STR和SNP对3个小鼠1号染色体替换系筛选结果的比较

目的比较STR和SNP对3个1号染色体替换系的分型结果，并为每个替换系选择合适的基因分型方法。方法采用20个SNP和10个STR位点分别对3个1号染色体替换系N2代各40个样本进行分型。结果采用20个SNP位点，从C3H／He替换系中筛选到6个样本，从FVB／N替换系中筛选到9个样本，从AKR替换系中筛选到4个样本。采用10个STR位点，从C3H／He替换系中筛选到6个样本，从FVB／N替换系中筛选到10个样本，从AKR替换系中筛选到6个样本。结论根据每个品系基因组背景不同，可选择三组多重STR方案作为C3H／He替换系的基因分型方法，三组多重SNP方案作为FVB／N和AKR替换系的基因分型方法。