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DNA序列非退化的二维图形表示及其应用
被引量:
1
1
作者
李春
刘欢
+2 位作者
褚威威
费文超
韩苗苗
《渤海大学学报(自然科学版)》
CAS
2014年第4期307-312,324,共7页
提出了一种新的DNA序列的2-D图形表示方法,并证明了它的非退化性,随后结合图形表示给出DNA序列的12个正规化的ALE指标.在此基础上,结合双核苷酸计数和符号序列LZ复杂度,将DNA序列转化为一个29维的数值向量.对23个物种的β球蛋白基因和1...
提出了一种新的DNA序列的2-D图形表示方法,并证明了它的非退化性,随后结合图形表示给出DNA序列的12个正规化的ALE指标.在此基础上,结合双核苷酸计数和符号序列LZ复杂度,将DNA序列转化为一个29维的数值向量.对23个物种的β球蛋白基因和18个物种的线粒体NADH脱氢酶序列进行的系统发生分析,证明了所提方法的有效性.
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关键词
DNA
2-d图形表示
非退化
ALE指标
系统发生分析
下载PDF
职称材料
题名
DNA序列非退化的二维图形表示及其应用
被引量:
1
1
作者
李春
刘欢
褚威威
费文超
韩苗苗
机构
渤海大学数理学院
出处
《渤海大学学报(自然科学版)》
CAS
2014年第4期307-312,324,共7页
基金
国家自然科学基金项目(No:11171042)
辽宁省"百千万人才工程"项目(No:2012921060)
+1 种基金
辽宁省高等学校创新团队(No:LT2014024)
辽宁省食品安全重点实验室开放课题(No:LNSAKF2011034)
文摘
提出了一种新的DNA序列的2-D图形表示方法,并证明了它的非退化性,随后结合图形表示给出DNA序列的12个正规化的ALE指标.在此基础上,结合双核苷酸计数和符号序列LZ复杂度,将DNA序列转化为一个29维的数值向量.对23个物种的β球蛋白基因和18个物种的线粒体NADH脱氢酶序列进行的系统发生分析,证明了所提方法的有效性.
关键词
DNA
2-d图形表示
非退化
ALE指标
系统发生分析
Keywords
DNA
2
-d
graphical representation
nondegeneracy
ALE-index
phylogenetic analysis
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
DNA序列非退化的二维图形表示及其应用
李春
刘欢
褚威威
费文超
韩苗苗
《渤海大学学报(自然科学版)》
CAS
2014
1
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职称材料
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参考文献
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