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蜡状芽孢杆菌ATCC 10987基因组蛋白质编码基因的重新注释与分析
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作者 林岩 《天津理工大学学报》 2007年第4期10-14,共5页
蜡状芽胞杆菌ATCC 10987对于细菌比较基因组学的研究有重要意义.但其染色体中基因的数目被RefSeq注释为5 603个,这个注释是有疑问的.本文采用Zcurve和Glimmer程序联合打分的方法来识别其蛋白质编码基因.为保证预测结果的可靠性,对联合... 蜡状芽胞杆菌ATCC 10987对于细菌比较基因组学的研究有重要意义.但其染色体中基因的数目被RefSeq注释为5 603个,这个注释是有疑问的.本文采用Zcurve和Glimmer程序联合打分的方法来识别其蛋白质编码基因.为保证预测结果的可靠性,对联合判别附加预测的基因使用了BLAST方法进行数据库同源性搜索.结果,蜡状芽胞杆菌ATCC 10987基因组中的蛋白质编码基因的数目被重新确定为5 180个.这个数目明显低于原始注释的数目,并且一些指标表明新的注释更为可信.这些相对正确的基因集合为该细菌亲缘物种的深入研究提供了基础. 展开更多
关键词 蜡状芽孢杆菌ATCC 10987 细菌基因组 比较基因组学 蛋白质编码基因
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