转录因子Ets-1与β1,3-N-乙酰氨基葡萄糖基转移酶基因启动子结合活性分析(英文)

β1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-2,-8(β3GnT-2,β3GnT-8)共同参与多聚N-乙酰氨基乳糖([Galβ1→4GlcNAcβ1→3]n)的合成,从而使得细胞表面的相应糖链结构延长进而影响细胞的恶性转化.已有研究表明,在全反式维甲酸诱导人白血病细胞株HL-60分化过程中β3GnT-2,-8的表达上调,但其分子机制不明.本文旨在探讨ATRA诱导HL-60分化过程中,转录因子Ets-1对β3GnT-2,-8表达调控的分子机制.采用10-6mol/L ATRA诱导人白血病细胞株HL-60向粒系分化,RT-PCR检测到细胞中Ets-1的表达明显增加;进一步采用染色质免疫沉淀(ChIP)结合电泳迁移率变动实验(EMSA)检测证实,有活化的Ets-1结合至β3GnT-2/-8基因调控区.以上结果表明,转录因子Ets-1对人白血病细胞株HL-60分化过程中β3GnT-2,-8基因有表达调控作用.

UDP-N-乙酰-α-D-半乳糖氨基转移酶3:一个新的磷调节蛋白的调磷机制

UDP-N-乙酰-α-D-半乳糖氨基转移酶3(ppGalNacT3)是催化成纤维细胞生长因子23(FGF23)O-糖基化的起始酶,其编码基因GALNT3的突变可以导致以高磷酸盐血症及软组织钙化为特征的高磷酸盐血症型家族性肿瘤样钙化(HFTC)。磷是人体重要的矿物质,参与包括骨骼矿化在内的许多重要生理过程,磷代谢紊乱可以导致骨骼矿化障碍,引起骨软化、骨质疏松等代谢性骨病的发生。磷稳态的调节对骨骼健康有非常重要作用。本文就一个新近发现的磷调节相关蛋白ppGalNacT3的结构和功能进行综述,并试阐述其调节血磷的机制以及对骨骼矿化的影响。

解淀粉芽孢杆菌β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因的克隆表达及其酶学表征

从解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens YX-01)中克隆得到一个新型β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因(BaNagase),并成功在大肠杆菌中异源表达。BaNagase编码616个氨基酸,与B.subtilis来源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶(AIY91451.1)氨基酸序列相似性最高,为76.97%。通过对比分析,BaNagase属于糖苷水解酶3家族。纯化获得的BaNagase比活力为16.42 U/mg,最适温度65℃,最适pH 6.0,且在低于55℃条件下能保持高于70%的酶活力。BaNagase展现出高的热稳定性和严格的底物特异性,为其高效制备N-乙酰氨基葡萄糖提供了理论支持。

多肽：N-乙酰氨基半乳糖转移酶-2与共刺激分子B7-H3相互作用的结构信息学初步探讨

目的 研究多肽：N-乙酰氨基半乳糖转移酶-2（ppGalNAc-T2）与共刺激分子B7-H3的相互关系.方法 通过同源模拟,得到共刺激分子B7-H3两种不同剪接体（2IgB7-H3,4IgB7-H3）的分子结构,寻找PDB数据库中的ppGalNAc-T2的蛋白质晶体结构,利用软件GRAMM（http：//vakser.bioinformatics.ku.edu/main/resources_gramm.php）,与同源模拟得到的两种不同剪接体的B7-H3分子结构相结合,寻找两者之间是否存在直接结合的可能.结果 成功地模拟了共刺激分子B7-H3两种剪接体的分子结构,发现ppGalNA-T2与共刺激分子B7-H3有相互结合的可能性.结论 结构生物信息学的研究发现ppGalNAc-T2分子与B7-H3具有潜在相互作用位点,ppGalNAc-T2可能参与B7-H3蛋白质的O-糖链合成反应,并且很有可能是通过直接接触来催化控制B7-H3分子的O-糖链合成.

β1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-8在人垂体瘤组织的表达及其对侵袭性的影响

目的 探讨β1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-8（β3GuT8）在人垂体腺瘤中的表达及其意义.方法 收集经手术和病理检查结果证实的垂体腺瘤标本58例,其中侵袭组32例,非侵袭组26例,分别采用免疫组织化学和Western blot方法检测侵袭性和非侵袭性垂体腺瘤组β3GnT8、相对高分子质量细胞外基质金属蛋白酶诱导剂（HG-CD147）、基质金属蛋白酶-2（MMP-2）的表达.结果 免疫组织化学结果显示33 GnT8在侵袭组的阳性率为87.5％,明显高于非侵袭组中的57.7％（P＜0.05）;Western blot结果显示β3GnT8、HG-CD147、MMP-2在侵袭组表达水平均明显高于非侵袭组（t=2.72,P＜0.05;t =2.81,P＜0.05;t =2.68,P＜0.05）,且随着β3GnT8表达量增加,HG-CD147及MMP-2的表达量亦增加,Pearson相关分析显示在侵袭组中β3GnT8、HG-CD147、MMP-2表达两两呈正相关（r =0.78,P ＜0.05;r=0.64,P＜0.05;r=0.52,P＜0.05）,在非侵袭组中无明显相关（P＞0.05）.结论 β3GnT8在垂体瘤中表达且和垂体腺瘤的侵袭性密切相关。

MiR-338-3p靶向调控B3GNT3抑制肺腺癌的侵袭和转移

肺腺癌是目前肺癌最常见的组织学亚型,约占肺肿瘤的一半。MicroRNAs(miRNAs)是非常短(20~24个核苷酸)的非编码RNA,miRNA的异常表达与多种人类肿瘤的进展和转移有关。本研究通过GEO数据集GSE19945查询获得肺癌中降低最显著的miRNA即miR-338-3p,并通过Kaplan-Meier Plotter(Kmplot)网站查得低表达水平的miR-338与肺腺癌病人的不良预后有关。利用qRT-PCR检测发现,miR-338-3p在肺腺癌细胞中表达降低(P<0.05)。利用GV369-miR-338过表达慢病毒上调A549细胞中的miR-338,利用qRT-PCR检测过表达效率。Transwell细胞侵袭实验发现,miR-338的上调可抑制肺腺癌细胞的侵袭能力(P=0.0007)。基因预测网站分析获得miR-338-3p的靶基因-B3GNT3(β1,3-N-acetylglucosaminyltransferase-3),生物信息学数据库分析发现,B3GNT3在肺腺癌组织中升高。双荧光素酶分析验证miR-338和B3GNT3可靶向结合(P<0.05)。Western印迹结果证明,过表达miR-338后B3GNT3蛋白的表达下降,且差距具有统计学意义(P<0.05)。Transwell实验证明,miR-338-3p可通过靶向调控B3GNT3抑制肺腺癌细胞的侵袭和转移(P<0.05)。综上,miR-338-3p在肺腺癌组织和细胞中表达降低,且miR-338-3p可靶向调控B3GNT3抑制肺腺癌的侵袭和转移。

乙酰半乳糖氨基转移酶3和维生素D受体基因多态性与绝经后妇女骨质疏松的相关性研究

目的研究乙酰半乳糖氨基转移酶3(GALNT3)和维生素D受体(VDR)基因多态性与绝经后妇女骨质疏松的关联性。方法纳入50例绝经后骨质疏松患者作为观察组,50例绝经后无骨质疏松志愿者作为对照组,检测两组女性的腰椎L2~L4、近端股骨颈和全髋骨密度(BMD),采用Taq Man基因分型技术检测GALNT3和VDR标签单核苷酸多态性(tag SNP),比较骨转换标志物(BTM)、血钙和磷水平,采用多因素Logistic回归分析筛选骨质疏松的危险因素。结果观察组GALNT33个位点和VDR 1个位点tag SNP百分比均明显高于对照组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。观察组血清25-羟维生素D3[25-(OH)-D_3]、Ⅰ型胶原交联C-末端肽(β-CTX)和血钙水平明显低于对照组,血磷水平高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。回归分析得出:4个tag SNP均是骨质疏松发生的独立危险指标。结论 GALNT3和VDR基因多态性与绝经后妇女骨质疏松密切相关。

GCNT3通过PI3K/Akt/mTOR和RhoA/ROCK/Cofilin途径促进肝癌细胞增殖、迁移和侵袭(英文)

β-1,3-半乳糖-O-糖基-糖蛋白β-1,6-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶(β-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoproteinβ-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase,GCNT3)是黏液蛋白质生物合成中不可缺少的一类N-乙酰葡萄糖转移酶。越来越多的证据表明,GCNT3的异常表达与肿瘤的侵袭以及病人的生存率有关,然而相关的研究仍较少报道。本研究旨在揭示GCNT3在调控肝细胞癌进程中的潜在机制。本研究首先利用高通量基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)和癌症基因组图谱(Cancer Genome Atlas databases,TCGA)数据库分析肝癌和正常组织中GCNT3的mRNA表达水平,结果表明,肝癌组织中GCNT3的mRNA表达水平高于正常组织(P≤0.001)。同时利用免疫组化、Western印迹进一步分析了肝癌组织、癌旁组织、正常组织中GCNT3蛋白的表达,发现有30%肝癌组织GCNT3表达水平高于癌旁组织和正常组织。随后,在肝癌细胞系HCCLM3和Huh7细胞中,采用CCK-8、平板克隆、划痕实验、Transwell实验分析GCNT3对肝癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响,结果显示,敲低GCNT3可抑制肝癌细胞的增殖、迁移和侵袭,而过表达GCNT3发挥相反作用。细胞周期和Western印迹结果显示,GCNT3调控G_(0/)G_1期关键蛋白质的表达来促进肝癌细胞周期G_1/S的转换。进一步探究发现,GCNT3可能通过激活PI3K/AKT/mTOR信号通路促进细胞增殖;以及GCNT3上调RhoA/ROCK/Cofilin通路关键蛋白质的表达来促进F-肌动蛋白(F-actin)的形成,从而参与细胞的迁移和侵袭。总之,本研究通过对GCNT3在肝癌细胞中的功能分析,初步证明,GCNT3与肝癌细胞增殖、迁移和侵袭中的功能有关,证实了GCNT3在肝癌临床治疗中的潜在价值,为肝癌治疗和诊断提供了新思路。

基于生物信息学方法分析B3GNT7基因在甲状腺癌组织中的表达水平及其对免疫细胞浸润的影响

目的基于生物信息学方法分析β-1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶7(B3GNT7)基因在甲状腺癌组织中的表达水平及其对免疫细胞浸润的影响。方法在肿瘤免疫评估资源数据库、GEPIA2数据库、UALCAN数据库中检索B3GNT7基因在甲状腺癌患者癌组织和癌旁组织中的表达情况,分析不同临床特征、病理分期甲状腺癌患者癌组织中B3GNT7基因的表达水平,采用多因素COX回归模型分析B3GNT7基因表达水平与甲状腺癌患者预后的关系,采用Spearman相关性模型分析B3GNT7基因表达水平与甲状腺癌组织中免疫细胞浸润丰度的相关性,以及B3GNT7基因表达水平与免疫细胞标志物、T淋巴细胞标志物、免疫检查点基因表达水平的相关性。结果B3GNT7基因在甲状腺癌患者癌组织中的表达高于癌旁组织(P<0.05)。不同病理分期的甲状腺癌患者癌组织中的B3GNT7基因表达水平具有差异性(P<0.05)。多因素COX分析结果显示,CD8^(+)T淋巴细胞、B3GNT7基因表达水平是甲状腺癌患者预后的影响因素(均P<0.05)。Spearman相关性分析结果显示,B3GNT7基因表达水平与B淋巴细胞、CD4^(+)T淋巴细胞、CD8^(+)T淋巴细胞、巨噬细胞、树突状细胞、中性粒细胞的浸润丰度,以及细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA4)的表达水平密切相关(均P<0.05),还与多种免疫标志物的表达水平相关。结论B3GNT7基因在甲状腺癌组织中呈高表达,其表达水平与甲状腺癌患者的病理分期密切相关,B3GNT7基因与甲状腺癌组织中B淋巴细胞、CD4^(+)T淋巴细胞、CD8^(+)T淋巴细胞、巨噬细胞、树突状细胞、中性粒细胞的浸润丰度相关,且与CTLA4表达密切相关。

NAG/UCr、CRP及补体C3、C4与过敏性紫癜患儿并发肾炎的关系

目的探讨N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶/尿肌酐(NAG/UCr)、C-反应蛋白(CRP)及补体C3、C4与过敏性紫癜(HSP)患儿并发肾炎的关系。方法纳入2020年7月至2021年4月就诊于安徽儿童医院的HSP患儿142例,根据患儿是否并发肾炎分成HSP组(n=97)和过敏性紫癜性肾炎组(HSPN,n=45)。比较两组患儿的临床资料和NAG/UCr、CRP及补体C3、C4水平,采用多因素Logistic回归分析HSP患儿并发肾炎的影响因素,受试者工作特性曲线(ROC)分析D-二聚体、UA联合补体C3、C4水平对HSP患儿并发肾炎的预测价值。结果HSP和HSPN组患儿的年龄、紫癜反复次数、皮疹持续时间、PLT、WBC、RDW、NEU、DD、尿蛋白量、NAG/UCr、CRP及补体C3、C4等比较,差异均有统计学意义(t=15.431、2.828、3.199、2.644、7.747、27.408、15.806、7.992、3.133、4.609、3.118,χ^(2)=9.988、8.715,P<0.05);多因素Logistic回归显示,年龄、紫癜反复次数、皮疹持续时间、NAG/UCr、CRP及补体C3、C4是HSP患儿并发肾炎的独立危险因素(P<0.05)。ROC曲线显示,NAG/UCr、CRP与补体C3、C4及四者联合检测曲线下面积为0.793、0.701、0.784、0.713、0.896。结论NAG/UCr、CRP及补体C3、C4与HSP患儿并发肾炎密切相关,NAG/UCr、CRP及补体C3、C4联合检测对HSP患儿并发肾炎有良好的预测价值。

siRNA下调Smad3基因后对多肽N-乙酰氨基半乳糖转移酶表达的影响

目的以Smad3基因为研究对象,筛选出该基因的有效siRNA干扰载体,并探讨下调表达Smad3基因对多肽N-乙酰氨基半乳糖转移酶(ppGalNAcTs)家族mRNA水平表达的影响。方法将事先构建的3个带有荧光标记的干扰载体分别转染人肝星状细胞株(HSC)中,通过RT-PCR、Western blot方法分别从mRNA水平及蛋白水平检测干扰效率。并通过转染有效的Smad3基因的siRNA表达载体,检测下调Smad3以后对糖基转移酶ppGalNAcTs家族mRNA表达的影响情况。结果成功筛选到Smad3基因的有效siRNA干扰载体,检测出转染了Smad3的siRNA表达载体的肝星状细胞中Smad3的mRNA和蛋白表达都受到了抑制,而糖基转移酶ppGalNAcTs的mRNA表达也随之发生了一些变化。结论成功筛选到一个Smad3基因的siRNA干扰载体,继而可转染人肝星状细胞,并抑制其中Smad3蛋白的表达,为研究siRNA方法在肝纤维化中的治疗作用提供了实验基础和理论支持。

胰腺癌组织中miR-338-3p、B3GNT3表达变化及意义

目的探讨胰腺癌组织中miR-338-3p、β-1,3-N-乙酰氨基葡萄糖氨基转移酶3(B3GNT3)的表达变化及意义。方法选择行腹腔镜切除手术的胰腺癌患者92例,术中取癌组织及其癌旁组织(距肿瘤组织边缘≥5 cm),采用qRT-PCR检测组织中miR-338-3p、B3GNT3 mRNA表达,用Pearson相关分析二者相关性,分析二者与患者临床病理特征的关系;对患者进行随访,统计患者3年生存率,分析miR-338-3p、B3GNT3 mRNA表达与胰腺癌患者生存的关系;Cox回归分析影响胰腺癌患者生存的危险因素。结果与癌旁组织比较,胰腺癌组织中miR-338-3p表达低,B3GNT3 mRNA表达高(P均<0.05)。胰腺癌组织中miR-338-3p表达与B3GNT3 mRNA表达呈负相关(r=-0.571,P<0.05)。新发糖尿病、低中分化、TNM分期Ⅲ期、有淋巴结转移的胰腺癌患者miR-338-3p低于无新发糖尿病、高分化、TNM分期Ⅰ~Ⅱ期、未发生淋巴结转移患者(P均<0.05),低中分化、TNM分期Ⅲ期、有淋巴结转移的胰腺癌患者B3GNT3 mRNA表达高于高分化、TNM分期Ⅰ~Ⅱ期、未发生淋巴结转移患者(P均<0.05)。根据miR-338-3p、B3GNT3 mRNA相对表达量的均值将患者分为miR-338-3p高表达组、miR-338-3p低表达组,B3GNT3高表达组、B3GNT3低表达组。miR-338-3p低表达组3年生存率低于miR-338-3p高表达组,B3GNT3低表达组3年生存率高于B3GNT3高表达组(P均<0.05)。有淋巴结转移、低表达miR-338-3p、高表达B3GNT3是胰腺癌患者术后3年死亡的危险因素(P均<0.05)。结论胰腺癌组织中miR-338-3p低表达、B3GNT3 mRNA高表达,这与胰腺癌恶性生物学行为及预后不良有关。

共刺激分子B7-H3与糖基化相关性的初步探讨

目的:探讨共刺激分子B7-H3与N-乙酰氨基半乳糖转移酶之间的相关性。方法:采用RT-PCR的方法检测同一细胞系上B7-H3和N-乙酰氨基半乳糖转移酶(T1-T7)的表达,从而探讨它们之间可能的相关性。结果:成功地检测到了B7-H3与N-乙酰氨基半乳糖转移酶(T1-T7)表达的差异性和一致性。结论:共刺激分子B7-H3和N-乙酰氨基半乳糖转移酶(T1-T7)在T1、T2存在可能的结合点,为进一步的研究提供了线索。

柚皮苷调节GALNT2-ANGPTL3通路改善小鼠的血脂异常

目的测试柚皮苷对小鼠的血脂异常的影响。方法 50只小鼠,随机分为正常对照组、高脂血症模型组、10 mg/kg柚皮苷组、20 mg/kg柚皮苷组、30 mg/kg柚皮苷组,各10只。观察比较五组小鼠肝组织N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(GALNT2)和血管生成素样蛋白3(ANGPTL3)m RNA表达及血脂[甘油三酯(TG)、胆固醇(TC)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)]水平。结果与正常对照组比较,高脂血症模型组小鼠GALNT2的表达显著降低,ANGPTL3的表达显著升高,差异有统计学意义(P<0.01)。与高脂血症模型组比较,10 mg/kg柚皮苷组、20 mg/kg柚皮苷组、30 mg/kg柚皮苷组小鼠GALNT2的表达明显升高,ANGPTL3表达明显降低,差异有统计学意义(P<0.05或<0.01)。高脂血症模型组TG水平(96.3±6.6)mg/dl和TC水平(211.8±15.5)mg/dl高于正常对照组的(65.7±5.2)、(135.8±7.4)mg/dl,HDL-C水平(32.9±4)mg/dl低于正常对照组的(62.5±6.2)mg/dl,差异有统计学意义(P<0.01);10 mg/kg柚皮苷组、20 mg/kg柚皮苷组、30 mg/kg柚皮苷组的TC和TG及HDL-C水平均优于高脂血症模型组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论柚皮苷调节GALNT2-ANGPTL3通路改善高脂血症小鼠的血脂异常。

创伤性老年患者急性肾损伤的预测价值分析

目的探讨几丁质酶3样蛋白1(CHI3L1)、中性粒细胞明胶酶相关脂质转载蛋白(NGAL)及N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(NAG)对老年创伤患者急性肾损伤(AKI)早期诊断的预测价值。方法老年创伤患者120例,在入科时收集血、尿标本,检测血清和尿CHI3L1、血清和尿NGAL、尿NAG浓度。每6 h记录尿量。入科同时检测血肌酐。采用logistic回归及ROC曲线分析CHI3L1、NGAL、NAG对老年AKI的预测作用。结果多因素logistic回归分析显示血清CHI3L1(SCHI3L1)与血清NGAL(SNGAL)是AKI发生的高危因素。ROC曲线显示预测老年创伤患者AKI的发生,SNGAL的AUC为0.819,SCHI3L1的AUC为0.729,SNGAL联合SCHI3L1的AUC为0.834。结论SCHI3L1与SNGAL是老年创伤患者AKI发生的高危因素,两者均可以预测其AKI的发生,以SNGAL的预测作用更明显,联合指标能提高预测准确率。

OGT在胰腺癌中表达及预后的相关研究

目的:胰腺癌(Pancreatic cancer, PC)是一种高度侵袭性的恶性肿瘤,对患者的生存率造成严重威胁。越来越多的研究表明,糖基化修饰在胰腺癌的发生和发展中扮演着关键角色。O-连接β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶(O-linked N-acetylglucosamine transferase, OGT)是糖基化的关键调节者,其异常表达与多种癌症相关。本研究旨在探究OGT在胰腺癌中的异常表达,并分析其与胰腺癌预后的相关性。方法:回顾性收集2017年1月至2021年1月就诊于青岛大学附属医院确诊胰腺癌且行手术治疗患者的临床及组织病理资料。临床资料包括患者年龄、性别、身体质量指数(Body mass index, BMI)、烟酒史、糖尿病病史、家族史、肿瘤大小、位置、TNM分期、组织浸润及器官转移情况、癌胚抗原(Carcinoembryonic antigen, CEA)、糖类抗原19-9 (Carbohydrate antigen19-9, CA19-9)水平等信息。应用免疫组织化学染色的方法检测癌组织及癌旁胰腺导管组织中OGT的表达水平,并根据表达量的高低分为高表达组和低表达组,分析其与患者临床病理特征及预后的关系。结果:1) 胰腺癌组织中OGT的表达水平与癌旁组织的表达水平之间存在显著统计学差异(P P P > 0.05)。3) 生存分析表明,OGT的表达水平与患者不良预后存在明显相关性(P = 0.029)。结论:胰腺癌组织中OGT表达水平明显增加,OGT的高表达与淋巴结转移、TNM分期正相关。胰腺癌中OGT的高表达与胰腺癌患者不良预后相关。

GNPNAT1与HDAC11在非小细胞肺癌组织中的表达及其临床意义

目的:探讨磷酸氨基葡萄糖-N-乙酰基转移酶1(glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1,GNPNAT1)与组蛋白去乙酰化酶11(histone deacetylases 11,HDAC11)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)组织中的表达及其临床意义。方法:采用免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)染色检测GNPNAT1和HDAC11蛋白在158例手术切除NSCLC组织及癌旁组织中的表达。分析两者表达与肿瘤病理组织学特征的关系,通过Kaplan-Meier曲线计算不同表达水平组患者的总体生存(overall survival,OS)率。进行单、多因素Cox回归分析确定NSCLC患者的独立预后因素。结果:GNPNAT1(Z=8.611,P<0.001)与HDAC11(Z=7.731,P<0.001)在NSCLC组织中表达显著高于其邻近癌旁组织。根据IHC染色结果,在158例NSCLC样本中观察到GNPNAT1高表达80例(50.6%),HDAC11高表达75例(47.5%)。GNPNAT1高表达在中、低分化(χ^(2)=33.747,P<0.001)及TNMⅡ-Ⅲ期肿瘤(χ^(2)=13.664,P=0.001)中更为常见,淋巴结转移率更高(χ^(2)=10.534,P=0.001),淋巴血管侵犯更为频繁(χ^(2)=5.425,P=0.020)。HDAC11高表达与淋巴结转移(χ^(2)=8.265,P=0.004)、胸膜侵犯(χ^(2)=4.373,P=0.037)及TNM分期(χ^(2)=6.472,P=0.039)显著相关。GNPNAT1高、低表达者3年OS率分别为67.5%和88.3%(χ^(2)=16.362,P<0.001),而HDAC11高、低表达患者3年OS率分别为61.4%和91.3%(χ^(2)=8.864,P=0.003)。单、多变量Cox回归分析显示,GNPNAT1(P=0.014,HR:2.236,95%CI:1.180~4.239)和HDAC11高表达(P=0.042,HR:1.813,95%CI:1.022~3.218)是NSCLC患者的独立预后因素。结论:GNPNAT1和HDAC11高表达与肿瘤侵袭性特征及不良预后有关,两者或许是NSCLC患者的潜在预后标志物。

甲状腺乳头状癌脑转移差异表达基因生物学功能分析及关键调控基因筛选

目的采用生物信息学方法分析甲状腺乳头状癌(PTC)脑转移差异表达基因的生物学功能,并筛选PTC脑转移的关键调控基因。方法从GEO数据库获取基因芯片GSE66463,利用GEO2R中GEOquery、limma包筛选PTC脑转移灶癌组织差异表达基因,对差异表达基因进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能注释,利用京都基因和基因组数据库对差异表达基因的信号通路进行富集分析。通过String数据库构建差异表达基因的蛋白互作网络,筛选可能参与PTC脑转移的关键调控基因,分别基于GEPIA数据库、人类蛋白质表达图谱数据库数据分析PTC脑转移关键调控基因及蛋白与PTC患者预后的关系。结果PTC脑转移灶癌组织中共183个差异表达基因,其中表达上调82个、下调101个。PTC脑转移灶癌组织差异表达基因生物学功能主要有金属离子动态平衡、小分子转运及分子细胞间黏附等,信号通路主要集中在风湿性炎症信号通路、NF-kB信号通路及IL17信号通路等。β-1,3-N-乙酰氨基葡萄糖氨基转移酶(B3GNT7)、丝氨酸/苏氨酸激酶(BUB1)、细胞分裂周期蛋白20(CDC20)、集落刺激因子2(CSF2)、趋化因子CXC配体2、白细胞介素1α(IL1α)、IL1β、骨诱导因子、骨调蛋白、脯氨酸/精氨酸丰富端亮氨酸丰富重复蛋白可能是参与PTC脑转移的关键调控基因。与B3GNT7低表达者比较,B3GNT7基因及蛋白高表达的PTC患者预后较好(P均<0.05)。结论PTC脑转移的差异表达基因的生物学功能主要有金属离子动态平衡、小分子转运及分子细胞间黏附等。PTC脑转移的关键调控基因主要有B3GNT7、BUB1及CDC20等。

EOGT介导的O-GlcNAc修饰对Notch信号通路的影响及其在疾病中的作用

O-连接-N-乙酰氨基葡萄糖(O-linked-N-acetylglucosamine,O-GlcNAc)修饰是一种特殊的翻译后修饰,在众多细胞过程中发挥调节作用,例如转录、胞内信号转导、内吞作用和蛋白质稳定性。表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)结构域特异性O-GlcNAc转移酶(EGF domain-specific O-linked-N-acetylglucosamine transferase,EOGT)是一种内质网(endoplasmic reticulum,ER)驻留蛋白质,能够对含有EGF结构域的分泌或膜(跨膜)糖蛋白丝氨酸/苏氨酸残基进行糖基化修饰。Notch信号通路是一种普遍存在的细胞间通讯过程,通过邻近细胞间的相互作用调节细胞生物过程。目前,已经在多种人类疾病中发现有EOGT介导的O-GlcNAc修饰参与,并且通常与Notch信号通路相关。然而,其中具体分子机制尚未完全阐明。本文对近年来EOGT介导的O-GlcNAc修饰,以及相关Notch信号通路在多种人类疾病中的作用研究现状进行简要回顾。

β3GnT8/β3GalT7催化活性的研究

目的进一步验证β1,3半乳糖基转移酶(β3GalT7)的催化功能。方法将重组表达载体pGEX-6p-1-β3GnT8/GalT7转化BL21大肠杆菌,经IPTG诱导表达后,得到GST-β3GnT8/GalT7融合蛋白,分别进行β3GalT7和β3GnT8反应体系的酶促反应,利用高效液相色谱(HPLC)进行检测。结果HPLC检测结果表明,β3GalT7同时具有β3GalT7和β3GnT8的活性。结论β3GalT7具有双重酶活性,拟初步重命名为β3GnT8/β3GalT7。