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毛茛中与苯丙烷生物合成途径相关的1R-MYB类转录因子的鉴定与分析
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作者 樊金世博 钟欣欣 +3 位作者 单婷玉 张京晶 王郅炜 吴家文 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期478-487,共10页
1R-MYB家族在植物生长发育、抗胁迫、次生代谢物合成中具有重要的调控作用。本研究基于毛茛(Ranunculus japonicus Thunb.)的全长转录组测序数据库,分析了其1R-MYB家族成员的基序、系统进化关系、表达特性、空间结构及功能。结果共鉴定... 1R-MYB家族在植物生长发育、抗胁迫、次生代谢物合成中具有重要的调控作用。本研究基于毛茛(Ranunculus japonicus Thunb.)的全长转录组测序数据库,分析了其1R-MYB家族成员的基序、系统进化关系、表达特性、空间结构及功能。结果共鉴定出221个1R-MYB基因,其中18个通过KEGG富集到苯丙烷生物合成途径,可能调控此途径中的过氧化物酶。研究结果为深入探究毛茛1R-MYB转录因子调控苯丙烷的生物合成机制奠定了基础。 展开更多
关键词 毛茛 转录因子 全长转录组 1r-myb 苯丙烷生物合成途径
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蒙古沙冬青1R-MYB基因AmMYB1R的克隆与表达分析 被引量:1
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作者 任美艳 马利 +2 位作者 贾俊欣 张锋 王茅雁 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期1468-1474,共7页
MYB家族转录因子与植物抗逆性密切相关。本研究利用RT-PCR方法从强抗逆沙漠植物蒙古沙冬青中克隆到AmMYB1R基因的编码区cDNA(903 bp)。推测其编码蛋白含一个由单一MYB重复单元(含端粒盒)组成的DNA结合域和一个H15结构域,故属于1R-MYB亚... MYB家族转录因子与植物抗逆性密切相关。本研究利用RT-PCR方法从强抗逆沙漠植物蒙古沙冬青中克隆到AmMYB1R基因的编码区cDNA(903 bp)。推测其编码蛋白含一个由单一MYB重复单元(含端粒盒)组成的DNA结合域和一个H15结构域,故属于1R-MYB亚族的端粒结合型转录因子。利用半定量RT-PCR方法进行表达分析,表明该基因在正常培养的蒙古沙冬青幼苗中有一定量的基础表达,低温胁迫可迅速诱导其表达量明显上调,干燥胁迫诱导其表达上调较为迟缓,而盐胁迫可诱导其表达量波浪式少量上调。将克隆到的cDNA片段成功构建到植物表达载体上,为深入研究其功能奠定了基础。 展开更多
关键词 沙冬青 1r-myb 基因克隆 表达分析 载体构建
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烟草1R MYB转录因子亚家族鉴定与分析 被引量:6
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作者 刘彻 姚盼盼 +3 位作者 宋皓 郑聪 曹培健 杨永霞 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期904-918,共15页
MYB转录因子在植物生长发育、代谢调节和抵御逆境胁迫中具有重要作用。本研究从中国烟草基因组数据库(非公开)中搜索到普通烟草栽培品种‘红花大金元’(Nicotiana tabacum‘Honghuadajinyuan’)及其祖先种绒毛状烟草(N.tomentosiformis... MYB转录因子在植物生长发育、代谢调节和抵御逆境胁迫中具有重要作用。本研究从中国烟草基因组数据库(非公开)中搜索到普通烟草栽培品种‘红花大金元’(Nicotiana tabacum‘Honghuadajinyuan’)及其祖先种绒毛状烟草(N.tomentosiformis)和林烟草(N.sylvestris)的MYB转录因子家族信息,从中分别鉴定出35、19和15个1R MYB转录因子,对其系统发育关系、基因结构、保守结构域、染色体定位、启动子顺式作用元件、microRNA靶基因、蛋白质三维结构、时空表达及生物与非生物胁迫处理下的表达模式进行了分析。结果表明,69条序列可以分为18个亚类,相同亚类转录因子具有相似的外显子-内含子结构和保守基序。启动子顺式作用元件分析结果表明烟草1R MYB转录因子启动子含有参与调控生长发育、物质合成、响应生长调节剂信号和非生物胁迫的顺式作用元件。组织特异性分析表明其表达具有时空特异性。干旱处理、青枯菌(Ralstonia solanacearum)和烟草疫霉(Phytophthora parasitica var.nicotianae)侵染后的转录组测序结果表明,烟草1R MYB转录因子响应生物和非生物胁迫。依据转录组测序分析结果,本研究筛选出潜在的调控抗旱的转录因子Ntab0880830(18亚类)和调控抗病的转录因子Ntab0257060(6亚类)、Ntab0866820(17亚类)、Ntab0873380(17亚类)。采用实时荧光定量PCR分析发现,1R MYB转录因子可以响应脱落酸、生长素、赤霉素等植物生长调节剂和非生物胁迫(37℃、干旱和盐)处理,不同基因表达模式不同。本研究结果为深入分析烟草1R MYB转录因子的功能提供理论参考和依据。 展开更多
关键词 烟草 1R MYB 转录因子 生物信息学分析 表达模式
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Molecular mechanism analysis of ZmRL6 positively regulating drought stress tolerance in maize
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作者 Pengyu Zhang Tongchao Wang +9 位作者 Liru Cao Zhixin Jiao Lixia Ku Dandan Dou Zhixue Liu Jiaxu Fu Xiaowen Xie Yingfang Zhu Leelyn Chong Li Wei 《Stress Biology》 2023年第1期511-525,共15页
MYB-related genes,a subclass of MYB transcription factor family,have been documented to play important roles in biological processes such as secondary metabolism and stress responses that affect plant growth and devel... MYB-related genes,a subclass of MYB transcription factor family,have been documented to play important roles in biological processes such as secondary metabolism and stress responses that affect plant growth and development.However,the regulatory roles of MYB-related genes in drought stress response remain unclear in maize.In this study,we discovered that a 1R-MYB gene,ZmRL6,encodes a 96-amino acid protein and is highly drought-inducible.We also found that it is conserved in both barley(Hordeum vulgare L.)and Aegilops tauschii.Furthermore,we observed that overexpression of ZmRL6 can enhance drought tolerance while knock-out of ZmRL6 by CRISPR-Cas9 results in drought hypersensitivity.DAP-seq analyses additionally revealed the ZmRL6 target genes mainly contain ACC GTT,TTA CCA AAC and AGC CCG AG motifs in their promoters.By combining RNA-seq and DAP-seq results together,we subsequently identified eight novel target genes of ZmRL6 that are involved in maize’s hormone signal transduction,sugar metabolism,lignin synthesis,and redox signaling/oxidative stress.Collectively,our data provided insights into the roles of ZmRL6 in maize’s drought response. 展开更多
关键词 ZmRL6 1r-myb MYB-related genes Drought stress MAIZE
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