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腈水解酶及其镜像突变体与3-取代戊二腈底物结合模型的研究
1
作者
李一新
解英培
+4 位作者
武小楚
赵凡
赵乐乐
高蕾
田歌
《山东第一医科大学(山东省医学科学院)学报》
CAS
2023年第6期408-413,共6页
目的 探析底物3-取代戊二腈在酶活性中心的结合模式。方法 采用分子对接方法,选取4种3-取代戊二腈底物分别与腈水解酶(SsNIT)及其突变体进行分子对接,并对酶-底物结合模型进行分析。结果果3-取代戊二腈底物与腈水解酶突变体具有较强的...
目的 探析底物3-取代戊二腈在酶活性中心的结合模式。方法 采用分子对接方法,选取4种3-取代戊二腈底物分别与腈水解酶(SsNIT)及其突变体进行分子对接,并对酶-底物结合模型进行分析。结果果3-取代戊二腈底物与腈水解酶突变体具有较强的结合力,其突变体-底物复合物的结合构象更稳定。4种底物分子中,带有芳香环取代基的底物分子与酶活性中心形成较强的π-π相互作用,芳香型底物-酶复合物结合能力最强,构型最稳定。结论 SsNIT及其突变体与不同底物小分子的结合模式存在差异,底物与酶活性中心的相互作用是影响酶底物选择性的关键因素。研究结果为进一步阐明SsNIT催化不同底物去对称性水解的机理及选择性差异提供了一定的理论基础。
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关键词
分子模拟
腈
水解酶
3-取代戊二腈
突变体
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职称材料
题名
腈水解酶及其镜像突变体与3-取代戊二腈底物结合模型的研究
1
作者
李一新
解英培
武小楚
赵凡
赵乐乐
高蕾
田歌
机构
山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院
出处
《山东第一医科大学(山东省医学科学院)学报》
CAS
2023年第6期408-413,共6页
基金
国家自然科学基金(32000477)
山东省自然科学基金(ZR2020QB075)。
文摘
目的 探析底物3-取代戊二腈在酶活性中心的结合模式。方法 采用分子对接方法,选取4种3-取代戊二腈底物分别与腈水解酶(SsNIT)及其突变体进行分子对接,并对酶-底物结合模型进行分析。结果果3-取代戊二腈底物与腈水解酶突变体具有较强的结合力,其突变体-底物复合物的结合构象更稳定。4种底物分子中,带有芳香环取代基的底物分子与酶活性中心形成较强的π-π相互作用,芳香型底物-酶复合物结合能力最强,构型最稳定。结论 SsNIT及其突变体与不同底物小分子的结合模式存在差异,底物与酶活性中心的相互作用是影响酶底物选择性的关键因素。研究结果为进一步阐明SsNIT催化不同底物去对称性水解的机理及选择性差异提供了一定的理论基础。
关键词
分子模拟
腈
水解酶
3-取代戊二腈
突变体
Keywords
molecular docking
nitrilase
3
-
substituted glutaronitrile
mutant
分类号
TS2 [轻工技术与工程—食品科学与工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
腈水解酶及其镜像突变体与3-取代戊二腈底物结合模型的研究
李一新
解英培
武小楚
赵凡
赵乐乐
高蕾
田歌
《山东第一医科大学(山东省医学科学院)学报》
CAS
2023
0
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