不同化州柚品系新橘皮糖苷合成关键酶基因的差异表达分析

目的:发掘5个化州柚品系中新橘皮糖苷(NEO)关键合成酶差异表达基因及其序列变异。方法:调查分析不同化州柚品系性状特征,基于转录组数据筛选品系差异表达的NEO合成关键酶基因,并通过RT-qPCR验证表达量,再进行候选基因的克隆及序列比对、蛋白质性质分析、进化树构建等生信分析。结果:密叶、密叶红肉品系性状高度相似,且2个品系幼果中NEO合成关键酶基因CgT1,2RhaT的表达量均低于其他品系;各品系CgT1,2RhaT基因编码区序列长1 359 bp,编码452个氨基酸,高度同源且无内含子,但密叶、密叶红肉品系该基因的启动子区域存在多个SNPs和InDels;预测CgT1,2RhaT蛋白为不稳定的可溶性非分泌型蛋白,与Cm1,2RhaT亲缘关系最近。结论:克隆获得5个化州柚品系新橘皮糖苷合成关键酶差异表达基因CgT1,2RhaT序列,发现2个性状相似的化州柚品系的基因CgT1,2RhaT表达量较低,可能与其启动子区域的变异位点有关,该发现为阐明不同化州柚品系成分积累的差异、功能基因差异表达的分子机制提供了基础研究,并为化州柚品种选育提供了基因资源。