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等电聚焦分离与^18O稳定同位素标记联用的磷酸化蛋白质组学定量方法研究
被引量:
5
1
作者
隋少卉
王京兰
+5 位作者
贾伟
卢庄
刘金风
宋丽娜
蔡耘
钱小红
《分析化学》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第8期1017-1023,共7页
磷酸化蛋白质组学定量分析,要对磷酸化修饰富集技术和定量技术进行研究。基于此,本研究采用18O稳定同位素标记技术对胰蛋白酶酶解肽段混合物进行标记,并对其标记时间和标记后胰蛋白酶的变性条件进行优化。结果表明:在pH=4~5的KH2PO4缓...
磷酸化蛋白质组学定量分析,要对磷酸化修饰富集技术和定量技术进行研究。基于此,本研究采用18O稳定同位素标记技术对胰蛋白酶酶解肽段混合物进行标记,并对其标记时间和标记后胰蛋白酶的变性条件进行优化。结果表明:在pH=4~5的KH2PO4缓冲体系中,37℃,标记反应持续19~24h,除了C-端肽之外,几乎所有的肽段都可达到100%标记;采用TCEP可以有效地抑制16O-18O回标现象。建立了与18O标记技术兼容性良好的IPG-IEF技术对磷酸化肽段进行选择性富集,富集后共从HepG2细胞中鉴定到491个磷酸化位点、362个磷酸化肽段和356个磷酸化蛋白,表明IPG-IEF在大规模磷酸化肽段分离富集中是有效的;最后与高准确度高灵敏度高分辨率的LTQ-FTICR质谱仪联用,建立了基于18O-IPG-IEF-LTQ-FTICR的磷酸化蛋白质组定量技术。实验结果表明,该技术可以实现磷酸化肽段的有效定性和定量。本研究为磷酸化蛋白质组学定量研究提供了实用技术。
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关键词
18o标记技术
等电聚焦
傅里叶交换离子回旋质谱(LTQ-FTICR-MS)
磷酸化蛋白质组定性与定量
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职称材料
题名
等电聚焦分离与^18O稳定同位素标记联用的磷酸化蛋白质组学定量方法研究
被引量:
5
1
作者
隋少卉
王京兰
贾伟
卢庄
刘金风
宋丽娜
蔡耘
钱小红
机构
军事医学科学院放射与辐射医学研究所
防化指挥工程学院重点实验室
出处
《分析化学》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第8期1017-1023,共7页
基金
国家自然科学基金(Nos.20405017,20505018,20505017,20635010)
国家重点基础研究发展计划项目(973)(Nos.2004CB518707,2006CB910801,2006CB910803,2007CB714104)资助
文摘
磷酸化蛋白质组学定量分析,要对磷酸化修饰富集技术和定量技术进行研究。基于此,本研究采用18O稳定同位素标记技术对胰蛋白酶酶解肽段混合物进行标记,并对其标记时间和标记后胰蛋白酶的变性条件进行优化。结果表明:在pH=4~5的KH2PO4缓冲体系中,37℃,标记反应持续19~24h,除了C-端肽之外,几乎所有的肽段都可达到100%标记;采用TCEP可以有效地抑制16O-18O回标现象。建立了与18O标记技术兼容性良好的IPG-IEF技术对磷酸化肽段进行选择性富集,富集后共从HepG2细胞中鉴定到491个磷酸化位点、362个磷酸化肽段和356个磷酸化蛋白,表明IPG-IEF在大规模磷酸化肽段分离富集中是有效的;最后与高准确度高灵敏度高分辨率的LTQ-FTICR质谱仪联用,建立了基于18O-IPG-IEF-LTQ-FTICR的磷酸化蛋白质组定量技术。实验结果表明,该技术可以实现磷酸化肽段的有效定性和定量。本研究为磷酸化蛋白质组学定量研究提供了实用技术。
关键词
18o标记技术
等电聚焦
傅里叶交换离子回旋质谱(LTQ-FTICR-MS)
磷酸化蛋白质组定性与定量
Keywords
S
o
Labeling meth
o
d, is
o
electric f
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cusing, linear i
o
n trap F
o
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nance mass spectr
o
metry, qualitative and quantitative ph
o
sph
o
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o
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o
mics
分类号
Q51-3 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
等电聚焦分离与^18O稳定同位素标记联用的磷酸化蛋白质组学定量方法研究
隋少卉
王京兰
贾伟
卢庄
刘金风
宋丽娜
蔡耘
钱小红
《分析化学》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008
5
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