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基于蛋白质组学探讨Ppp3cb和Ppm1g在NHE1基因敲除模型鼠海马组织中的表达
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作者 马鹏飞 杨攀 +5 位作者 郑乾 张祥明 屠秋霞 张春林 叶兰 冯占辉 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期1244-1253,共10页
目的通过NHE1基因敲除模型鼠的海马组织差异蛋白质组学分析,发现并明确Ppp3cb和Ppm1g的表达特征。方法①选取6只2周龄NHE1基因敲除模型鼠作为模型组,同周龄野生型小鼠6只作为对照组,采用琼脂糖凝胶电泳检测其基因型;应用旷场实验和强迫... 目的通过NHE1基因敲除模型鼠的海马组织差异蛋白质组学分析,发现并明确Ppp3cb和Ppm1g的表达特征。方法①选取6只2周龄NHE1基因敲除模型鼠作为模型组,同周龄野生型小鼠6只作为对照组,采用琼脂糖凝胶电泳检测其基因型;应用旷场实验和强迫游泳实验对模型组和对照组小鼠进行行为学评估,并按照Racine评分标准对模型鼠进行癫痫发作分级;②通过串联质谱分析技术对模型组和对照组的海马组织进行差异蛋白筛选,基因本体论(Gene Ontology Analysis,GO)分析差异蛋白并进行注释和富集,蛋白网络数据库(search tool for the retrieval of interesting genes,STRING)分析差异蛋白之间的蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI);③应用qPCR和Western blot检测Ppp3cb和Ppm1g的转录和翻译水平,应用免疫组织化学技术分别观察其在组织中的表达量。结果①模型组小鼠NHE1基因未见表达,旷场实验中模型鼠的运动总距离较对照组减少(P=0.0073),跨越的格子数比对照组显著减少(P<0.0001)。强迫游泳实验结果显示,模型鼠不动的时间明显延长(P<0.0001);②以表达倍数(FC)≥1.2倍且P<0.05为筛选标准,检测到海马组织中845个差异表达的蛋白质点,其中有9个蛋白表达上调,7个蛋白表达下调。其中Ppp3cb下调,Ppm1g上调。GO功能注释结果表明,NHE1敲除后,分子功能(MF)富集在蛋白丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性的差异最显著,细胞成分(CC)富集在质膜部分的差异蛋白数量最多,生物过程(BP)富集在负向调节生物过程、免疫系统过程的差异蛋白数量最多。STRING分析显示差异蛋白Ppp3cb和Slc9a1直接作用,Ppm1g通过Ppp3cb和Slc9a1间接作用,Ppp3cb和Ppm1g之间相互作用。③Ppp3cb的转录和翻译水平减少,在组织中的表达量下降,而Ppm1g转录和翻译水平增加,在组织中的表达量上升(P<0.05)。结论本研究确定了NHE1基因敲除小鼠海马组织中差异蛋白Ppp3cb表达下调,而Ppm1g表达上调,为进一步研究Ppp3cb和Ppm1g参与癫痫发病机制提供了依据。 展开更多
关键词 NHE1基因敲除 癫痫 海马 蛋白质组学 Ppp3cb Ppm1g
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大肠癌组织中PIK3CA和PIK3CB的表达及意义 被引量:10
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作者 燕炜 吴淑华 +2 位作者 李扬扬 高向前 孟晓 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期18-22,共5页
目的观察癌基因PIK3CA、PIK3CB在大肠癌组织中的表达及其相互关系,并分析PIK3CA和PIK3CB的表达对大肠癌患者预后的影响。方法采用免疫组化EnVision法染色并结合图像进行分析,探讨PIK3CA和PIK3CB在大肠癌组织及正常大肠黏膜组织中的表达... 目的观察癌基因PIK3CA、PIK3CB在大肠癌组织中的表达及其相互关系,并分析PIK3CA和PIK3CB的表达对大肠癌患者预后的影响。方法采用免疫组化EnVision法染色并结合图像进行分析,探讨PIK3CA和PIK3CB在大肠癌组织及正常大肠黏膜组织中的表达;应用RT-PCR和Western blot技术分别检测PIK3CA mRNA和PIK3CB mRNA及其相应蛋白的表达;回访125例大肠癌术后患者,生存分析用Kaplan-Meier法,生存曲线用Log-Rank检验。结果在300例大肠癌蜡块组织及正常黏膜组织中,PIK3CA表达的平均光密度值分别为:10.087 9±2.148 7、6.937 6±2.065 3,PIK3CB表达的平均光密度值分别为:15.870 6±2.877 7、8.693 2±2.442 4。PIK3CA和PIK3CB在大肠癌组织中的表达具有相关性(r=0.68,P<0.05);RT-PCR检测结果显示,与正常大肠黏膜组织相比,大肠癌组织中PIK3CA mRNA和PIK3CB mRNA的表达水平均明显升高,且二者表达结果呈正相关(r=0.74,P<0.05);Western blot法检测发现PIK3CA和PIK3CB蛋白表达水平同样升高,二者表达结果呈正相关(r=0.71,P<0.05);生存分析显示PIK3CA和PIK3CB高表达与患者死亡风险具有明显相关性。结论 PIK3CA和PIK3CB在大肠癌组织中高表达,与正常黏膜组织中的表达相比差异较明显,且PIK3CA和PIK3CB在大肠癌的发生、发展中具有协同作用,PIK3CA、PIK3CB高表达亦是大肠癌患者预后相关的因素之一。检测大肠癌患者PIK3CA和PIK3CB的表达对于控制大肠癌的进展、确定大肠癌的靶点治疗及判断预后具有重要意义。 展开更多
关键词 大肠肿瘤 PIK3CA PIK3cb 免疫组织化学
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大鼠Pik3cb短发卡状RNA对平滑肌细胞增殖的影响 被引量:3
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作者 刘苏健 刘宏 +4 位作者 赵京 申庆民 常程 邓勇志 马捷 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1234-1239,共6页
目的:构建大鼠Pik3cb短发卡状RNA(shRNA)真核表达载体,为利用RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术从转录后水平抑制血管移植术后移植静脉再狭窄的研究做准备。方法:经预实验设计并合成6条shRNA寡核苷酸片段,酶切鉴定和测序正确后挑选2... 目的:构建大鼠Pik3cb短发卡状RNA(shRNA)真核表达载体,为利用RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术从转录后水平抑制血管移植术后移植静脉再狭窄的研究做准备。方法:经预实验设计并合成6条shRNA寡核苷酸片段,酶切鉴定和测序正确后挑选2条质粒转染入大鼠胸主动脉平滑肌细胞内,48、72h用荧光显微镜观察转染效率,Western blot检测Phospho-Akt(Ser473)蛋白的表达,流式细胞仪分别在24、48、72、96h检测细胞凋亡数目。结果:构建的两条大鼠Pik3cbshRNA经限制性内切酶酶切和DNA测序正确后分别命名为pU6-Pik3cb-shRNA-1和pU6-Pik3cb-shRNA-2,转染平滑肌细胞48h和72h转染率分别为15.7%和10.1%;Westernblot结果显示转染组Phospho-Akt(Ser473)蛋白表达明显下降;流式结果表明pU6-Pik3cb-shRNA-1和pU6-Pik3cb-shRNA-2组凋亡细胞数目明显增加,与对照组相比有统计学意义(P<0.05),各时间点错配质粒组与正常对照组相比差异无统计学意义。结论:成功构建了2条大鼠Pik3cbshRNA真核表达载体,有效促进凋亡,抑制平滑肌细胞增殖,为靶向Pik3cb的RNAi防治血管再狭窄奠定了基础。 展开更多
关键词 载体构建 Pik3cb SHRNA 血管再狭窄 RNAI
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大鼠Pik3cb shRNA质粒的构建及鉴定
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作者 刘苏健 邓勇志 马捷 《山西医科大学学报》 CAS 2007年第9期769-773,共5页
目的构建大鼠Pik3cb短发卡状RNA(shRNA)真核表达载体,为利用RNA干扰技术(RNA interference,RNAi)从转录后水平抑制移植术后血管再狭窄的研究做准备。方法根据大鼠Pik3cb mRNA序列设计6条并经预实验挑选出2条shRNA寡核苷酸片段,退火形成... 目的构建大鼠Pik3cb短发卡状RNA(shRNA)真核表达载体,为利用RNA干扰技术(RNA interference,RNAi)从转录后水平抑制移植术后血管再狭窄的研究做准备。方法根据大鼠Pik3cb mRNA序列设计6条并经预实验挑选出2条shRNA寡核苷酸片段,退火形成双链并克隆进入载体pGenesil-1,进行酶切鉴定和测序。结果酶切证明构建的shRNA已插入载体,经测序证明与设计的相同,获得大鼠Pik3cb shRNA表达载体质粒。结论成功构建了2条大鼠Pik3cb shRNA真核表达载体,为靶向Pik3cb的RNAi防治血管再狭窄奠定了基础。 展开更多
关键词 载体构建 质粒 RNA干扰 Pik3cb SHRNA
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大肠癌组织中PIK3CA、PIK3CB蛋白与多药耐药基因产物表达的相关性及其临床意义 被引量:5
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作者 温菲菲 吴淑华 +2 位作者 李扬扬 高向前 何双 《世界华人消化杂志》 CAS 2015年第2期202-209,共8页
目的:检测PIK3CA、PIK3CB和多药耐药基因1(muhidrug resistance 1,MDR-1)、肺耐药蛋白(lung cancer resistance protein,LRP)、谷胱甘肽转移酶π(glutathione-S-transferaseπ,GST-π)、D N A拓扑异构酶Ⅱ(DNA topoisomeraseⅡ,TopoⅡ)... 目的:检测PIK3CA、PIK3CB和多药耐药基因1(muhidrug resistance 1,MDR-1)、肺耐药蛋白(lung cancer resistance protein,LRP)、谷胱甘肽转移酶π(glutathione-S-transferaseπ,GST-π)、D N A拓扑异构酶Ⅱ(DNA topoisomeraseⅡ,TopoⅡ)在大肠癌中的表达,探讨PIK3CA、PIK3CB对大肠癌多药耐药性的影响.方法:应用免疫组织化学EnVision法检测316例大肠癌组织中PIK3CA、PIK3CB、MDR-1、LRP、GST-π和TopoⅡ的表达情况,并结合临床病理因素进行分析.结果:316例大肠癌中,PIK3CA、PIK3CB的表达与肿瘤的分化程度、淋巴结转移成正相关,其相关系数分别为0.136、0.168.MDR基因在大肠癌组织中的阳性率分别为:M D R-1为72.78%(230/316)、L R P为70.89%(224/316)、TOPⅡ为77.53%(245/316)及GST-π为76.58%(242/316).经Spearman相关性分析,PIK3CA、PIK3CB的表达与多药耐药蛋白MDR-1、LRP、GST-π的表达均成正相关,相关系数分别为0.288、0.128、0.1 9 7.3 1 6例大肠癌患者的中位生存期为60 mo,5年生存率为47.5%,Kaplan-Meier分析结果显示,PIK3CA与PIK3CB同时高表达、淋巴结转移、MDR-1(+)、GST-π(+)患者术后5年生存率明显降低.Cox比例风险模型显示,PIK3CA(+)PIK3CB(+)、淋巴结转移、MDR-1、GST-π是影响大肠癌患者预后的独立因素.结论:PIK3CA、PIK3CB与大肠癌的多药耐药密切相关,PIK3CA、PIK3CB、淋巴结转移、MDR-1、GST-π是影响大肠癌患者预后的独立因素,检测PIK3CA、PIK3CB为临床合理选择化疗药物、初步判断预后具有重要参考价值. 展开更多
关键词 大肠癌 多药耐药基因 PIK3CA PIK3cb 预后
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PIK3CB、Akt及p-Akt在子宫内膜癌中的表达及意义 被引量:4
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作者 张琛 杨清 王玉 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期544-546,549,共4页
目的检测PIK3CB、Akt及p-Akt在增殖期子宫内膜、子宫内膜非典型增生和子宫内膜样腺癌中的表达,探讨它们在子宫内膜癌发生、发展中的作用。方法应用免疫组化SP法和Western blot检测PIK3CB、Akt及p-Akt在不同子宫内膜组织中的表达情况。结... 目的检测PIK3CB、Akt及p-Akt在增殖期子宫内膜、子宫内膜非典型增生和子宫内膜样腺癌中的表达,探讨它们在子宫内膜癌发生、发展中的作用。方法应用免疫组化SP法和Western blot检测PIK3CB、Akt及p-Akt在不同子宫内膜组织中的表达情况。结果 PIK3CB、Akt及p-Akt在子宫内膜样腺癌中的表达水平均高于子宫内膜非典型增生和增殖期子宫内膜组织(P<0.05)。PIK3CB的表达与子宫内膜癌的临床分期和病理学分级无关。Akt及p-Akt在不同病理学分级子宫内膜癌组织中表达的差异有统计学意义,但与临床分期无关。结论 PI3K/Akt信号转导通路在子宫内膜癌发生、发展中发挥着重要作用,针对PI3K/Akt信号转导通路的干预可能为子宫内膜癌的预防及治疗提供新的靶点。 展开更多
关键词 PIK3cb 子宫内膜癌 过表达
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大肠癌中PIK3CA、PIK3CB与EGFR表达的相关性及其临床意义 被引量:4
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作者 王雷动 吴淑华 +3 位作者 李扬扬 高向前 何双 温菲菲 《世界华人消化杂志》 CAS 2015年第26期4200-4207,共8页
目的:检测大肠癌组织中上皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、PIK3CA和PIK3CB的表达水平,分析EGFR与PIK3CA、PIK3CB之间的相关性,探讨三者在大肠癌发生、发展及对靶向治疗的影响.方法:应用免疫组织化学Envision法... 目的:检测大肠癌组织中上皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、PIK3CA和PIK3CB的表达水平,分析EGFR与PIK3CA、PIK3CB之间的相关性,探讨三者在大肠癌发生、发展及对靶向治疗的影响.方法:应用免疫组织化学Envision法检测120例大肠癌组织、30例正常大肠黏膜(距病变边缘>5cm)病例组织中的EGFR、PIK3CA和PIK3CB蛋白的表达情况,并结合临床病理因素进行相关分析.结果:在大肠癌组织中EGFR、PIK3CA、PIK3CB蛋白表达的阳性率依次为48%、55.7%和75.9%,显著高于正常黏膜(P<0.05).大肠癌中EGFR阳性同时伴有68.9%的PIK3CA阳性及86.2%的PIK3CB阳性,而EGFR阴性时依然伴有PIK3CA(43.5%)、PIK3CB(66.1%)阳性.EGFR受体的表达水平与PIK3CA、PIK3CB蛋白的表达差异有显著(P<0.05).大肠癌组织中EGFR、PIK3CA和PIK3CB蛋白与肿瘤的分化程度、淋巴结转移成正相关(P<0.05).120例大肠癌患者的中位生存期为54.5 mo,5年生存率为49.2%,Cox多因素分析结果显示,PIK3CA、PIK3CB、EGFR、淋巴结转移均是影响大肠癌患者预后的独立因素,而患者年龄、性别、肿瘤大小、分化程度均不是影响大肠癌预后的独立因素.结论:大肠癌组织中存在EGFR、PIK3CA与PIK3CB的高表达,并且与大肠癌的分化程度、淋巴结转移等临床病理因素密切相关;PIK3CA、PIK3CB的高表达不仅与EGFR的激活有关,同时存在自身突变引起的高表达,PIK3CA、PIK3CB、EGFR、淋巴结转移均是影响大肠癌患者预后的独立因素,PIK3CA、PIK3CB突变可成为影响以EGFR为靶点治疗的因素. 展开更多
关键词 结直肠癌 上皮生长因子受体 PIK3CA PIK3cb 免疫组织化学 预后
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中国荷斯坦牛PIK3CB基因多态性及其与繁殖和产奶性状的关联分析 被引量:3
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作者 徐昊祺 许静漪 +9 位作者 胡丽蓉 张帆 罗汉鹏 张海亮 师睿 李想 刘林 刘巧香 郭刚 王雅春 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第9期3438-3452,共15页
【目的】探究磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚单位β(PIK3CB)基因多态性及其与中国荷斯坦牛繁殖和产奶性状的关系。【方法】通过混池测序对中国荷斯坦牛PIK3CB基因进行单核苷酸多态性(SNP)位点筛选,采用竞争性等位基因特异性PCR(KASP... 【目的】探究磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚单位β(PIK3CB)基因多态性及其与中国荷斯坦牛繁殖和产奶性状的关系。【方法】通过混池测序对中国荷斯坦牛PIK3CB基因进行单核苷酸多态性(SNP)位点筛选,采用竞争性等位基因特异性PCR(KASP)技术在1 160头健康泌乳中国荷斯坦牛中进行SNP分型并进行群体遗传学分析,采用线性模型进行SNP与11个繁殖和产奶性状基于单位点和单倍型组合的关联分析。【结果】在PIK3CB基因中共检测到了17个SNPs,筛选出7个SNPs用于后续分析。关联分析发现,7个SNPs与多个目标性状存在显著或极显著的关联(P<0.05;P<0.01);位于外显子区域的g.130433743 A>G位点AA基因型个体和位于可变剪接区域的g.130448069 G>A位点GG基因型个体,其经产牛首末次配种间隔、产奶量、乳蛋白量和乳脂量最低,体细胞评分最高,上述基因型个体具有较短的首末次配种间隔,而产奶性能相对较差;g.130387717 G>A位点AA基因型个体,其初配日龄和青年牛首末次配种间隔最低,产奶量、乳蛋白量和乳脂量最高,该基因型个体的繁殖和产奶性能均较好,上述3个SNPs位点可作为中国荷斯坦牛繁殖和产奶性状的候选位点重点关注。单倍型分析发现,PIK3CB基因的g.130387717 G>A、g.130430832 A>-、g.130433743 A>G、g.130433982 C>T、g.130446073 C>T和g.130448069 G>A 6个SNPs紧密连锁形成一个单倍型块,且与多个目标性状存在显著或极显著关联(P<0.05;P<0.01),其中H2H3和H2H4单倍型组合个体的繁殖和产奶性能较好,为优势单倍型组合。【结论】中国荷斯坦牛PIK3CB基因存在丰富的遗传变异,其多态性与繁殖和产奶性状存在关联,g.130433743 A>G、g.130448069 G>A和g.130387717 G>A位点可作为潜在分子标记,为中国荷斯坦牛的平衡育种提供理论依据。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 PIK3cb基因 单核苷酸多态性(SNP) 繁殖性状 产奶性状
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食管鳞状细胞癌癌变过程中HPV16/18 E6蛋白与PIK3CA、PIK3CB突变的相关性及其临床意义 被引量:2
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作者 温菲菲 李扬扬 +4 位作者 何双 许晓阳 崔忠泽 路丽祯 吴淑华 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期397-403,共7页
目的探讨HPV感染与PIK3CA、PIK3CB突变在食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)癌变过程中的表达差异及其临床意义。方法采用免疫组化EnVision法检测32例食管正常黏膜、35例食管低级别异型增生(low-grade intraepith... 目的探讨HPV感染与PIK3CA、PIK3CB突变在食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)癌变过程中的表达差异及其临床意义。方法采用免疫组化EnVision法检测32例食管正常黏膜、35例食管低级别异型增生(low-grade intraepithelial neoplasia,LGIN)、34例食管高级别异型增生(high-grade intraepithelial neoplasia,HGIN)及137例ESCC中HPV16/18 E6蛋白、p53、PIK3CA、PIK3CB的表达,并分析蛋白表达之间的相关性及与临床病理特征的关系。结果HPV16/18 E6蛋白在食管正常黏膜组、LGIN组、HGIN组、ESCC组的阳性率分别为0、8.6%、26.5%、29.9%,HPV16/18 E6蛋白在ESCC和HGIN中的表达高于食管正常黏膜和LGIN(P<0.05);p53蛋白在食管正常黏膜组、LGIN组、HGIN组、ESCC组的阳性率分别为9.4%、28.6%、50.0%、68.6%,p53在HGIN中的表达高于食管正常黏膜(P<0.05);PIK3CA蛋白在食管正常黏膜组、LGIN组、HGIN组、ESCC组的阳性率分别为9.4%、17.1%、26.5%、25.5%;PIK3CB蛋白在食管正常黏膜组、LGIN组、HGIN组、ESCC组的阳性率分别为6.3%、14.3%、23.5%、21.9%,PIK3CA和PIK3CB蛋白在ESCC中的表达高于食管正常黏膜(P<0.05)。HPV16/18 E6蛋白表达与肿瘤发病部位、分化程度、淋巴结转移相关(P<0.05);p53表达与肿瘤浸润深度、淋巴结转移相关(P<0.05);PIK3CA、PIK3CB表达与肿瘤淋巴结转移相关(P<0.05)。ESCC组中HPV16/18 E6与p53的表达呈正相关(r=0.202,P=0.018);HPV 16/18 E6与PIK3CA在HGIN、ESCC组中的表达均呈正相关(r=0.368,P=0.021;r=0.198,P=0.018);HPV 16/18 E6与PIK3CB的表达无关(P>0.05)。HPV16/18 E6、p53、PIK3CA和淋巴结转移与ESCC预后相关,HPV16/18 E6是ESCC的良好预后因素,p53、PIK3CA和淋巴结转移是ESCC的不良预后因素。结论HPV感染与ESCC的发生密切相关,其可能通过异常激活PI3K/Akt信号通路而促进肿瘤的发生、发展,联合检测HPV16/18 E6蛋白和PIK3CA突变对ESCC的预后判断和优化治疗具有重要意义。 展开更多
关键词 食管肿瘤 鳞状细胞癌 HPV16/18 E6 PIK3CA PIK3cb 预后
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牦牛PIK3CB基因克隆及其在卵泡发育过程中的表达研究 被引量:3
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作者 马鸿程 熊显荣 +3 位作者 王晗 海卓 闵星宇 李键 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2021年第1期210-218,共9页
旨在探讨磷脂酰肌醇-3激酶催化亚基β(Phosphoinositide-3 kinase,PI3K,catalytic subunit beta,PIK3CB/P110β)基因序列特征,比较分析其在牦牛不同发育阶段卵泡中的表达规律。通过RT-PCR技术从牦牛卵巢组织中克隆获得PIK3CB基因序列并... 旨在探讨磷脂酰肌醇-3激酶催化亚基β(Phosphoinositide-3 kinase,PI3K,catalytic subunit beta,PIK3CB/P110β)基因序列特征,比较分析其在牦牛不同发育阶段卵泡中的表达规律。通过RT-PCR技术从牦牛卵巢组织中克隆获得PIK3CB基因序列并对其进行生物信息学分析;采用RT-qPCR方法检测PIK3CB基因在牦牛不同组织中的表达水平;将采集的牦牛卵泡根据直径大小分为大(≥7 mm)、中(3.0~6.9 mm)、小(≤2.9 mm)3组,分别收集各组卵泡中的壁颗粒细胞及卵母细胞提取总RNA,采用RT-qPCR方法检测PIK3CB mRNA在各级别卵泡壁颗粒细胞及卵母细胞中的相对表达量。结果显示:克隆获得牦牛PIK3CB基因CDS区长3213 bp,共编码1070个氨基酸。蛋白质分析显示,PIK3CB蛋白为亲水酸性蛋白,无跨膜结构无信号肽,二级结构主要由α-螺旋和无规卷曲组成。PIK3CB核苷酸同源性及遗传进化树分析显示,牦牛与野牦牛和黄牛亲缘关系最近。PIK3CB基因在牦牛心脏、脾脏、肾脏、肌肉、肝脏、肺脏、子宫、胃、小肠、卵巢组织中均有表达,尤其在脾脏、子宫和卵巢组织中表达量显著高于其他组织(P<0.05)。RT-qPCR结果显示,PIK3CB基因在卵泡发育过程中均有表达,其中在各级别卵泡壁颗粒细胞中,mRNA表达量随着卵泡发育进程呈现上升趋势,且大、中级别卵泡中的表达量极显著高于小卵泡组(P<0.01);但是卵母细胞中mRNA表达量差异不显著(P>0.05)。结果提示,mRNA基因参与了牦牛卵泡发育调控,是PI3K信号通路在调节颗粒细胞的功能中不可或缺的催化亚基之一,具体调控机制有待进一步研究。本研究为深入探讨PI3K-AKT信号通路在卵巢发育中的调控机理提供基础资料。 展开更多
关键词 牦牛 PIK3cb 组织表达 卵泡
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RNAi下调PIK3CB表达抑制U251胶质瘤细胞生长的体内外研究 被引量:3
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作者 康春生 浦佩玉 +5 位作者 张志勇 王广秀 刘晓智 贾志凡 黄强 裘明哲 《中华神经外科杂志》 CSCD 北大核心 2008年第4期271-274,共4页
目的探讨应用RNAi技术靶向磷酸肌醇酯-3-激酶β催化亚单位(PIK3CB)抑制恶性胶质瘤细胞系U251的PIK3CB表达后在体内外对U251细胞生长抑制作用。方法将短发夹RNA(shRNA)表达载体psiRNA-PIK3CB进行脂质体介导的U251人脑恶性胶质瘤细胞... 目的探讨应用RNAi技术靶向磷酸肌醇酯-3-激酶β催化亚单位(PIK3CB)抑制恶性胶质瘤细胞系U251的PIK3CB表达后在体内外对U251细胞生长抑制作用。方法将短发夹RNA(shRNA)表达载体psiRNA-PIK3CB进行脂质体介导的U251人脑恶性胶质瘤细胞系表达,检测细胞转染前后的细胞增殖能力和凋亡的变化。应用裸鼠皮下荷瘤模型观察脂质体介导shRNA基因治疗对U251细胞生长抑制作用,对肿瘤组织应用免疫荧光双染色和免疫组化的方法分析结果。结果靶向PIK3CB的shRNA转染后U251细胞生长受到抑制,细胞周期出现G2/M阻滞,细胞明显凋亡。裸鼠皮下荷瘤模型实验显示psiRNA-PIK3CB显著抑制皮下肿瘤生长(P〈0.01)。结论靶向PIK3CB的shRNA基因治疗可以成为胶质瘤治疗的新策略。 展开更多
关键词 磷酸肌醇酯-3-激酶β催化亚单位(PIK3cb) 短发夹RNA(shRNA) 神经胶质瘤 增殖 细胞凋亡
原文传递
PIK/Akt/mTOR信号通路在肺腺癌不同EGFR突变状态中的临床相关研究与预测价值
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作者 摆惠芹 加孜那·托哈依 《新疆医科大学学报》 CAS 2024年第3期308-313,共6页
目的 探讨PIK/Akt/mTOR信号通路在肺腺癌不同表皮生长因子受体(EGFR)突变状态中与患者临床特征的相关性与预测价值。方法 采用二代基因测序法(NGS)检测342例2010-2019年于本院明确诊断肺腺癌的患者,其中DNA总量不少于150 ng, DNA降解程... 目的 探讨PIK/Akt/mTOR信号通路在肺腺癌不同表皮生长因子受体(EGFR)突变状态中与患者临床特征的相关性与预测价值。方法 采用二代基因测序法(NGS)检测342例2010-2019年于本院明确诊断肺腺癌的患者,其中DNA总量不少于150 ng, DNA降解程度≥C级,根据是否有EGFR突变将患者分为阳性组与阴性组,比较两组在肺腺癌患者不同临床病理特征中的分布差异;根据PIK/Akt/mTOR信号通路在342例肺腺癌患者中的分布情况,分析PIK/Akt/mTOR信号通路与EGFR不同突变状态和淋巴结转移的相关性,以及PIK信号通路在EGFR不同突变状态中的分布差异及与T790M突变状态的相关性。使用多元Logistic回归分析影响EGFR基因突变的因素。结果 (1)60岁以下的肺腺癌患者更易发生EGFR突变;(2)磷脂酰肌醇-4,5-双磷酸3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、磷脂酰肌醇3-激酶(PIK3CG)表达阳性的患者EGFR的突变频率更高;(3)PIK3CA突变阳性患者更易诱导T790M耐药突变;(4)PIK3CB、mTOR表达阳性的肺腺癌患者更易发生淋巴结转移。(5)年龄、PIK3CA、PIK3CG表达水平是预测EGFR突变的危险因素(P<0.05)。结论 肺腺癌EGFR突变在60岁以下的患者中更常见,PIK3CA、PIK3CG的表达与EGFR基因突变具有相关性,PIK3CA的阳性表达可能参与调节T790M耐药突变的发生,PIK3CB、mTOR表达阳性会增加肺腺癌患者淋巴结转移的风险,年龄、PIK3CA、PIK3CG是预测EGFR突变的危险因素。 展开更多
关键词 肺腺癌 EGFR突变 PIK信号通路 PIK3CA PIK3cb PIK3CG
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PIK3CA、PIK3CB、PIK3CD在胶质瘤中的表达及其意义 被引量:2
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作者 潘起晨 班允超 +1 位作者 刘源 王刚 《解剖科学进展》 2020年第2期162-165,共4页
目的应用在线公共数据集,研究胶质瘤中PIK3CA、PIK3CB、PIK3CD表达及与预后的关系。方法通过ONCOMINE在线数据库对临床癌症样本中PIK3CA、PIK3CB和PIK3CD mRNA表达进行分析;应用GEPIA分析TCGA和GTEx数据库中的PIK3CA、PIK3CB和PIK3CD在... 目的应用在线公共数据集,研究胶质瘤中PIK3CA、PIK3CB、PIK3CD表达及与预后的关系。方法通过ONCOMINE在线数据库对临床癌症样本中PIK3CA、PIK3CB和PIK3CD mRNA表达进行分析;应用GEPIA分析TCGA和GTEx数据库中的PIK3CA、PIK3CB和PIK3CD在胶质瘤和正常样本中的表达及与病人生存期的关系。通过cBioportal分析TCGA胶质瘤数据库中PIK3CA、PIK3CB、PIK3CD的突变、共表达以及调控网络。结果PIK3CA在胶质母细胞瘤(GBM)和低级别胶质瘤(LGG)中表达增加,其表达与GBM和LGG患者总体生存率(OS)和无病生存率(DFS)无显著相关。PIK3CB在GBM中表达水平下降,但差异不显著,在LGG中表达无明显变化,与GBM和LGG患者OS和DFS无显著相关。PIK3CD在GMB和LGG中表达水平下降,但差异不显著(P>0.05),其表达与GBM患者的DFS显著相关,与LGG患者的DFS和OS显著相关(P<0.05)。PIK3CA在GBM和LGG病例中突变比例较高,分别为12%和10%,PIK3CB和PIK3CD的突变较低;在GBM和LGG病例中,PIK3CB与PIK3CA的表达存在正相关;表达调控网络分析结果显示,此调控网络中包含51节点,包含PIK3CA和其它50个相关基因,IK3CA主要通过I3K/AKT发挥生物学作用。结论PIK3CD在胶质瘤中表达下降,且与胶质瘤的预后密切相关。 展开更多
关键词 胶质瘤 PIK3CA PIK3cb PIK3CD
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麝鼠PIK3cb基因的生物信息学及表达分析
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作者 廖光珍 李天峰 +3 位作者 张宇 王春阳 史成龙 白素英 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第20期132-135,138,162,163,共7页
为了了解麝鼠PIK3cb基因及其所编码蛋白的性质功能,研究PIK3cb基因在麝鼠香腺周期变化中的作用,试验利用生物信息学分析方法对麝鼠PIK3cb基因编码蛋白的理化性质、跨膜结构、亚细胞定位、磷酸化位点、信号肽、结构域及其高级结构进行了... 为了了解麝鼠PIK3cb基因及其所编码蛋白的性质功能,研究PIK3cb基因在麝鼠香腺周期变化中的作用,试验利用生物信息学分析方法对麝鼠PIK3cb基因编码蛋白的理化性质、跨膜结构、亚细胞定位、磷酸化位点、信号肽、结构域及其高级结构进行了分析,并利用RT-qPCR技术比较了PIK3cb基因在2—9月份麝鼠香腺中的转录水平差异。结果表明:PIK3cb基因的编码序列(CDS)区编码1070个氨基酸,是不稳定的亲水性蛋白;有76个磷酸化位点;该蛋白的亚细胞定位主要位于细胞质;预测该蛋白由5个结构域组成,即p85蛋白结合域(p85B)、Ras结合域(RBD)、脂质结合域C2(PI3K-C2)、PIK域(PI3Ka)和催化核心域(PI3Kc);在2—9月份的麝鼠香腺中,PIK3cb基因的表达量呈下调趋势。说明该基因在麝鼠的香腺发育或萎缩中可能起到重要调控作用。 展开更多
关键词 麝鼠 香腺 PIK3cb基因 生物信息学分析 蛋白表达
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Functional characterization of a novel somatic oncogenic mutation of PIK3CB 被引量:1
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作者 Andrew D Whale Lucy Colman +2 位作者 Letitia Lensun Helen L Rogers Stephen J Shuttleworth 《Signal Transduction and Targeted Therapy》 SCIE 2017年第1期1-9,共9页
Class I phosphoinositide 3-kinase(PI3K)enzymes have attracted considerable attention as drug targets in cancer therapy over the last 20 years.The signaling pathway triggered by class I PI3Ks is dysregulated in a range... Class I phosphoinositide 3-kinase(PI3K)enzymes have attracted considerable attention as drug targets in cancer therapy over the last 20 years.The signaling pathway triggered by class I PI3Ks is dysregulated in a range of tumor types,impacting cell proliferation,survival and apoptosis.Frequent oncogenic mutations of PIK3CA have previously been discovered.In contrast,reports of PIK3CB mutations have been limited;however,in most cases,those that have been identified have been shown to be activating and oncogenic.The functional characterization of a PIK3CB catalytic domain mutant,p110β^(E1051K),first discovered by others in castrateresistant prostate cancer(mCRPC),is outlined in this report;our data suggest that p110β^(E1051K)is a gain-of-function mutation,driving PI3K signaling,tumorigenic cell growth and migration.Tumor cells expressing p110β^(E1051K)are sensitive to p110βinhibition;its characterization as an oncogenic driver adds to the rationale for targeting p110βand indicates a continuing need to further develop specific PI3K inhibitors for clinical development in cancer therapy. 展开更多
关键词 PIK3cb PIK3CA CHARACTERIZATION
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EGFR及PIK3CB在胃癌中的表达及意义
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作者 李尚明 吴淑华 《中国医疗器械信息》 2015年第01Z期47-47,共1页
目的研究EGFR、PIK3CB在胃癌组织中的表达和相互关系。方法采用免疫组化检测60例胃腺癌组织中EGFR及PIK3CB的表达情况,并进行多因素分析。结果60例胃腺癌组织中EGFR及HK3CB的阳性表达率为43.2%和63.2%,差异具有统计学意义(P≤0.05... 目的研究EGFR、PIK3CB在胃癌组织中的表达和相互关系。方法采用免疫组化检测60例胃腺癌组织中EGFR及PIK3CB的表达情况,并进行多因素分析。结果60例胃腺癌组织中EGFR及HK3CB的阳性表达率为43.2%和63.2%,差异具有统计学意义(P≤0.05)。结论EGFR及PIK3CB在胃癌的发生、发展中具有协同作用,对于判断胃癌的生物学行为和筛选有效的分子靶向治疗药物具有重要意义。 展开更多
关键词 胃癌 表皮生长因子受体 PIK3cb 免疫组织化学
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口腔鳞癌中预后相关miRNA的生物信息学分析及实验验证 被引量:2
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作者 苟秋童 谢强 +3 位作者 靳文珂 廖敏茹 李自祥 黄海霞 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第16期2988-2995,共8页
目的:通过生物信息学筛选与口腔鳞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后显著相关的miRNA,并通过体外实验进行验证。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载OSCC患者数据。通过R分析差异表达的miRNA。使用回归... 目的:通过生物信息学筛选与口腔鳞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后显著相关的miRNA,并通过体外实验进行验证。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载OSCC患者数据。通过R分析差异表达的miRNA。使用回归分析建立风险模型。通过Kaplan-Meier生存分析预测OSCC患者预后。通过受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线及回归分析验证风险模型可靠性。使用GO和KEGG分析预测预后相关miRNA的生物学功能。通过qRT-PCR及Western blot对生物信息学结果进行体外验证。结果:20个miRNA在OSCC中差异表达;miR-204-5p及miR-503-3p与OSCC预后显著相关;本研究构建的风险模型能有效预测OSCC预后;GO分析显示miR-204-5p与细胞凋亡、增殖及迁徙相关,而miR-503-3p与细胞分化、细胞周期及GTP结合有关;KEGG分析显示miR-204-5p与PI3K/Akt/mTOR通路及自噬通路相关,而miR-503-3p与Ras通路及HIF-1通路相关;qRT-PCR显示OSCC细胞中miR-204-5p表达量下降(P<0.05),瞬时转染miR-204-5p mimic后OSCC细胞中miR-204-5p表达量明显升高(P<0.05);Western blot显示升高miR-204-5p后OSCC细胞中PIK3CB表达量明显下降(P<0.05)。结论:miR-204-5p及miR-503-3p是OSCC中有效的预后生物标志物。miR-204-5p及miR-503-3p构建的风险模型能有效预测OSCC患者预后。miR-204-5p在OSCC细胞中低表达,升高miR-204-5p后OSCC细胞中PIK3CB的表达量下降。 展开更多
关键词 口腔鳞癌 MIRNA 生物信息学 预后 生物标志物 风险模型 PIK3cb
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前列腺癌相关基因及功能的生物信息学分析 被引量:5
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作者 何宜宸 孙浩 +4 位作者 焦志敏 周洋 王诚悦 张金虎 陈兵海 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2019年第3期258-263,共6页
目的:利用生物信息学方法和体外实验,寻找前列腺癌发生的关键基因。方法:从GEO数据库下载基因芯片数据GSE60502,其中包括48例正常前列腺组织样本和47例前列腺癌组织样本。利用Morpheus(https:∥software.broadinstitute.org/morpheus/)... 目的:利用生物信息学方法和体外实验,寻找前列腺癌发生的关键基因。方法:从GEO数据库下载基因芯片数据GSE60502,其中包括48例正常前列腺组织样本和47例前列腺癌组织样本。利用Morpheus(https:∥software.broadinstitute.org/morpheus/)在线工具分析前列腺癌组织和正常前列腺组织的差异表达基因,然后使用GCBI(https:∥www.GCBI.com.cn)在线进行差异表达基因的基因本体富集论(gene ontology,GO)分析、Pathway分析,对同时参与GO分析和Pathway分析的差异基因取交集,构建基因共表达网络和基因相互作用网络。最后通过CCK8实验进行验证。结果:共筛选出6 903个表达差异的基因,差异最大的前15个基因中,有上调基因9个,下调基因6个,其中表达差异最大的基因为CRISP3。GO分析提示差异基因主要参与的分子生物学过程包括小分子代谢过程、信号转导、DNA依赖的转录过程、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调节等。Pathway分析提示差异基因主要参与的通路包括PI3K-Akt信号通路、代谢途径、MAPK信号通路以及Wnt信号通路等。CACNA1A基因位于共表达网络的核心位置,而ADCY5、PIK3CB基因位于基因相互作用网络的核心位置。体外CCK8实验证实下调CACNA1A表达可明显抑制前列腺癌细胞增殖能力。结论:CRISP3、CACNA1A、ADCY5、PIK3CB基因可能是影响前列腺癌发生的关键基因。 展开更多
关键词 生物信息学分析 前列腺癌 CACNA1A CRISP3 ADCY5 PIK3cb
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可光固化超支化聚硅氧基硅烷的合成与表征 被引量:5
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作者 王生杰 范晓东 +2 位作者 孔杰 王欣 张国彬 《高分子学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第8期1024-1028,共5页
A new monomer,vinyltriallylsilane(CB3),having functionnal groups with different hydrosilylation reactivity was designed and synthesized by allylation reaction from vinyltrichlorosilane.Then,photocrosslinkable hyperb... A new monomer,vinyltriallylsilane(CB3),having functionnal groups with different hydrosilylation reactivity was designed and synthesized by allylation reaction from vinyltrichlorosilane.Then,photocrosslinkable hyperbranched(poly(siloxysilane)) with terminal allyl groups was prepared via hydrosilylation reaction of vinyltriallylsilane(CB3) and dimethylbis(dimethylsiloxy)silane(A2) monomers at the presence of Karstedt catalyst,and characterized by means of FTIR,()1H-NMR,()29Si-NMR,and SEC/RI/MALLS technology.The polymerization process of A2 and CB3 monomers was studied in situ by using FTIR.It was found that silicon hydride would preferentially react with vinyl groups during the reaction. This can cause to the generation of an intermediate with one Si—H and three allyl groups.By using it to conduct further self-polymerization,hyperbranched polymer can be obtained.The degree of branching of the resulting hyperbranched poly(siloxysilane) was calculated to be 0.44 by quantitative()29Si-NMR spectroscopy,and the weight average molecular weight was 12.1 kg/mol with its polydispersity of 2.52.Finally,the UV curing behavior of the resulting polymer initiated with different photoinitors was also investigated. 展开更多
关键词 超支化 聚硅氧基硅烷 A2 CB3型单体 硅氢加成 紫外光固化
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1株毒死蜱降解菌的降解特性 被引量:2
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作者 卢洁 曹明星 +2 位作者 李晓花 梁同军 鲍海鸥 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2013年第12期127-130,共4页
为弄清菌株CB3对毒死蜱的降解特性,采用摇床振荡培养等方法,对从长期受有机磷农药污染的土壤和废水中分离出的1株毒死蜱降解茵的降解特性进行了研究。结果表明:CB3生长和对毒死蜱的降解作用具有一定的同步性,当其生长量最大时,对... 为弄清菌株CB3对毒死蜱的降解特性,采用摇床振荡培养等方法,对从长期受有机磷农药污染的土壤和废水中分离出的1株毒死蜱降解茵的降解特性进行了研究。结果表明:CB3生长和对毒死蜱的降解作用具有一定的同步性,当其生长量最大时,对毒死蜱的降解率达89.6%。初始浓度200~800mg/L时,CB3对毒死蜱的降解率较高;浓度高于800mg/L时,随着初始浓度的增加,降解率逐渐下降;当初始浓度为2000mg/L时,降解率仅32%。接种量低于1mL时,CB3对毒死蜱的降解率随着接种量增加而提高,当接种量在1~2.5mL时,CB3对毒死蜱降解率无明显差异。CB3在PH6.0~7.0,25~35℃条件下对毒死蜱的降解率较高。CB3对有机磷类农药的降解作用具有选择性,利用三唑磷作为碳源时生长良好,利用马拉硫磷和氧乐果作碳源时生长较差,利用辛硫磷和乙酰甲胺磷作为碳源时几乎不生长。 展开更多
关键词 毒死蜱 降解菌 CB3 降解特性
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