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赖氨酰氧化酶LOXL2稳定性的理论计算研究
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作者 林李锐 林凯 +3 位作者 邹海鹰 许丽艳 李恩民 东庚 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期685-695,共11页
赖氨酰氧化酶LOXL2是一种依赖于铜离子的胺氧化酶,催化胶原蛋白和弹性蛋白的赖氨酸残基侧链发生氧化脱氨,发挥着稳固细胞外基质的作用。而稳定性是蛋白质的一个重要特性,直接影响蛋白质的分子动态及其正常功能发挥,这与人类的健康和疾... 赖氨酰氧化酶LOXL2是一种依赖于铜离子的胺氧化酶,催化胶原蛋白和弹性蛋白的赖氨酸残基侧链发生氧化脱氨,发挥着稳固细胞外基质的作用。而稳定性是蛋白质的一个重要特性,直接影响蛋白质的分子动态及其正常功能发挥,这与人类的健康和疾病密切相关。然而,关于LOXL2的稳定性目前鲜有报道,哪些位点对其稳定性有显著影响尚不清楚。本研究采用冷冻电镜和Alphafold2的数据,建立LOXL2的全长结构,通过分子动力学模拟得到其优化构象。再通过4种方法(mCSM,PremPS,DeepDDG和FoldX),计算所有位点的稳定性属性,筛选出对稳定性有显性影响的位点(定义为关键位点)。结果表明,95个关键位点对LOXL2的稳定性具有显著影响,在5个结构域上的分布数量依次为14、13、8、11和26,而结构域间的连接肽段上也有23个关键位点。在这些关键位点中,类型及数量分别为Leu(24个)、Val(20个)、Ile(12个)、Trp(11个)、Phe(11个)、Tyr(6个)、Cys(6个)、Met(4个)和Arg(1个)。其中大部分关键位点(88个)为疏水性质,这与蛋白质折叠的主要力量为疏水作用的情况是一致的,而Cys两两成对,构成二硫键,对LOXL2的结构及功能发挥重要作用。讨论中,我们将预测结果与实验值进行比较,并用自由能微扰方法,对部分关键位点进行比较,从多方面论证此项工作的可信度。此项研究,可为靶向LOXL2的疾病治疗研究,提供重要指导。 展开更多
关键词 赖氨酰氧化酶样2 稳定性 分子动力学模拟 计算预测 吉布斯自由能
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Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein(N-WASP)promotes distant metastasis in pancreatic ductal adenocarcinoma via activation of LOXL2
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作者 HYUNG SUN KIM YUN SUN LEE +5 位作者 SEUNG MYUNG DONG HYO JUNG KIM DA EUN LEE HYEON WOONG KANG MYEONG JIN KIM JOON SEONG PARK 《Oncology Research》 SCIE 2024年第4期615-624,共10页
Pancreatic ductal adenocarcinoma(PDAC)is one of the most aggressive solid malignancies.A specific mechanism of its metastasis has not been established.In this study,we investigated whether Neural Wiskott-Aldrich syndr... Pancreatic ductal adenocarcinoma(PDAC)is one of the most aggressive solid malignancies.A specific mechanism of its metastasis has not been established.In this study,we investigated whether Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein(N-WASP)plays a role in distant metastasis of PDAC.We found that N-WASP is markedly expressed in clinical patients with PDAC.Clinical analysis showed a notably more distant metastatic pattern in the N-WASP-high group compared to the N-WASP-low group.N-WASP was noted to be a novel mediator of epithelialmesenchymal transition(EMT)via gene expression profile studies.Knockdown of N-WASP in pancreatic cancer cells significantly inhibited cell invasion,migration,and EMT.We also observed positive association of lysyl oxidase-like 2(LOXL2)and focal adhesion kinase(FAK)with the N-WASP-mediated response,wherein EMT and invadopodia function were modulated.Both N-WASP and LOXL2 depletion significantly reduced the incidence of liver and lung metastatic lesions in orthotopic mouse models of pancreatic cancer.These results elucidate a novel role for N-WASP signaling associated with LOXL2 in EMT and invadopodia function,with respect to regulation of intercellular communication in tumor cells for promoting pancreatic cancer metastasis.These findings may aid in the development of therapeutic strategies against pancreatic cancer. 展开更多
关键词 Pancreatic cancer Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein(N-WASP)signaling METASTASIS Epithelial-mesenchymal transition(EMT) Lysyl oxidase-like 2(loxl2)
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赖氨酰氧化酶(LOX)和赖氨酰氧化酶样蛋白2(LOXL2) 在细胞核内转录调控中的作用研究综述
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作者 熊伟 李彬 +4 位作者 梅雯 赵一 王播勇 自加吉 周静华 《平顶山学院学报》 2023年第2期125-128,共4页
赖氨酰氧化酶(lysyl oxidase,LOX)蛋白家族由LOX和4种LOX样蛋白(lysyl oxidase like 1~4,LOXL 1~4)组成,其作用主要是氧化位于赖氨酸ε位的氨基以生成醛基.通常来说,它们被认为是以细胞外蛋白质,尤其是弹性蛋白和胶原蛋白为主要底物.然... 赖氨酰氧化酶(lysyl oxidase,LOX)蛋白家族由LOX和4种LOX样蛋白(lysyl oxidase like 1~4,LOXL 1~4)组成,其作用主要是氧化位于赖氨酸ε位的氨基以生成醛基.通常来说,它们被认为是以细胞外蛋白质,尤其是弹性蛋白和胶原蛋白为主要底物.然而,最近研究结果表明LOX和LOXL2也可以在细胞核内基因转录调控中发挥关键的作用.值得一提的是,这两种蛋白质的细胞核定位和它们的底物可以是核内组蛋白的事实已被阐明,提示它们在组蛋白修饰等表观遗传学领域发挥作用.重点综述和探讨LOX蛋白和LOXL2蛋白这2个LOX家族成员在细胞核内的基因转录调控作用. 展开更多
关键词 赖氨酰氧化酶(LOX) 赖氨酰氧化酶样蛋白2(loxl2) 转录调控 表观遗传学 组蛋白
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E47和LOXL2表达下调对食管鳞癌Eca-109细胞迁移和凋亡的影响研究 被引量:3
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作者 马红 郭琼 +4 位作者 张燕萍 侯敏杰 李金钰 朱亚杰 史永华 《新疆医科大学学报》 CAS 2020年第11期1425-1430,共6页
目的探讨核转录因子E47和赖氨酰氧化酶样蛋白-2(LOXL2)基因表达下调后对食管鳞癌细胞株Eca109迁移、凋亡的影响及其机制。方法采用RNAi技术沉默E47和LOXL2基因作为实验组,同时设立空白对照组和阴性对照组。采用实时荧光定量PCR及Western... 目的探讨核转录因子E47和赖氨酰氧化酶样蛋白-2(LOXL2)基因表达下调后对食管鳞癌细胞株Eca109迁移、凋亡的影响及其机制。方法采用RNAi技术沉默E47和LOXL2基因作为实验组,同时设立空白对照组和阴性对照组。采用实时荧光定量PCR及Western blot检测各组细胞中E47、LOXL2基因mRNA和蛋白表达水平,通过流式细胞术和Transwell检测细胞凋亡和迁移变化,采用免疫共沉淀技术检测E47和LOXL2蛋白相互作用。结果与空白对照组和阴性对照组比较,E47、LOXL2 mRNA和蛋白表达水平下调;流式细胞术和Transwell实验结果显示,E47和LOXL2干扰后Eca109细胞的凋亡率增高(P<0.01),细胞迁移数目降低(P<0.01)。免疫共沉淀结果显示E47和LOXL2蛋白存在相互作用。结论E47和LOXL2表达下调可以抑制Eca109细胞迁移,并诱导细胞凋亡,E47和LOXL2蛋白相互作用可能促进食管癌细胞的恶性增殖和侵袭。 展开更多
关键词 食管鳞癌 核转录因子E47 赖氨酰氧化酶样蛋白-2 上皮间质转化
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LOXL2与HER-2蛋白在原发性肝癌中的表达及其临床意义 被引量:4
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作者 张迎 徐瀚峰 +1 位作者 万莉 张启佳 《广西医科大学学报》 CAS 2017年第8期1189-1191,共3页
目的:探讨赖氨酰氧化酶样蛋白2(LOXL2)与表皮生长因子受体2(HER-2)蛋白在原发性肝癌中的表达及其临床意义。方法:选取2014年7月至2016年11月江苏省南京市第二医院收治的82例原发性肝癌患者,通过手术收集患者肝癌组织及相应的癌旁组织,... 目的:探讨赖氨酰氧化酶样蛋白2(LOXL2)与表皮生长因子受体2(HER-2)蛋白在原发性肝癌中的表达及其临床意义。方法:选取2014年7月至2016年11月江苏省南京市第二医院收治的82例原发性肝癌患者,通过手术收集患者肝癌组织及相应的癌旁组织,采用免疫组织化学染色检测患者不同分期、不同分化程度、不同直径和是否转移情况下LOXL2与HER-2蛋白表达情况。结果:与癌旁组织相比,原发性肝癌组织中LOXL2与HER-2蛋白表达量显著升高,差异有统计学意义(P<0.05);肿瘤直径≥4cm、低分化程度、Ⅲ~Ⅳ期和存在远处转移的患者LOXL2与HER-2蛋白表达阳性率分别高于肿瘤直径<4cm、高或中分化程度、Ⅰ或Ⅱ期和无远处转移,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:原发性肝癌患者肝癌组织LOXL2和HER-2蛋白呈高表达,且肿瘤直径大、分期晚、分化程度低,出现转移的患者LOXL2和HER-2蛋白表达阳性率较高。 展开更多
关键词 loxl2 HER-2 原发性肝癌 蛋白表达
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房颤患者血清LOXL2水平与射频消融术后复发的相关性分析
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作者 武英彪 张小刚 +3 位作者 郝舒雯 金灿 金鹿 宁忠平 《医药论坛杂志》 2024年第1期5-9,15,共6页
目的探究LOXL2在房颤患者血清中的表达情况,研究其与射频消融术后复发的关系及预后作用。方法挑选2017年1月—2019年12月在上海市浦东新区周浦医院就诊的房颤患者173例,这些患者都是第一次使用射频消融术进行治疗,手术结束后开展为期6... 目的探究LOXL2在房颤患者血清中的表达情况,研究其与射频消融术后复发的关系及预后作用。方法挑选2017年1月—2019年12月在上海市浦东新区周浦医院就诊的房颤患者173例,这些患者都是第一次使用射频消融术进行治疗,手术结束后开展为期6个月的随访,观察患者是否出现病情反复与复发,依据随访结果将患者分为两组,分别是复发组和非复发组。比较两组的临床资料及各项指标,关注血清LOXL2的情况,分析研究血清LOXL2表达情况和临床血清学指标的关系,评测影响房颤复发的因素。结果参加研究的173例房颤患者全部实施射频消融术,男性患者94例,平均年龄(66.3±10.7)岁。在手术后6个月的随访中,出现62例病情复发。相较于非复发组,房颤复发组患者血清中LOXL2明显升高,而且和体质指数、CHA2DS2-VASC评分、左心房内径(LAD)、BNP、hs-CRP、TGF-β1呈正相关,与左室射血分数(LVEF)呈负相关。运用受试者操作特征(ROC)曲线图,将房颤患者血清LOXL2水平和是否复发作为横纵坐标绘制曲线,确定房颤复发的最佳临界值是LOXL2大于470.94 ng/mL,其敏感性和特异性分别为85.5%和68.5%。多因素logistic回归分析显示,血清LOXL2(OR=1.014,95%CI:1.008~1.021,P<0.001)、BNP、hs-CRP和LVEF是射频消融术后房颤复发的独立预测因子。结论LOXL2蛋白可以作为一种房颤复发的血清生物标志物,术前高水平血清LOXL2提示射频消融术后具有较高的房颤复发风险。 展开更多
关键词 心房颤动 射频消融术 赖氨酰氧化酶类2(loxl2) 心房纤维化
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赖氨酰氧化酶样蛋白2在肺腺癌患者中的预后价值 被引量:3
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作者 展平 谢海燕 《肿瘤学杂志》 CAS 2017年第11期973-977,共5页
[目的]探讨LOXL2在肺腺癌中的表达情况及与临床病理特征预后意义。[方法]采用免疫组化染色(Immunohistochemical staining,IHC)的方法检测60对配对的肺腺癌及癌旁组织中LOXL2蛋白的表达水平,并根据免疫组化染色评分判断LOXL2蛋白的表达... [目的]探讨LOXL2在肺腺癌中的表达情况及与临床病理特征预后意义。[方法]采用免疫组化染色(Immunohistochemical staining,IHC)的方法检测60对配对的肺腺癌及癌旁组织中LOXL2蛋白的表达水平,并根据免疫组化染色评分判断LOXL2蛋白的表达强度,分析LOXL2蛋白表达与肺腺癌临床病理特征以及预后的相关性。[结果]LOXL2蛋白在癌组织中显著性高表达。LOXL2蛋白在肺腺癌组织中主要定位于细胞核。细胞核LOXL2高表达与肺腺癌的淋巴结转移(P=0.025)、TNM分期(P=0.031)相关,并是肺腺癌差预后的独立预测因子(P=0.028)。[结论]细胞核LOXL2蛋白的高表达与肺腺癌患者的差预后相关,LOXL2可以作为肺腺癌患者的一种新的预后生物指标和潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 赖氨酰氧化酶样蛋白2 loxl2 肺腺癌 预后 转移
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赖氨酰氧化酶样蛋白2对慢性心力衰竭患者的诊断价值探讨
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作者 唐康庭 吴鑫 +1 位作者 王俊宏 赵英明 《药物生物技术》 CAS 2017年第6期517-520,共4页
研究慢性心力衰竭患者血清赖氨酰氧化酶样蛋白2(lysyl oxidase like 2,LOXL2)水平变化情况,探讨LOXL2在心力衰竭诊断中的应用价值。入选心力衰竭住院患者74例,按纽约心功能分级标准分为心功能Ⅱ级组26例、心功能Ⅲ级组27例、心功能Ⅳ级... 研究慢性心力衰竭患者血清赖氨酰氧化酶样蛋白2(lysyl oxidase like 2,LOXL2)水平变化情况,探讨LOXL2在心力衰竭诊断中的应用价值。入选心力衰竭住院患者74例,按纽约心功能分级标准分为心功能Ⅱ级组26例、心功能Ⅲ级组27例、心功能Ⅳ级组21例,并收集38例同期住院非心衰患者作为对照组。采集入选者的临床资料,入院后行心脏彩色超声检查,测定血浆NT-pro BNP水平,采用酶联免疫法测定血清LOXL2浓度。患者血清LOXL2水平在心功能Ⅳ级组(992.1±404.5)pg/mL显著高于心功能Ⅲ,Ⅱ级组[分别为(637.1±125.8)和(467.5±88.7)pg/mL,均P<0.01]及对照组[(314.2±143.5)pg/mL,P<0.01],与对照组相比,各组心衰患者LOXL2水平均显著升高(均P<0.05)。LOXL2浓度与左室舒张末期内径(LVEDd)呈正相关(R^2=0.25,P<0.01)、而与心功能分级(R^2=-0.26,P<0.01)呈负相关。血清LOXL2诊断心力衰竭的ROC曲线下面积(AUC)为0.699,95%可信区间为(0.644~0.894,P<0.001)。心力衰竭患者血清LOXL2水平明显升高,并且升高水平与心力衰竭程度显著相关。LOXL2或可作为NT-pro BNP和超声心动图外的补充手段,对心力衰竭的诊断与鉴别有一定意义。 展开更多
关键词 赖氨酰氧化酶样蛋白2 慢性心力衰竭 纽约心功能分级(NYHA) N端-B型脑钠肽前体(NT-proBNP) 诊断
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LOX家族与乳腺癌相关性研究进展 被引量:3
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作者 吴颖 杨继鑫 +1 位作者 李南林 凌瑞 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2015年第17期1412-1416,共5页
目的总结近年来赖氨酰氧化酶(lysyl oxidase,LOX)与乳腺癌相关性的研究进展。方法应用PubMed及CNKI期刊全文数据库检索系统,以"lysyl oxidase、LOX、LOX乳腺癌和lysyl oxidase乳腺癌"为关键词,检索2009-01-2015-06文献。共检... 目的总结近年来赖氨酰氧化酶(lysyl oxidase,LOX)与乳腺癌相关性的研究进展。方法应用PubMed及CNKI期刊全文数据库检索系统,以"lysyl oxidase、LOX、LOX乳腺癌和lysyl oxidase乳腺癌"为关键词,检索2009-01-2015-06文献。共检索到英文文献3 041条,中文文献24条。纳入标准:1)LOX基因及其编码蛋白质特性;2)LOX与乳腺癌的相关性。剔除标准:1)LOX与其他肿瘤相关性的研究;2)有关LOX综述文献。根据上述标准最终分析28篇文献,并加入早期原始文献1篇。结果 LOX可促进乳腺癌细胞迁移、侵袭和增殖,干扰乳腺癌细胞中的LOX表达,可抑制其恶性行为,且LOX过表达患者预后及淋巴结情况差。赖氨酰氧化酶前肽(LOX pro-peptide,LOX-PP)的表达与乳腺癌呈负相关。针对LOX的治疗方案可能对乳腺癌有一定的效果。结论 LOX家族与乳腺癌密切相关,但一些结论仍需基础及临床研究支持。通过大样本分层分析结合基因组多位点关联研究验证LOX与乳腺癌的相关性。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 赖氨酰氧化酶 赖氨酰氧化酶样蛋白-2 赖氨酰氧化酶前肽 预后 治疗 综述文献
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