【目的】探究猪特有的细胞色素P450超家族3A亚族成员29(cytochrome P4503A 29,CYP3A29)基因3′-UTR区核苷酸结构变异(structural variation,SV)对该基因表达的影响,解析该结构变异与香猪肉质性状形成的关系。【方法】以香猪、大白猪为...【目的】探究猪特有的细胞色素P450超家族3A亚族成员29(cytochrome P4503A 29,CYP3A29)基因3′-UTR区核苷酸结构变异(structural variation,SV)对该基因表达的影响,解析该结构变异与香猪肉质性状形成的关系。【方法】以香猪、大白猪为研究对象,应用UCSC、miRBase、PITA、RBPsuite等软件预测CYP 3 A 29基因3′-UTR区结构变异区间所包含的重复元件、miRNA和RBP结合位点;采用PCR方法对结构变异位点进行基因分型;计算群体基因型频率、基因频率及Hardy-Weinberg平衡状态;采用实时荧光定量PCR检测该变异对CYP 3 A 29基因表达的影响;利用ELISA法检测香猪肌肉组织中CYP3A29蛋白含量和雄激素(T、DHT)水平,并使用SPSS 17.0软件对T、DHT含量与不同基因型进行Pearson相关性分析。【结果】生物信息学分析显示,CYP 3 A 29基因3′-UTR的结构变异区全长303 bp,该变异区存在1个长为241 bp的短散在元件(short interspersed element,SINE),属于Pre0_SStRNA家族,位于Chr3:6819917―6820161,含有33个miRNAs和13个RBPs结合位点。基因分型显示,该结构变异在香猪、大白猪群体中呈现出丰富的多态性,表现为II基因型(插入型)、ID基因型(杂合型)、DD基因型(双缺失)。基因型群体分布频率显示,香猪中的D等位基因频率高于大白猪,该结构变异在香猪中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),在大白猪中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。实时荧光定量PCR和ELISA结果显示,CYP 3 A 29基因ID基因型个体mRNA表达量和蛋白含量均显著高于II和DD基因型(P<0.05)。相关性分析结果显示,香猪不同基因型个体CYP3A29基因含量与肌肉组织中T浓度呈显著相关(P<0.05),与DHT浓度不相关(P>0.05)。香猪ID基因型个体T浓度显著高于DD和II基因型(P<0.05),DD基因型个体DHT浓度显著高于ID和II基因型(P<0.05)。【结论】CYP 3 A 29基因3′-UTR区长度为303 bp的结构变异在香猪群体中具有多态性,以缺失型D等位基因为主,即该结构变异在香猪中缺失SINE元件,导致CYP 3 A 29基因表达上调,进而影响香猪肌肉组织中T浓度。CYP 3 A 29基因3′-UTR结构变异与香猪肉质性状具有相关性。展开更多
目的探讨TRIM29基因表达与非小细胞肺癌临床病理的关系及意义。方法用免疫组化Envision二步法检测251例非小细胞肺癌手术治疗患者癌组织(其中肺鳞癌127例、肺腺癌124例)和癌旁组织的TR IM 29蛋白表达,分析其与临床病理因素的关系。结果 ...目的探讨TRIM29基因表达与非小细胞肺癌临床病理的关系及意义。方法用免疫组化Envision二步法检测251例非小细胞肺癌手术治疗患者癌组织(其中肺鳞癌127例、肺腺癌124例)和癌旁组织的TR IM 29蛋白表达,分析其与临床病理因素的关系。结果 251例非小细胞肺癌的癌组织TR IM 29表达明显高于癌旁正常肺组织,TR IM 29表达与肺鳞癌组织分级、TNM分期及淋巴结转移呈正相关,与肺腺癌肿块大小、组织分级、TN M分期及淋巴结转移呈正相关,TRIM29在肺鳞癌及腺癌中表达差异具有显著性,低分化肺鳞癌TRIM29表达强度明显高于低分化肺腺癌(以上均P<0.01)。结论建议在常规肺癌病理诊断中组合免疫标记TRIM29,可提高病理诊断的正确率,对临床的分期及治疗具有参考价值。展开更多
目的研究TRIM29在非小细胞肺癌中的表达情况并探讨其临床诊断价值。方法采用免疫组化检测依兰县人民医院2011年1月~2015年1月间收治的113例非小细胞肺癌手术治疗患者癌组织中TRIM29表达情况。结果 TRIM 29在肺鳞癌与肺腺癌中阳性率较高...目的研究TRIM29在非小细胞肺癌中的表达情况并探讨其临床诊断价值。方法采用免疫组化检测依兰县人民医院2011年1月~2015年1月间收治的113例非小细胞肺癌手术治疗患者癌组织中TRIM29表达情况。结果 TRIM 29在肺鳞癌与肺腺癌中阳性率较高,均有明显高表达,差异具有统计学意义（P〈0.05）,并且TRIM 29在肺鳞癌中表达强度明显高于在肺腺癌中表达,差异显著,具有统计学差异（P〈0.05）。TRIM 29表达与肺鳞癌组织分级、TNM分期及淋巴结转移呈密切正相关性（P〈0.05）,与肿瘤大小无关（P〉0.05）。TRIM 29表达与肺腺癌肿块大小、组织分级、TNM分期及淋巴结转移呈密切正相关性（P〈0.05）。且在非小细胞肺癌中TRIM 29表达与患者的性别、年龄无关（P〉0.05）。结论 TRIM29基因表达在非小细胞肺癌病理诊断中有重要意义,可提高病理诊断的正确率。展开更多
文摘【目的】探究猪特有的细胞色素P450超家族3A亚族成员29(cytochrome P4503A 29,CYP3A29)基因3′-UTR区核苷酸结构变异(structural variation,SV)对该基因表达的影响,解析该结构变异与香猪肉质性状形成的关系。【方法】以香猪、大白猪为研究对象,应用UCSC、miRBase、PITA、RBPsuite等软件预测CYP 3 A 29基因3′-UTR区结构变异区间所包含的重复元件、miRNA和RBP结合位点;采用PCR方法对结构变异位点进行基因分型;计算群体基因型频率、基因频率及Hardy-Weinberg平衡状态;采用实时荧光定量PCR检测该变异对CYP 3 A 29基因表达的影响;利用ELISA法检测香猪肌肉组织中CYP3A29蛋白含量和雄激素(T、DHT)水平,并使用SPSS 17.0软件对T、DHT含量与不同基因型进行Pearson相关性分析。【结果】生物信息学分析显示,CYP 3 A 29基因3′-UTR的结构变异区全长303 bp,该变异区存在1个长为241 bp的短散在元件(short interspersed element,SINE),属于Pre0_SStRNA家族,位于Chr3:6819917―6820161,含有33个miRNAs和13个RBPs结合位点。基因分型显示,该结构变异在香猪、大白猪群体中呈现出丰富的多态性,表现为II基因型(插入型)、ID基因型(杂合型)、DD基因型(双缺失)。基因型群体分布频率显示,香猪中的D等位基因频率高于大白猪,该结构变异在香猪中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),在大白猪中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。实时荧光定量PCR和ELISA结果显示,CYP 3 A 29基因ID基因型个体mRNA表达量和蛋白含量均显著高于II和DD基因型(P<0.05)。相关性分析结果显示,香猪不同基因型个体CYP3A29基因含量与肌肉组织中T浓度呈显著相关(P<0.05),与DHT浓度不相关(P>0.05)。香猪ID基因型个体T浓度显著高于DD和II基因型(P<0.05),DD基因型个体DHT浓度显著高于ID和II基因型(P<0.05)。【结论】CYP 3 A 29基因3′-UTR区长度为303 bp的结构变异在香猪群体中具有多态性,以缺失型D等位基因为主,即该结构变异在香猪中缺失SINE元件,导致CYP 3 A 29基因表达上调,进而影响香猪肌肉组织中T浓度。CYP 3 A 29基因3′-UTR结构变异与香猪肉质性状具有相关性。
文摘目的探讨TRIM29基因表达与非小细胞肺癌临床病理的关系及意义。方法用免疫组化Envision二步法检测251例非小细胞肺癌手术治疗患者癌组织(其中肺鳞癌127例、肺腺癌124例)和癌旁组织的TR IM 29蛋白表达,分析其与临床病理因素的关系。结果 251例非小细胞肺癌的癌组织TR IM 29表达明显高于癌旁正常肺组织,TR IM 29表达与肺鳞癌组织分级、TNM分期及淋巴结转移呈正相关,与肺腺癌肿块大小、组织分级、TN M分期及淋巴结转移呈正相关,TRIM29在肺鳞癌及腺癌中表达差异具有显著性,低分化肺鳞癌TRIM29表达强度明显高于低分化肺腺癌(以上均P<0.01)。结论建议在常规肺癌病理诊断中组合免疫标记TRIM29,可提高病理诊断的正确率,对临床的分期及治疗具有参考价值。
