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生物信息学技术分析lncRNA USP30-AS1与卵巢浆液性囊腺癌免疫细胞浸润的相关性
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作者 王海燕 黄守国 +2 位作者 蒙秋 张静 魏莉 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期834-840,共7页
目的 研究卵巢浆液性囊腺癌(OSC)中长链非编码RNA泛素特异性蛋白酶30-反义RNA 1(USP30-AS1)的表达及其与免疫浸润的关系,并确定其在OSC中的预后作用。方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库检索了384名OSC患者的USP30-AS1表达和临床信息... 目的 研究卵巢浆液性囊腺癌(OSC)中长链非编码RNA泛素特异性蛋白酶30-反义RNA 1(USP30-AS1)的表达及其与免疫浸润的关系,并确定其在OSC中的预后作用。方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库检索了384名OSC患者的USP30-AS1表达和临床信息。Wilcoxon秩和检验用于比较OSC和正常卵巢组织中USP30-AS1的表达。采用逻辑回归分析临床病理特征与USP30-AS1的关系,进行基因集富集分析(GSEA)和单样本基因集富集分析(ssGSEA)以研究富集途径和功能,并量化USP30-AS1的免疫细胞浸润程度。根据长链非编码RNA (lncRNA) USP30-AS1的表达情况,根据表达均值将样本分为高表达组和低表达组。采用对数秩检验、单变量和多变量比例风险回归模型(Cox)用于比较不同USP30-AS1表达组之间的预后差异,lncRNA USP30-AS1的表达对其他基因组的影响也据此分析。结果 USP30-AS1高表达与肿瘤国际妇产科协会(FIGO)分期显著相关。多变量生存分析表明,USP30-AS1表达水平是OSC独立预后标志物。GSEA数据显示USP30-AS1高表达可能激活程序性细胞死亡蛋白1(PD-1)信号转导、细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA4)通路、 B细胞受体信号通路、细胞凋亡、成纤维细胞生长因子受体(FGFR)信号通路,以及Janus激酶/信号转导子与转录激活子(JAK/STAT)信号通路。USP30-AS1表达与免疫细胞浸润呈负相关,包括B细胞、 CD4^(+)T细胞、树突状细胞、 CD8^(+)T细胞和中性粒细胞。结论 USP30-AS1有可能作为预测OSC预后的分子标志物。 展开更多
关键词 生物标志物 长链非编码RNA泛素特异性蛋白酶30-反义RNA 1(usp30-as1) 卵巢浆液性囊腺癌 预后
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MicroRNA-137-5p靶向USP30改善阿尔茨海默病
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作者 姜扬 卞威 +5 位作者 刘婷 隋轶 任莉 曹晓攀 肖莹 徐冰 《河北医药》 CAS 2024年第19期2898-2903,共6页
目的 探索miR-137-5p对阿尔茨海默病(AD)的保护机制。方法 首先用qRT-PCR评估AD患者和健康对照组人血清中miR-137和USP30的表达。用D-半乳糖和氯化铝建立AD小鼠模型,用水迷宫试验检测小鼠的行为,确认AD小鼠模型的成功。用Aβ1-42寡聚体... 目的 探索miR-137-5p对阿尔茨海默病(AD)的保护机制。方法 首先用qRT-PCR评估AD患者和健康对照组人血清中miR-137和USP30的表达。用D-半乳糖和氯化铝建立AD小鼠模型,用水迷宫试验检测小鼠的行为,确认AD小鼠模型的成功。用Aβ1-42寡聚体诱导的SH-SY5Y细胞建立AD细胞模型,通过实时定量聚合酶链反应检测AD模型中miR-137-5p和USP30的表达。双重荧光素酶试验用于验证miR-137-5p和USP30之间的靶向结合关系。结果 miR-137-5p的表达在AD患者中与健康对照组相比有所下降(P<0.05),而USP30则明显增加(P<0.05)。miR-137-5p能改善AD细胞模型中的细胞凋亡,USP30的过表达部分废除了miR-137-5p对Aβ1-42-处理的SH-SY5Y细胞的影响,miR-137-5p通过靶向USP30改善AD小鼠的认知能力和Aβ的沉积。结论 miR-137-5p可以通过下调USP30来改善AD症状,miR-137-5p可能能成为治疗AD的一个靶点。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 miR-137-5p usp30 1-42
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NPHP3-AS1通过调控miR-30a-5p影响缺氧诱导的心肌细胞增殖及凋亡的研究 被引量:3
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作者 王苗 王裕岱 +4 位作者 黄玉冰 陈芬 王圣 李斌 董小莉 《中国循证心血管医学杂志》 2020年第8期918-922,926,共6页
目的探讨长链非编码RNA(LncRNA NPHP3-AS1)对缺氧诱导的心肌细胞增殖及凋亡的影响,及其对微小RNA-30a-5p(miR-30a-5p)的调控作用。方法体外培养大鼠心肌细胞H9C2,缺氧处理心肌细胞建立细胞损伤模型,将缺氧处理的心肌细胞作为模型组。同... 目的探讨长链非编码RNA(LncRNA NPHP3-AS1)对缺氧诱导的心肌细胞增殖及凋亡的影响,及其对微小RNA-30a-5p(miR-30a-5p)的调控作用。方法体外培养大鼠心肌细胞H9C2,缺氧处理心肌细胞建立细胞损伤模型,将缺氧处理的心肌细胞作为模型组。同时将正常培养的心肌细胞作为对照组。分别将si-NC、si-NPHP3-AS1、anti-miR-30a-5p、si-NPHP3-AS1与anti-miR-30a-5p转染至心肌细胞,随后进行缺氧处理,分别记作模型组+si-NC组、模型组+si-NPHP3-AS1组、模型组+anti-miR-30a-5p组、模型组+si-NPHP3-AS1+anti-miR-30a-5p组。实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测NPHP3-AS1、miR-30a-5p的表达量;应用流式细胞仪检测细胞周期及细胞凋亡率;双荧光素酶报告实验验证NPHP3-AS1、miR-30a-5p的靶向结合关系;蛋白免疫印迹法(Western blot)检测半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶3(Caspase3)、增殖标记蛋白细胞增殖核抗原67(Ki67)的表达量。结果缺氧处理后,心肌细胞中NPHP3-AS1的表达量显著升高,G0-G1期细胞比例显著升高,S期细胞比例显著降低,细胞凋亡率显著升高,Caspase3蛋白水平显著升高,Ki67蛋白水平显著降低(P均<0.05);干扰NPHP3-AS1的表达后,G0-G1期细胞比例显著降低,S期细胞比例显著升高,细胞凋亡率显著降低,Caspase3蛋白水平显著降低,Ki67蛋白水平显著升高(P均<0.05);双荧光素酶报告实验证实NPHP3-AS1可靶向结合miR-30a-5p;干扰miR-30a-5p能减弱干扰NPHP3-AS1对缺氧诱导的心肌细胞增殖及凋亡的作用。结论干扰NPHP3-AS1可能通过上调miR-30a-5p的表达从而促进缺氧诱导的心肌细胞增殖及抑制细胞凋亡。 展开更多
关键词 LncRNA NPHP3-as1 miR-30a-5p 缺氧 心肌细胞
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lncRNA RAB30-AS1对宫颈癌Hela细胞增殖和凋亡影响的机制研究
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作者 万淑琼 鲍群丽 +3 位作者 黄耿 姜艳萍 张青冬 王楚平 《国际医药卫生导报》 2021年第20期3139-3143,共5页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)RAB30-AS1对宫颈癌Hela细胞增殖和凋亡的影响。方法体外培养宫颈癌Hela细胞,分别转染pcDNA-NC(NC组)和pcDNA-RAB30-AS1(RAB30-AS1组),采用荧光定量PCR(qRT-PCR)检测转染效率。通过Edu试验和流式细胞术检... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)RAB30-AS1对宫颈癌Hela细胞增殖和凋亡的影响。方法体外培养宫颈癌Hela细胞,分别转染pcDNA-NC(NC组)和pcDNA-RAB30-AS1(RAB30-AS1组),采用荧光定量PCR(qRT-PCR)检测转染效率。通过Edu试验和流式细胞术检测细胞增殖能力和凋亡能力的改变。qRT-PCR和蛋白质印迹法(Westernblot)检测磷脂酰肌醇蛋白聚糖-5(GPC5)基因的表达。结果NC组和RAB30-AS1组Hela细胞中RAB30-AS1的表达分别为(1.34±0.27)和(8.90±1.60),NC组RAB30-AS1表达明显低于RAB30-AS1组(P<0.01)。NC组和RAB30-AS1组Hela细胞增殖率分别为(41.82±2.86)%和(20.85±3.82)%,RAB30-AS1组细胞增殖率明显低于NC组(P<0.01)。NC组和RAB30-AS1组Hela细胞凋亡率分别为(12.61±1.96)%和(32.19±4.29)%,RAB30-AS1组细胞凋亡率明显高于NC组(P<0.01)。与NC组相比,RAB30-AS1组Hela细胞中GPC5基因表达显著增加(P<0.01)。结论RAB30-AS1过表达能够抑制宫颈癌Hela细胞的增殖、诱导细胞凋亡,其机制可能与促进GPC5基因表达有关。 展开更多
关键词 宫颈癌 RAB30-as1 磷脂酰肌醇蛋白聚糖-5 增殖 凋亡
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TPT1-AS1靶向miR-30c对肺癌细胞发生发展的影响
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作者 符国奋 梁海梅 +2 位作者 王志峰 颜洪顺 符之月 《河北医药》 CAS 2021年第12期1770-1774,共5页
目的探讨TPT1-AS1对肺癌细胞发生发展的影响及分子机制。方法选取肺癌及癌旁组织标本,将pcDNA3.1、pcDNA3.1-TPT1-AS1、anti-miR-NC、anti-miR-30c分别转染至A549细胞中,记为pcDNA3.1组、pcDNA3.1-TPT1-AS1组、anti-miR-NC组、anti-miR-... 目的探讨TPT1-AS1对肺癌细胞发生发展的影响及分子机制。方法选取肺癌及癌旁组织标本,将pcDNA3.1、pcDNA3.1-TPT1-AS1、anti-miR-NC、anti-miR-30c分别转染至A549细胞中,记为pcDNA3.1组、pcDNA3.1-TPT1-AS1组、anti-miR-NC组、anti-miR-30c组。实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测TPT1-AS1和miR-30c表达水平;流式细胞仪检测各细胞周期细胞比例;克隆形成实验检测细胞克隆形成数;蛋白质印迹(Western blot)法检测细胞增殖核抗原Ki67(Ki67)、上皮钙粘蛋白(E-cadherin)、神经钙粘蛋白(N-cadherin)蛋白表达;Transwell检测细胞迁移;荧光素酶报告实验检测TPT1-AS1对miR-30c的靶向调控。结果肺癌组织中TPT1-AS1高表达(P<0.05)。过表达TPT1-AS1或抑制miR-30c表达,G0期细胞所占比例显著降低,S期细胞所占比例显著升高(P<0.05),G2期细胞所占比例差异无统计学意义(P>0.05);细胞克隆形成数显著升高,迁移细胞数显著升高,Ki67、N-cadherin表达水平显著升高,E-cadherin表达水平显著降低(P<0.05)。TPT1-AS1靶向调控miR-30c。结论过表达TPT1-AS1可能通过下调miR-30c促进肺癌细胞从G0期到S期转化,促进细胞的克隆形成和迁移。 展开更多
关键词 TPT1-as1 miR-30c 肺癌 增殖 迁移
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下调lncRNA OIP5-AS1可通过miR-217/USP7轴抑制肝癌细胞EMT及侵袭迁移 被引量:1
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作者 刘星 刘小梯 +1 位作者 符秋红 陈学东 《邵阳学院学报(自然科学版)》 2022年第3期94-103,共10页
目的探究lncRNA OIP5-AS1/miR-217/USP7分子轴对肝癌细胞EMT和侵袭迁移的调控作用。方法选取正常肝细胞HL-7702和肝癌细胞系(MHCC97H,Hep3B,HepG2和HCCLM3),实时荧光定量PCR法检测正常肝细胞和肝癌细胞系中lncRNA OIP5-AS1的表达水平,Tr... 目的探究lncRNA OIP5-AS1/miR-217/USP7分子轴对肝癌细胞EMT和侵袭迁移的调控作用。方法选取正常肝细胞HL-7702和肝癌细胞系(MHCC97H,Hep3B,HepG2和HCCLM3),实时荧光定量PCR法检测正常肝细胞和肝癌细胞系中lncRNA OIP5-AS1的表达水平,Transwell实验检测肝癌细胞在下调lncRNA OIP5-AS1的表达后其侵袭和迁移能力的变化,蛋白质印迹实验检测上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关蛋白E-cadherin,N-cadherin和Vimentin的表达情况。通过生物信息学方法和双荧光素酶报告基因实验预测并验证lncRNA OIP5-AS1、miR-217和USP7的靶向关系,蛋白质印迹和Transwell实验检测LncRNA OIP5-AS1/miR-217/USP7分子轴对肝癌细胞EMT和侵袭迁移能力的影响。结果lncRNA OIP5-AS1在肝癌细胞系中均明显高表达(P<0.05或P<0.01)。下调肝癌细胞中lncRNA OIP5-AS1的表达可明显抑制肝癌细胞EMT及侵袭迁移(P<0.05);lncRNA OIP5-AS1靶向结合miR-217,且USP7是miR-217的靶基因(P<0.05);进一步研究证实,IncRNA OIP5-AS1通过miR-217上调USP7的表达水平,从而促进肝癌细胞的EMT和侵袭迁移(P<0.05或P<0.01)。结论IncRNA OIP5-AS1通过靶向miR-217/USP7分子轴促进肝癌细胞的EMT和侵袭迁移。 展开更多
关键词 肝癌 lncRNA OIP5-as1 miR-217 usp7 侵袭迁移 上皮-间质转化(EMT)
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miRNA-137-5p improves spatial memory and cognition in Alzheimer's mice by targeting ubiquitin-specific peptidase 30 被引量:1
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作者 Yang Jiang Wei Bian +5 位作者 Jing Chen Xiaopan Cao ChunYao Dong Ying Xiao Bing Xu XiaoHong Sun 《Animal Models and Experimental Medicine》 CAS CSCD 2023年第6期526-536,共11页
Background:Alzheimer’sdisease(AD)is a prevalent neurodegenerative disorder causing progressive dementia.Research suggests that microRNAs(miRNAs)could serve as biomarkers and therapeutic targets for AD.Reduced levels ... Background:Alzheimer’sdisease(AD)is a prevalent neurodegenerative disorder causing progressive dementia.Research suggests that microRNAs(miRNAs)could serve as biomarkers and therapeutic targets for AD.Reduced levels of miR-137 have been observed in the brains of AD patients,but its specific role and down stream mechanisms remain unclear.This study sought to examine the therapeutic potential of miR-137-5p agomir in alleviating cognitive dysfunction induced in AD models and explore its potential mechanisms.Methods:This study utilized bioinformatic analysis and a dual-l uciferase reporter assay to investigate the relationship between miR-137-5p and ubiquitin-specific peptidase 30(USP30).In vitro experiments were conducted using SH-SY5Y cells to assess the impact of miR-137-5p on Aβ1-42 neurotoxicity.In vivo experiments on AD mice evaluated the effects of miR-137-5p on cognition,Aβ1-42 deposition,Tau hyperphosphorylation,and neuronal apoptosis,as well as its influence on USP30 levels.Results:It was discovered that miR-137-5p mimics efficiently counteract Aβ1-42 neurotoxicity in SH-SY5Y cells,a protective effect that is negated by USP30 overexpression.In vivo experiments demonstrated that miR-137-5p enhances the cognition and mobility of AD mice,significantly reducing Aβ1-42 deposition,Tau hyperphosphorylation,and neuronal apoptosis within the hippocampus and cortex regions.Mechanistically,miR-137-5p significantly suppresses USP30 levels in mice,though USP30 overexpression partially buffers against miR-137-5p-i nduced AD symptom improvement.Conclusion:Our study proposes that miR-137-5p,by instigating the downregulation of USP30,has the potential to act as a novel and promising therapeutic target for AD. 展开更多
关键词 Alzheimer's disease 1-42 miR-137-5p usp30
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miR-30b在子宫内膜异位症中的表达及功能研究 被引量:1
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作者 黄敏 徐超逸 +3 位作者 陈海燕 朱旦华 梁宗文 段萍 《中国现代医生》 2022年第4期35-39,43,F0003,共7页
目的检测miR-30b在子宫内膜异位症中的表达水平,并探究miR-30b对子宫内膜异位症的治疗作用。方法2018年7月至2020年7月在温州医科大学附属第二医院手术获取的27例子宫内膜异位症患者病理组织为子宫内膜异位症组,15例子宫肌瘤患者子宫内... 目的检测miR-30b在子宫内膜异位症中的表达水平,并探究miR-30b对子宫内膜异位症的治疗作用。方法2018年7月至2020年7月在温州医科大学附属第二医院手术获取的27例子宫内膜异位症患者病理组织为子宫内膜异位症组,15例子宫肌瘤患者子宫内膜组织为正常子宫内膜组。实时定量PCR(qRT-PCR)检测组织中miR-30b的表达量。培养人原代子宫内膜间质细胞(HESCs),5-乙炔基-2′-脱氧尿苷掺入(EdU)法来检测miR-30b对细胞增殖能力的影响。根据starBase 2.0软件预测与miR-30b相互作用的长链非编码RNA(lncRNA),使用qRT-PCR初步验证该lncRNA在异位内膜中的表达量及与miR-30b的相互关系。进一步建造子宫内膜异位症SD大鼠模型,在活体实验水平,使用miR-30b的模拟物来验证miR-30b对子宫内膜异位症异位囊肿的治疗作用。结果与正常子宫内膜(EN)相比,miR-30b在子宫内膜异位症(EC)中的表达显著下降。miR-30b的外源性过表达抑制了HESCs的增殖能力,同时,下调miR-30b的表达量可促进HESCs的增殖能力。StarBase 2.0软件预测lncRNA OIP5-AS1与miR-30b有多个结合位点,与正常内膜比较,lncRNA OIP5-AS1在异位内膜中表达上调,且与miR-30b的表达量呈负相关。此外,在子宫内膜异位症的大鼠模型中,miR-30b模拟物显著抑制子宫内膜异位症异位囊肿的生长。结论miR-30b在异位子宫内膜中低表达且抑制HESCs的增殖能力,可能成为子宫内膜异位症潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 子宫内膜异位症 miR-30b lncRNA OIP5-as1 增殖 SD大鼠
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宝马FYT30—A1型鸿运扇电气控制原理与故障检修
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作者 詹新生 《家电检修技术》 2002年第8期39-39,共1页
电气控制原理如图1所示。把定时器开关拨到开位置或设置某一定时时间,调整开关放在合适的档位,风扇电机旋转。闭合同步电机开关,同步电机转动带动转页盘,送出柔和的风。有的鸿运扇还在电源线中串一安全开关。
关键词 宝马FYT30-a1型 鸿运扇 电气控制原理 故障 检修
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Systematic identification of wheat spike developmental regulators by integrated multiomics, transcriptional network, GWAS, and genetic analyses 被引量:2
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作者 Xuelei Lin Yongxin Xu +13 位作者 Dongzhi Wang Yiman Yang Xiaoyu Zhang Xiaomin Bie Lixuan Gui Zhongxu Chen Yiliang Ding Long Mao Xueyong Zhang Fei Lu Xiansheng Zhang Cristobal Uauyo Xiangdong Fu Jun Xiao 《Molecular Plant》 SCIE CSCD 2024年第3期438-459,共22页
The spike architecture of wheat plays a crucial role in determining grain number,making it a key trait for optimization in wheat breeding programs.In this study,we used a multi-omic approach to analyze the transcripto... The spike architecture of wheat plays a crucial role in determining grain number,making it a key trait for optimization in wheat breeding programs.In this study,we used a multi-omic approach to analyze the transcriptome and epigenome profiles of the young spike at eight developmental stages,revealing co-ordinated changes in chromatin accessibility and H3K27me3 abundance during the flowering transition.We constructed a core transcriptional regulatory network(TRN)that drives wheat spike formation and experimentally validated a multi-layer regulatorymodule involving TaSPL15,TaAGLG1,and TaFUL2.By integrating the TRN with genome-wide association studies,we identified 227 transcription factors,including 42 with known functions and 185 with unknown functions.Further investigation of 61 novel transcription factors using multiple homozygous mutant lines revealed 36 transcription factors that regulate spike architecture or flowering time,such as TaMYC2-A1,TaMYB30-A1,and TaWRKY37-A1.Of particular interest,TaMYB30-A1,downstream of and repressed by WFzP,was found to regulate fertile spikelet number.Notably,the excellent haplotype of TaMYB30-A1,which contains a C allele at the WFzP binding site,was enriched during wheat breeding improvement in China,leading to improved agronomic traits.Finally,we constructed a free and open access Wheat Spike Multi-Omic Database(http://39.98.48.156:8800/#/).Our study identifies novel and high-confidence regulators and offers an effective strategy for dissecting the genetic basis of wheat spike development,with practical value forwheat breeding. 展开更多
关键词 wheat spike development EPIGENOME TRN TaMYB30-a1 breeding selection
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