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题名R-2-氯丙酸脱卤酶的定向进化
被引量:1
- 1
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作者
秦迎春
刘鹏
杨立荣
徐刚
吴坚平
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机构
浙江大学化学工程与生物工程学系
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出处
《生物加工过程》
CAS
CSCD
2013年第1期65-69,共5页
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基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)资助(2011CB710800)
国家高技术研究发展计划(863计划)资助(2011AA02A209)
国家自然科学基金面上项目资助(21076187)
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文摘
通过易错PCR手段将R-2-氯丙酸脱卤酶定向进化,并使用基于Cl-浓度显色反应的高通量筛选得到有效突变子库,发现突变子DehDIV-G2和DehDIV-E7的酶比活力分别提高25.2%和38.7%。通过SYBYL对酶与底物进行分子对接显示,DehDIV-G2的活化能下降0.961 4 kJ/mol,DehDIV-E7的活化能下降2.549 8 kJ/mol。由于酶和底物R-2-氯丙酸的活化能下降,亲和能力提高,从而提高酶的比活力。
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关键词
2-氯丙酸
脱卤酶
定向进化
分子对接
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Keywords
2-chloropropionic acid
dehalogenase
directed evolution
molecular docking
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分类号
Q814
[生物学—生物工程]
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题名S-2-氯丙酸脱卤酶的定向进化及其应用
被引量:4
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作者
刘鹏
林春娇
杨立荣
徐刚
吴坚平
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机构
浙江大学化学工程与生物工程学系
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出处
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期66-72,共7页
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基金
国家"973"计划(2011CB710805)
国家自然科学基金面上项目(21076187)资助项目
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文摘
为提高S-2-氯丙酸脱卤酶的活力,通过易错PCR的方法将源于假单胞菌(Pseudomonas sp.CGMCC 3267)的脱卤酶(DehII)进行定向进化,进化酶DehII-B2的比活提高3.9倍。同源模建两者的三维结构,并与底物进行分子对接。结果表明,突变位点为A7I,进化酶DehII-B2的结合能比原始酶降低了1.4kcal/mol,活性中心Asp10与底物α碳原子的距离缩短了0.321 6nm,因而加快了酶反应速率、提高了酶比活。目前,该酶的比活高于实验室已得酶。与原始酶相比,其最适温度和热稳定性略有增加,最适pH和pH稳定性没有明显变化。对该酶的应用做了初步的探索,结果表明在40℃,60mmol/L底物浓度下反应10h,转化率达到49.6%,ees>99.9%,因此该酶有一定的应用价值。
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关键词
2-氯丙酸
脱卤酶
定向进化
分子对接
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Keywords
2-cpa dehalogenase directed evolution molecular docking
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分类号
Q556
[生物学—生物化学]
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