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小西葫芦黄化花叶病毒分离物的3′末端序列多态性研究 被引量:4
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作者 陈洁云 陈集双 洪健 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期388-394,共7页
研究了来自中国大陆 9个小西葫芦黄化花叶病毒 (ZYMV)分离物的基因组 3′末端核苷酸序列及所推导的外壳蛋白 (CP)氨基酸序列以及 3′末端非编码区 (UTR)序列 ,并与其它地区所报道的 1 6个ZMYV分离物进行了同源性比较。ZYMVCP基因核苷酸... 研究了来自中国大陆 9个小西葫芦黄化花叶病毒 (ZYMV)分离物的基因组 3′末端核苷酸序列及所推导的外壳蛋白 (CP)氨基酸序列以及 3′末端非编码区 (UTR)序列 ,并与其它地区所报道的 1 6个ZMYV分离物进行了同源性比较。ZYMVCP基因核苷酸序列具有一定的寄主相关性和地域相关性 ,但总体上其关联程度不明显 ;同时 ,CP氨基酸序列的寄主适应性程度明显高于地域相关性。 2 5个ZYMV分离物的CP氨基酸序列根据其变异程度分为 2个区 :N端约 41个氨基酸为高度变异区 ,CP核心区和C端氨基酸序列为保守区。研究结果初步揭示了ZYMV作为单链RNA病毒通过与寄主相互作用而表现寄主适应性变异的趋势。 展开更多
关键词 小西葫芦黄化花叶病毒 3′末端序列 多态性 同源性分组 CP保守区 寄主适应性 马铃薯Y病毒属
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一步PCR法快速扩增辽宁碱蓬胆碱单加氧酶cDNA3′末端序列 被引量:2
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作者 李秋莉 高晓蓉 +2 位作者 袁晓东 刘大伟 安利佳 《植物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期584-587,共4页
根据已获得的辽宁碱蓬 (SuaedaliaotungensisKitag)胆碱单加氧酶cDNA的部分序列 ,设计一条基因特异性引物 ,与通用引物并用 ,一步PCR成功地克隆了辽宁碱蓬胆碱单加氧酶cDNA 3′末端。与常规的3′_RACE法相比 ,一步PCR法具有快速、简便... 根据已获得的辽宁碱蓬 (SuaedaliaotungensisKitag)胆碱单加氧酶cDNA的部分序列 ,设计一条基因特异性引物 ,与通用引物并用 ,一步PCR成功地克隆了辽宁碱蓬胆碱单加氧酶cDNA 3′末端。与常规的3′_RACE法相比 ,一步PCR法具有快速、简便、经济等优点 ,是一种非常快捷的扩增cDNA 展开更多
关键词 一步PCR法 快速扩增 辽宁碱蓬 胆碱单加氧酶 cDNA3′末端序列
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玉米叶片中甘蔗花叶病毒检测及其基因组3'端序列分析
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作者 龚海燕 朱水芳 +2 位作者 张永江 杨碧 高必达 《湖南农业科学》 2011年第6期8-10,共3页
在云南元谋采集的玉米叶片样品上获得一病毒分离物,经生物学(摩擦接种)、血清学(DAS-ELISA)和分子生物学(RT-PCR)鉴定,确定为甘蔗花叶病毒(Sugarcane Mosaic Virus,SCMV)。为分析其基因组3′端特性,以叶片中提取的总RNA为模板,对基因组... 在云南元谋采集的玉米叶片样品上获得一病毒分离物,经生物学(摩擦接种)、血清学(DAS-ELISA)和分子生物学(RT-PCR)鉴定,确定为甘蔗花叶病毒(Sugarcane Mosaic Virus,SCMV)。为分析其基因组3′端特性,以叶片中提取的总RNA为模板,对基因组3′端进行RT-PCR扩增,产物克隆到pMD18-T载体上进行序列分析。结果表明,SCMV基因组3′端序列包含了非编码区254个碱基和编码蛋白的1 578个碱基。运用Mega4.1构建进化树,系统进化树表明,除SCMV-Spain2外,其余分离物可明显的划分为2个群体:第Ⅰ群体包括分离物SCMV-SHANDONG,SCMV-SHANXI与SCMV-HENAN;第Ⅱ群体包括SCMV-Mexico和SCMV-Spain1。直观地看,SCMV分离物之间的系统进化关系和地理分布有一定的联系,SCMV-SHANDONG与SCMV-HENEN分离物关系很近,而SCMV云南分离物距离相对较远。其原因可能是云南分离物与中国其他地区分离物具有一个距今较近的共同祖先。 展开更多
关键词 玉米 甘蔗花叶病毒 检测 3′末端序列
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Identification of 5' capped structure and 3' terminal sequence of hepatitis E virus isolated from Morocco
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作者 Guo-BingChen Ji-HongMeng 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2004年第14期2045-2049,共5页
AIM: To examine 5′ and 3′ terminal sequences of hepatitis E virus (HEV) isolated from Morocco, to confirm 5′ methylated cap structure of the genome, and to investigate whether the 3′ UTR can be used to distinguish... AIM: To examine 5′ and 3′ terminal sequences of hepatitis E virus (HEV) isolated from Morocco, to confirm 5′ methylated cap structure of the genome, and to investigate whether the 3′ UTR can be used to distinguish HEV genotypes instead of HEV complete genome sequence.METHODS: RNA ligase-mediated rapid amplification of cDNA ends (RLM-RACE) was employed to obtain the 5′ and 3′ terminal sequences of HEV Morocco strain. The 3′ UTR sequence of the Morocco strain was compared with that of the other 29 HEV strains using the DNAStar software.RESULTS: The 5′ PCR product was obtained only from the RLM-RACE based on the capped RNA template. The 5′ UTR of the Morocco strain had 26 nucleotides, and the 3′ UTR had 65 nucleotides upstream to the polyA. The 5′ UTR between HEV strains had only point mutations of nucleotides.The phylogenetic tree based on the sequences of 3′ UTR was not the same as that based on the complete sequences.CONCLUSION: The genome of HEV Morocco strain was methylated cap structure. The 3′ terminal sequence can not be used for distinguishing HEV genotype for all HEV strains in place of the whole HEV genome sequence. 展开更多
关键词 5′帽结构 3′末端序列 HEV 戊型肝炎病毒 摩洛哥 CDNA
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An Experimental Model for Screening Anti-AIDS Drugs with Bovine Immunodeficiency Virus
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作者 王岱 刘淑红 +3 位作者 陈启民 耿运琪 徐为人 魏月芳 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS 1997年第1期35-39,共5页
The assays for bovine immunodeficiency virus (BIV) induced syncytium formation and BIV long terminal repeat (LTR) directed luciferase (Luc) gene expression were applied to screen and evaluate anti AIDS drugs. Frequen... The assays for bovine immunodeficiency virus (BIV) induced syncytium formation and BIV long terminal repeat (LTR) directed luciferase (Luc) gene expression were applied to screen and evaluate anti AIDS drugs. Frequency of the syncytium formation and BIV LTR directed Luc activity were in proportion to the number of input BIV infected cells. AZT inhibited the syncytium formation and the BIV LTR directed Luc gene expression level. Its inhibitory effects were dosedependent with the IC 50 being 0.24 and 0.052 mmol / L, respectively. 展开更多
关键词 Acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) Drug screening Bovine immunodeficiency virus (BIV) SYNCYTIUM Long terminal repeat (LTR) 3′ Azido 2′ 3′ dide oxythymidine (AZT)
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