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小麦粒重基因TaGW2-6A等位变异的高通量分子检测 被引量:3
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作者 寇程 李学军 +5 位作者 高欣 吕千 杜登峰 程显 李扬 李立群 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1467-1475,共9页
为了开发出一种高通量的TaGW2-6A基因等位变异分子检测技术,利用高分辨率熔解曲线分析技术(High resolution melting curve analysis,HRM)检测了316份小麦材料的TaGW2-6A基因编码区T碱基插入等位变异以及启动子区Hap-6A-A(-593A和-739G)... 为了开发出一种高通量的TaGW2-6A基因等位变异分子检测技术,利用高分辨率熔解曲线分析技术(High resolution melting curve analysis,HRM)检测了316份小麦材料的TaGW2-6A基因编码区T碱基插入等位变异以及启动子区Hap-6A-A(-593A和-739G)和Hap-6A-G(-593G和-739A)等位变异,同时利用桑格测序和Hap-6A-P1/P2分子标记验证HRM的分析结果。结果表明,HRM技术能够准确、高效的检测TaGW2-6A基因的等位变异。在316份材料中,检测到61份T碱基插入等位变异材料(命名为TT基因型)和255份无T碱基插入的等位变异材料(命名为tt基因型);其中,189份为Hap-6A-A单倍型材料,127份为Hap-6A-G单倍型材料。 展开更多
关键词 小麦 TaGW2-6A基因 等位变异 高分辨率熔解曲线(HRM)
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香蕉海藻糖-6-磷酸合成酶基因MaTPS2克隆及表达特性分析 被引量:1
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作者 王安邦 吴琼 +6 位作者 舒海燕 许桂莺 苗红霞 柯建浩 贾彩虹 邢文婷 许奕 《中国南方果树》 北大核心 2016年第6期19-24,共6页
在获得MaTPS2基因全长序列的基础上,采用同源序列比对、聚类分析、实时定量PCR等技术初步探讨香蕉MaTPS2基因的功能。从香蕉A基因组中获得一条3 277bp MaTPS2全长序列,包含一个完整的开放阅读框1 344bp,编码蛋白含447个氨基酸。其氨基... 在获得MaTPS2基因全长序列的基础上,采用同源序列比对、聚类分析、实时定量PCR等技术初步探讨香蕉MaTPS2基因的功能。从香蕉A基因组中获得一条3 277bp MaTPS2全长序列,包含一个完整的开放阅读框1 344bp,编码蛋白含447个氨基酸。其氨基酸理化性质分析表明,MaTPS2蛋白属于不稳定疏水性蛋白,具有一个结构域GT1-TPS。通过与已知植物的TPS氨基酸同源序列比对,同源性达77.95%。系统发育树进化关系分析表明,MaTPS2编码的氨基酸序列与银杏TPS氨基酸序列(AAX16014.1)邻近,说明二者的亲缘关系较近。器官特异性分析表明,MaTPS2在香蕉植株的根、球茎、假茎、叶、花各器官中均有表达,其中在球茎、假茎和叶中表达量较多,在果实中表达量较低。在ABA、干旱、盐害和枯萎病菌胁迫处理下,MaTPS2表达量升高,在ACC胁迫处理下,MaTPS2表达量显著下降,而低温胁迫条件下,MaTPS2表达不响应。由此推导,MaTPS2可能参与调控香蕉抗旱、抗病机制。植物生长调节剂ACC和ABA胁迫处理说明MaTPS2的表达可能受激素蛋白间接调控。 展开更多
关键词 香蕉 海藻糖-6-磷酸合成酶基因(TPS2) 生物信息学 qPCR 表达分析 胁迫
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PRRSV河南地方分离株ORF 2~6基因的克隆与序列分析 被引量:1
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作者 党占国 李志勇 +2 位作者 陈溥言 崔保安 夏平安 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2008年第7期10-13,共4页
根据GenBank公布的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ATCC VR-2332株的ORF2~6基因的核苷酸序列,设计合成4对特异性引物,用RT—PCR方法扩增出PRRSV河南地方株(命名为HN-2株)的ORF 2~6片段,克隆到pUC-57T载体并进行测序。应用DNASta... 根据GenBank公布的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ATCC VR-2332株的ORF2~6基因的核苷酸序列,设计合成4对特异性引物,用RT—PCR方法扩增出PRRSV河南地方株(命名为HN-2株)的ORF 2~6片段,克隆到pUC-57T载体并进行测序。应用DNAStar序列分析软件对分离株的ORF 2~6基因和其推导的氨基酸序列与不同来源的9个PRRSV毒株进行了同源性比较,结果表明:该分离株的ORF 2~6基因与不同来源美洲型毒株之间的同源性分别为89.1%~98.1%和81.4%~96.1%,而与欧洲型毒株之间的同源性仅为46.9%~61.9%和44.2%~45.0%;同时将分离株ORF 2~6基因的推导氨基酸序列与7个关洲型PRRSV毒株进行变异分析比较,证实了该分离株ORF 2~6基因发生了变异。 展开更多
关键词 PRRSV ORF 2-6基因 基因克隆 变异分析
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2-氧化戊二酸依赖的双加氧酶基因F6’H1促进拟南芥叶片衰老 被引量:1
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作者 胡有贞 王雅欣 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1873-1879,共7页
拟南芥2-氧化戊二酸依赖的双加氧酶基因F6’H1缺失突变体f6’h1出现叶片衰老延迟表型。利用根癌农杆菌介导的花序浸染法转化拟南芥,再以抗性筛选方法获得了F6’H1基因诱导过量表达拟南芥植株,地塞米松(DEX)喷施处理24 h能显著诱导F6’H... 拟南芥2-氧化戊二酸依赖的双加氧酶基因F6’H1缺失突变体f6’h1出现叶片衰老延迟表型。利用根癌农杆菌介导的花序浸染法转化拟南芥,再以抗性筛选方法获得了F6’H1基因诱导过量表达拟南芥植株,地塞米松(DEX)喷施处理24 h能显著诱导F6’H1基因上调表达,F6’H1基因的过量表达使转基因拟南芥叶片衰老提前。结果表明,拟南芥2-氧化戊二酸依赖的双加氧酶基因F6’H1正向调控叶片衰老。 展开更多
关键词 拟南芥 2-氧化戊二酸依赖的双加氧酶基因F6’H1 叶片衰老
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NKX6-2基因纯合突变致痉挛型共济失调8型1例报告并文献复习
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作者 李碧云 肖慧媚 +3 位作者 裴铮 常燕群 刘芳 王林淦 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期456-459,共4页
NKX6-2编码一种涉及少突胶质细胞发生和发育的转录因子。近年来,NKX6-2基因突变被证实与一种严重的低髓鞘化性脑白质营养不良——痉挛型共济失调8型(SPAX8)有关。截至2020年3月24日,已有36例共涉及11种NKX6-2基因突变类型的SPAX8病例报... NKX6-2编码一种涉及少突胶质细胞发生和发育的转录因子。近年来,NKX6-2基因突变被证实与一种严重的低髓鞘化性脑白质营养不良——痉挛型共济失调8型(SPAX8)有关。截至2020年3月24日,已有36例共涉及11种NKX6-2基因突变类型的SPAX8病例报道,但尚未见中国病例。本研究回顾性报道2019年10月广东省妇幼保健院康复医学科收治的第1例SPAX8中国患儿(男,2岁7个月),其携带一种新的纯合NKX6-2移码突变c.234dup(p.Leu79Alafs*?),临床表现为严重的全面发育迟缓、四肢痉挛、眼球震颤、听力障碍和一些尚未见报道的眼部表型,如倒睫、双眼屈光不正和右眼视网膜变性。本研究同时报道了与先证者有类似症状但未进行基因检测的姐姐表型,并进行相关文献复习。本例报道扩展了SPAX8的基因型和表型谱。 展开更多
关键词 痉挛型共济失调8型 NKX6-2基因 低髓鞘化性脑白质营养不良 突变
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