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最短α-螺旋的理论研究(英文)
1
作者
蒋帆
吴云东
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第12期2371-2376,共6页
在B3LYP/6-31+G**水平下的溶剂中优化得到4个残基长和5个残基长的α-螺旋.计算得到的骨架构象与蛋白质晶体结构的统计结果符合得很好.类似于一般的较长α-螺旋,观察到了C-端的散开.对很短的聚丙氨酸肽链,从焓上看310-螺旋明显比α-螺旋...
在B3LYP/6-31+G**水平下的溶剂中优化得到4个残基长和5个残基长的α-螺旋.计算得到的骨架构象与蛋白质晶体结构的统计结果符合得很好.类似于一般的较长α-螺旋,观察到了C-端的散开.对很短的聚丙氨酸肽链,从焓上看310-螺旋明显比α-螺旋稳定,然而熵效应不利于310-螺旋结构.螺旋N2(N-端第二个残基)位上天冬氨酸侧链的加盖(Capping)效应明显使α-螺旋相对310-螺旋更加稳定.因而,在同样长度下α-螺旋比310-螺旋多的统计结果能够被理解.另外,最短的α-螺旋的C-端倾向于以β-转角结构结束.
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关键词
Α
-
螺旋
310-螺旋
密度泛函理论(DFT)计算
氢键加盖
下载PDF
职称材料
题名
最短α-螺旋的理论研究(英文)
1
作者
蒋帆
吴云东
机构
北京大学深圳研究生院
香港科技大学化学系
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第12期2371-2376,共6页
基金
Research Grants Council of Hong Kong(批准号:N-HKUST623/04)
国家自然科学基金(批准号:20225312)
文摘
在B3LYP/6-31+G**水平下的溶剂中优化得到4个残基长和5个残基长的α-螺旋.计算得到的骨架构象与蛋白质晶体结构的统计结果符合得很好.类似于一般的较长α-螺旋,观察到了C-端的散开.对很短的聚丙氨酸肽链,从焓上看310-螺旋明显比α-螺旋稳定,然而熵效应不利于310-螺旋结构.螺旋N2(N-端第二个残基)位上天冬氨酸侧链的加盖(Capping)效应明显使α-螺旋相对310-螺旋更加稳定.因而,在同样长度下α-螺旋比310-螺旋多的统计结果能够被理解.另外,最短的α-螺旋的C-端倾向于以β-转角结构结束.
关键词
Α
-
螺旋
310-螺旋
密度泛函理论(DFT)计算
氢键加盖
Keywords
α
-
Helix
310
-
Helix
Density functional theory(DFT)calculation
H
-
bond capping
分类号
O641 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
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1
最短α-螺旋的理论研究(英文)
蒋帆
吴云东
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008
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职称材料
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