猪1、3号染色体微卫星位点多态性及遗传连锁图谱的构建

利用 3头英系大白猪和 7头梅山猪为父母本建立了F2 参考家系。F1 公猪 5头 ,母猪 2 3头 ,随机交配产生 147个F2 个体。根据美国肉畜研究中心 (USDA MARC)公布的猪遗传连锁图谱 ,在 1号和 3号染色体上等间隔 (2 0cM)选择 8个和 9个微卫星标记 ,对参考家系全部的F0 、F1 和F2 个体进行扩增 ,获得各标记位点基因型。研究结果表明 ,等位基因数介于 2到 5之间 ,平均每位点 3.35个等位基因 ;部分等位基因片段长度超过USDA MARC所报道的结果。标记位点杂合度为 0 .385 3～ 0 .70 97,平均 0 .5 795。有信息的减数分裂数为 35～ 30 5 ,平均 2 40。利用此参考家系和CRI MAP软件包构建的 1号和 3号染色体图谱分别长 182 .3cM和 180 .2cM。 1号染色体的母畜图谱短于公畜图谱 ,而 3号染色体正好相反。与USDA MARC报道相比较 ,微卫星排列顺序与报道相同 ,但 1号染色体长 44 .8cM ,3号染色体长 6 3.3cM。此连锁图的构建为以后的数量性状基因位点 (quantitativetraitloci,QTLs)定位奠定了基础。

3号染色体两单核苷酸多态性与中国前列腺癌风险的相关性研究

目的:探讨3号染色体常见单核苷酸多态性(SNP)与中国前列腺癌(PCa)发病风险的关系,并探讨其与临床相关危险因素的关系。方法:采用病例对照设计方法,选取124例PCa患者以及年龄、性别匹配的111例正常对照人群作为研究对象,使用聚合酶链反应-高分辨熔解曲线(PCR-HRM)技术结合测序验证法检测SNPrs10934853和rs2660753基因型与等位基因分布情况,分析两位点危险基因型的累积效应,并探讨其不同基因型与PCa患者临床相关危险因素间是否存在相关性。结果:①rs10934853的基因型AA、CC、AC在PCa组中分别有28例(22.8%)、46例(37.4%)、49例(39.8%),在正常对照组中分别有24例(22.0%)、34例(31.2%)、51例(46.8%);rs2660753的基因型AA、GG、AG在PCa组中分别有13例(11.0%)、59例(50.0%)、46例(39.0%),在正常对照组中分别有9例(8.8%)、47例(45.6%)、47例(45.6%),2个SNP的基因型频率与等位基因频率在2组间的分布均无显著性差异(P值分别为0.520、0.582)。②SNP rs10934853和rs2660753两独立变异危险基因型累积效应分析发现:与野生型组相比较,含有危险基因型的两组PCa的发病风险略有增加(OR值分别为1.831、1.968),但组间差异不具有统计学意义(P>0.05)。③SNP rs10934853和rs2660753的不同基因型与PCa患者不同临床相关危险因素间均无显著相关性(P>0.05)。结论:SNP rs10934853和rs2660753与中国PCa的发生无明显相关性,可能与中国PCa的发病风险无关。

山东地区冠状动脉粥样硬化性心脏病患者3号染色体基因扫描研究

目的对冠心病患者及正常对照者的3号染色体进行扫描,查找与冠心病关联的遗传位点。方法在3号染色体上采用间隔为10 cM(厘摩)遗传距离的23个微卫星遗传标记,分别对156例冠心病患者和450名正常对照者的DNA混合池样本进行基因组扫描,采用CLUMP软件对比患者组与对照组等位基因频率的差异。结果在D3S1278(3q13.31)位点和D3S1300(3p14.2)位点患者组与对照组的等位基因频率差异有统计学意义(P<0.001)。结论山东地区冠心病患者群体中存在与3号染色体q13.31和p14.2区域的关联,致病基因或调控因子可能位于其附近。

猪3号染色体九个微卫星位点的遗传多态性研究和遗传图谱构建

从已公布的猪 3号染色体连锁图谱中选取 9个微卫星位点 ,分析了这些位点在大白猪×梅山猪资源家系F2代 140头个体上的多态性 ,利用Crimap软件分别构建了猪 3号染色体两性平均连锁图谱以及公、母畜连锁图谱。结果表明 :各位点等位基因数为 2～ 4个 ,杂合度为 0 .436～ 0 .6 5 6 ,多态信息含量为 0 .35 1～ 0 .5 82 ;本研究所构建的平均连锁图谱全长为 16 1.1cM ,公、母畜连锁图谱全长分别为 135 .8cM和 188.7cM。与USDA所公布的连锁图谱相比 ,两者的标记顺序一致 ,但我们的图谱标记间隔偏大。

胃癌3号染色体短臂抑癌基因CpG岛甲基化表型研究

背景:3号染色体短臂(3p)抑癌基因CpG岛甲基化表型(CIMP)涉及的甲基化异常见于多种类型的癌症中,但与胃癌的关系迄今仍未阐明。目的:研究胃癌中3p抑癌基因启动子区CIMP的临床意义。方法:采用甲基化特异性PCR(MSP)法检测100例胃癌组织及其对应癌旁组织中hOGG1、VHL、RAR-B、hMLH1、SEMA3B、RASSF1A、BLU和FHIT共8个抑癌基因启动子区CpG岛甲基化状态。以每份样本中含有4个及以上甲基化基因定义为高CIMP水平(CIMP-H)。分析CIMP-H与胃癌临床病理特征的关系。结果:胃癌组织中VHL(P=0.030)、hMLH1(P<0.001)、SEMA3B(P=0.003)、RASSF1A(P<0.001)和FHIT(P<0.001)基因甲基化阳性率显著高于癌旁组织。胃癌组织和对应癌旁组织中CIMP-H发生率分别为44.0%和4.0%,差异有统计学意义(P<0.001)。胃癌组织CIMP-H与肿瘤分化程度呈显著负相关(P=0.004),与淋巴结转移呈显著正相关(P=0.005),而与性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤直径、浸润深度和TNM分期均无关(P>0.05)。结论:3p CIMP异常状态可能在胃癌形成早期已发生,并影响肿瘤分化,导致淋巴结转移。

小鼠高、低转移性肝癌3号染色体微卫星不稳定性的研究

目的 了解小鼠高、低转移性肝癌细胞系Hca/16A3-F(F)和Hca/A2 -P(P)发生微卫星不稳定性 (MSI)情况 ,探讨它们与肝癌发生及转移之间的关系。方法 随机选择 3号和 4号染色体上 10个多态微卫星标记 ,采用聚合酶链式反应 -简单重复序列多态性 (SSLP)和单链构象多态性 (SSCP)方法对F和P细胞系进行分析。结果 F和P细胞系有信息的微卫星位点其等位基因与C3H小鼠相同 ,且存在多位点MSI。结论 该肝癌细胞系

口腔鳞癌3号染色体等位基因杂合缺失的测定

目的 分析口腔鳞癌３ 号染色体等位基因杂合缺失的频率，探讨抑癌基因在口腔鳞癌发生、发展中的作用。方法 应用聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析方法对４０ 例口腔鳞癌组织中３ 号染色体的等位基因杂合缺失进行测定。结果 ３ 号染色体短臂二区四带位点ＥＡβＭＤ的杂合缺失频率为５０％ ，ＥＡβＨ 的杂合缺失频率为６２．５ ％ 。结论 ３ 号染色体等位基因杂合缺失是口腔鳞癌进程中的普遍现象，在口腔鳞癌的发生、发展中可能起重要作用。

人乳头瘤病毒、端粒酶基因及3号染色体数目与宫颈病变关系的探讨

目的探讨人端粒酶(TERC)基因的表达和人乳头瘤病毒(HPV)感染及3号染色体数目突变与宫颈病变的关系。方法 2008年6月至2009年2月昆明医学院第二附属医院妇科门诊接受诊治者共81例,其中健康组(病检结果正常)20例,子宫颈上皮非典型增生(CIN)1组28例,CIN2组12例,CIN3组9例,宫颈癌组12例。采用荧光原位杂交技术(FISH)进行子宫颈上皮脱落细胞TERC基因的检测,同时利用实时荧光定量聚合酶链反应(FQPCR)技术检测这81例受试者的HPV感染情况。并进行宫颈癌与TERC基因和HPV的相关性分析。同时记录81例受试者3号染色体数目突变情况。结果在宫颈病变检测中TERC基因检测和HPV检测阳性率差异无统计学意义(P>0.05),二者阳性率在CIN1组、CIN2组、CIN3组和宫颈癌组均明显高于健康组(P<0.05),CIN1组与CIN2组差异无统计学意义(P>0.05),CIN3组与宫颈癌组差异有统计学意义(P<0.05),恶性程度越高,二者阳性率越高。健康组和CIN1组3号染色体数目异常突变率为0%;CIN2组为16.7%;CIN3组为66.7%;宫颈癌组为100.0%,CIN3组和宫颈癌组阳性率明显高于健康组、CIN1组CIN2组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论在宫颈癌的发生、发展过程中TERC基因异常表达、高危HPV感染、3号染色体数目的突变可能起着重要的协同作用。

伴3号染色体异常的骨髓增生异常综合征临床特性分析

目的分析伴3号染色体异常的骨髓增生异常综合征(MDS)患者的临床特征。方法回顾性分析283例MDS患者的临床资料,观察伴3号染色体异常患者的临床特征,并与伴其他染色体异常患者作比较;比较伴3号染色体异常与复杂核型、单体核型患者的预后情况。结果 283例患者中伴3号染色体异常的有13例(4.59%),其中MDS-EB-2型10例,MDS-EB-1型1例,MDS-MLD型1例,MDS-U型1例。伴3号染色体异常患者中del(3q)4例;t(3q)4例,其中t(3;3)易位1例;der(3q)3例;3p异常2例。伴3号染色体异常患者与伴其他染色体异常患者性别、年龄、ANC、Hb、PLT比较差异均无统计学意义(均P>0.05);伴3号染色体异常患者骨髓原始细胞比例、复杂核型比例、单体核型比例均高于伴其他染色体异常患者(均P<0.05)。13例伴3号染色体异常患者中5例转化为急性髓系白血病(AML),中位转白时间3.7个月,中位生存时间8.0个月。伴3号染色体异常与复杂核型、单体核型患者1年生存率分别为46.15%、53.57%、58.67%,伴3号染色体异常患者1年生存率与复杂核型、单体核型MDS患者比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论伴3号染色体异常在MDS患者中并不少见,多为MDS-EB-2型,多属于单体核型或复杂核型,转化AML的风险明显增加,预后极差。

3号染色体三体、嵌合及单亲二体的临床特征及遗传咨询

3号染色体属于中着丝粒染色体,可由于减数分裂后期同源染色体不分离,或减数分裂末期和有丝分裂后期姐妹染色单体不分离,导致三体及嵌合型三体。完全型的3号染色体三体(trisomy3)极其少见,在妊娠早期自然流产标本中核型检出率约占0.8%,目前在活产儿中尚未见报道。3号染色体三体主要以嵌合方式存在,嵌合型3号染色体三体是一种较为罕见的常染色体异常,多见于宫内生长受限、身材矮小、骨骼发育异常等先天性发育异常,也有正常存活无异常临床表型的报道;3号染色体单亲二体的相关报道较少。本综述综合既往的文献、数据库等数据,对3号染色体三体、嵌合型3号染色体三体、母源性及父源性3号染色体单亲二体的产生机制、发生率、临床表型、相关治疗、预后及再发风险等进行总结,以期对3号染色体产前遗传学诊断及遗传咨询提供帮助。

125例伴3号染色体异常血液病患者的临床特征及预后

目的:探讨3号染色体异常在血液病患者中的临床特征及其预后的意义。方法:回顾分析2011年1月-2018年6月来于院就诊的125例伴3号染色体异常的血液病患者的临床资料。采用R显带技术进行常规核型分析,根据主要遗传学异常将患者分为3组:3q异常、3p异常及+3/-3。结果:3组中以3q异常最常见,其次为+3和3p异常。各组在年龄、性别、WBC、Plt计数和Hb水平方面无明显差异(P>0.05)。125例患者中未治疗即死亡或放弃治疗的42例,治疗2个疗程以上的共83例;3组患者的2年总生存率分别为30.25%、43.0%和58.7%。3q异常组患者的2年总生存率明显低于+3/-3组(P=0.041)。而3q异常中以涉及3q21/3q26位点异常的检出率最高,其2年的总生存率(41.1%)明显高于其它的3q位点异常(11.1%)(P=0.044)。结论:患者伴有3号染色体异常尤其是3q异常预后较差,而3q异常中涉及3q21/3q26位点异常的患者预后相对较好。

3号染色体短臂上八个短串联重复序列位点的遗传多态性研究

目的 研究湖南汉族人群 8个位于染色体 3 p区域的短串联重复序列 (short tandem repeat,STR)位点 :D3 S12 97、D3 S14 89、D3 S12 66、D3 S1568、D3 S12 89、D3 S13 0 0、D3 S12 85和 D3 S3 681基因型及等位片段频率分布。方法 随机抽取 2 2 5名湖南汉族无关个体静脉血 ,抽提 DNA,复合 PCR技术扩增上述位点 ,ABI 3 77全自动测序仪进行基因分型。结果 共检出 91种等位基因 ,基因频率分布在 0 .0 0 2～ 0 .43 1之间 ,构成 3 12种基因型。 8个 STR位点基因型分布均符合 Hardy-Weinberg平衡 (P>0 .0 5) ,杂合度大于0 .72 9,个体识别力大于 0 .72 5,非父排除率大于 0 .596,多态信息含量大于 0 .682。民族比较结果显示 ,湖南汉族与非洲黑人及欧洲白人在大多数位点差异有显著性 (P<0 .0 0 1)。

伴3号染色体异常的18例恶性血液病分析

目的探讨3号染色体异常在恶性血液病中的发生及预后意义。方法采用R带常规显带技术进行染色体检查,对18例恶性血液病患者的核型进行分析。结果 2254例恶性血液病患者中检出伴3号染色体异常18例(0.8%),其中伴3q异常12例(66.7%),3p异常6例(33.3%),前者检出率明显高于后者;伴3q异常的12例患者中,有3q21或3q26异常者6例(50.0%),包括2例t(3;3)。12例进行化疗的患者中只有2例获得完全缓解。结论累及3q异常是3号染色体最为常见的核型改变,其中又以3q21和3q26异常检出率最多;伴3号染色体异常的恶性血液病患者预后较差。

3号染色体短臂远端缺失一例

患儿女,1岁.第2胎,足月顺产.出生体重1.8 kg,就诊时体重5.5 kg,身高66 cm,头小,头围40 cm,鼻梁低平,小颌小耳,哭声细弱.重度智力低下,面部表情呆滞,反应迟钝,发育迟缓,语言障碍,不会说话,不会坐,也不会站立.

通过检测葡萄膜黑色素瘤患者血循环黑色素瘤细胞中3号染色体单体阳性率评估肿瘤转移风险

德国吕贝克大学AysegtilTura等于2016年7月在Pig—mentCellMelanomaRes杂志上发表的一篇文章报道了检测葡萄膜黑色素瘤（uvealmelanoma，UM）患者血循环黑色素瘤细胞（circulatingmelanomacells，CMC）中3号染色体单体以帮助评估肿瘤转移风险的研究。约50％的UM患者最终由于肿瘤发生全身转移而死亡，因此及早预测肿瘤转移风险对患者的治疗及预后具有重要意义。

肠道黏膜相关淋巴组织淋巴瘤3号染色体三体的研究

目的 检测肠道黏膜相关淋巴组织 (MALT)淋巴瘤中 3号染色体三体 (C3三体 )的发生率 ,并探讨此变异与该肿瘤发生的关系。方法 11例诊断为肠道MALT淋巴瘤的标本 ,根据新的WHO分类标准 ,对实验成功的 8例进行分型 ,7例为经典MALT型淋巴瘤 ,临床为惰性 ;1例在MALT型淋巴瘤基础上有大细胞转化 ,临床为侵袭性。实验中选用生物素标记的染色体特异的着丝粒探针 ,采用染色体原位杂交方法 ,以 16号染色体探针作为技术参照组 ,以肠道慢性炎症作为实验对照组 ,检测肿瘤细胞中 3号染色体的拷贝数。结果 在 7例惰性淋巴瘤患者中 5例为C3三体 ,发生率为 71.4 % ,2例为C3正常 ;1例侵袭性病例为C3三体。结论 C3三体在肠道MALT淋巴瘤中发生率较高 ,该高发生率与肿瘤的发生或演进可能有一定的相关性 ,并对协助临床诊断可能具有价值。

3号染色体短臂抑癌基因与肾透明细胞癌

人类3号染色体短臂（3p）上抑癌基因的异常改变（如缺失突变、转录失活或沉默等）被认为是包括肾癌尤其是肾透明细胞癌在内的人类多种肿瘤起始发生的关键步骤，它们与肿瘤的后续发展演变亦关联紧密。大量研究发现并证实诸如VHL、RASSF1A、SEMA3B、SETD2、PBRM1、NPRL2、GPX1等3p基因的缺失或下调在肾透明细胞癌的形成与发展中扮演了极为重要的角色，这为进一步阐释肾透明细胞癌分子形成机制奠定了基础，是当前研究的重要方向。关于其具体调控路径及作用机制的研究除部分基因已初步明晰外，余尚在继续进行中。

葡萄膜黑色素瘤单体型3号染色体的检测:荧光原位杂交与多重连接依赖式探针扩增的比较

目的比较荧光原位杂交(FISH)和多重连接依赖式探针扩增(MLPA)两种方法对于检测葡萄膜黑色素瘤的3号染色体异常的效能。设计实验研究。研究对象北京同仁医院2019年行眼球摘除治疗的33例葡萄膜黑色素瘤患者的眼球标本。方法分析33例患者的临床组织病理学特征。对摘除后行福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的眼球标本中的肿瘤组织采用FISH和MLPA两种方法分别检测3号染色体的拷贝数并进行比较,并对单体型3号染色体与临床组织病理特征做相关性分析。主要指标3号染色体拷贝数,年龄,性别,肿瘤位置,肿瘤最大基底径,肿瘤细胞类型。结果 33例葡萄膜黑色素瘤患者的肿瘤组织通过FISH和MLPA两种方法检测到单体型3号染色体的比例分别为33.3%和36.4%,其中1例患者FISH检测为二倍体型3号染色体,但MLPA检测为单体型3号染色体。FISH和MLPA两种方法检测的总体符合率为97.0%。单体型3号染色体的比例在肿瘤侵犯睫状体组为66.7%(6/9例),而在肿瘤未侵犯睫状体组仅为25.0%(6/24例)(P=0.044)。单体型3号染色体的比例在上皮样细胞型组为50.0%(8/16例),而在非上皮样细胞型组为23.5%(4/17例)(P=0.157)。结论葡萄膜黑色素瘤为单体型3号染色体者占36.4%。FISH和MLPA均可在葡萄膜黑色素瘤的FFPE样本中完成3号染色体异常的检测,MLPA检测的敏感性较FISH略高。