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肠道病毒71型山东临沂分离株3D区遗传进化分析 被引量:4
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作者 温红玲 郝树彬 +5 位作者 高峰 赵丽 袁晓晶 司鲁莹 王东旭 王志玉 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1283-1286,共4页
目的构建肠道病毒71型(EV71)山东临沂分离株3D区的系统进化树,进行遗传进化分析,探讨3D区与神经毒力的关系。方法于2009—2010年在山东省临沂市人民医院采集手足口病(HFMD)患儿的粪便标本和咽拭子标本107份,进行EV71的分离;用Bioedit和M... 目的构建肠道病毒71型(EV71)山东临沂分离株3D区的系统进化树,进行遗传进化分析,探讨3D区与神经毒力的关系。方法于2009—2010年在山东省临沂市人民医院采集手足口病(HFMD)患儿的粪便标本和咽拭子标本107份,进行EV71的分离;用Bioedit和MEGA 4对EV71山东临沂分离株SDLY1、SDLY11、SDLY48、SDLY96、SDLY107的3D区进行序列分析,参比序列选自GenBank。结果 3D区的系统发生树分析结果显示,5株临沂分离株在发生树上比较集中,SDLY11、96、107的3D区同源性最高,与CoxA16原型株G-10的系统发生关系较近,与EV71原型株BrCr/70的系统发生关系较远;3D区碱基构成比和氨基酸构成比分析显示,含量最高的碱基为A(29%),含量最高的氨基酸为亮氨酸(>10%);基因序列比对和氨基酸序列比对分析结果显示,碱基突变较多,但大多为静默突变,临沂分离株与CoxA16 G-10之间的氨基酸突变中有很大一部分是赖氨酸与精氨酸之间的突变,在SDLY107的3D区发现了3个特有的氨基酸突变:N37S、K142R、G261E。结论 EV71山东临沂分离株3D区的进化可能与CoxA16 G-10有关,突变N37S、K142R、G261E可能与EV71的神经毒力有关。 展开更多
关键词 手足口病(HFMd) 肠道病毒71型(EV71) 3d区 遗传进化分析
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基于RNG k-ε湍流模型的3D采空区瓦斯上浮贮移 被引量:40
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作者 李宗翔 顾润红 +2 位作者 张晓明 毕强 温永宇 《煤炭学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第5期880-885,共6页
为研究工作面后方采空区3D空间瓦斯上浮特征,根据质量守恒、动量守恒和Fick定律,建立综放采空区风流-瓦斯变密度混合气体非线性渗流-扩散控制方程。结合大兴矿N2-706工作面实例,运用CFD软件模拟三维采空区瓦斯运移及分布的状态;流场冒... 为研究工作面后方采空区3D空间瓦斯上浮特征,根据质量守恒、动量守恒和Fick定律,建立综放采空区风流-瓦斯变密度混合气体非线性渗流-扩散控制方程。结合大兴矿N2-706工作面实例,运用CFD软件模拟三维采空区瓦斯运移及分布的状态;流场冒落非均质按照"O"型分布描述,计算采用RNGk-ε湍流模型,并考虑重力场条件。理论计算调整与现场实际条件和瓦斯监测记录数据相拟合,指出三维采空区形成的瓦斯分布及上浮态势,是风流移动、瓦斯组分扩散-弥散和含瓦斯风流密度差引起上浮迁移的结果,也是流场瓦斯不断解吸涌出与漏风不断流入所形成的一种动态平衡结果。研究结果表明,采空区高位抽采流量与抽采获得的瓦斯体积分数近似呈反比例函数关系、与回风巷瓦斯体积分数呈负指数函数关系。 展开更多
关键词 3d采空 瓦斯上浮 CFd仿真 k-ε湍流模型 瓦斯抽采
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甘肃小麦禾谷孢囊线虫rDNA-ITS和28SrDNA-D2/D3区序列特征及ITS-RFLP分析 被引量:17
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作者 叶文兴 徐秉良 +1 位作者 彭德良 黄文坤 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期58-65,共8页
禾谷孢囊线虫是危害禾谷类作物的重要病原,严重威胁我国小麦主产区的小麦产量和品质。利用通用引物对甘肃、河南、安徽禾谷孢囊线虫群体28SrDNA-D2/D3区和rDNA-ITS区进行PCR扩增和序列测定,利用UPG-MA方法分析了甘肃省7个种群、河南1个... 禾谷孢囊线虫是危害禾谷类作物的重要病原,严重威胁我国小麦主产区的小麦产量和品质。利用通用引物对甘肃、河南、安徽禾谷孢囊线虫群体28SrDNA-D2/D3区和rDNA-ITS区进行PCR扩增和序列测定,利用UPG-MA方法分析了甘肃省7个种群、河南1个种群、安徽1个种群的禾谷孢囊线虫群体D2/D3区和ITS区的系统发育关系;用9种限制性内切酶对7个甘肃禾谷孢囊线虫群体的rDNA-ITS区进行了RFLP分析。结果表明:中国甘肃的禾谷孢囊线虫rDNA-D2/D3区片段长度约为780bp,rDNA-ITS片段长度约为1040bp。7个甘肃禾谷孢囊线虫群体、1个河南安阳群体、1个安徽蚌埠群体的D2/D3区和新西兰的H.aucklandica群体亲缘关系很近;其ITS区同澳大利亚的H.australis、北京通州的H.avenae(AY148382)的亲缘关系很接近。RFLP分析表明,9种限制性内切酶酶切禾谷孢囊线虫群体的rDNA-ITS共产生了22个酶切片段,不同酶切的RFLP分布型在7个种群间没有差异。甘肃省禾谷孢囊线虫群体的rDNA-ITS区具有高度的保守性,与中国的C型群体相近,但不同于欧洲的A型群体和印度的B型群体。这是首次报道甘肃CCN种群分子特征。 展开更多
关键词 禾谷孢囊线虫 核糖体基因d2/d3 核糖体基因ITS ITS-RFLP 序列分析
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28S核糖体RNA基因D3区序列在两种甲螨中的测定及其系统学意义
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作者 付荣恕 王德印 +3 位作者 葛君 谢秀霞 朱立华 张丛 《山东师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2006年第4期114-116,共3页
利用引物D3A和D3B扩增出姬三皱甲螨Rhysotritiaardua和棒菌甲螨Scheloribateslatipes的28SrDNAD3区序列,结合GenBank检索得到蛛形纲的8个相关序列,采用MP法构建分子进化树.发现蜘蛛目分化较早,前气门亚目、甲螨亚目首先聚合,再与中气门... 利用引物D3A和D3B扩增出姬三皱甲螨Rhysotritiaardua和棒菌甲螨Scheloribateslatipes的28SrDNAD3区序列,结合GenBank检索得到蛛形纲的8个相关序列,采用MP法构建分子进化树.发现蜘蛛目分化较早,前气门亚目、甲螨亚目首先聚合,再与中气门亚目聚为一类;但蝎目比蛛蛛目进化晚.说明28SrDNAD3区对于蛛形纲分子系统分类有一定的意义. 展开更多
关键词 甲螨 蛛形纲 28S RdNA d3 系统分类
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城市视觉导向系统的一个慢行补丁——3D平面减速区的设计
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作者 万向阳 《交通企业管理》 2014年第5期8-10,共3页
城市视觉导向系统集城市规划、标志设计、景观设计等为一体,对其设计一度围绕着平面标志进行,这是因为其核心仍旧是二维码,难以用立体符号来表达。然而,交通标志有别于其他的城市导向系统,人脑对这些二维标志的信息解读要经过若干次的... 城市视觉导向系统集城市规划、标志设计、景观设计等为一体,对其设计一度围绕着平面标志进行,这是因为其核心仍旧是二维码,难以用立体符号来表达。然而,交通标志有别于其他的城市导向系统,人脑对这些二维标志的信息解读要经过若干次的信息转化过程,存在着明显的反应延迟时间,不如身体本能反应迅速。 展开更多
关键词 城市交通 视觉导向 慢行标志 3d平面减速 传达效率 设计
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河北省长针线虫新纪录种松长针线虫Longidorus pinus Xu,Ye,Wang & Zhao的形态与分子鉴定
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作者 王宏洪 邵晓勇 +1 位作者 李秀芬 廖金铃 《林业与环境科学》 2019年第1期107-111,共5页
2018年,在河北省保定市园林植物紫荆(Cercis chinensis)根围分离到一种长针线虫。经形态学观察和28S rDNA D2D3区序列分析,将其鉴定为松长针线虫(Longidorus pinus Xu, Ye, Wang&Zhao)。其雌虫主要形态特征为:雌虫体长3 048~3 464... 2018年,在河北省保定市园林植物紫荆(Cercis chinensis)根围分离到一种长针线虫。经形态学观察和28S rDNA D2D3区序列分析,将其鉴定为松长针线虫(Longidorus pinus Xu, Ye, Wang&Zhao)。其雌虫主要形态特征为:雌虫体长3 048~3 464μm,唇区明显缢缩,宽9.5~10.5μm,侧器囊袋状,齿尖针长66.0~69.5μm,导环距体前端27.5~30.0μm,尾长31~33μm,短圆锥形,尾长与肛门处体宽比值=1.5~1.6。松长针线虫河北种群28S rDNA D2D3区与GenBank数据库的山西种群进行序列比对,相似性为99.2%~99.9%。松长针线虫是河北省长针线虫新纪录种。紫荆是松长针线虫的新寄主。 展开更多
关键词 长针线虫 紫荆 形态学 28S RdNA d2d3 河北省
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马铃薯腐烂茎线虫28S rDNA-D2/D3区序列分析 被引量:11
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作者 于海英 彭德良 +1 位作者 胡先奇 黄文坤 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期254-261,共8页
我国危害甘薯的马铃薯腐烂茎线虫rDNA-ITS基因片段长度存在A型(900bp)和B型(1100bp)2个类型,A型腐烂茎线虫群体的ITS片段比B型群体少200bp。为了进一步研究这2种类型群体的发育关系,本文用线虫通用引物D2A和D3B对来自国内的21个马铃薯... 我国危害甘薯的马铃薯腐烂茎线虫rDNA-ITS基因片段长度存在A型(900bp)和B型(1100bp)2个类型,A型腐烂茎线虫群体的ITS片段比B型群体少200bp。为了进一步研究这2种类型群体的发育关系,本文用线虫通用引物D2A和D3B对来自国内的21个马铃薯腐烂茎线虫群体和1个韩国的马铃薯腐烂茎线虫28SrDNA-D2/D3区进行了PCR扩增,均产生大小一致的片段,长度约为780bp,克隆、测序后用DNAMAN5.2软件和MEGA4软件进行分析比对,结果表明我国21个马铃薯腐烂茎线虫群体28SrDNA-D2/D3区只有20余个碱基的差异,相似率达97.2%。基于UPGMA构建的系统发育树很好地区分了马铃薯腐烂茎线虫A型和B型群体,展现出了群体的来源及发育关系。 展开更多
关键词 马铃薯腐烂茎线虫 d2/d3片段 序列分析
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C3d-M28增强伪狂犬病毒gC基因体液免疫 被引量:2
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作者 樊惠英 刘中勇 +2 位作者 佟铁铸 刘星 郭爱珍 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期987-992,共6页
研究补体C3d的受体结合功能区(M28)对伪狂犬病毒gC基因DNA疫苗免疫增强作用。将4拷贝的M28基因与伪狂犬病毒gC基因串联后,克隆到载体pcDNA3.1中,构建融合表达的重组质粒(sgC-M284)。BALB/c小鼠免疫试验表明,sgC-M284免疫组比单独表达伪... 研究补体C3d的受体结合功能区(M28)对伪狂犬病毒gC基因DNA疫苗免疫增强作用。将4拷贝的M28基因与伪狂犬病毒gC基因串联后,克隆到载体pcDNA3.1中,构建融合表达的重组质粒(sgC-M284)。BALB/c小鼠免疫试验表明,sgC-M284免疫组比单独表达伪狂犬病毒gC蛋白的重组质粒(sgC)免疫组产生的ELISA抗体高17倍,对致死剂量(316LD50)伪狂犬病毒攻毒的保护率提高了63%。gC基因与M28基因融合表达诱导产生的IL-4水平接近了伪狂犬灭活疫苗免疫组的产生的IL-4水平,显著增强了基于Th2途径的体液免疫反应。 展开更多
关键词 补体C3d gC糖蛋白 伪狂犬病毒 C3d受体结合功能(M28) 分子免疫佐剂
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Dynamic analysis on pressure fluctuation in vaneless region of a pump turbine 被引量:6
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作者 LI DeYou GONG RuZhi +3 位作者 WANG HongJie XIANG GaoMing WEI XianZhu LIU ZhanSheng 《Science China(Technological Sciences)》 SCIE EI CAS CSCD 2015年第5期813-824,共12页
As the pump turbine tends to be operated with high head and high rotational speed, the study of stability problems becomes more important. The pump turbine usually works at operating conditions where the guide vanes e... As the pump turbine tends to be operated with high head and high rotational speed, the study of stability problems becomes more important. The pump turbine usually works at operating conditions where the guide vanes experience strong vibrations. However, most traditional studies were carried out based on constant GVO(guide vane opening) simulations. In this work, dynamic analysis on pressure fluctuation in the vaneless region of a pump turbine model was conducted using a dynamic mesh method in turbine mode. 3D unsteady simulations were conducted where GVO was closed and opened by 1° from the initial 18°. Detailed time domain and frequency domain characteristics on pressure fluctuation in the vaneless region under different guide vane rotational states compared with constant GVO simulations were investigated. Results show that, during the guide vanes oscillating process, the low and intermediate frequency components in the vaneless region are significantly different. The amplitudes of pressure fluctuation are higher than those with constant GVO simulations, which agree better with the experimental data. In addition, the pressure fluctuation increases when GVO is opened, and vice versa. It can be concluded that pressure fluctuation in the vaneless region is strongly influenced by the oscillating of the guide vanes. 展开更多
关键词 fluctuation turbine agree unsteady listed operated opened creased Figure inlet
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日本盆景中截获的短体线虫与根结线虫的鉴定 被引量:3
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作者 王金成 林宇 +3 位作者 郭京泽 顾建锋 陈先锋 魏亚东 《植物检疫》 北大核心 2015年第4期38-42,共5页
2014年,天津口岸从日本进境盆景中截获3种短体线虫和1种根结线虫。通过形态学和DNA条形码方法将截获的短体线虫鉴定为朱顶红短体线虫(Pratylenchus hippeastri)、伤残短体线虫(P.vulnus)和穿刺短体线虫(P.penetrans)。根据形态学并结合... 2014年,天津口岸从日本进境盆景中截获3种短体线虫和1种根结线虫。通过形态学和DNA条形码方法将截获的短体线虫鉴定为朱顶红短体线虫(Pratylenchus hippeastri)、伤残短体线虫(P.vulnus)和穿刺短体线虫(P.penetrans)。根据形态学并结合特异PCR和DNA条形码方法,将截获的根结线虫2龄幼虫鉴定为南方根结线虫(Meloidogyne incognita)。朱顶红短体线虫是短体线虫属非中国种,为我国进境植物检疫性有害生物,在挪威槭和榉树盆景中截获该线虫为国内外首次报道。 展开更多
关键词 朱顶红短体线虫 伤残短体线虫 穿刺短体线虫 南方根结线虫 形态特征 PCR 28Sr RNA-d2/d3 鉴定
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进境美国苜蓿草中截获的菊花滑刃线虫检疫鉴定
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作者 林宇 王金成 +4 位作者 张瑞峰 刘鹏 顾建锋 边勇 魏亚东 《植物检疫》 北大核心 2016年第5期53-57,共5页
2016年,天津口岸检疫人员从美国进境饲用苜蓿草中发现一种滑刃属线虫,通过形态学特征、形态测计值以及核糖体28S r RNA-D2/D3区与ITS区核酸序列比对和系统进化分析,最终确定为我国检疫性有害生物菊花滑刃线虫(Aphelenchoides ritzemabo... 2016年,天津口岸检疫人员从美国进境饲用苜蓿草中发现一种滑刃属线虫,通过形态学特征、形态测计值以及核糖体28S r RNA-D2/D3区与ITS区核酸序列比对和系统进化分析,最终确定为我国检疫性有害生物菊花滑刃线虫(Aphelenchoides ritzemabosi)。从进境饲用苜蓿草中截获该线虫为全国口岸首次。 展开更多
关键词 菊花滑刃线虫 苜蓿草 形态特征 序列分析 ITS d2/d3 鉴定
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