猪圆环病毒2型2d基因型毒株的鉴定及全基因组序列分析

辽宁省某市猪场发生疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)传染性疾病,采集病死仔猪肺脏组织和淋巴结,经PCR检测、阳性产物测序、基因组分析,结果表明,该分离株为猪圆环病毒2型2 d基因型(PCV2d),命名为PCV-LNZh W1,全长1 767 bp,与国内外参考毒株核苷酸序列同源性为94.5%~99.9%,与PCV2d基因型的参考毒株位于同一遗传进化树分支。

猪圆环病毒2型2d基因型毒株的全基因组序列分析

根据Gen Bank中猪圆环病毒2型(PCV 2)基因序列,设计特异性引物,用PCR方法从福州郊区某猪场疑似PMWS仔猪病料处理后接种育传三代的PK-15细胞中扩增1个分离毒株的全基因组,并将其克隆到p MD-18T载体上,对鉴定为阳性的重组质粒送检测序。对该分离株的基因全序列及其开放阅读框2(ORF2)进行同源性分析及遗传进化关系分析。PCR鉴定结果显示,本试验中分离到的病毒属于PCV2,命名为PCV2-FZ株。全基因组序列分析显示,分离株全基因组大小为1 767 bp,含有11个开放性阅读框,其中ORF2大小为705 bp,共编码234个氨基酸。PCV2-FZ株与参考毒株基因全序列的核苷酸同源性为94.3%~99.4%,与SD毒株同源性最高,为99.4%;与DK1980PMWSfree和DK1990PMWSfree毒株同源性最低,为94.3%。分离株与参考毒株ORF2核苷酸同源性为89.2%~99.4%,其中与SD毒株同源性最高,为99.4%,与DK1980PMWSfree毒株和DK1987PMWSfree毒株同源性最低,均为89.2%。全基因组与ORF2序列遗传进化树分析均表明,PCV2-FZ株属于PCV2d基因型。本研究从福建省首次分离并鉴定了1株PCV2d型毒株,这对PCV2流行病学研究和遗传变异分析具有重要意义。

中国人群CYP2D6基因多态性及其与激素受体阳性早期乳腺癌他莫昔芬代谢的关系

目的拟行前瞻Ⅱ期临床研究,探讨CYP2D6基因多态性在中国人群中的分布及其与激素受体阳性早期乳腺癌他莫昔芬代谢的关系。方法使用ABI 3500遗传分析仪通过Sanger测序行CYP2D6基因型测定。使用HPLC-MS/MS(API 2000)测定他莫昔芬和吲哚昔芬的血药浓度。CPIP数据库下载CYP2D6等位基因型数据进行统计学分析。结果 (1)中国乳腺癌患者最常见的等位基因型是CYP2D6*1,*2和*10;主要的双倍型是*1/*10(38.3%)和*10/*10(18.8%)。(2)在不同的CYP2D6活性预测标准下,代谢表型的分布存在差异,吲哚昔芬血药浓度以及吲哚昔芬/他莫昔芬血药浓度比值在正常代谢表型(EM)与中间表型(IM)之间结果不一致。(3)通过聚类分析三组之间吲哚昔芬血药浓度以及吲哚昔芬/他莫昔芬血药浓度比值差异有统计学意义。结论中国人CYP2D6基因型分布与西方人不同。以前被称为CYP2D6中间代谢型的患者间血清吲哚昔芬浓度有相当大的差异。在目前精准医学的时代,仅靠标准的CYP2D6基因型-表型分类系统不能对中国人群中不同吲哚昔芬浓度进行分层。

不同CYP2D6基因型对奥氮平药物副作用的影响

分析细胞色素P450酶(CYP2D6)基因型对奥氮平药物副作用的影响。方法:以我院收治的精神分裂症患者76例作为本实验的研究对象,根据患者CYP2D6基因型的不同,将研究对象分为CYP2D6*10组(n=34)、CYP2D6*2组(n=21)以及CYP2D6*65组(n=21)。所有患者在入院后均给予奥氮平进行治疗。观察比较患者治疗4周、8周后甘油三酯变化情况。结果:应用奥氮平进行治疗4周后,基因型为CYP2D6*10的患者TG变化情况最为明显;治疗8周后,基因型为CYP2D6*2的患者TG变化情况最为明显。结论:不同CYP2D6基因型精神分裂患者应用奥氮平所发生不良反应的概率有所不同,可根据患者基因型对药物使用进行调整,以降低不良反应。