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基于双向LSTM和注意力机制的DNA N4-甲基胞嘧啶修饰位点识别
被引量:
1
1
作者
崔鼎
《软件》
2021年第4期96-100,共5页
目的:DNA N4-甲基胞嘧啶(4mC)修饰是原核DNA中重要的表观遗传修饰,因为它在调节DNA复制和保护宿主DNA免受降解等多种生物学过程中起着至关重要的作用。因此,4mC位点的准确鉴定有助于深入研究其生物学功能和机制。然而4m C位点的实验鉴...
目的:DNA N4-甲基胞嘧啶(4mC)修饰是原核DNA中重要的表观遗传修饰,因为它在调节DNA复制和保护宿主DNA免受降解等多种生物学过程中起着至关重要的作用。因此,4mC位点的准确鉴定有助于深入研究其生物学功能和机制。然而4m C位点的实验鉴定是费时且昂贵的,特别是考虑到基因序列的快速累积,急需找到有效的计算方法加以改进。在本研究中,方法:我们针对上述问题将CNN,Attention机制和双向LSTM相结合,构建了一个多层深度学习预测系统用于识别DNA N4-甲基胞嘧啶修饰位点。结论:基于注意力机制的深度学习框架不仅能快速有效处理数据,同时也能提高识别结果准确度,提升识别效率。
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关键词
4mC位点
注意力机制
双向LSTM
3-merid特征
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职称材料
题名
基于双向LSTM和注意力机制的DNA N4-甲基胞嘧啶修饰位点识别
被引量:
1
1
作者
崔鼎
机构
浙江理工大学信息学院
出处
《软件》
2021年第4期96-100,共5页
文摘
目的:DNA N4-甲基胞嘧啶(4mC)修饰是原核DNA中重要的表观遗传修饰,因为它在调节DNA复制和保护宿主DNA免受降解等多种生物学过程中起着至关重要的作用。因此,4mC位点的准确鉴定有助于深入研究其生物学功能和机制。然而4m C位点的实验鉴定是费时且昂贵的,特别是考虑到基因序列的快速累积,急需找到有效的计算方法加以改进。在本研究中,方法:我们针对上述问题将CNN,Attention机制和双向LSTM相结合,构建了一个多层深度学习预测系统用于识别DNA N4-甲基胞嘧啶修饰位点。结论:基于注意力机制的深度学习框架不仅能快速有效处理数据,同时也能提高识别结果准确度,提升识别效率。
关键词
4mC位点
注意力机制
双向LSTM
3-merid特征
Keywords
4mC sites
attention mechanism
Bi-LSTM
3
-Mer ID feature
分类号
TP391.1 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于双向LSTM和注意力机制的DNA N4-甲基胞嘧啶修饰位点识别
崔鼎
《软件》
2021
1
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