应用噬菌体展示随机12肽库筛选诺如病毒抗原模拟表位

目的:利用Ph.D.-12噬菌体展示肽库筛选诺如病毒(NoV)的抗原模拟表位。方法:包被与GⅡ.4、GⅡ.6、GⅡ.17型NoV具有高特异性及中和能力较强的单链可变片段抗体(scFv),用Ph.D.-12噬菌体展示肽库进行3轮生物淘选。ELISA鉴定淘选所得噬菌体与scFv的结合活性及其与NoV P蛋白的竞争作用;阳性克隆测序后进行生物信息学分析,合成多肽鉴定其抗原性。结果:发现1段与GⅡ.6 VP1区同源性较高的氨基酸序列“MG-D-W”,综合分析提示其可能为GⅡ.6 NoV的抗原模拟表位,且合成的包含“MG-D-W”的多肽可竞争抑制P蛋白与人类组织血型抗原(HBGAs)受体的结合。结论:“MG-DW”是与NoV单链抗体高亲和力的肽段,可能模拟了GⅡ.6 NoV与scFv结合的抗原表位。

高产优质抗病棉花品种中棉所12号细菌人工染色体(BAC)文库构建

中棉所12号是我国自育的高产、优质、抗枯萎病、耐黄萎病棉花品种,其重要创新是使抗性和产量、品质得到结合改良和提高。本研究以plndigoBAC-5为载体,对中棉所12号进行了细菌人工染色体(BAC)文库构建。初步建立的文库含有38800个克隆,覆盖2倍基因组。对文库中132个重组克隆的分析表明:插入片段为50～150kb,平均大小为120kb;大于100kb的克隆占87 7%,大于110kb的克隆占56%;空载率小于1%。该文库的构建为深入开展棉花基因组有关研究奠定了基础。

水稻中与盐碱适应性相关的VB_(12)不依赖型蛋氨酸合成酶基因的克隆和表达(英文)

VB12 不依赖型蛋氨酸合成酶广泛存在于高等植物中 ,它可催化高半光氨酸甲基化而生成蛋氨酸 ,为生物体内的甲基化反应和多胺、乙烯的合成提供中间产物。以水稻品种日本晴为材料 ,在碱性条件下利用cDNA RAPD法 ,在水稻中首次报道了VB12 不依赖型蛋氨酸合成酶基因的克隆和表达。结果表明 ,VB12 不依赖型蛋氨酸合成酶cDNA基因全长为 2 74 0bp ,在水稻基因组中以单或低拷贝存在 ,编码 76 5个氨基酸 ,与Mesembryanthemumcystallinum(U84 889)和Cathararanthusroseus (X83499)的同源性分别为 92 %和 83%。水稻在受到碳酸钠胁迫 12h和 2 4h后 ,其转录较氯化钠明显增强 ,而到 4 8h后下降 ,暗示它可能与水稻的盐碱适应性有关。

应用噬菌体随机12肽库筛选TβR Ⅱ特异性序列

目的从噬菌体随机12肽库中筛选TGF-β1Ⅱ型受体(TGF-beta receptorⅡ,TβRⅡ)的特异性序列,评估其对瘢痕疙瘩成纤维细胞的作用。方法以人TGF-β1单克隆抗体为靶,在噬菌体随机12肽库中进行4轮生物筛选;应用ELISA法挑选结合活性较好的单克隆噬菌体,进行DNA序列分析;MTT法评估TGF-β1单克隆噬菌体对瘢痕疙瘩成纤维细胞的生物学效应。结果测序共获得5种类似于TβRⅡ的特异性序列。MTT结果显示其中有3种噬菌体模拟肽能够抑制瘢痕疙瘩成纤维细胞增殖。结论具有TβRⅡ特异性序列的噬菌体模拟肽能够抑制瘢痕疙瘩成纤维细胞增殖。

幽门螺杆菌基因克隆表达及其抗原表位分析

目的克隆表达幽门螺杆菌基因hp0410,构建12肽噬菌体展示库,对hp0410的抗原表位进行筛选和分析,为构建多表位嵌合疫苗提供理论依据。方法从幽门螺杆菌NCTC11639基因组DNA中扩增出hp0410,并克隆入pGEX-4T-1中表达。利用纯化重组蛋白筛选出特异性单抗E018,利用该单抗和M13噬菌体12肽随机肽库,构建HP0410抗原表位的抗原展示库。竞争-抑制实验验证获得的阳性噬菌体并测序,生物信息学分析HP0410的抗原表位。结果成功构建可高水平分泌型表达HP0410的原核表达系统。对13株阳性噬菌体测序后获得8个表位,其中候选表位1个。HP0410可有效抑制展示该表位的噬菌体与单抗E018结合。分析表明,获得的8个表位与HP0410同源性不高,但处于生物信息学预测的区域。结论获得8个HP0410高抗原性区域的模拟表位,其中1个为模拟单抗E018特异性结合的抗原决定基的候选表位。

日本血吸虫细胞免疫原模拟表位的筛选及初步鉴定

目的从噬菌体随机12肽库中筛选日本血吸虫(Schistosoma japonicum,S.j)具有保护性的细胞免疫原模拟表位,为进一步阐明其免疫保护性分子机制提供依据。方法用具有保护性的S.j12d童虫培养细胞(S.jC-12)免疫鼠血清中的IgG对随机12肽库作亲和筛选,随机挑取20个噬菌体克隆用ELISA检测其特异性;对阳性克隆进行测序,采用ELISA和Western blot检测阳性克隆免疫鼠血清中的特异性抗体及其识别天然抗原的特性。结果经过4轮免疫淘洗,洗脱的噬菌体得到了有效富集(16 250倍)。20个噬菌体克隆经检测有15个能被S.jC-12免疫鼠血清识别,有12个序列不同的噬菌体克隆;ELISA检测显示有11个阳性噬菌体克隆诱导小鼠产生IgG应答,其中含精氨酸的阳性噬菌体克隆免疫血清中IgG水平与不含精氨酸克隆免疫鼠比较差异有统计学意义(P<0.01)。结论利用噬菌体展示技术可筛选出S.jC-12免疫原的部分模拟表位且能在小鼠模型中诱导免疫应答。

噬菌体随机十二肽库淘选三水白虎汤作用于类风湿关节炎滑膜细胞的靶点研究

目的:利用噬菌体随机十二肽库淘选出与三水白虎汤(SSBH)作用的类风湿关节炎滑膜成纤维细胞(RASFs)特异性结合的多肽,寻找SSBH治疗类风湿关节炎的蛋白靶点。方法:以SSBH处理过的RASFs为靶细胞,生理盐水(NS)处理的RASFs为吸附细胞,全细胞差减筛选法对噬菌体十二肽库进行3轮淘选,挑取单克隆、扩增纯化噬菌体,并初步鉴定噬菌体克隆的亲和力,阳性克隆测序后进行生物学分析。结果:3轮淘选后,随机挑选32个噬菌体克隆进行DNA序列分析,展示SGVYKVAYDWQH十二肽的噬菌体被富集约为56%(18/32)。结论:从噬菌体肽库筛选到SSBH作用RASFs的特异性结合短肽,并分析出相关作用蛋白。

“故事天地”：儿童数字图书馆评析

被美国图书馆协会授予面向儿童的优秀网站＂故事天地＂儿童数字图书馆,由美国北卡州夏洛特和梅克伦堡县公共图书馆创建,集多媒体动画故事、交互性活动、儿童手工活动和阅读书目等教育性、娱乐性和参与性项目为一体.这是一个将传统儿童图书馆服务和互联网交互性本质相结合的服务站点创新尝试.文章对该数字图书馆的背景、设计理念、资源组织、服务提供、技术特征、特点和局限等方面进行了评述.

立体仓库PLC控制系统设计

立体仓库PLC控制装置由底盘、三列四行十二层仓位库体、巷道堆垛机、检测元件及电气控制元件组成。其设计思路包括硬件设计与软件设计两部分。在PLC软硬件设计完成后.对课题设计的立体仓库模型进行了调试,来验证其设计的可行性。

噬菌体肽库筛选转化生长因子βⅡ型受体亲和肽

目的:从噬菌体随机肽库中筛选转化生长因子β(TGF-β)Ⅱ型受体的亲和短肽。方法:以重组可溶性人TGF-βⅡ型受体作为靶标,应用噬菌体随机十二肽库进行筛选,经过3轮淘选,提取阳性噬菌体克隆ssDNA,测序并进行序列分析。结果:通过筛选噬菌体获得富集,挑选10个能与人TGF-βⅡ型受体特异性结合的噬菌体克隆,测序得到4个核酸序列,未发现共有保守序列。结论:通过噬菌体肽库技术能筛选出与TGF-βⅡ型受体结合的噬菌体展示肽,为进一步研究TGF-βⅡ型受体亲和短肽及在抗肝纤维化中的作用提供依据。

基于抗原表位预测的MUC1模拟肽表位筛选

目的:预测粘蛋白1(Mucin1,MUC1)抗原的B细胞表位,从噬菌体随机多肽文库筛选及鉴定MUC1抗原的模拟表位。方法:对MUC1的二级结构及免疫原性进行分析,预测MUC1的抗原表位。利用纯化获得的Ma695抗体筛选噬菌体随机12肽库,夹心ELISA分析噬菌体克隆,测定阳性克隆DNA序列,竞争性抑制实验鉴定阳性噬菌体克隆。结果:MUC1存在有17个潜在的抗原表位区域。经3轮筛选,获得了14个阳性克隆,DNA序列分析并推导出其氨基酸序列:KHYDPFHHRMPQ,QADTARSVALAG,VPSKPDLHVRSI及MTPIHYWNHNRV;4个噬菌体展示肽克隆抑制率均在50%以上。结论:预测MUC1抗原B细胞表位,为进一步研究MUC1结构和功能奠定了基础。所得序列KHYDPFHHRMPQ,QADTARSVALAG,VPSKPDLHVRSI及MTPIHYWNHNRV能模拟MUC1抗原表位。

人泌尿系上皮肿瘤疫苗的初步研究

目的通过筛选噬菌体随机12肽库获得MUC1糖链抗原模拟表位。方法利用纯化获得的M a695抗体筛选噬菌体随机12肽库,通过夹心ELISA分析噬菌体克隆,测定阳性克隆DNA序列并进行同源性及氨基酸分析,竞争性抑制实验鉴定噬菌体克隆。结果经3轮筛选,获得了14个阳性克隆,DNA序列分析并推导出氨基酸序列:KHYDPFHHRMPQ,QADTARSVALAG,VPSKPDLHVRSI,MTPIHYWNHNRV。鉴定结果表明4个噬菌体展示肽克隆抑制率均在50%以上。结论所得序列KHYDPFH-HRMPQ,QADTARSVALAG,VPSKPDLHVRSI,及MTPIHYWNHNRV模拟了MUC1抗原表位。

P-糖蛋白结合肽的筛选及合成肽鉴定

目的筛选人膀胱癌P-糖蛋白特异性结合肽并合成鉴定。方法利用表达获得的P-糖蛋白胞外段融合蛋白为靶蛋白,采用酶联板法筛选噬菌体随机12肽库,化学合成该特异性肽序列,免疫细胞化学方法进行鉴定。结果从噬菌体随机肽库中筛选获得了与P-糖蛋白特异性结合的噬菌体阳性克隆,测序获得特异性结合肽序列。免疫细胞化学结果显示特异性合成肽可与耐药细胞BIU-87/ADM结合,而与敏感细胞BIU-87不结合。结论筛选获得的结合肽具有一定的亲和力,可与特定的肿瘤细胞结合,表现出一定的肿瘤特异性;P-糖蛋白结合肽的筛选,为人膀胱癌多药耐药的靶向治疗结论提供实验依据。

转化生长因子β1的关键序列筛选及鉴定

目的应用噬菌体随机12肽库,筛选转化生长因子β1(Transforming growth factor-beta1,TGF-β1)的关键序列,进行TGF-β1活性短肽的合成,并检测其与成纤维细胞的亲和力。方法以TGF-β1单克隆抗体为靶,筛选噬菌体随机12肽库,获得TGF-β1的特异性序列。进行序列比对分析,选择TGF-β1的关键序列。进行TGF-β1活性短肽的合成、纯化、修饰及免疫荧光标记。应用免疫荧光法检测TGF-β1活性短肽的成纤维细胞亲和力。结果筛选噬菌体随机12肽库,获得10个与TGF-β1相似的特异性序列。分析获得7个TGF-β1的关键序列。合成获得7个TGF-β1活性短肽,并纯化至98%,短肽的C端进行氨基化封闭,N端进行罗丹明激光染料标记。免疫荧光检测结果显示,1个TGF-β1活性短肽能够与成纤维细胞相结合。结论从噬菌体随机12肽库中筛选到TGF-β1的关键序列,1个TGF-β1活性短肽能够与成纤维细胞相结合,有望应用于促进创面愈合的相关研究。

利用十二肽库筛选心肌型脂肪酸结合蛋白特异性的亲和配体

采用噬菌体表面展示十二肽库对心肌型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)特异性亲和配体进行筛选,经3轮筛选及序列比对后得到一个酶联免疫测定分析(ELISA)检测阳性特征序列:W-P-N-H-H-M-L-H-K-R-W-P.对此序列进行肽合成,并标记上荧光标记物芘,经高效液相纯化、冻干及质谱确定其分子量后制成荧光肽探针检测急性心肌梗塞病人血样,结果均呈阳性.结果表明,所获得的肽探针具有较好的临床应用效果.

土质技术、岩石和水资源图书馆——面向多用户的高质量互动学习平台

土质技术、岩石工程和水资源图书馆（Geotechnical，Bock and Water Besource Library，GBOW）是美国NSFNSDL的子项目，是美国国家土木工程资源图书馆建设的第一阶段，该数字图书馆具有资源检索、基础研究、科普教育等多种功能。文章从资源组织、技术特征、服务特征、评价和建议等方面对土质技术、岩石工程和水资源图书馆做了概要的评述。

“SIMPLE Science”——基于图像的中小学简化科学教育数字图书馆

SIMPLEScience是一个通过利用图像处理及分析技术（IPA）辅助青少年学习的数字图书馆，通过提供图片信息、教学计划、课程活动使得图像处理和分析能够作为一种学习工具得以使用，同时也为教育工作者在教学过程中使用图像信息提供便利条件。文章对该项目的建设及现状进行了综合性的评析，包括项目概述、数字资源及组织、技术特征、服务特点等。

明清四卷本孟浩然集考论

在孟浩然集的版本史上,《孟浩然集》之由三卷本而四卷本、由分体编排而分类编排,均始于有明一代。明代现所存见之四卷本《孟浩然集》,其主要者有"十二家本""四家诗本""王孟集本"三种。通过具体的比勘与校核,表明这三种四卷本乃源出一途,即"十二家本"为其底本。而清代的《四库全书》本、《四部丛刊》本与《四库备要》本及《孟浩然集》四卷,也是源此"十二家本"。明清两朝的这些四卷本《孟浩然集》,由于皆属于一种版本系统,故其收诗数量、诗题次序、文本同异等,均具有惊人的相同性与一致性。

有机磷农药广谱抗原表位多肽的制备及应用

利用噬菌体展示技术,以广谱型单克隆抗体筛选十二肽噬菌体展示库,获得能够模拟有机磷类农药抗原表位的十二肽,建立了一种间接竞争ELISA方法用于检测多种有机磷类农药。结果表明,获得的特异性多肽氨基酸序列为HPAPDHSSQSHQ,呈现出较好的抗原性、亲水性及表面可及性,可广谱模拟有机磷农药抗原表位。所建立的间接ELISA方法对有机磷农药通用结构半抗原(BPB)的IC50和IC10分别为1.776μg/ml及0.358μg/ml,与对硫磷、蝇毒磷、乙拌磷、辛硫磷、喹硫磷和三唑磷的交叉反应率分别为58.74%、44.93%、52.03%、43.98%、36.82%和4.87%。建立的检测方法具有绿色、广谱、高效的特点,是一种新型有机磷类农药累积毒性检测技术。

乳腺癌原代细胞特异性多肽的筛选

目的利用噬菌体展示技术从噬菌体随机十二肽库中筛选出能够特异性结合乳腺癌原代细胞的噬菌体多肽。方法以乳腺正常细胞为减性筛选细胞、乳腺癌原代细胞为靶细胞,对从商业购买的噬菌体随机十二肽库进行筛选,选取富集后的单克隆噬菌体,ELISA鉴定阳性噬菌体的特异性及亲和力,扩增阳性噬菌体克隆并提取DNA,测序后进行比对。结果经过3轮筛选,噬菌体得到近100倍富集,随机挑选11株单克隆噬菌体,ELISA鉴定显示2号噬菌体对乳腺癌细胞具有较高特异性及亲和力,测序结果显示其表达的多肽序列为未知序列。结论利用噬菌体筛选技术成功筛选出能够特异性结合乳腺癌原代细胞的特异性多肽,为进一步合成多肽应用于靶向治疗乳腺癌奠定基础。