数据,利用同源克隆法得到了GhAOP2-like的基因序列,用生物信息学方法对GhAOP2-like蛋白的理化性质、结构、... 为了研究棉花中AOP2-like(GhAOP2-like)与抗旱耐盐的相关性,根据河北省农林科学院棉花研究所遗传育种研究室前期获得的蛋白质组数据,利用同源克隆法得到了GhAOP2-like的基因序列,用生物信息学方法对GhAOP2-like蛋白的理化性质、结构、亚细胞定位等进行了分析,利用qRT-PCR技术检测了GhAOP2-like的组织特异性表达以及在干旱、盐和激素处理下的表达量变化。结果显示,GhAOP2-like位于D13染色体上,CDS序列长972 bp,编码323个氨基酸。生物信息学分析发现,GhAOP2-like蛋白的分子式为C_(1654)H_(2525)N_(429)O_(478)S_(19),理论等电点为5.20,不含信号肽和跨膜结构域,定位于细胞质中。聚类分析结果显示,棉花与其他物种中的AOP序列被明显分成2组,但与木槿中AOP序列关系最近。根据qRT-PCR的结果,发现GhAOP2-like在根、茎、叶和发育中的种子中都表达,但在根中表达量最高,并且在干旱、盐、GA_(3)、MeJA和ABA处理下上调表达,但在MeJA处理下表达变化最强烈,说明GhAOP2-like可能通过参与茉莉酸信号通路调节根系的生长从而提高陆地棉的抗逆性。 展开更多
关键词 陆地棉 非生物胁迫 GhAOP2-like 茉莉酸信号通路 次生代谢产物
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食管癌组织中Krüppel-like Factor4表达与术后复发转移的相关性 被引量:1
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作者 安小康 丁钎州 +5 位作者 郭明杰 周冉 陈涛 黄智超 郑先杰 张国瑜 《实用癌症杂志》 2023年第7期1082-1085,共4页
目的探究食管癌组织中Krüppel-like Factor4表达与术后复发转移的相关性。方法选取食管癌患者160例并收集其临床资料。采取免疫组化法检测Krüppel-like Factor4表达,根据患者术后是否复发转移将其分为复发转移组和无复发转移... 目的探究食管癌组织中Krüppel-like Factor4表达与术后复发转移的相关性。方法选取食管癌患者160例并收集其临床资料。采取免疫组化法检测Krüppel-like Factor4表达,根据患者术后是否复发转移将其分为复发转移组和无复发转移组,对比Krüppel-like Factor 4表达水平,并采用多因素logistic回归分析食管癌切除术患者术后复发转移的危险因素。结果Krüppel-like Factor4蛋白表达与分化程度、临床分期和淋巴结转移等临床病理参数显著相关(P<0.05),与患者的年龄、性别、肿瘤直径均无相关性(P>0.05)。复发转移组术后Krüppel-like Factor4阳性表达率显著低于未复发转移组,差异有统计学意义(P<0.05)。多因素分析显示,Krüppel-like Factor4(OR=2.012,P<0.001)是食管癌术后发生复发转移的独立影响因素。结论食管癌组织中Krüppel-like Factor4表达与患者术后复发转移具有相关性,其对患者术后复发转移具有重要预测价值。 展开更多
关键词 食管癌 组织 Krüppel-like Factor4 复发转移 相关性
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辣椒锌指蛋白DnaJ-Like基因家族鉴定及对高温胁迫的表达响应 被引量:2
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作者 段敏杰 李怡斐 +4 位作者 杨小苗 王春萍 黄启中 黄任中 张世才 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期187-198,共12页
植物DnaJ-Like锌指蛋白(DNAJE)是近年来发现的一类具有重要功能的蛋白,在光合作用、质体发育与运动和植物抗逆及防御反应中发挥重要作用。基于辣椒全基因组数据,对辣椒DNAJE基因家族(CaDNAJE)进行鉴定,利用生物信息学方法对基因和蛋白... 植物DnaJ-Like锌指蛋白(DNAJE)是近年来发现的一类具有重要功能的蛋白,在光合作用、质体发育与运动和植物抗逆及防御反应中发挥重要作用。基于辣椒全基因组数据,对辣椒DNAJE基因家族(CaDNAJE)进行鉴定,利用生物信息学方法对基因和蛋白特征、比较进化、共线性关系及高温胁迫下基因表达模式等进行分析。结果表明,CaDNAJE基因家族有28个成员,不均匀的分布在10条染色体和3个Scaffold上,氨基酸序列长度为99-470 aa,分子量为10.05-52.26 kD,理论等电点(pI)为4.75-9.64,其编码蛋白主要定位在叶绿体和细胞核中;辣椒、番茄和拟南芥的比较进化分析可将其分为GroupⅠ和GroupⅡ2个亚族,同一亚族具有类似的蛋白保守motif和基因结构;CaDNAJE基因启动子区包含大量光响应、激素响应和胁迫应答元件;辣椒与拟南芥DNAJE之间存在10对共线性基因,辣椒种内仅有1对;辣椒不同组织转录组分析发现,GroupⅠ中多数成员在各组织中均有高表达,而GroupⅡ中除CaDNAJE2、CaDNAJE9等基因存在高表达外,多数基因表达量都很低甚至不表达;高温胁迫下,辣椒叶片过氧化氢含量急速上升后降低,丙二醛含量持续升高,抗氧化物酶活性也有不同程度的提高。同时,高温诱导热激转录因子Hsf和热激蛋白HSP耐热相关基因及CaDNAJE基因高表达,在不同胁迫时期发挥调控作用。推测CaDNAJE基因家族可能参与辣椒响应高温胁迫,提高其耐受力,以降低细胞损伤。 展开更多
关键词 辣椒 DnaJ-like锌指蛋白 全基因组鉴定 高温胁迫 基因表达 调控
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汉麻Alfin-like转录因子家族鉴定及表达分析 被引量:1
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作者 陈晗 徐洪国 +2 位作者 王志刚 高美玲 祁宏英 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第3期410-415,共6页
对汉麻Alfin-like转录因子家族进行鉴定和生物信息学分析,为Alfin-like转录因子调控汉麻生长发育及抗性奠定基础。通过利用拟南芥Alfin-like转录因子蛋白序列作为模板,利用TBtools、MEGA等生物信息学工具分析汉麻全基因组数据。在汉麻... 对汉麻Alfin-like转录因子家族进行鉴定和生物信息学分析,为Alfin-like转录因子调控汉麻生长发育及抗性奠定基础。通过利用拟南芥Alfin-like转录因子蛋白序列作为模板,利用TBtools、MEGA等生物信息学工具分析汉麻全基因组数据。在汉麻基因中共鉴定出5个CsALs基因,对其进行了理化性质分析、亚细胞定位、保守基序、基因结构、染色体定位、顺式元件、共线性分析、进化分析及聚类分析等基础分析。结果表明:鉴定的5个汉麻AL转录因子均含有DUF3594结构域(PAL结构域)和PHD手指状结构域;经理化性质分析得出,CsALs蛋白质长度在239~256 aa之间,等电点在4.97~5.31之间,亲水性为–0.809~–0.623,属于酸性亲水蛋白;CsALs基因分布在4条染色体上,亚细胞定位发现AL转录因子均定位在细胞核;上游2000 bp启动子元件分析与光响应、胁迫响应和激素相关;根据与拟南芥、大豆、水稻、玉米、烟草等系统发育分析共分为B、E、F 3个亚族;热图聚类分析表明CsALs基因在汉麻中具有较高表达。 展开更多
关键词 汉麻 Alfin-like 成员鉴定 生物信息学 表达分析
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斑节对虾新型抗菌肽ALF-like基因克隆表达及其抗菌功能分析 被引量:1
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作者 梁子莹 邱丽华 +4 位作者 王鹏飞 张博 闫路路 乔秀亭 赵超 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期2654-2664,共11页
【目的】克隆并明确斑节对虾(Penaeus monodon)新型抗菌肽ALF-like基因(PmALF-like)的结构特征、组织表达分布规律及副溶血弧菌(Vibrio parahemolyticus)刺激后的表达变化,探究其在抗菌先天免疫中的作用与功能,为阐明斑节对虾抗菌免疫... 【目的】克隆并明确斑节对虾(Penaeus monodon)新型抗菌肽ALF-like基因(PmALF-like)的结构特征、组织表达分布规律及副溶血弧菌(Vibrio parahemolyticus)刺激后的表达变化,探究其在抗菌先天免疫中的作用与功能,为阐明斑节对虾抗菌免疫调控机制提供参考依据。【方法】依据PmALF-like基因表达序列标签(EST)序列,利用RACE扩增获得PmALF-like基因cDNA全长序列,通过ProtParam、SignalP 5.0、MegAlign和MEGA 7.0等在线软件进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR检测PmALF-like基因在斑节对虾不同组织中的表达特征及其在副溶血弧菌刺激后的表达模式;利用原核重组方法获得PmALF-like成熟肽的重组蛋白(去信号肽),并通过液体培养基法和牛津杯法等探究Pm ALF-like成熟肽抑制细菌生长的作用。【结果】PmALF-like基因cDNA序列全长1242 bp,包括45 bp的5’端非编码区(5’-UTR)、798 bp的3’端非编码区(3’-UTR)和399 bp的开放阅读框(ORF),共编码132个氨基酸残基;分子量为15.26k D,理论等电点(pI)为7.67;利用SignalP5.0对PmALF-like蛋白进行信号肽预测,结果表明其第18个氨基酸处存在信号肽剪切位点。实时荧光定量PCR检测结果表明,PmALF-like基因在斑节对虾血淋巴、肝胰腺、鳃、肠道、肌肉等组织中均有不同程度的表达,以肝胰腺中的相对表达量最高,血淋巴次之,肌肉组织中的相对表达量较少。副溶血弧菌刺激后,斑节对虾肝胰腺组织PmALF-like基因产生免疫应答,其基因相对表达量在6~72 h显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)上调。利用原核表达方法在体外成功获得不含信号肽的PmALF-like成熟肽,借助液体培养基法和牛津杯法发现PmALF-like成熟肽对维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)、副溶血弧菌及嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)的生长均有明显抑制作用。【结论】PmALF-like基因在斑节对虾各组织中广泛表达,其成熟肽对维氏气单胞菌、副溶血弧菌及嗜水气单胞菌的生长具有明显抑制作用。 展开更多
关键词 斑节对虾 抗菌肽 PmALF-like基因 组织表达 功能分析
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