橡胶树死皮(Tapping panel dryness,TPD)是限制天然橡胶产量提高的关键因子之一,鉴定健康和死皮橡胶树胶乳差异表达蛋白对阐明橡胶树死皮发生机制具有重要意义。研究首次采用同位素标记相对和绝对定量(Isobaric tags for relative and a...橡胶树死皮(Tapping panel dryness,TPD)是限制天然橡胶产量提高的关键因子之一,鉴定健康和死皮橡胶树胶乳差异表达蛋白对阐明橡胶树死皮发生机制具有重要意义。研究首次采用同位素标记相对和绝对定量(Isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)结合二维液相色谱串联质谱(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry,2D LC-MS/MS)技术对健康和死皮橡胶树胶乳蛋白质组的差异进行研究。结果显示,有16个蛋白差异表达,其中,在死皮树中表达上调的蛋白有2个,下调的蛋白有14个。进一步应用实时荧光定量RT-PCR对其中6个差异蛋白的基因进行表达分析,发现其表达趋势与蛋白质组水平的研究结果一致。功能分析显示,这些差异蛋白主要与细胞程序性死亡(如TCTP、HSP70、CaM、cysteine protease等)和橡胶生物合成(如SRPP和diphosphomevelonate decarboxylase)相关,从蛋白质组学角度进一步验证了橡胶树死皮发生过程中涉及细胞程序性死亡和橡胶生物合成途径。展开更多
首次利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术结合二维液相色谱串联质谱对草菇(Volvariella volvacea)同核和异核菌丝蛋白质组进行研究。采用QExactive质谱鉴定并经MASCOT软...首次利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术结合二维液相色谱串联质谱对草菇(Volvariella volvacea)同核和异核菌丝蛋白质组进行研究。采用QExactive质谱鉴定并经MASCOT软件搜库,对所有鉴定蛋白进行主成分分析(principal component analysis,PCA)、层次聚类(hierarchical clustering)分析和GO(gene ontology)注释,并进行生物信息学分析。结果共获得2335个不同肽段,鉴定到1039个蛋白,其中1030个蛋白具有定量信息。在同核菌丝中显著上调蛋白83个,下调蛋白97个,表明iTRAQ标记技术结合二维液相色谱串联质谱可有效地分离和鉴定草菇菌丝蛋白质组。该研究结果为更深入全面地研究草菇菌丝蛋白质组学奠定基础。展开更多
目的分析2型糖尿病患者25-羟维生素D[25(OH)D]水平,初步了解血清25(OH)D水平与2型糖尿病患者糖化血红蛋白(HbA1c)、胰岛功能等代谢指标的相关性。方法选择新乡市第一人民医院内分泌科2020年1月至2020年12月收治的459例2型糖尿病患者为...目的分析2型糖尿病患者25-羟维生素D[25(OH)D]水平,初步了解血清25(OH)D水平与2型糖尿病患者糖化血红蛋白(HbA1c)、胰岛功能等代谢指标的相关性。方法选择新乡市第一人民医院内分泌科2020年1月至2020年12月收治的459例2型糖尿病患者为研究对象。收集患者的临床资料,包括性别、年龄、血清25(OH)D、空腹胰岛素、C肽、HbA1c、空腹血糖、餐后血糖、尿微量白蛋白、尿白蛋白肌酐比值、血钙、血尿酸(UA)、三酰甘油(TG)、总胆固醇(TCH)、低密度脂蛋白(LDL)、高密度脂蛋白(HDL)等。根据血清25(OH)D水平将患者分为充足组[n=20,25(OH)D≥30μg·L^(-1)]、不足组[n=95,20μg·L^(-1)≤25(OH)D<30μg·L^(-1)]、缺乏组[n=231,10μg·L^(-1)≤25(OH)D<20μg·L^(-1)]、严重缺乏组[n=113,25(OH)D<10μg·L^(-1)]。比较4组患者各代谢指标的差异,采用Pearson相关分析25(OH)D与各代谢指标的相关性。结果2型糖尿病患者血清25(OH)D水平为3.00~46.59(15.75±0.35)μg·L^(-1),男性患者的血清25(OH)D水平显著高于女性患者(P<0.05)。2型糖尿病患者25(OH)D缺乏的患病率为74.9%(344/459),25(OH)D缺乏主要发生在1、2、3、4、11、12月份。不足组、缺乏组和严重缺乏组患者HbA1c显著高于充足组(P<0.05),缺乏组和严重缺乏组患者HbA1c显著高于不足组(P<0.05);缺乏组和严重缺乏组患者HbA1c比较差异无统计学意义(P>0.05)。充足组与不足组、缺乏组与严重缺乏组患者空腹血糖比较差异无统计学意义(P>0.05);缺乏组和严重缺乏组患者空腹血糖显著高于充足组、不足组(P<0.05)。充足组、不足组、缺乏组患者空腹胰岛素、尿微量白蛋白、日尿白蛋白总量、尿白蛋白肌酐比值比较差异无统计学意义(P>0.05);严重缺乏组患者空腹胰岛素显著低于充足组、不足组和缺乏组,尿微量白蛋白、日尿白蛋白总量、尿白蛋白肌酐比值显著高于充足组、不足组和缺乏组(P<0.05)。4组患者的稳态模型评估的胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)、血清白蛋白、血肌酐、餐后1 h血糖、餐后2 h血糖、餐后3 h血糖、空腹C肽、餐后1 h C肽、餐后2 h C肽、餐后3 h C肽、TG、TCH、LDL、HDL、血UA、血钙比较差异均无统计学意义(P>0.05)。Pearson相关性分析结果显示,2型糖尿病患者血清25(OH)D水平与HbA1c、尿微量白蛋白、尿白蛋白肌酐比值呈负相关(r=-0.093、-0.166、-0.157,P<0.05),与空腹胰岛素呈正相关(r=0.089,P<0.05)。2型糖尿病患者血清25(OH)D水平与空腹血糖、HOMA-IR、血清白蛋白、血肌酐、餐后1 h血糖、餐后2 h血糖、餐后3 h血糖、空腹C肽、餐后1 h C肽、餐后2 h C肽、餐后3 h C肽、TG、TCH、LDL、HDL、血UA、血钙等无相关性(P>0.05)。结论2型糖尿病患者25(OH)D缺乏与不足普遍存在,女性患者缺乏更明显。2型糖尿病患者25(OH)D水平与空腹胰岛素呈正相关,与HbA1c、尿微量白蛋白、尿白蛋白肌酐比值呈负相关,25(OH)D缺乏的2型糖尿病患者主要分布在1、2、3、4、11、12月份。展开更多
基金国家现代农业产业技术体系建设专项资金资助(编号:CARS 24)supported by the Engineering Research Center of EdibleFungi of Fujian Province,National ImprovementCenter of Edible Fungi Varieties(Fujian Subcenter)and the Institute of Biochemistry and Cell Biology,Shanghai Institute for Biological Science,Chinese Academy of Sciences~~
文摘首次利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术结合二维液相色谱串联质谱对草菇(Volvariella volvacea)同核和异核菌丝蛋白质组进行研究。采用QExactive质谱鉴定并经MASCOT软件搜库,对所有鉴定蛋白进行主成分分析(principal component analysis,PCA)、层次聚类(hierarchical clustering)分析和GO(gene ontology)注释,并进行生物信息学分析。结果共获得2335个不同肽段,鉴定到1039个蛋白,其中1030个蛋白具有定量信息。在同核菌丝中显著上调蛋白83个,下调蛋白97个,表明iTRAQ标记技术结合二维液相色谱串联质谱可有效地分离和鉴定草菇菌丝蛋白质组。该研究结果为更深入全面地研究草菇菌丝蛋白质组学奠定基础。
文摘目的分析2型糖尿病患者25-羟维生素D[25(OH)D]水平,初步了解血清25(OH)D水平与2型糖尿病患者糖化血红蛋白(HbA1c)、胰岛功能等代谢指标的相关性。方法选择新乡市第一人民医院内分泌科2020年1月至2020年12月收治的459例2型糖尿病患者为研究对象。收集患者的临床资料,包括性别、年龄、血清25(OH)D、空腹胰岛素、C肽、HbA1c、空腹血糖、餐后血糖、尿微量白蛋白、尿白蛋白肌酐比值、血钙、血尿酸(UA)、三酰甘油(TG)、总胆固醇(TCH)、低密度脂蛋白(LDL)、高密度脂蛋白(HDL)等。根据血清25(OH)D水平将患者分为充足组[n=20,25(OH)D≥30μg·L^(-1)]、不足组[n=95,20μg·L^(-1)≤25(OH)D<30μg·L^(-1)]、缺乏组[n=231,10μg·L^(-1)≤25(OH)D<20μg·L^(-1)]、严重缺乏组[n=113,25(OH)D<10μg·L^(-1)]。比较4组患者各代谢指标的差异,采用Pearson相关分析25(OH)D与各代谢指标的相关性。结果2型糖尿病患者血清25(OH)D水平为3.00~46.59(15.75±0.35)μg·L^(-1),男性患者的血清25(OH)D水平显著高于女性患者(P<0.05)。2型糖尿病患者25(OH)D缺乏的患病率为74.9%(344/459),25(OH)D缺乏主要发生在1、2、3、4、11、12月份。不足组、缺乏组和严重缺乏组患者HbA1c显著高于充足组(P<0.05),缺乏组和严重缺乏组患者HbA1c显著高于不足组(P<0.05);缺乏组和严重缺乏组患者HbA1c比较差异无统计学意义(P>0.05)。充足组与不足组、缺乏组与严重缺乏组患者空腹血糖比较差异无统计学意义(P>0.05);缺乏组和严重缺乏组患者空腹血糖显著高于充足组、不足组(P<0.05)。充足组、不足组、缺乏组患者空腹胰岛素、尿微量白蛋白、日尿白蛋白总量、尿白蛋白肌酐比值比较差异无统计学意义(P>0.05);严重缺乏组患者空腹胰岛素显著低于充足组、不足组和缺乏组,尿微量白蛋白、日尿白蛋白总量、尿白蛋白肌酐比值显著高于充足组、不足组和缺乏组(P<0.05)。4组患者的稳态模型评估的胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)、血清白蛋白、血肌酐、餐后1 h血糖、餐后2 h血糖、餐后3 h血糖、空腹C肽、餐后1 h C肽、餐后2 h C肽、餐后3 h C肽、TG、TCH、LDL、HDL、血UA、血钙比较差异均无统计学意义(P>0.05)。Pearson相关性分析结果显示,2型糖尿病患者血清25(OH)D水平与HbA1c、尿微量白蛋白、尿白蛋白肌酐比值呈负相关(r=-0.093、-0.166、-0.157,P<0.05),与空腹胰岛素呈正相关(r=0.089,P<0.05)。2型糖尿病患者血清25(OH)D水平与空腹血糖、HOMA-IR、血清白蛋白、血肌酐、餐后1 h血糖、餐后2 h血糖、餐后3 h血糖、空腹C肽、餐后1 h C肽、餐后2 h C肽、餐后3 h C肽、TG、TCH、LDL、HDL、血UA、血钙等无相关性(P>0.05)。结论2型糖尿病患者25(OH)D缺乏与不足普遍存在,女性患者缺乏更明显。2型糖尿病患者25(OH)D水平与空腹胰岛素呈正相关,与HbA1c、尿微量白蛋白、尿白蛋白肌酐比值呈负相关,25(OH)D缺乏的2型糖尿病患者主要分布在1、2、3、4、11、12月份。