568例少突胶质细胞肿瘤中染色体1p/19q缺失和多体特点分析

目的研究少突胶质细胞肿瘤1p/19q缺失及1q/19p多倍体状态与肿瘤病理分型及肿瘤部位的关系。方法应用荧光原位杂交方法(fluorescence in situ hybridization,FISH)对2012年1月至2014年12月患者石蜡包埋组织切片染色,进行1p/19q缺失和1q/19p多体分析,分析其与肿瘤部位、病理分型及分级的关系。结果在568例胶质瘤患者中,年龄为3~76岁,中位年龄42岁,男女比例1.5:1。肿瘤位于额叶249例,颞叶68例,顶叶14例,累及2个以上部位166例,丘脑30例,其他部位41例。1p缺失者74例,19q缺失者39例,联合缺失者192例,无缺失者263例。1p染色体多体30例,19q多体32例,1p/19q均为多体者55例,均无多体表现者451例。少突胶质细胞瘤染色体lp/19q联合缺失达67.4%,间变性少突胶质细胞瘤约为64.7%,少突星形细胞瘤约为38.3%,间变性少突星形细胞瘤为19.2%,含有少突胶质细胞瘤成分的胶质母细胞瘤为5.2%。在少突胶质细胞瘤和间变性少突胶质细胞瘤中,1p/19q联合缺失率及1p或19q的单独缺失均显著高于少突星形细胞瘤和间变性少突星形细胞瘤,差异有显著性(P<0.01);1p/19q联合缺失率在少突星形细胞瘤和间变性少突星形细胞瘤中明显高于含少突胶质细胞瘤成分的胶质母细胞瘤,差异有显著性(P<0.01)。1q/19p多体率在不同的肿瘤类型中差异有显著性(P=0.019),1q/19p多体率与肿瘤部位无关(P>0.05)。结论检测1p/19q杂合性缺失状态有助于胶质瘤的病理分型,有助于少突胶质细胞肿瘤与混合性少突-星形细胞肿瘤的鉴别诊断。

低级别胶质肿瘤的1p/19q缺失研究

背景与目的:近几年来,少枝胶质细胞瘤,特别是有染色体1p/19q的联合缺失者被证实对烷化剂化疗敏感,成为预后良好的标志物。本实验旨在研究低级别胶质瘤中1p/19q的联合缺失率和与标本中1p/19q的缺失百分比相关的分子病理特征。方法:搜集北京天坛医院低级别胶质瘤标本25例,应用免疫荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)的方法对1p36和19q13的缺失程度进行定量分析,统计其在低级别胶质瘤中的联合缺失率,并应用Spearman秩相关分析方法分析标本中1p36、19q13缺失百分比与P170、MGMT、MMP-9、PTEN、EGFR、P53、VEGF、Ki-67、TOPO-Ⅱ、GST-π的分子病理结果的关系。结果:在25例低级别胶质瘤标本中,星形细胞瘤10例,少枝胶质细胞瘤3例,少枝星形细胞瘤12例。在星形细胞瘤、少枝胶质瘤和少枝星形细胞瘤中,1p/19q联合缺失率分别为40%、67%和50%。1p36、19q13的缺失程度与MGMT表达呈负相关,(P分别为0.042和0.015),1p36的缺失程度与GST-π表达呈负相关(P=0.024)。结论:在低级别胶质瘤中,1p/19q的联合缺失率与国外报道相似,MGMT、GST-π的低表达可能与1p、19q的缺失有关。

对成人1p/19q未共缺失的“少突胶质细胞瘤”的临床病理及分子学分析

目的 探讨成人1p/19q未共缺失的“少突胶质细胞瘤”中的临床病理特征与及其他分子标记物相关性。方法 收集326例手术切除后组织病理诊断为少突胶质细胞瘤、间变少突胶质细胞瘤、少突-星形细胞瘤及间变少突-星形细胞瘤的病例。采用荧光原位杂交(FISH)检测1p/19q的共缺失状态,采用直接测序法检测IDH1/2、TP53、TERT启动子突变状态,采用免疫组化染色检测ATRX、PDGFRA、EGFR、 CIC、FUBP1、INA、PTEN表达水平,采用甲基化特异性PCR(MSP)方法检测(MGMT)甲基化水平。结果 326例成人少突胶质细胞瘤的1p/19q状态检测结果为37.6%的肿瘤1p/19q未共缺失,超过一半的1p/19q未共缺失的“少突胶质细胞瘤”缺乏星形细胞特征性标记物p53和ATRX表达。1p/19q未共缺失的“少突胶质细胞瘤”队列中,年龄较小(<45岁)、WHO 2级和典型少突胶质细胞瘤组织形态学的患者,预后较好(P <0.01),典型少突胶质细胞瘤组织形态学与TERTp突变状态、p53表达、EFGR表达、PDGFRA表达相关(P <0.05)。FUBP1、TERT、MGMT、PDGFRA、EGFR、PTEN、INA和CIC的表达未检测到显著的预后价值(P> 0.05)。结论 依据2021年第5版WHO中枢神经系统肿瘤分类,星形细胞瘤不能解释所有的1p/19q未共缺失的“少突胶质肿瘤”,1p/19q未共缺失的“少突胶质细胞瘤”可能形成弥漫性胶质瘤的一个不同亚群。

^(11)C-MET-PET/CT成像对脑胶质瘤1p/19q共缺失状态预测价值的研究

目的:研究1p/19q共缺失状态与蛋氨酸(methionine,MET)摄取之间的关系,探讨^(11)C-MET-PET/CT对脑胶质瘤1p/19q共缺失状态是否具有预测价值。方法:回顾性选取56例新诊断的神经胶质瘤患者,所有患者术前均行^(11)C-MET-PET/CT检查,术后均进行1p/19q共缺失的荧光毛细管电泳分析及组织病理学分析,并对^(11)C-MET-PET/CT数据进行特征提取和分析。采用IBM SPSS 26.0软件进行统计学分析。结果:与1p/19q共缺失患者相比,非1p/19q缺失患者的肿瘤最大标准摄取值和平均标准摄取值更高。在世界卫生组织Ⅱ级胶质瘤的亚组分析中,1p/19q共缺失患者的肿瘤/正常组织比最大值及平均值均较高,且纹理分析参数Entropy和DiffEntropy也较高。结论:胶质瘤1p/19q共缺失状态与蛋氨酸摄取之间存在相关性,非1p/19q缺失患者蛋氨酸摄取能力可能更强。^(11)C-MET-PET/CT作为一种无创的影像学方法,对各类型胶质瘤1p/19q共缺失状态具备一定的预测能力。

多模态MRI影像组学可预测弥漫性较低级别胶质瘤的1p/19q共缺失状态

目的应用多模态MRI影像组学特征无创性预测弥漫性较低级别胶质瘤1p/19q共缺失状态。方法收集2015年10月~2022年9月经病理证实为弥漫性较低级别胶质瘤的104例患者的MRI数据,并从T2WI、T1WI、FLAIR、对比增强T1WI和DWI序列提取535个组学特征,包括70个形态学特征,90个一阶统计学特征以及375个纹理特征。构建逻辑回归(LR)、基于逻辑回归的最小绝对收缩和选择算子(LRlasso)、支持向量机(SVM)和线性判别分析(LDA)模型,经十折交叉验证后,比较4组模型的预测效能。两位影像医师根据MRI图像来预测弥漫性较低级别胶质瘤1p/19q共缺失状态。采用受试者工作特性曲线(ROC)来评估影像组学模型和影像医师预测效能。结果LR、LRlasso、SVM、LDA模型在验证集的AUC值分别为0.833、0.819、0.824、0.819,差异不具有统计学意义(P>0.1)。4组影像组学模型预测效能均高于住院医师(AUC=0.645,P=0.011、0.022、0.016、0.030),并与主治医师相仿(AUC=0.838,P>0.05)。结论多模态MRI影像组学模型可以非侵入性地预测弥漫性较低级别胶质瘤1p/19q共缺失状态。

基于临床和放射特征的列线图非侵入性预测低级别胶质瘤患者的1p/19q染色体共缺失突变

目的 1p/19q共缺失突变已被证明是低级别胶质瘤(LGG)患者的良好预后和治疗计划的生物标志物。本研究的目的是建立一个联合临床和磁共振(MRI)放射组学特征的列线图模型来预测1p/19q共缺失状态。方法 回顾性研究了来自癌症影像数据库的2个不同数据集的209名经病理证实的LGG患者。先使用三次插值方法从T2和T1加权后对比MRI重采样数据中提取放射组学特征。然后最大相关最小冗余(mRMR)和最小绝对收缩和选择算子(LASSO)用于选择特征。我们将独立的临床特征纳入放射组学特征模型并形成一个联合模型(即基于放射组学特征的列线图)。将联合模型的性能与其他两种模型的性能进行了比较,通过接受者操作特征(ROC)分析用于评估模型的性能,并计算临床效用指数(CUI),分析了所选特征的分布和相关性。结果 我们结合mRMR和LASSO分析选择14个最佳放射组学特征来构建放射模型。与单独的放射特征模型相比,结合临床特征和Radscore的列线图联合模型在预测1p/19q共缺失突变方面表现出较好的灵敏度和辨别力(灵敏度:训练队列:0.91,验证队列:0.83;AUC:训练队列:0.93,验证队列:0.93)。CUI显示该模型取得了令人满意的正负值。我们的最终模型在训练集和外部测试集上分别达到了100%和80%的准确率。结论 本研究表明,凭借联合模型可以识别LGG患者的1p/19q共缺失状态。

基于常规MRI的纹理分析预测低级别胶质瘤1p/19q共缺失状态

目的探讨基于常规磁共振成像(MRI)纹理分析在预测低级别胶质瘤(LGG)1p/19q共缺失状态中的价值。方法回顾性纳入106例低级别胶质瘤患者,根据患者1p/19q共缺失状态分为2组,在不同MRI序列图像上勾画感兴趣区域(ROI),并提取ROI参数。基于单因素分析,使用受试者工作特征曲线(ROC)和多因素Logistics回归进行结果分析。结果ROC分析显示,T2WI偏度参数的灵敏度为92.9%,特异度为69.4%,AUC为0.857;T2WI变异系数的灵敏度为65.7%,特异度为69.4%,AUC为0.702。多因素logistics回归分析显示,T2WI(OR=1.004,95%CI:1.001~1.006,P=0.001)和CE-T1WI(OR=0.393,95%CI:0.206~0.748,P=0.004)偏度参数是低级别胶质瘤1p/19q共缺失状态的独立预测因素。结论基于常规MRI的纹理分析对预测低级别胶质瘤1p/19q共缺失状态具有重要价值。

少突胶质细胞瘤中染色体1p/19q联合缺失与MGMT基因启动子甲基化的相关性

目的研究少突胶质细胞瘤染色体1p/19q联合缺失与MGMT基因启动子甲基化的相关性。方法选取少突胶质细胞瘤35例、间变型少突胶质细胞瘤32例标本作为实验组,星形细胞瘤20例及瘤旁正常脑组织标本20例作为对照组,荧光原位杂交方法检测染色体1p/19q联合缺失情况,巢式甲基化特异性PCR技术检测MGMT基因启动子甲基化情况。结果少突胶质细胞瘤和间变型少突胶质细胞瘤1p/19q联合缺失率分别为85.71%、75.00%,均显著高于星形细胞瘤及正常脑组织(P<0.05);少突胶质细胞瘤、间变型少突胶质细胞瘤、星形细胞瘤的MGMT基因启动子甲基化率均显著高于正常脑组织(P<0.05),但三者组间比较差异无统计学意义(P>0.05);少突胶质细胞瘤1p/19q联合缺失与MGMT基因启动子甲基化呈正相关性,并且均与患者3年生存率相关(P<0.05)。结论少突胶质细胞瘤中1p/19q联合缺失与MGMT基因启动子甲基化状态密切相关,联合检测有助于提高临床病理诊断的精确性,更好地评估预后。

基于T2WI影像组学模型可预测低级别胶质瘤1p/19q的缺失状态

目的 基于磁共振T2WI构建影像组学模型,预测低级别胶质瘤1p/19q缺失状态的价值。方法 回顾性分析本院经病理证实的154例低级别胶质瘤患者(1p/19q共缺失100例,1p/19q非共缺失54例),按照分层抽样7∶3分成训练集和验证集。使用3DSlicer软件对肿瘤区域进行手动分割,用pyradiomics进行特征提取。临床资料的分析采用t检验/χ^(2)检验;影像组学特征采用方差法和10折交叉验证的LASSO算法进行筛选,最后建立支持向量机、高斯朴素贝叶斯、K-近邻、逻辑回归模型,采用ROC曲线的曲线下面积值和sklearn分类报告中的参考指标(准确度、敏感度、特异性、F1分数)进行效能评价。结果 4种模型中,支持向量机的曲线下面积值最高,训练集和验证集分别为0.95、0.91;参考指标中表现最佳为K-近邻,其准确度、敏感度、特异性及F1分数分别为0.87、0.97、0.70、0.91;其次为支持向量机,各项指标与模型平均值相当。结论 基于T2WI影像组学模型可以有效地预测低级别胶质瘤1p/19q的缺失状态。

胶质细胞肿瘤中染色体1p/19q杂合性缺失的临床病理分析

目的探讨染色体1p/19q联合缺失与胶质细胞肿瘤患者临床特征的关系。方法使用荧光原位杂交(FISH)技术,收集新疆医科大学第一附属医院151例手术确诊胶质细胞肿瘤标本,进行染色体1p/19q联合缺失检测,分析1p/19q杂合性缺失与患者性别、年龄、部位、病理组织类型等临床特征的相关性。结果星形细胞肿瘤染色体1p、19q、lp/19q联合缺失率分别为19.82%、41.44%、11.71%,少突胶质细胞肿瘤染色体1p、19q、lp/19q联合缺失率分别为51.72%、55.17%、51.72%,二者染色体联合缺失率差异有统计学意义(P<0.05),少突星形细胞肿瘤染色体1p、19q、lp/19q联合缺失率分别为54.55%、63.6%、36.36%,与前两类型比较差异无统计学意义(P>0.05)。少突胶质细胞瘤和间变型少突胶质细胞瘤1p、19q和1p/19q杂合性缺失率差异均无统计学意义(P=0.33,P=0.4913,P=0.58)。星形细胞肿瘤各型之间1p、19q、1p/19q杂合性缺失率差异均无统计学意义(P=0.88,P=0.25,P=0.34)。同时,少突星形细胞肿瘤中少突星形细胞瘤和间变型少突星形细胞瘤1p、19q、1p/19q杂合性缺失率差异无统计学意义(P=0.98,P=0.65,P=0.32);1p/19q杂合性缺失与少突胶质细胞肿瘤患者性别有关(P<0.05),与年龄、级别、肿瘤部位和族别无关(P>0.05)。星形细胞肿瘤和少突星形细胞肿瘤中1p/19q杂合性缺失与年龄、部位、性别、族别无关(P>0.05)。结论 1p/19q联合缺失可作为胶质细胞肿瘤病理诊断的重要参考指标。

胶质瘤1p/19q联合缺失特征分析

目的研究胶质瘤中1p/19q联合缺失与患者临床特征及O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)表达的关系。方法使用荧光原位杂交技术,对中山大学附属肿瘤医院2009年3月至2011年3月的63例手术确诊胶质瘤标本进行1p/19q联合缺失检测,利用统计学方法分析1p/19q联合缺失患者与无联合缺失患者在性别、年龄、部位、病理类型及MGMT表达状态是否有差异。结果全组63例患者,男38例,女25例,年龄(41.7±15.3)岁。其中,16例(25.4%)存在1p/19q联合缺失。1p/19q联合缺失患者与无联合缺失患者在性别、年龄及肿瘤部位间的差异无统计学意义。各病理类型1p/19q联合缺失的比例从高到低依次为少突胶质细胞瘤(9/16)、间变性少突胶质细胞瘤(3/8)、星形细胞瘤(2/10)、间变性星形细胞瘤(1/6)及胶质母细胞瘤(1/21),其差异有统计学意义(P<0.01)。在全组63例胶质瘤及25例含少突成分胶质瘤中,MGMT阳性肿瘤1p/19q联合缺失比例与MGMT阴性组间的差异皆无统计学意义。结论 1p/19q联合缺失主要与胶质瘤的病理类型有关,含少突成分胶质瘤中1p/19q联合缺失比例较高。1p/19q联合缺失可作为少突胶质细胞瘤病理诊断的重要参考指标。

IDH突变和1p/19q联合缺失型脑胶质瘤的影像学研究进展

异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变和染色体1p/19q联合缺失是脑胶质瘤的重要分子生物学标志物,与脑胶质瘤的诊断、治疗及预后密切相关。目前,多模态MRI、PET/CT等影像学检查能获取反映脑胶质瘤结构、功能、代谢及分子水平改变的重要信息,影像组学也可通过提取图像特征来反映肿瘤表型,极大地改变了对胶质瘤诊断、预后和治疗计划的认识。本文就IDH突变和1p/19q联合缺失型脑胶质瘤的影像学研究进展予以综述。

异柠檬酸脱氢酶基因突变的弥漫性较低级别胶质瘤中α地中海贫血伴智力低下综合征基因缺失与1p/19q联合缺失的表达分析

目的探讨不同亚型异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变弥漫性较低级别胶质瘤中α地中海贫血伴智力低下综合征X染色体连锁基因(ATRX)缺失和1号染色体短臂和19号染色体长臂(1p/19q)联合缺失的表达及意义。方法回顾性分析2012年6月至2017年6月确诊并在苏州大学第一附属医院和常熟市第二人民医院手术及放化疗治疗的IDH突变型成年较低级别弥漫性胶质瘤患者142例,依据组织学分型分为星形细胞瘤与少突胶质细胞瘤两组,采用免疫组化法检测ATRX缺失,FISH法检测1p/19q联合缺失,比较两组ATRX缺失及1p/19q联合缺失的差异,χ2检验评价各参数间相关性的显著性。平均随访40个月(10-88个月),分析ATRX缺失及1p/19q联合缺失与生存时间之间的关系。结果星形细胞瘤组ATRX缺失显著高于少突胶质细胞瘤组,少突胶质细胞瘤组1p/19q联合缺失显著高于星形细胞瘤组,差异有统计学意义(P<0.05)。星形细胞瘤组中ATRX缺失的患者预后优于野生型ATRX的患者,中位生存时间分别为46、40个月,差异有统计学意义(P<0.05)。少突胶质细胞瘤组中1p/19q联合缺失患者的预后优于1p/19q正常患者,中位生存时间分别为53个月、42个月,差异有统计学意义(P<0.05)。结论ATRX缺失和1p/19q联合缺失可用于鉴别IDH突变型星形细胞瘤与少突胶质细胞瘤,可作为评价IDH突变型弥漫性较低级别胶质瘤预后的独立因素。联合应用基因变异的分类比单纯组织学分类更准确。

1p/19q分子遗传学改变在脑胶质瘤中的临床意义

胶质瘤是最常见的中枢神经系统原发性肿瘤,约占中枢神经系统肿瘤的3/5。除常规检查外,分子生物学检测在研究胶质瘤临床特点中具有独特的意义。分子生物学检测主要是对记录独特信息的遗传物质变化进行精确检测,具体到肿瘤患者肿瘤的精确分型、可能的预后情况、适合使用的药物以及后续药物的疗效都可以通过基因检测来实现。分子生物学检测逐步在胶质瘤的精确分型、分子水平治疗及预后预测中得以应用,并随之探明了若干分子生物学改变如端粒酶逆转录酶(TERT)启动子突变、Ki-67基因过度表达、p53基因突变、染色体1p/19q杂合性缺失等,与脑胶质瘤有着密切的关系。

胶质瘤染色体1p/19q联合缺失特点分析

目的 研究胶质瘤1p/19q联合缺失与患者性别、年龄、肿瘤部位及病理分型是否具有相关性.方法 用荧光原位杂交法（Fluorescence in situ hybridization,FISH）对2009年1月至12月的138例胶质细胞瘤患者术后胶质瘤标本进行1P和19q缺失状态分析,男性80例,女性58例;年龄17～68岁,平均41.6岁.利用X2检验分析不同性别、年龄、肿瘤部位、病理类型的1p/19q联合缺失是否有差异.结果 星形细胞肿瘤（22.2%）的1p/19q联合缺失率显著低于少枝胶质细胞肿瘤（81.3%）和少枝星形细胞肿瘤（55.8%）（P＜0.01）,少枝胶质细胞肿瘤的1p/19q联合缺失率高于少枝星形细胞肿瘤（P＜0.05）.额叶胶质瘤的1p/19q联合缺失率（61.8%）显著高于颢叶（31.8%）和岛叶（34.6%）（P＜0.05）.1p/19q联合缺失与患者的性别、年龄无明显相关性.结论 1p/19q联合缺失主要与胶质瘤的病理类型和部位相关,与患者的年龄和性别无明显相关性.

胶质瘤1p/19q联合缺失与临床病理因素的相关性分析

目的 本研究旨在筛选与胶质瘤组织1p/19q联合缺失相关的临床病理因素.方法 收集胶质瘤标本56例,采用荧光原位杂交（FISH）方法检测肿瘤组织标本中1p和19q的状态,并用免疫组化对9种肿瘤相关蛋白进行半定量分析,应用统计学方法筛选与1p/19q联合缺失相关的临床病理因素.结果 单因素分析证实病理类型、p53和O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶（MGMT）表达水平与1p/19q联合缺失相关,Logistic回归进一步证实病理类型和MGMT表达水平与1p/19q联合缺失相关,P值分别为0.001和0.004.结论 在胶质瘤中,通过病理类型和MGMT表达水平可以准确预测部分胶质瘤的1p/19q缺失状态,1p/19q联合缺失有可能通过p53和MGMT的低表达,增强烷化剂化疗疗效和延长存活期.

少突胶质细胞肿瘤1p／19q联合缺失与p53、10号染色体上磷酸酶及张力蛋白同源物和6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶蛋白表达的关系

目的探讨少突胶质细胞肿瘤染色体1p／19q联合缺失及其与p53、10号染色体上磷酸酶及张力蛋白同源物（PTEN）和O2-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶（MGMT）蛋白表达的关系。方法收集少突胶质细胞肿瘤标本68例，其中WHO-Ⅱ级少突胶质细胞瘤42例，WHO-Ⅲ级间变性少突胶质细胞瘤26例。采用荧光原位杂交（FISH）方法分析肿瘤组织中1p／19q缺失状态；采用免疫组织化学方法对肿瘤组织中p53、PTEN和MGMT蛋白表达进行半定量分析，并进一步分析其与1p／19q联合缺失的相关性。结果68例少突胶质细胞肿瘤中，染色体1P、19q缺失率及1p／19q联合缺失率分别为67．65％（46／68）、61．76％（42／68）、57．35％（39／68）。1p／19q联合缺失率在Ⅱ级和Ⅲ级少突胶质细胞肿瘤之间，差异无统计学意义（P〉0．05）。1p／19q联合缺失在额叶肿瘤的发生率（76．67％，23／30）明显高于颞叶（45．00％，9／20）及其他部位肿瘤（38．89％，7／18），差异有统计学意义（P〈0．05）。1p／19q联合缺欠与患者性别及发病年龄无明显相关（P〉0．05）。p53和MGMT蛋白表达与肿瘤分级呈正相关，而PTEN表达与肿瘤分级呈负相关，差异均有统计学意义（P〈0．05）。1p／19q联合缺失与p53和MGMT蛋白低表达相关（P〈O．05），而与PTEN蛋白表达无明显相关（P〉0．05）。结论在少突胶质细胞肿瘤中，染色体1p／19q联合缺失与p53和MGMT蛋白表达水平呈负相关。

TERTp突变和1p/19q联合缺失对新诊断MGMT启动子未甲基化/IDH野生型GBM预后的影响

目的探讨端粒逆转录酶启动子(TERTp)突变和1号染色体的短臂(1p)/19号染色体的长臂(19q)联合缺失对新诊断O6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(MGMT)启动子未甲基化/异柠檬酸脱氢酶(IDH)野生型胶质母细胞瘤(GBM)预后的影响。方法选择上海市静安区中心医院放疗科和复旦大学附属华山医院上海伽玛医院放疗科自2016年3月至2018年11月收治的新诊断MGMT启动子未甲基化/IDH野生型GBM患者82例。采用PCR测序法检测GBM标本TERTp突变,分为TERTp野生型(wt)、TERTp突变型(mut)(包括C228 mut和C250 mut)2组。采用荧光原位杂交(FISH)技术检测GBM标本1p/19q联合缺失,比较不同分子分型患者的临床资料、不良反应和预后。结果82例患者中TERTp wt患者33例,TERTp mut患者49例。TERTp mut患者的年龄大于TERTp wt患者,差异有统计学意义(P<0.05)。2组患者的性别分布、Karnofsky功能状态(KPS)评分、肿瘤部位及手术切除程度差异均无统计学意义(P>0.05)。82例患者中1p/19q联合缺失患者8例,无1p/19q联合缺失患者74例,2类患者上述临床资料差异均无统计学意义(P>0.05)。TERTp wt、TERTp mut患者,1p/19q联合缺失、无1p/19q联合缺失患者骨髓抑制、消化道反应和疲乏的发生率、无疾病进展率、生存率差异均无统计学意义(P>0.05)。C228 mut患者(40例)、C250 mut患者(8例)上述临床资料、无疾病进展率、生存率差异均无统计学意义(P>0.05)。结论未发现TERTp分型和1p/19q联合缺失状态对新诊断MGMT启动子未甲基化/IDH野生型GBM的预后有影响,TERTp mut患者年龄明显高于TERTp wt患者,C250 mut患者生存率有高于C228 mut患者的趋势。

基于机器学习筛选脑胶质瘤1p/19q共缺失特征基因及其在预测1p/19q共缺失中的作用

目的基于机器学习方法筛选脑胶质瘤1p/19q共缺失特征基因, 并探讨其在预测1p/19q共缺失中的作用。方法回顾性分析中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)、癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库中脑胶质瘤患者的肿瘤组织转录组测序数据及临床信息, 将CGGA693的数据作为试验组(508例), CGGA325(298例)和TCGA(545例)的数据作为验证组。采用单因素Cox回归方法和机器学习方法分别筛选试验组中1p/19q共缺失与1p/19q非共缺失者与免疫相关的差异表达基因。2种筛选方法共同具有的候选基因定义为1p/19q共缺失特征基因(以下简称特征基因)。在2个验证组中验证特征基因在1p/19q共缺失与非共缺失者间的差异。绘制受试者工作特征曲线(ROC), 计算试验组和验证组中特征基因预测1p/19q共缺失的曲线下面积(AUC);采用Kaplan-Meier生存分析法分析AUC值较大的特征基因与预后的关系。在试验组, 采用logistic回归分析方法, 基于特征基因及临床信息构建不同的1p/19q共缺失预测模型;采用AUC、赤池信息量准则、净重新分类指数、综合判别改善指数、决策曲线分析法综合评估每个模型的预测效能。另纳入南京医科大学附属常州第二人民医院神经外科行手术切除的22例脑胶质瘤标本, 采用实时荧光定量PCR法检测1P/19q类缺失者与非共缺失者特征基因mRNA的表达水平。结果试验组中共筛选出6个特征基因, 分别为血管生成素样蛋白2(ANGPTL2)、骨形成蛋白2(BMP2)、骨形成蛋白8b(BMP8b)、成纤维细胞生长因子11(FGF11)、组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)及滑行蛋白α(TXLNA)。2个验证组中, 6个特征基因在1p/19q共缺失与非共缺失组中的表达差异均有统计学意义(均P<0.001)。试验组和验证组的ROC显示, HDAC1、TXLNA基因预测1p/19q共缺失的AUC值均>0.9;生存分析显示, HDAC1、TXLNA基因低表达者的总生存期均长于高表达者, 差异均有统计学意义(均P<0.001)。共建立3个预测1p/19q共缺失模型:模型A (变量:TXLNA), 模型B (变量:TXLNA+HDAC1), 模型C[变量:TXLNA+HDAC1+年龄+世界卫生组织(WHO)分级+异柠檬酸脱氢酶突变] 。多个预测效能评估结果显示, 模型A对1p/19q共缺失的预测能力略逊于模型B、C, 但差异不大。1p/19q共缺失者TXLNA的mRNA表达水平低于非共缺失者(P<0.01)。结论 TXLNA是胶质瘤1p/19q共缺失特征基因, 其预测1p/19q共缺失的效能较高。

胶质瘤IDH1和TP53突变与LOH1p/19q的表达及意义

目的探讨胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)突变、TP53突变和1p/19q联合性缺失(LOH 1p/19q)的表达及其意义。方法病理组织学证实的Ⅱ-Ⅲ级胶质瘤136例,采用基因片段测序检测IDH1突变,免疫组织化学检测TP53突变,荧光原位杂交法检测LOH 1p/19q的表达。结果 136例中,IDH1突变107例,TP53突变59例,LOH 1p/19q 36例。其中,同时存在IDH1突变和TP53突变共有55例(弥漫性细胞瘤24例,间变性星形细胞瘤26例,少突星形细胞瘤3例,间变性少突星形细胞瘤2例)。同时存在IDH1突变和LOH 1p/19q共有26例(少突胶质细胞瘤13例,间变性少突胶质细胞瘤9例,少突星形细胞瘤2例,间变性少突星形细胞瘤2例)。无一例同时存在TP53突变和LOH 1p/19q。结论联合检测IDH1突变、TP53突变和LOH 1p/19q能有利于明确肿瘤分子病理分型和预后判断,可能成为未来胶质瘤基因治疗的新靶点。