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基于矩阵图谱表达法的蛋白质序列的相似性分析
被引量:
2
1
作者
赵静静
齐斌
+1 位作者
王寒冰
唐旭清
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2011年第7期222-225,共4页
在DNA序列的混沌游走方法(CGR)及DNA序列的4线图谱表达方法(4-LGR)的基础上,提出了一种新型DNA序列的表达方法—矩阵图谱表达法(MGR),并进一步,在DNA序列的上述三种表达式基础上,分别推广建立了基于经典HP模型的蛋白质序列的图谱表达法...
在DNA序列的混沌游走方法(CGR)及DNA序列的4线图谱表达方法(4-LGR)的基础上,提出了一种新型DNA序列的表达方法—矩阵图谱表达法(MGR),并进一步,在DNA序列的上述三种表达式基础上,分别推广建立了基于经典HP模型的蛋白质序列的图谱表达法,对蛋白质序列的相似性进行了比较验证。研究表明:矩阵图谱表达方法不仅能够说明蛋白质序列间的相似性,而且与传统的方法相比,该方法更具有灵活性和变通性。
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关键词
经典HP模型
混沌游走表达
4
线图谱表达
矩阵图谱表达
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职称材料
题名
基于矩阵图谱表达法的蛋白质序列的相似性分析
被引量:
2
1
作者
赵静静
齐斌
王寒冰
唐旭清
机构
江南大学理学院
无锡职业技术学院
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2011年第7期222-225,共4页
基金
江南大学创新团队发展计划(PIRTJiangnan)资助
财政部专项"外来物种环境风险评估技术研究"资助
文摘
在DNA序列的混沌游走方法(CGR)及DNA序列的4线图谱表达方法(4-LGR)的基础上,提出了一种新型DNA序列的表达方法—矩阵图谱表达法(MGR),并进一步,在DNA序列的上述三种表达式基础上,分别推广建立了基于经典HP模型的蛋白质序列的图谱表达法,对蛋白质序列的相似性进行了比较验证。研究表明:矩阵图谱表达方法不仅能够说明蛋白质序列间的相似性,而且与传统的方法相比,该方法更具有灵活性和变通性。
关键词
经典HP模型
混沌游走表达
4
线图谱表达
矩阵图谱表达
Keywords
the detailed Hpmodel
Chaos Game
representation
(CGR)
4 line graphical representation method(4-lgr)
Matrix
graphical
representation
(MGR)
分类号
O29 [理学—应用数学]
TP301 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于矩阵图谱表达法的蛋白质序列的相似性分析
赵静静
齐斌
王寒冰
唐旭清
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2011
2
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职称材料
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