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4-巯乙基吡啶配基与IgG相互作用的分子模拟研究
被引量:
8
1
作者
王红寅
林东强
+2 位作者
姚善泾
贠军贤
姚克俭
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2010年第16期1597-1602,共6页
4-巯乙基吡啶(MEP)是一种新型的疏水性电荷诱导层析(HCIC)配基,具有良好的抗体分离性能,采用分子模拟方法研究MEP配基与IgG间的分子相互作用,以探讨HCIC分离机制.先通过分子对接搜索IgG分子Fc片段A链的蛋白表面,确定12个可能与MEP结合...
4-巯乙基吡啶(MEP)是一种新型的疏水性电荷诱导层析(HCIC)配基,具有良好的抗体分离性能,采用分子模拟方法研究MEP配基与IgG间的分子相互作用,以探讨HCIC分离机制.先通过分子对接搜索IgG分子Fc片段A链的蛋白表面,确定12个可能与MEP结合的位点区域,然后用分子动力学模拟考察了其中6个位点的结合性能.结果表明,MEP在Fc-A链表面的结合具有疏水倾向性,pH中性条件下,MEP能稳定地结合在TYR319和LEU309附近的位点,并与两者形成氢键作用,该区域具有疏水性极强的口袋结构;其他位点的结合较不稳定,受MEP取向影响大.在pH4.0酸性条件下,原先稳定结合的MEP快速从Fc-A链表面脱离,主要原因是MEP和Fc间的静电排斥作用,以及疏水作用减弱和氢键结合的消失.通过分子模拟方法,从分子水平验证了HCIC独特的作用机理:疏水相互作用主导吸附,静电排斥作用协助解吸.
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关键词
4-巯乙基吡啶
IGG
疏水性电荷诱导层析
结合模式
分子模拟
原文传递
题名
4-巯乙基吡啶配基与IgG相互作用的分子模拟研究
被引量:
8
1
作者
王红寅
林东强
姚善泾
贠军贤
姚克俭
机构
化学工程联合国家重点实验室浙江大学化学工程与生物工程学系
绿色化学合成技术国家重点实验室培育基地浙江工业大学
出处
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2010年第16期1597-1602,共6页
基金
国家自然科学基金(Nos.20776129
20976154)
+1 种基金
新世纪优秀人才支持计划
绿色化学合成技术国家重点实验室培育基地开放研究基金资助项目
文摘
4-巯乙基吡啶(MEP)是一种新型的疏水性电荷诱导层析(HCIC)配基,具有良好的抗体分离性能,采用分子模拟方法研究MEP配基与IgG间的分子相互作用,以探讨HCIC分离机制.先通过分子对接搜索IgG分子Fc片段A链的蛋白表面,确定12个可能与MEP结合的位点区域,然后用分子动力学模拟考察了其中6个位点的结合性能.结果表明,MEP在Fc-A链表面的结合具有疏水倾向性,pH中性条件下,MEP能稳定地结合在TYR319和LEU309附近的位点,并与两者形成氢键作用,该区域具有疏水性极强的口袋结构;其他位点的结合较不稳定,受MEP取向影响大.在pH4.0酸性条件下,原先稳定结合的MEP快速从Fc-A链表面脱离,主要原因是MEP和Fc间的静电排斥作用,以及疏水作用减弱和氢键结合的消失.通过分子模拟方法,从分子水平验证了HCIC独特的作用机理:疏水相互作用主导吸附,静电排斥作用协助解吸.
关键词
4-巯乙基吡啶
IGG
疏水性电荷诱导层析
结合模式
分子模拟
Keywords
4
-
mercaptoethyl
-
pyridine
IgG
hydrophobic charge induction chromatography
binding mode
molecular simulation
分类号
R392 [医药卫生—免疫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
4-巯乙基吡啶配基与IgG相互作用的分子模拟研究
王红寅
林东强
姚善泾
贠军贤
姚克俭
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2010
8
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