基于12S、16S和Cyt b基因部分序列的丽棘蜥系统发育分析

本文测定丽棘蜥12SRNA、16SRNA、Cyt b基因部分序列,并从GenBank中下载15种有鳞目动物的同源序列,以鳄目的2个种(Alligator sinensis和Cairman crocodilus)作为外群,构建MP、NJ和ML分子系统树,探讨它们的系统发育关系。MP、NJ和ML分子系统树聚类的结果显示:蛇蜥亚目、壁虎亚目、蚓蜥亚目、石龙子亚目和鬣蜥亚目能够完全分开,蛇亚目和蜥蜴亚目在有鳞目中为姐妹支关系。

0～6月龄不同排便频率健康婴儿的肠道菌群构成分析

目的分析0～6月龄健康婴儿不同排便频率的肠道菌群构成差异。方法收集25例0～6月龄健康婴儿粪便,采用16S RNA基因测序技术检测肠道菌群构成,比较不同排便频率者肠道菌群构成差异。结果健康婴儿肠道菌群中拟杆菌门和疣微菌门丰度水平差异显著,而不同排便频率者肠道菌群中毛螺菌科、双岐杆菌科和卟啉单胞菌科差异有显著性。结论 0～6月龄不同排便频率健康婴儿肠道菌群中存在细菌科水平差异。

胰腺神经内分泌肿瘤患者舌苔菌群微生态分析

目的探讨胰腺神经内分泌肿瘤(pNENs)患者舌苔菌群微生态的特点。方法选取2019年11月至2020年7月间南京市第一医院15例经病理确诊的pNENs患者的舌苔菌群,招募15名健康志愿者作为正常对照组。使用口腔咽拭子刮取舌苔,对两组样本舌苔进行DNA提取和检测,通过16S rRNA高通量测序技术比较两组舌苔菌群的差异。分别用Chao1指数、Shannon指数和主成分分析检验α和β多样性差异。采用组间差异分析比较两组间舌苔菌群门、属、种水平上的物种组成,线性判断分析(LEfSe)两组优势菌属的差异。结果pNENs患者与健康对照者舌苔菌群的种类和数量相似,但结构组成明显不同。在门水平上,两组舌苔菌群均以变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)、梭杆菌门(Fusobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)为主,pNENs患者厚壁菌门、放线菌门相对丰度较高,而健康者拟杆菌门较高。在属水平上,两组舌苔菌群菌属均以嗜血杆菌属(Haemophilus)、奈瑟菌属(Neisseria)、普雷沃菌7属(Prevotella_7)、链球菌属(Streptococcus)、梭杆菌属(Fusobacterium)、拟普雷沃菌属(Alloprevotella)、韦荣球菌属(Veillonella)为主,pNENs患者韦荣球菌属相对丰度较高,而健康者梭杆菌属、拟普雷沃菌属、普雷沃菌属(Prevotella)和凝聚杆菌属(Aggregatibacter)相对丰度较高。LEfSe结果显示,pNENs患者优势菌属在门水平和属水平分别为放线菌门和罗氏菌属,健康者在属水平上的优势菌属为凝聚杆菌属。结论pNENs患者舌苔菌群的结构组成与健康人群存在差异,放线菌门及罗氏菌属丰度的增加和凝聚杆菌属丰度的减少可能对pNENs的诊断存在潜在的意义。

具抗肿瘤活性中度嗜盐菌YIM 80186的分离和系统发育分析

从青海盐碱土壤样品中分离到1株中度嗜盐放线菌YIM80186，该菌株的代谢产物具有很强的抗肿瘤和抗菌活性．菌株YIM80186在添加20～100g/L NaCl的培养基上生长良好，而在未添加Naa的多数培养基上生长微弱．最高能耐受200g／L NaCl．气生菌丝和基内菌丝丰富，白色至黄白色．气生菌丝产生直的或弯曲的孢子链，基内菌丝发育良好，断裂,生长pH范围6．0～10．0，最适pH7．5～8．0．通过对其进行的包括形态、生理生化特性、细胞化学以及基于16SRNA基因序列的系统发育分析等方面的多相分类研究．该菌株具有拟诺卡氏属的典型特征，初步鉴定其为拟诺卡氏菌属的1个潜在新种．

念珠状链杆菌引起鼠咬热1例

目的通过对一株念珠状链杆菌及其引发的鼠咬热病例的回顾性分析,为临床微生物室和临床医生提供诊治经验。方法病例回顾性分析:患者因被老鼠咬伤左手拇指引起发热就诊,入院后进行血培养,并用美华Ma120、梅里埃Vitek 2细菌鉴定系统、杭州滨河微量生化管、梅里埃TM质谱仪和16SrRNA基因测序进行细菌鉴定。临床给予阿莫西林氟氯西林联合左氧氟沙星抗感染治疗12 d。结果血培养分离出革兰阴性呈链状、菌体有念珠状肿胀的L型细菌;该菌用美华Ma120、梅里埃Vitek 2细菌鉴定系统、杭州滨河微量生化管、梅里埃TM质谱仪均无法鉴定;16sRNA基因测序结果显示该菌与念珠状链杆菌的相似度为100%;临床确诊为念珠状链杆菌型鼠咬热,用阿莫西林氟氯西林联合左氧氟沙星治疗有效。结论念珠状链杆菌能引起人类鼠咬热,该菌用16sRNA基因测序能准确鉴定,常规细菌鉴定仪和质谱仪均难以鉴定。临床医生对于有鼠咬史的患者,血液中检出革兰阴性呈链状、菌体有念珠状肿胀的L型细菌时需考虑念珠状链杆菌引发鼠咬热的可能。。