稻曲病菌一种新型真菌病毒UvBV7的分子特征

为了挖掘稻曲病菌中的真菌病毒资源,深入解析新型真菌病毒基因组结构与功能的关系,以分离自海南省的一株表型异常的稻曲病菌菌株Uv321为研究对象,在前期宏转录组数据的基础上,鉴定该菌株中存在的新型真菌病毒的种类,并围绕着该新型真菌病毒开展了一系列的研究。结果表明,在菌株Uv321中鉴定到一种新型真菌病毒,命名为Ustilaginoidea virens botourmiavirus 7(UvBV7)。UvBV7基因组为正单链RNA(+ssRNA),全长2406 nt,GC含量为53.78%,包含一个编码RNA依赖的RNA聚合酶(RdRP)的开放阅读框(ORF),该ORF编码643个氨基酸,分子量约为72.727 ku。病毒末端二级结构预测表明,UvBV7的5′和3′末端的碱基均互补配对,形成发夹结构。BlastP比对表明,UvBV7与隶属于葡萄孢欧尔密病毒科、Botoulivirus病毒属的病毒Erysiphe necator associated ourmia-like virus 72有着最高的相似度,但仅为44.52%。基于UvBV7及其他相似病毒的RdRP序列的多重比对结果表明,UvBV7与葡萄孢欧尔密病毒科成员的RdRP氨基酸序列存在8个保守结构域,并在第Ⅵ保守结构域中发现GDD基序,这是病毒RdRP蛋白典型的高度保守核心基序;基于病毒RdRP氨基酸序列构建的系统发育树的结果也表明,UvBV7与隶属于Botoulivirus属的成员聚集成一簇。因此,UvBV7是隶属于葡萄孢欧尔密病毒科、Botoulivirus属的一种新型真菌病毒。稻曲病菌不同菌株的对峙培养结果表明,UvBV7可在营养体亲和的菌丝间进行水平传播,但菌丝尖端-利巴韦林法、高温-利巴韦林法和原生质体再生-利巴韦林法处理均不能将菌株Uv321中的真菌病毒UvBV7脱除。综上所述,本研究不仅丰富了稻曲病菌中真菌病毒的多样性,也为稻曲病的生物防治提供了潜在的低毒力生防因子。

马铃薯种苗复合感染病毒多重RT-PCR同步快速检测

基于马铃薯病毒ssRNA的快速制备方法,根据马铃薯病毒CP基因序列设计PVX、PVS、PVY和PLRV特异性引物对、P1基因序列设计PVA特异性引物对,建立了多重RT-PCR快速检测体系,可以同步检出复合侵染马铃薯种苗主要病毒,灵敏度比传统的ELISA至少高100倍.结合生物活性稳定剂研制的固相化检测试剂盒,已用于四川和重庆等省区的15个县市田间与苗圃248个马铃薯显症或无症样品的实际检测,表明四川和重庆地区2～3种马铃薯病毒往往复合侵染(PVX、PVA和PVS三种病毒复合侵染或PLRV和PVY二种病毒复合侵染).

TLR7在结核分枝杆菌感染中的作用研究

目的将TLR7激活基序ssRNA加入结核分枝杆菌感染的小鼠巨噬细胞,研究TLR7被激活后在结核分枝杆菌感染中的作用。方法结核分枝杆菌感染RAW264.7细胞,感染后加入化学合成的TLR7激活基序ssRNA,RT-PCR法检测感染不同时间之后细胞对细菌的吞噬率;无菌TritonX-100裂解细胞,罗氏培养基培养计数活细菌;电镜观察细胞内自噬小体;ELISA检测细胞上清中IL-12、TNF-α与IL-4的含量。结果感染3h后RAW264.7细胞吞噬率最高(P>0.05);处理3h后电镜观察,ssRNA组细胞状态明显好于对照组;36h后ssRNA组IL-12(P<0.05)、IL-4(P<0.05)水平高于对照组,细胞内活菌数量ssRNA组低于对照组(P<0.05),48h后IL-4(P<0.05)水平下降,TNF-α的含量上升(P<0.05)。结论TLR7能通过诱导细胞自噬、调节细胞因子产生等机制增强细胞杀结核分枝杆菌的能力,TLR7激活基序ssRNA可以用于治疗结核分枝杆菌感染。

AmpliDet RNA技术

随着分子生物学发展 ,核酸实时定量检测已成为人们研究的热点问题。分子标灯与NASBA结合实时检测ssRNA发展成为一种新技术 ,称为AmpliDetRNA。就NASBA扩增原理。

一种适合于马铃薯病毒ssRNA快速提取技术

针对马铃薯病毒ssRNA制样过程中产生色素、多酚物质抑制RT PCR反应的问题 ,通过确定多酚氧化酶抑制剂Na2 SO3 的最适浓度 ,筛选核酸快速浸提的表面活性剂 ,研制出马铃薯病毒简易浸提制样技术 ,可以从植物组织中快速释放ssRNA并减少PCR反应抑制物质的析出。此法简便有效 ,可以从马铃薯叶片 ,叶柄 ,茎和块茎中快速提取PVY、PVX ,PLRV、PVA、PVS等多种马铃薯病毒ssRNA 。

Toll样受体7介导的抗病毒天然免疫反应研究进展

概述了Toll样受体(TLRs)的发现、种类及其作用模式,重点介绍了TLR7的分子结构、组织分布、识别的配体以及依赖MyD88接头分子的信号转导通路,最后,综述了TLR7介导的抗病毒效应的研究进展。提出,对TLR7及其作用机制的研究必将有助于新型动物用疫苗的创制。

A versatile building block:the structures and functions of negative-sense single-stranded RNA virus nucleocapsid proteins

Nucleocapsid protein(NPs)of negative-sense single-stranded RNA(-ssRNA)viruses function in different stages of viral replication,transcription,and maturation.Structural investigations show that-ssRNA viruses that encode NPs preliminarily serve as structural building blocks that encapsidate and protect the viral genomic RNA and mediate the interaction between genomic RNA and RNA-dependent RNA polymerase.However,recent structural results have revealed other bio-logical functions of-ssRNA viruses that extend our understanding of the versatile roles of virally encoded NPs.