目的明确一个智力低下家系染色体拷贝数变异(copy number variants,CNVs)的情况及发生机制,并探讨其与表型的相关性.方法应用二代测序(next generation sequencing,NGS)技术检测先证者的染色体拷贝数变异,并用高分辨染色体核型分析以及...目的明确一个智力低下家系染色体拷贝数变异(copy number variants,CNVs)的情况及发生机制,并探讨其与表型的相关性.方法应用二代测序(next generation sequencing,NGS)技术检测先证者的染色体拷贝数变异,并用高分辨染色体核型分析以及荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术对先证者及其家属的染色体进行分析.结果先证者以及家系中的其他患者主要表现为智力低下及特殊面容.NGS检测结果提示先证者染色体4p16.3-15.32区存在约16.24 Mb的微重复,8p23.3-23.2区存在约2.2 Mb的微缺失.经验证,家系中其他患病成员均携带有相同的染色体变异,而表型正常的成员均未携带上述变异.高分辨核型及FISH检测显示先证者母亲的4号染色体短臂与8号染色体短臂存在相互易位,其核型为46,XX,t(4;8)(p16;p23);先证者父亲染色体核型未见异常.结论该家系中患者的致病原因为4号染色体微重复合并8号染色体微缺失,导致上述变异的原因为亲代4号染色体短臂及8号染色体短臂之间的平衡易位.展开更多
目的应用微阵列比较基因组杂交技术探讨胎儿先天性泌尿系统畸形的遗传学病因。方法选取32例经产前超声检查提示发生不同程度泌尿系统畸形并且常规G显带核型分析方法未发现异常的胎儿病例及其父母的DNA,按照标准的Affymetri xcytogenet...目的应用微阵列比较基因组杂交技术探讨胎儿先天性泌尿系统畸形的遗传学病因。方法选取32例经产前超声检查提示发生不同程度泌尿系统畸形并且常规G显带核型分析方法未发现异常的胎儿病例及其父母的DNA,按照标准的Affymetri xcytogenetic2.7M芯片的操作手册进行杂交、洗涤及全基因组扫描,应用配套的CHAS软件分析结果。结果微阵列比较基因组杂交技术检测发现9例胎儿基因组发生了不平衡的拷贝数变异(copy number variations,CNVs),检出率为28%。其中4例CNVs遗传自亲代(12.5%);2例CNVs在相关数据库中提示在正常人基因组中存在(6%);3例是新发的致病性CNVs(9%),并且这3例胎儿样本均发生了染色体1q21.1微缺失和微重复,异常片段内包含与泌尿生殖系统功能密切相关的PDZK1基因。结论先天性泌尿系统畸形胎儿基因组发生不平衡畸变的几率约为28%,其中致病性的基因组不平衡异常约占9%。染色体lq21.1区带DNA拷贝数改变是导致先天性泌尿系统畸形的病因之一,其致病机制可能与PDZK1基因的异常表达有关。展开更多
文摘目的明确一个智力低下家系染色体拷贝数变异(copy number variants,CNVs)的情况及发生机制,并探讨其与表型的相关性.方法应用二代测序(next generation sequencing,NGS)技术检测先证者的染色体拷贝数变异,并用高分辨染色体核型分析以及荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术对先证者及其家属的染色体进行分析.结果先证者以及家系中的其他患者主要表现为智力低下及特殊面容.NGS检测结果提示先证者染色体4p16.3-15.32区存在约16.24 Mb的微重复,8p23.3-23.2区存在约2.2 Mb的微缺失.经验证,家系中其他患病成员均携带有相同的染色体变异,而表型正常的成员均未携带上述变异.高分辨核型及FISH检测显示先证者母亲的4号染色体短臂与8号染色体短臂存在相互易位,其核型为46,XX,t(4;8)(p16;p23);先证者父亲染色体核型未见异常.结论该家系中患者的致病原因为4号染色体微重复合并8号染色体微缺失,导致上述变异的原因为亲代4号染色体短臂及8号染色体短臂之间的平衡易位.
文摘目的应用微阵列比较基因组杂交技术探讨胎儿先天性泌尿系统畸形的遗传学病因。方法选取32例经产前超声检查提示发生不同程度泌尿系统畸形并且常规G显带核型分析方法未发现异常的胎儿病例及其父母的DNA,按照标准的Affymetri xcytogenetic2.7M芯片的操作手册进行杂交、洗涤及全基因组扫描,应用配套的CHAS软件分析结果。结果微阵列比较基因组杂交技术检测发现9例胎儿基因组发生了不平衡的拷贝数变异(copy number variations,CNVs),检出率为28%。其中4例CNVs遗传自亲代(12.5%);2例CNVs在相关数据库中提示在正常人基因组中存在(6%);3例是新发的致病性CNVs(9%),并且这3例胎儿样本均发生了染色体1q21.1微缺失和微重复,异常片段内包含与泌尿生殖系统功能密切相关的PDZK1基因。结论先天性泌尿系统畸形胎儿基因组发生不平衡畸变的几率约为28%,其中致病性的基因组不平衡异常约占9%。染色体lq21.1区带DNA拷贝数改变是导致先天性泌尿系统畸形的病因之一,其致病机制可能与PDZK1基因的异常表达有关。