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家蚕3-羟基异丁酸脱氢酶基因克隆及其在模拟失重环境中的表达模式分析
被引量:
2
1
作者
田宗成
周博
+7 位作者
骞爱荣
续惠云
狄升蒙
赵云坡
章玉萍
刘佳
黄勇平
商澎
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第12期2041-2048,共8页
采用RT-PCR和RACE技术克隆了家蚕3-羟基异丁酸脱氢酶(hibadh)基因全长cDNA(GenBank登录号EU719652)并对其序列进行了分析,用RT-PCR方法检测了hibadh基因在家蚕5龄幼虫不同组织中的分布,最后用real-timeRT-PCR方法分析了整个胚胎期家蚕hi...
采用RT-PCR和RACE技术克隆了家蚕3-羟基异丁酸脱氢酶(hibadh)基因全长cDNA(GenBank登录号EU719652)并对其序列进行了分析,用RT-PCR方法检测了hibadh基因在家蚕5龄幼虫不同组织中的分布,最后用real-timeRT-PCR方法分析了整个胚胎期家蚕hibadh基因在模拟失重环境中的表达模式。克隆的hibadh基因cDNA全长1074bp,包含1个能编码完整Hibadh长度为969bp的开放阅读框。家蚕hibadh基因与伯霍尔德杆菌、果蝇、蜜蜂、热带爪蟾、小鼠、人类等6个物种hibadh基因推导的氨基酸序列同源性分别达到46%、43%、48%、44%、45%、45%。Hibadh蛋白为分泌蛋白,不存在糖基磷脂酰肌醇锚定位点,分子量和等电点分别为34.1kD和9.14。hibadh基因在家蚕5龄幼虫的头、丝腺、中肠、皮肤、血液、脂肪体、马氏管等组织中稳定表达。模拟失重环境中家蚕hibadh基因在胚胎发育的不同时期表达量不同,胚体突起发生期和反转期hibadh基因表达量分别上调2.3倍(P<0.05)和4.6倍(P<0.01),气管形成期hibadh基因表达量下调7.6倍(P<0.01),其余时间段hibadh基因表达量没有明显变化。整个胚胎发育期内,模拟失重组与对照组相比较hibadh基因总表达量下调2.6倍(P<0.05)。在模拟失重环境中,家蚕hibadh基因的表达模式与家蚕整体的响应模式有相似之处但不尽相同。基因对环境反应的灵敏度高于有机体整体对环境反应的灵敏度。该研究有利于进一步探讨hibadh基因的重力生物学机制。
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关键词
家蚕
3
-
羟基
异
丁酸
脱
氢
酶
RACE(Rapid
AMPLIFICATION
of
cDNA
ends)
失重
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职称材料
BDH2抑制MIF影响鼻咽癌对巨噬细胞的招募
2
作者
苏嘉鸣
汤诗玥
+1 位作者
黄光武
张哲
《广西医科大学学报》
CAS
2024年第9期1282-1288,共7页
目的:研究3-羟基丁酸脱氢酶2(BDH2)和巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)在鼻咽癌(NPC)中的表达特征及其对肿瘤免疫微环境中巨噬细胞浸润的影响。方法:使用BDH2过表达质粒转染5-8F细胞,实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)检测BDH2的转录水平。使...
目的:研究3-羟基丁酸脱氢酶2(BDH2)和巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)在鼻咽癌(NPC)中的表达特征及其对肿瘤免疫微环境中巨噬细胞浸润的影响。方法:使用BDH2过表达质粒转染5-8F细胞,实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)检测BDH2的转录水平。使用GEO数据库和蛋白免疫印迹法(western blotting)验证BDH2和MIF的表达差异。通过酶联免疫吸附法和比色法分别检测细胞内MIF和乙酰乙酸的表达。通过免疫组化分析BDH2和MIF在NPC和正常鼻咽上皮组织中的表达水平,使用连续切片染色和相关性分析评估MIF表达与M1、M2型巨噬细胞浸润的关系。结果:过表达BDH2显著增加了5-8F细胞内乙酰乙酸含量(P<0.01),且MIF表达下调。GEO数据库分析和免疫组化结果表明NPC中BDH2的表达显著下调(P<0.0001),MIF的表达显著上调(P<0.01)。在连续切片分析中,高表达MIF的NPC组织内M1巨噬细胞浸润减少(P<0.0001)。结论:NPC中BDH2-MIF轴通过抑制M1巨噬细胞的浸润调控免疫微环境,可能是NPC潜在的治疗靶点。
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关键词
鼻咽癌
3-羟基丁酸脱氢酶
2
巨噬细胞迁移抑制因子
肿瘤微环境
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职称材料
富养罗尔斯通氏菌菌株PHB“泄漏”机理的初探
3
作者
刘双江
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第1期111-114,共4页
建立了一种分离纯化聚羟基丁酸 (Polyhydroxybutyrate ,PHB)颗粒的改良方法。采用这种方法从Ralstoniaeu tropha菌株H1 6 (野生型 )、SK1 4 89(Tn5诱变的PHB泄漏菌株 )、JMP2 2 2 (野生的PHB泄漏菌株 )分离了PHB颗粒。进一步比较研究了...
建立了一种分离纯化聚羟基丁酸 (Polyhydroxybutyrate ,PHB)颗粒的改良方法。采用这种方法从Ralstoniaeu tropha菌株H1 6 (野生型 )、SK1 4 89(Tn5诱变的PHB泄漏菌株 )、JMP2 2 2 (野生的PHB泄漏菌株 )分离了PHB颗粒。进一步比较研究了不同菌株的PHB解聚酶和 3 羟基丁酸脱氢酶的活性。研究结果表明 ,菌株SK1 4 89的PHB解聚酶活性 (4 8h培养后达 1 .82U mg)明显高于野生型菌株H1 6 (4 8h培养后达 0 .37U mg) ,菌株JMP2 2 2的 3 羟基丁酸脱氢酶活性 (培养 96h后达 1 6 5 9U mg)比菌株H1 6培养 (96h后达 6 4 0U mg)高许多。这些结果显示 ,不同菌株PHB的泄漏有不同的原因 ,突变株SK1 4 89导致PHB泄漏的原因是解聚酶活性高 ,而野生型JMP2 2 2PHB泄漏的原因主要是 3
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关键词
聚
羟基
烷酸
PHB解聚
酶
3-羟基丁酸脱氢酶
富养罗尔斯通氏菌
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职称材料
MNSV p42与寄主因子3-HIBADH互作
被引量:
1
4
作者
吴会杰
彭斌
+1 位作者
康保珊
古勤生
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期583-591,共9页
甜瓜坏死斑点病毒(melon necrotic spot virus,MNSV)是侵染甜瓜的重要病毒之一,为害严重。为了明确MNSV的致病机制,本研究以pGBK-p42为诱饵载体,利用Mating的方法从感染MNSV的甜瓜cDNA文库中筛选出6个与p42互作的寄主因子,进一步利用酵...
甜瓜坏死斑点病毒(melon necrotic spot virus,MNSV)是侵染甜瓜的重要病毒之一,为害严重。为了明确MNSV的致病机制,本研究以pGBK-p42为诱饵载体,利用Mating的方法从感染MNSV的甜瓜cDNA文库中筛选出6个与p42互作的寄主因子,进一步利用酵母双杂交系统、双分子荧光互补技术(Bimolecular fluorescence complementation,BiFC)等验证p42与寄主因子3-羟基异丁酸脱氢酶(3-Hydroxyisobutyrate dehydrogenase-like 1,3-HIBADH)的互作,并明确了p42蛋白的s-domain是与3-HIBADH互作的关键区域。此外,利用激光共聚焦显微镜观察发现p42 s-domain与3-HIBADH作用改变了3-HIBADH蛋白在烟草表皮的亚细胞定位,进一步证实p42可与3-HIBADH发生相互作用。该结果为阐明甜瓜响应MNSV侵染的互作机制奠定了基础。
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关键词
甜瓜坏死斑点病毒
外壳蛋白p42
寄主因子
3
-
羟基
异
丁酸
脱
氢
酶
互作
原文传递
ACAT1、BDH2基因与肾透明细胞癌患者发病及病情进展的关系
5
作者
雷乃军
祝德
+2 位作者
龙家才
张旭明
宋争放
《中国肿瘤外科杂志》
CAS
2021年第4期384-387,共4页
目的研究胆固醇酰基转移酶1(ACAT1)、3-羟基丁酸脱氢酶2(BDH2)基因与肾透明细胞癌患者发病及病情进展的关系。方法选择2018年5月至2020年5月巴中市人民医院收治的86例肾透明细胞癌患者为研究组,另选择同期收治的因肾外伤行肾切除的患者3...
目的研究胆固醇酰基转移酶1(ACAT1)、3-羟基丁酸脱氢酶2(BDH2)基因与肾透明细胞癌患者发病及病情进展的关系。方法选择2018年5月至2020年5月巴中市人民医院收治的86例肾透明细胞癌患者为研究组,另选择同期收治的因肾外伤行肾切除的患者30例为对照组,收集研究组术中切除的癌组织及对照组术中切除的肾组织,比较两组组织中ACAT1、BDH2基因相对表达量,比较不同临床病理特征肾透明细胞癌患者癌组织中ACAT1、BDH2基因相对表达量,采用Spearman相关分析ACAT1、BDH2基因与肾透明细胞癌患者病情进展的相关性,采用Logistic回归分析肾透明细胞癌患者发病的影响因素。结果研究组的ACAT1、BDH2基因相对表达量为11.52±0.99、10.48±0.73,均低于对照组(分别为13.93±1.32、12.86±1.01),差异有统计学意义(P<0.05);不同性别、年龄、肿瘤直径、肿瘤部位、病理分级的肾透明细胞癌患者癌组织中ACAT1、BDH2基因相对表达量差异无统计学意义(P>0.05);不同病理分期、淋巴结转移情况的肾透明细胞癌患者癌组织中ACAT1、BDH2基因相对表达量差异有统计学意义(P<0.05);ACAT1、BDH2基因相对表达量与肾透明细胞癌患者的病理分期、淋巴结转移呈负相关(P<0.05);ACAT1、BDH2基因表达下调是肾透明细胞癌患者发病的危险因素(P<0.05)。结论 ACAT1、BDH2基因在肾透明细胞癌中表达下调,ACAT1、BDH2基因与肾透明细胞癌发病及病理分期、淋巴结转移有关。
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关键词
胆固醇酰基转移
酶
1
3-羟基丁酸脱氢酶
2
肾透明细胞癌
发病
病情进展
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职称材料
题名
家蚕3-羟基异丁酸脱氢酶基因克隆及其在模拟失重环境中的表达模式分析
被引量:
2
1
作者
田宗成
周博
骞爱荣
续惠云
狄升蒙
赵云坡
章玉萍
刘佳
黄勇平
商澎
机构
西北工业大学生命科学院空间生物实验模拟技术国防重点学科实验室特殊环境生物物理学研究所
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第12期2041-2048,共8页
基金
国家自然科学基金(No.30770526)
西北工业大学青年科技创新基金(No.W016213)资助~~
文摘
采用RT-PCR和RACE技术克隆了家蚕3-羟基异丁酸脱氢酶(hibadh)基因全长cDNA(GenBank登录号EU719652)并对其序列进行了分析,用RT-PCR方法检测了hibadh基因在家蚕5龄幼虫不同组织中的分布,最后用real-timeRT-PCR方法分析了整个胚胎期家蚕hibadh基因在模拟失重环境中的表达模式。克隆的hibadh基因cDNA全长1074bp,包含1个能编码完整Hibadh长度为969bp的开放阅读框。家蚕hibadh基因与伯霍尔德杆菌、果蝇、蜜蜂、热带爪蟾、小鼠、人类等6个物种hibadh基因推导的氨基酸序列同源性分别达到46%、43%、48%、44%、45%、45%。Hibadh蛋白为分泌蛋白,不存在糖基磷脂酰肌醇锚定位点,分子量和等电点分别为34.1kD和9.14。hibadh基因在家蚕5龄幼虫的头、丝腺、中肠、皮肤、血液、脂肪体、马氏管等组织中稳定表达。模拟失重环境中家蚕hibadh基因在胚胎发育的不同时期表达量不同,胚体突起发生期和反转期hibadh基因表达量分别上调2.3倍(P<0.05)和4.6倍(P<0.01),气管形成期hibadh基因表达量下调7.6倍(P<0.01),其余时间段hibadh基因表达量没有明显变化。整个胚胎发育期内,模拟失重组与对照组相比较hibadh基因总表达量下调2.6倍(P<0.05)。在模拟失重环境中,家蚕hibadh基因的表达模式与家蚕整体的响应模式有相似之处但不尽相同。基因对环境反应的灵敏度高于有机体整体对环境反应的灵敏度。该研究有利于进一步探讨hibadh基因的重力生物学机制。
关键词
家蚕
3
-
羟基
异
丁酸
脱
氢
酶
RACE(Rapid
AMPLIFICATION
of
cDNA
ends)
失重
Keywords
silkworm,
3
-
Hydroxyisobutyrate dehydrogenase, RACE (Rapid amplification of cDNA ends), weightlessness
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
BDH2抑制MIF影响鼻咽癌对巨噬细胞的招募
2
作者
苏嘉鸣
汤诗玥
黄光武
张哲
机构
广西医科大学第一附属医院耳鼻咽喉头颈外科
出处
《广西医科大学学报》
CAS
2024年第9期1282-1288,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81960490)。
文摘
目的:研究3-羟基丁酸脱氢酶2(BDH2)和巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)在鼻咽癌(NPC)中的表达特征及其对肿瘤免疫微环境中巨噬细胞浸润的影响。方法:使用BDH2过表达质粒转染5-8F细胞,实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)检测BDH2的转录水平。使用GEO数据库和蛋白免疫印迹法(western blotting)验证BDH2和MIF的表达差异。通过酶联免疫吸附法和比色法分别检测细胞内MIF和乙酰乙酸的表达。通过免疫组化分析BDH2和MIF在NPC和正常鼻咽上皮组织中的表达水平,使用连续切片染色和相关性分析评估MIF表达与M1、M2型巨噬细胞浸润的关系。结果:过表达BDH2显著增加了5-8F细胞内乙酰乙酸含量(P<0.01),且MIF表达下调。GEO数据库分析和免疫组化结果表明NPC中BDH2的表达显著下调(P<0.0001),MIF的表达显著上调(P<0.01)。在连续切片分析中,高表达MIF的NPC组织内M1巨噬细胞浸润减少(P<0.0001)。结论:NPC中BDH2-MIF轴通过抑制M1巨噬细胞的浸润调控免疫微环境,可能是NPC潜在的治疗靶点。
关键词
鼻咽癌
3-羟基丁酸脱氢酶
2
巨噬细胞迁移抑制因子
肿瘤微环境
Keywords
nasopharyngeal carcinoma
3
-
hydroxybutyrate dehydrogenase 2
macrophage migration inhibitory factor
tumor microenvironment
分类号
R739.63 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
富养罗尔斯通氏菌菌株PHB“泄漏”机理的初探
3
作者
刘双江
机构
中国科学院微生物研究所
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第1期111-114,共4页
文摘
建立了一种分离纯化聚羟基丁酸 (Polyhydroxybutyrate ,PHB)颗粒的改良方法。采用这种方法从Ralstoniaeu tropha菌株H1 6 (野生型 )、SK1 4 89(Tn5诱变的PHB泄漏菌株 )、JMP2 2 2 (野生的PHB泄漏菌株 )分离了PHB颗粒。进一步比较研究了不同菌株的PHB解聚酶和 3 羟基丁酸脱氢酶的活性。研究结果表明 ,菌株SK1 4 89的PHB解聚酶活性 (4 8h培养后达 1 .82U mg)明显高于野生型菌株H1 6 (4 8h培养后达 0 .37U mg) ,菌株JMP2 2 2的 3 羟基丁酸脱氢酶活性 (培养 96h后达 1 6 5 9U mg)比菌株H1 6培养 (96h后达 6 4 0U mg)高许多。这些结果显示 ,不同菌株PHB的泄漏有不同的原因 ,突变株SK1 4 89导致PHB泄漏的原因是解聚酶活性高 ,而野生型JMP2 2 2PHB泄漏的原因主要是 3
关键词
聚
羟基
烷酸
PHB解聚
酶
3-羟基丁酸脱氢酶
富养罗尔斯通氏菌
Keywords
Polyhydroxyalkanoate, PHB depolymerase,
3
hydroxybutyrate dehydrogenase, Ralstonia eutropha
分类号
Q935 [生物学—微生物学]
Q939.11 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
MNSV p42与寄主因子3-HIBADH互作
被引量:
1
4
作者
吴会杰
彭斌
康保珊
古勤生
机构
中国农业科学院郑州果树研究所
出处
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期583-591,共9页
基金
国家青年科学基金项目(31701941)
河南省基础与前沿技术研究项目(152300410231)
+1 种基金
国家西甜瓜产业技术体系病毒防控岗(CARS-26-13)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(No.1610192020501)。
文摘
甜瓜坏死斑点病毒(melon necrotic spot virus,MNSV)是侵染甜瓜的重要病毒之一,为害严重。为了明确MNSV的致病机制,本研究以pGBK-p42为诱饵载体,利用Mating的方法从感染MNSV的甜瓜cDNA文库中筛选出6个与p42互作的寄主因子,进一步利用酵母双杂交系统、双分子荧光互补技术(Bimolecular fluorescence complementation,BiFC)等验证p42与寄主因子3-羟基异丁酸脱氢酶(3-Hydroxyisobutyrate dehydrogenase-like 1,3-HIBADH)的互作,并明确了p42蛋白的s-domain是与3-HIBADH互作的关键区域。此外,利用激光共聚焦显微镜观察发现p42 s-domain与3-HIBADH作用改变了3-HIBADH蛋白在烟草表皮的亚细胞定位,进一步证实p42可与3-HIBADH发生相互作用。该结果为阐明甜瓜响应MNSV侵染的互作机制奠定了基础。
关键词
甜瓜坏死斑点病毒
外壳蛋白p42
寄主因子
3
-
羟基
异
丁酸
脱
氢
酶
互作
Keywords
melon necrotic spot virus
coat protein p42
host factor
3
-
Hydroxyisobutyrate dehydrogenase
-
like l
interaction
分类号
S432.41 [农业科学—植物病理学]
原文传递
题名
ACAT1、BDH2基因与肾透明细胞癌患者发病及病情进展的关系
5
作者
雷乃军
祝德
龙家才
张旭明
宋争放
机构
巴中市中心医院肿瘤科
出处
《中国肿瘤外科杂志》
CAS
2021年第4期384-387,共4页
基金
四川省医学科研青年创新课题(Q17001)。
文摘
目的研究胆固醇酰基转移酶1(ACAT1)、3-羟基丁酸脱氢酶2(BDH2)基因与肾透明细胞癌患者发病及病情进展的关系。方法选择2018年5月至2020年5月巴中市人民医院收治的86例肾透明细胞癌患者为研究组,另选择同期收治的因肾外伤行肾切除的患者30例为对照组,收集研究组术中切除的癌组织及对照组术中切除的肾组织,比较两组组织中ACAT1、BDH2基因相对表达量,比较不同临床病理特征肾透明细胞癌患者癌组织中ACAT1、BDH2基因相对表达量,采用Spearman相关分析ACAT1、BDH2基因与肾透明细胞癌患者病情进展的相关性,采用Logistic回归分析肾透明细胞癌患者发病的影响因素。结果研究组的ACAT1、BDH2基因相对表达量为11.52±0.99、10.48±0.73,均低于对照组(分别为13.93±1.32、12.86±1.01),差异有统计学意义(P<0.05);不同性别、年龄、肿瘤直径、肿瘤部位、病理分级的肾透明细胞癌患者癌组织中ACAT1、BDH2基因相对表达量差异无统计学意义(P>0.05);不同病理分期、淋巴结转移情况的肾透明细胞癌患者癌组织中ACAT1、BDH2基因相对表达量差异有统计学意义(P<0.05);ACAT1、BDH2基因相对表达量与肾透明细胞癌患者的病理分期、淋巴结转移呈负相关(P<0.05);ACAT1、BDH2基因表达下调是肾透明细胞癌患者发病的危险因素(P<0.05)。结论 ACAT1、BDH2基因在肾透明细胞癌中表达下调,ACAT1、BDH2基因与肾透明细胞癌发病及病理分期、淋巴结转移有关。
关键词
胆固醇酰基转移
酶
1
3-羟基丁酸脱氢酶
2
肾透明细胞癌
发病
病情进展
Keywords
Acyl coenzyme A
-
cholesterol acyltransferase1
3
-
hydroxybutyrate dehydrogenase 2
Renal clear cell carcinoma
Pathogenesis
Disease progression
分类号
R737.11 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
家蚕3-羟基异丁酸脱氢酶基因克隆及其在模拟失重环境中的表达模式分析
田宗成
周博
骞爱荣
续惠云
狄升蒙
赵云坡
章玉萍
刘佳
黄勇平
商澎
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
2
下载PDF
职称材料
2
BDH2抑制MIF影响鼻咽癌对巨噬细胞的招募
苏嘉鸣
汤诗玥
黄光武
张哲
《广西医科大学学报》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
3
富养罗尔斯通氏菌菌株PHB“泄漏”机理的初探
刘双江
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004
0
下载PDF
职称材料
4
MNSV p42与寄主因子3-HIBADH互作
吴会杰
彭斌
康保珊
古勤生
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
原文传递
5
ACAT1、BDH2基因与肾透明细胞癌患者发病及病情进展的关系
雷乃军
祝德
龙家才
张旭明
宋争放
《中国肿瘤外科杂志》
CAS
2021
0
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职称材料
已选择
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