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High-level expression of 4-coumarate:coenzyme A ligase gene Pt4CL1 of Populus tomentosa in E. coli
1
作者 Fan Bing-you Lu Hai Jiang Xiang-ning 《Forestry Studies in China》 CAS 2007年第3期208-212,共5页
In order to investigate the enzymatic properties of the 4CL1 of Populus tomentosa, the recombinant expression vector pQE31-4CL 1 was constructed. The recombinant was identified by three restriction endonucleases, then... In order to investigate the enzymatic properties of the 4CL1 of Populus tomentosa, the recombinant expression vector pQE31-4CL 1 was constructed. The recombinant was identified by three restriction endonucleases, then the vector pQE31-4CL 1 was transformed into expression host M15 (pREP4) and induced by isopropyl-a-D-thiogalactoside (IPTG) to express 60 kD fused protein Pt4CL1. The biologically active Pt4CL1, expressed as soluble protein, was achieved with 0.6 mmol'L-1 IPTG induction as the expression temperature declined from 37 to 28℃. The 6-His tag facilitates affinity binding to Ni^2+-nitrolotriacetic acid (NTA) and enables one-step purification to acquire the molecular SDS-PAGE electrophoresis purity of the active 4CL1 protein by agarose coupled with Ni^2+-NTA affinity chromatography. The optimal substrate for Pt4CL 1 was 4-coumarate. 展开更多
关键词 4-coumarate:coenzyme A ligase Populus tomentosa prokaryotic expression enzyme activity
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紫穗槐4-香豆酸:CoA连接酶基因的克隆和结构分析 被引量:2
2
作者 刘文哲 胡学军 +4 位作者 高晓蓉 袁晓东 刘哲 范琦 安利佳 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期29-34,共6页
该文利用简并寡核苷酸PCR法结合cDNA末端快速扩增PCR法从紫穗槐 (Amorphafruticosa)茎中克隆了木质素生物合成过程中重要的酶 4 香豆酸 :CoA连接酶 (4CL)的cDNA全长序列 ,避免了复杂的构建、筛选cDNA文库的过程 .所获得的全长 4CLAcDN... 该文利用简并寡核苷酸PCR法结合cDNA末端快速扩增PCR法从紫穗槐 (Amorphafruticosa)茎中克隆了木质素生物合成过程中重要的酶 4 香豆酸 :CoA连接酶 (4CL)的cDNA全长序列 ,避免了复杂的构建、筛选cDNA文库的过程 .所获得的全长 4CLAcDNA ,有 1911个碱基 ,包含一个完整的阅读框架 ,编码 5 4 0个氨基酸 .氨基酸序列同源性分析表明 4CLA是典型的 4CL蛋白 ,含有预计的AMP binding位点 ,接触反应区和保守的Cys. 展开更多
关键词 coa连接酶 结构分析 基因克隆 紫穗槐 4-香豆酸 木质素 PCR
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法克隆紫穗槐4-香豆酸:CoA连接酶全长cDNA(英文)
3
作者 刘文哲 胡学军 +4 位作者 高晓蓉 袁晓东 刘哲 范琦 安利佳 《Forestry Studies in China》 CAS 2002年第1期13-17,共5页
An Amorpha fruticosa cDNA encoding 4 coumarate:CoA ligase (4CL), a key enzyme of phenylpropanoid metabolism related to lignin forming, was cloned by degenerating oligo primed polymerase chain reaction (PCR) and ... An Amorpha fruticosa cDNA encoding 4 coumarate:CoA ligase (4CL), a key enzyme of phenylpropanoid metabolism related to lignin forming, was cloned by degenerating oligo primed polymerase chain reaction (PCR) and rapid amplification of cDNA end (RACE) PCR. We designed 5′RACE primers based on 4CLA1 fragment which obtained from degenerate PCR. Inverse PCR and nested PCR enabled cloning of the remainder fragments of the gene included 5′ and 3′ end sequence. The ORF encodes a polypeptide of 540 amino acids. The predicted amino acid sequence exhibits significant homology with those of other cloned 4CL genes, contain domains typical of predicted 4CL proteins, in particular a postulated AMP binding site, catalytic domain, and conserved Cys residues. 展开更多
关键词 gene cloning random amplification of cDNA end PCR Amorpha fruticosa 4 coumarate:coa ligase LIGNIN
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胡萝卜4CL基因家族的鉴定及分析
4
作者 张新业 李文静 +4 位作者 闫训友 郑京 朱姝 王聪艳 周志国 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期1365-1375,共11页
旨在全基因组水平上鉴定胡萝卜4CL基因,揭示该基因家族成员的理化性质、系统进化、基因结构、组织表达模式及胁迫响应情况,为胡萝卜4CL的功能研究和利用奠定基础。基于AMP结合结构域(PF00501)的隐马尔可夫模型文件,利用HMMER软件对胡萝... 旨在全基因组水平上鉴定胡萝卜4CL基因,揭示该基因家族成员的理化性质、系统进化、基因结构、组织表达模式及胁迫响应情况,为胡萝卜4CL的功能研究和利用奠定基础。基于AMP结合结构域(PF00501)的隐马尔可夫模型文件,利用HMMER软件对胡萝卜蛋白质数据库进行检索,获得胡萝卜4CL基因(命名为Dc4CL);利用ProtParam分析Dc4CL的理化性质;利用MEGA6对Dc4CL进行系统进化分析;使用GSDS2.0、MEME分析Dc4CL的基因及蛋白结构;利用荧光定量PCR技术对Dc4CL的组织表达模式及胁迫响应情况进行研究。结果表明,胡萝卜基因组中存在12个4CL基因,分别为Dc4CL1~Dc4CL12。Dc4CL基因开放阅读框(ORF)长度为1350~3363 bp,编码蛋白质长度为449~1120 aa,编码蛋白的分子质量和等电点分别为48.92~123.73 ku和5.34~8.82。系统进化分析表明,Dc4CL与其他来自水稻、拟南芥、二穗短柄草、高粱、大白菜的4CL蛋白可分为两个类群。结构分析表明,Dc4CL基因外显子数目为4~11个,其蛋白序列中均含有BoxⅠ(SSGTTGLPKGV)和BoxⅡ(GEICIRG)两个保守序列。荧光定量PCR结果表明,Dc4CL3、Dc4CL12在胡萝卜叶片及肉质根中均有表达,而Dc4CL8主要在叶片中表达,盐胁迫和低温胁迫均使Dc4CL3、Dc4CL8、Dc4CL12的表达降低。总之,胡萝卜的12个Dc4CL基因在影响4CL蛋白功能的关键位点处具有保守性,而在其他位置上存在一定的差异,且部分成员在逆境胁迫应答过程中可能发挥了一定的作用。 展开更多
关键词 胡萝卜(Daucus carota) 4-香豆酰coa连接酶(4CL) 基因家族 生物信息学分析 基因表达分析
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Two Divergent Members of 4-Coumarate: Coenzyme A Ligase from Salvia miltiorrhiza Bunge: cDNA Cloning and Functional Study 被引量:13
5
作者 Shu-Juan Zhao Zhi-Bi Hu +1 位作者 DI Liu Frederick C. C. Leungt 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2006年第11期1355-1364,共10页
4-Coumarate : coenzyme A Ilgase (4CL) Is one of the key enzymes In phenylpropanoid metabolism leading to series of phenollcs, Including water-soluble phenolic acids, which are important compounds determining the me... 4-Coumarate : coenzyme A Ilgase (4CL) Is one of the key enzymes In phenylpropanoid metabolism leading to series of phenollcs, Including water-soluble phenolic acids, which are important compounds determining the medicinal quality of Danshen (Salvia miltiorrhiza Bunge), a traditional Chinese medicinal herb. To Investigate the function of 4CL in the biosynthesis of water-soluble phenolic acid in Danshen, we have cloned two cDNAs (Sm4CL1 and Sm4CL2) encoding divergent 4CL members by applying nested reverse transcrlptlon-polymerase chain reaction (RT-PCR) with degenerate primers followed by 5′/3′rapid amplification of cDNA ends (RACE) (Note, these sequence data have been submitted to the GenBank database under accession numbers AY237163 and AY237164). Either of the coding regions was inserted into a pRSET vector and a kinetic assay was performed with purified recombinant proteins. The substrate utilization profile of Sm4CL1 was distinct from that of Sm4CL2. The Km values of Sm4CL1 and Sm4CL2 to 4-coumarlc acid were (72.20±4.10) and (6.50±1.45) μmol/L, respectively. These results, In conjunction with Northern blotting and other information, imply that Sm4CL2 may play an Important role in the biosynthesis of watersoluble phenolic compounds, whereas Sm4CL1 may play a minor role in the pathway. Southern blotting analysis suggested that both Sm4CL1 and Sm4CL2 genes are present as a single copy and are located at different sites In the genome. 展开更多
关键词 cDNA cloning 4-coumarate coenzyme A ligase 4CL) Danshen (Salvia miltiorrhiza) enzymatic kinetic assays water-soluble phenolic acids.
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毛白杨4-CL cDNA的克隆、表达及活性分析 被引量:6
6
作者 杨向东 王汉中 +2 位作者 胡赞民 刘贵华 沈金雄 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期101-105,共5页
从毛白杨(Populus tomentosa)木质化茎中提取总RNA,利用RT-PCR技术进行cDNA扩增,获得1条1 621 bp的片段。测序结果表明:该片段编码536个氨基酸组成的多肽,序列中包含所有已知4-CL蛋白的2个特征序列boxⅠ(SSGTTGLPKGV)和boxⅡ(GEICIRG)。... 从毛白杨(Populus tomentosa)木质化茎中提取总RNA,利用RT-PCR技术进行cDNA扩增,获得1条1 621 bp的片段。测序结果表明:该片段编码536个氨基酸组成的多肽,序列中包含所有已知4-CL蛋白的2个特征序列boxⅠ(SSGTTGLPKGV)和boxⅡ(GEICIRG)。将cDNA克隆到原核表达载体pET-32a(+)中,并转化大肠杆菌(Escherichia coli)感受态细胞BL21(DE3)。IPTG诱导后,经SDS-PAGE和Western-blot分析表明,4-CL基因在大肠杆菌BL21中获得表达,所表达融合蛋白的分子量约为70 ku。酶活性分析表明:该重组蛋白对底物PA、FA、CA均表现出催化活性,其偏爱性顺序为PA>FA>CA,对SA则没有活性。 展开更多
关键词 毛白杨 4-香豆酰辅酶A连接酶 原核表达 偏爱性
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苦荞4-香豆酸辅酶A连接酶基因(Ft4CL)的克隆及序列分析 被引量:4
7
作者 凌瑶 高飞 +3 位作者 王安虎 李成磊 陈惠 吴琦 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期728-732,767,共6页
以苦荞栽培种‘西荞2号’为材料,利用同源克隆和RT-PCR技术获得Ft4CL保守片段,采用RACE技术获得Ft4CL基因的3'末端及5'末端序列,并进一步采用生物信息学方法进行序列分析。结果表明:从苦荞花蕾总RNA中获得一条苦荞麦(Fagopyrum ... 以苦荞栽培种‘西荞2号’为材料,利用同源克隆和RT-PCR技术获得Ft4CL保守片段,采用RACE技术获得Ft4CL基因的3'末端及5'末端序列,并进一步采用生物信息学方法进行序列分析。结果表明:从苦荞花蕾总RNA中获得一条苦荞麦(Fagopyrum tatarium)4-香豆酸辅酶A连接酶基因(4-coumarate:Coa ligase,Ft4CL)的cDNA全长序列。生物息学分析结果显示,Ft4CL基因ORF全长1 602 bp,可编码553个氨基酸,理论标准分子质量为58.02kDa,等电点(pI)为5.23。该研究首次从苦荞中获得Ft4CL基因的cDNA全长序列,该基因具有植物4CL同源基因的典型特征,推导的氨基酸序列具有4CL的所有活性位点并归属于黄酮代谢支路。该研究结果可为深入研究苦荞黄酮代谢途径奠定基础,为采用代谢工程技术提高苦荞黄酮含量提供候选靶基因。 展开更多
关键词 苦荞 4-香豆酸辅酶A连接酶 基因克隆 序列分析
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4-香豆酸辅酶A连接酶响应大豆孢囊线虫胁迫的潜在功能 被引量:4
8
作者 王惠 张顺斌 +5 位作者 金贺 王晗 张耕华 夏诗宁 陈井生 段玉玺 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期71-80,共10页
大豆孢囊线虫是大豆产区病虫害防治策略的重要目标之一,大豆孢囊线虫的防控也一直是线虫领域研究热点之一。大豆孢囊线虫侵染不仅会造成大豆地下部分损伤,也使得地上部分受损从而影响其产量,因此需对大豆孢囊线虫的抗性机制进行分析以... 大豆孢囊线虫是大豆产区病虫害防治策略的重要目标之一,大豆孢囊线虫的防控也一直是线虫领域研究热点之一。大豆孢囊线虫侵染不仅会造成大豆地下部分损伤,也使得地上部分受损从而影响其产量,因此需对大豆孢囊线虫的抗性机制进行分析以达到防控的目的。大豆孢囊线虫成功寄生宿主植物需对其细胞壁进行降解融合,形成为其生长发育提供唯一营养来源的合胞体。而阻碍大豆孢囊线虫移动和合胞体建立的细胞壁抗性是大豆抵御大豆孢囊线虫的关键,其中木质素是细胞壁发挥抗性的重要成分。木质素的生物合成主要包括莽草酸代谢途径、苯丙烷代谢途径和木质素合成的特异途径,4-香豆酸辅酶A连接酶(4-coumarate-Coenzyme A ligase,4CL)作为连接苯丙烷代谢途径和木质素特异合成途径的重要转折酶,决定了木质素的合成,其很可能是响应大豆孢囊线虫胁迫的重要调控因子。本文从线虫入侵需要细胞壁降解融合建立合胞体出发,围绕木质素导致的细胞壁抗性展开讨论,分析了4CL在细胞壁抗性中的响应机制,为进一步探索大豆孢囊线虫胁迫机制提供科学依据。 展开更多
关键词 大豆孢囊线虫 合胞体 木质素 细胞壁 4-香豆酸辅酶A连接酶
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反义4CL与UGPase双价基因在烟草中的转化及表达分析 被引量:6
9
作者 梁海泳 夏秀英 +1 位作者 高晓蓉 苏乔 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2007年第4期459-464,共6页
构建了携带紫穗槐尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-glucose pyrophosphorylase,UGPase)基因和4-香豆酸:辅酶A连接酶(4-coumarate:coenzyme A ligase,4CL)反义基因的双价基因植物表达载体,用热激法转化至根癌农杆菌LBA4404中,并用制备的... 构建了携带紫穗槐尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-glucose pyrophosphorylase,UGPase)基因和4-香豆酸:辅酶A连接酶(4-coumarate:coenzyme A ligase,4CL)反义基因的双价基因植物表达载体,用热激法转化至根癌农杆菌LBA4404中,并用制备的农杆菌工程菌进行了烟草转化。PCR及Southern杂交结果证实,双价基因已成功整合到烟草基因组中。综纤维素和硫酸木质素含量测定结果显示,转基因烟草纤维素含量增加,木质素含量减少,表明双价基因能够有效表达。 展开更多
关键词 纤维素 辅酶A连接酶 4-香豆酸 木质素 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶 双价基因
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苎麻4-香豆酸辅酶A连接酶-1基因的克隆与分析 被引量:1
10
作者 陈建荣 郭清泉 《中国农学通报》 CSCD 2008年第10期83-87,共5页
为了抑制苎麻木质素代谢关键酶基因的表达,克隆苎麻内源木质素代谢关键酶的基因,为通过基因手段降低木质素含量奠定基础。以苎麻为材料,采用PCR方法,以简并引物从苎麻基因组DNA模板中,首次克隆了其木质素代谢关键酶基因4-香豆酸辅酶A连... 为了抑制苎麻木质素代谢关键酶基因的表达,克隆苎麻内源木质素代谢关键酶的基因,为通过基因手段降低木质素含量奠定基础。以苎麻为材料,采用PCR方法,以简并引物从苎麻基因组DNA模板中,首次克隆了其木质素代谢关键酶基因4-香豆酸辅酶A连接酶-1基因(4CL-1)的DNA部分序列,长度为983bp;采用RT-PCR的方法,以特异引物,从苎麻茎RNA反转录的cDNA为模板中,首次克隆了苎麻4CL-1cDNA核心序列,长度为110bp;经生物信息学方法分析,得知所获得的基因序列编码一段含37个氨基酸残基的多肽,该多肽与几个酰基合成酶和AMP结合酶的同源性较高,可以推论其编码了AMP形成与结合的保守区域。 展开更多
关键词 苎麻 木质素生物合成代谢 4-香豆酸辅酶A连接酶 基因克隆
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中草药中4-香豆酸辅酶A连接酶的遗传进化分析
11
作者 李珊珊 常缨 冯艳 《中药材》 CAS 北大核心 2017年第7期1533-1539,共7页
目的:研究中草药中4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)基因的遗传进化,为中草药中有效成分黄酮类物质等的有效积累和调控奠定理论基础。方法:运用ClustalW 1.83、Mega 5.0、CodonW、DNAMAN等软件对搜集的部分中草药中的4CL进行遗传进化树的构建... 目的:研究中草药中4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)基因的遗传进化,为中草药中有效成分黄酮类物质等的有效积累和调控奠定理论基础。方法:运用ClustalW 1.83、Mega 5.0、CodonW、DNAMAN等软件对搜集的部分中草药中的4CL进行遗传进化树的构建、密码子偏好性分析及氨基酸保守区的分析。结果:不同植物以基因家族形式出现,通过遗传密码子使用情况分析,可推测植物中表达较强的基因。遗传进化分析表明,与模式植物相比,中草药中4CL基因有的聚在一起可能具有相同的功能,推测并没有发生基因的分化,而有些基因可能具有功能的分化。结论:通过4CL基因的遗传进化树、密码子偏好性分析、酶的保守区分析,可为进一步研究4CL在中草药中的应用提供理论支持。 展开更多
关键词 4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL) 密码子偏好性 遗传进化分析 基因功能
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FACL4 mRNA在PHC中的表达及与肿瘤临床病理特征的相关性
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作者 李祎 王葵 《山东医药》 CAS 北大核心 2009年第35期32-33,共2页
目的探讨脂肪酸辅酶A连接酶长链4(FACL4)在原发性肝癌(PHC)发生中的作用。方法收集40例PHC患者手术切除的癌组织及相应癌旁组织,采用半定量RT-PCR方法检测FACL4 mRNA表达,并分析其与PHC临床病理特征的关系。结果FACL4 mRNA在癌组织中的... 目的探讨脂肪酸辅酶A连接酶长链4(FACL4)在原发性肝癌(PHC)发生中的作用。方法收集40例PHC患者手术切除的癌组织及相应癌旁组织,采用半定量RT-PCR方法检测FACL4 mRNA表达,并分析其与PHC临床病理特征的关系。结果FACL4 mRNA在癌组织中的表达显著高于癌旁组织(P<0.01);FACL4 mRNA表达水平与肿瘤大小、病理分级、肝硬变类型等未见明显相关性(P均>0.05)。结论FACL4 mRNA过表达可能在PHC发生中具有一定作用,此为PHC的临床诊断及治疗提供了新的思路。 展开更多
关键词 肝细胞癌 脂肪酸辅酶A连接酶长链4
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甜高粱4-香豆酸辅酶A连接酶基因(4CL)的克隆与鉴定及时空表达分析 被引量:12
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作者 周 王玉锋 +4 位作者 娄来清 周华 陈素丽 蔡庆生 滕胜 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期9-19,共11页
通过对木质素合成途径中关键的限速酶4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL,EC6.2.1.12)基因克隆、鉴定与时空表达分析来研究甜高粱4CL基因家族的特性,为今后利用基因工程手段改造甜高粱木质素提供一定的理论依据。搜索NCBI数据库得到高粱4CL基因家... 通过对木质素合成途径中关键的限速酶4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL,EC6.2.1.12)基因克隆、鉴定与时空表达分析来研究甜高粱4CL基因家族的特性,为今后利用基因工程手段改造甜高粱木质素提供一定的理论依据。搜索NCBI数据库得到高粱4CL基因家族序列,以甜高粱品种‘大力士’的cDNA为模板克隆得到甜高粱4CL家族中各蛋白编码序列(CDS),CDS连入表达载体pET51B,转入大肠杆菌表达菌株(BL21)进行诱导表达,镍柱纯化后进行酶活性分析。实时定量荧光PCR(qPCR)检测甜高粱4CL基因家族各成员在不同时期和不同组织中的相对表达量。结果表明:通过在NCBI数据库中对植物4CL蛋白序列分析,在高粱基因组中,鉴定出7个4CL类似(4CL-like)基因。序列对位排列分析显示:甜高粱7个4CL-like基因在高粱属中非常保守;其氨基酸序列与水稻相对应的Os4CL有90%左右的相似度;它们可分为4CL ClassⅠ和4CL ClassⅡ两类,其中Sb07G007810、Sb04G005210、Sb10G026130、Sb07G022040、Sb03G000610和Sb06G016630属于4CL ClassⅠ,Sb04G031010属于4CL ClassⅡ。酶活性分析表明甜高粱7个4CL蛋白都具有4-香豆酸辅酶A连接酶活力。通过对甜高粱7个4CL基因时空表达分析发现,参与木质素合成的4CL ClassⅠ类基因在组织生长快速期的表达量非常高,而参与类黄酮合成的4CL ClassⅡ类基因在植物受到太阳直接照射的部位表达量显著地增加。在根和茎中,Sb04G005210基因的表达量最高;在叶中,Sb07G007810基因的表达量最高。上述甜高粱7个基因属于真正的4CL基因。 展开更多
关键词 甜高粱 4-香豆酸辅酶A连接酶 木质素 时空表达 类黄酮 酶活性 基因克隆
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植物脂酰-CoA合成酶基因家族研究进展 被引量:3
14
作者 张士花 邹恩强 杜希华 《山东师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2010年第3期119-123,共5页
脂酰-CoA合成酶在植物的脂肪酸代谢中有非常重要的作用.本文对长链脂酰-CoA合成酶(LACS)与一种新的脂酰-CoA合成酶(ACOS)的基因功能、酶学特性和基因家族表达调控的研究进展进行了综述.
关键词 脂肪酸代谢 脂酰-coa合成酶 LACS ACOS 4-香豆酸coa连接酶(4CL)相似基因
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毛白杨4-香豆酸:辅酶A连接酶338Val缺失突变分析 被引量:1
15
作者 王晓雪 蒋湘宁 陆海 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期84-88,共5页
通过对毛白杨中的4-香豆酸:辅酶A连接酶1(Pt4CL1)蛋白第338位缬氨酸进行缺失突变,从而获得了具有芥子酸催化活性的Pt4CL1蛋白突变体338dVal。与野生型4CL1蛋白活性相比较,该突变体获得了催化芥子酸的活性,比活力是(1.62±0.34)nkat... 通过对毛白杨中的4-香豆酸:辅酶A连接酶1(Pt4CL1)蛋白第338位缬氨酸进行缺失突变,从而获得了具有芥子酸催化活性的Pt4CL1蛋白突变体338dVal。与野生型4CL1蛋白活性相比较,该突变体获得了催化芥子酸的活性,比活力是(1.62±0.34)nkat/mg。同时,对4-香豆酸催化活性有轻微的降低(约降低12%),对咖啡酸的催化活性有明显增加(约增加126%),对阿魏酸的催化活性有部分的降低(约降低29%),对肉桂酸的催化活性没有显著变化。该结论证实了第338位缬氨酸对底物芥子酸5位甲氧基具有空间位阻效应。该项研究为通过基因工程技术调控木质素的合成提供了新的方法。 展开更多
关键词 毛白杨 4-香豆酸:辅酶A连接酶1 突变体 芥子酸 酶学特性
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核桃内果皮4-香豆酸辅酶A连接酶基因克隆及表达分析 被引量:1
16
作者 郭永翠 秦江南 +1 位作者 朱玲 张锐 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2019年第2期79-86,共8页
为研究新疆核桃露仁机制,以露仁核桃种质温138为研究对象,其突变纸皮核桃为对照,采用RT-PCR技术克隆4CL基因并进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR方法研究核桃硬化过程中4CL基因相对表达量,找到4CL基因在露仁核桃内果皮中硬核发育... 为研究新疆核桃露仁机制,以露仁核桃种质温138为研究对象,其突变纸皮核桃为对照,采用RT-PCR技术克隆4CL基因并进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR方法研究核桃硬化过程中4CL基因相对表达量,找到4CL基因在露仁核桃内果皮中硬核发育过程中的表达特性。结果表明,WJ-4CL基因cDNA序列包括552 bp ORF,编码184个氨基酸,分子质量20.10 ku,理论等电点5.83;ZJ-4CL基因包含453 bp ORF,编码151个氨基酸,分子质量16.52 ku,理论等电点9.35;系统进化树表明,温138与纸皮核桃聚为同一支,其亲缘关系较近。实时荧光定量PCR分析表明,露仁核桃4CL基因在花后100 d的相对表达量为花后51 d相对表达量的117倍,硬壳完整核桃4CL基因在花后86 d相对表达量为花后51 d相对表达量的205倍,初步证明4CL基因在硬壳完整和露仁核桃的不同发育时期表达量存在明显差异。表明4CL基因参与核桃内果皮(硬壳)硬化过程且影响内果皮木质素的合成,从而造成核桃内果皮发育不全,出现露仁现象。 展开更多
关键词 核桃 木质素 4-香豆酸辅酶A连接酶 基因克隆 表达分析
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3-(4-羟基苯基)丙酸在酿酒酵母中的生物合成
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作者 江晶洁 庄以彬 +2 位作者 殷华 刘涛 刘少伟 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期184-190,共7页
3-(4-羟基苯基)丙酸(HPPA)是一种芳香类化合物,作为中间体主要应用于医药、食品、化学领域,具有重要的经济价值。旨在实现HPPA在酿酒酵母中的从头合成,通过在酿酒酵母中过表达约氏黄杆菌来源的酪氨酸转移酶(Fj TAL)、拟南芥来源的对香... 3-(4-羟基苯基)丙酸(HPPA)是一种芳香类化合物,作为中间体主要应用于医药、食品、化学领域,具有重要的经济价值。旨在实现HPPA在酿酒酵母中的从头合成,通过在酿酒酵母中过表达约氏黄杆菌来源的酪氨酸转移酶(Fj TAL)、拟南芥来源的对香豆酰辅酶A连接酶(At4CL),同时利用酿酒酵母BY4742自身来源的超长链烯酰辅酶A还原酶(Sc TSC13)、硫酯水解酶,实现了在酿酒酵母中从头合成HPPA,产量约为70 mg/L左右。在以4 mmol/L酪氨酸为前体、半乳糖诱导Fj TAL过表达、30℃发酵培养72 h的条件下,约36%的酪氨酸转化生成对香豆酸;在以4 mmol/L对香豆酸或咖啡酸为前体,半乳糖诱导At4CL过表达,同时利用酵母内源Sc TSC13、硫酯水解酶,30℃发酵培养72 h的条件下,约94%的对香豆酸被还原成HPPA,约91%的咖啡酸被还原成3,4-二羟基苯丙酸(DHPPA),为进一步生物合成HPPA及其衍生物奠定了基础。 展开更多
关键词 酿酒酵母 3-(4-羟基苯基)丙酸(HPPA) 生物合成 酪氨酸氨基转移酶 对香豆酰辅酶A连接酶
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毛竹4-香豆酸辅酶A连接酶基因家族鉴定及表达分析 被引量:8
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作者 杨克彬 单雪萌 +2 位作者 史晶晶 朱成磊 高志民 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期72-82,共11页
4-香豆酸:辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,4CL)基因是植物木质素、类黄酮和其他次生代谢产物合成的关键基因之一。为探究毛竹(Phyllostachys edulis)4CL基因的分子特征和表达模式,利用生物信息学方法对毛竹4CL同源基因进行鉴定,并... 4-香豆酸:辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,4CL)基因是植物木质素、类黄酮和其他次生代谢产物合成的关键基因之一。为探究毛竹(Phyllostachys edulis)4CL基因的分子特征和表达模式,利用生物信息学方法对毛竹4CL同源基因进行鉴定,并对其基因结构、保守结构域和系统进化等进行全面分析,应用实时荧光定量PCR(qPCR)技术对基因表达模式进行研究。结果表明,在毛竹中共鉴定出15个4CL同源基因(Pe4CL1~Pe4CL15),均含有内含子,数量为2~5个。Pe4CLs编码蛋白长度为520~671 aa,分子量为55~72 kDa。Pe4CLs均含有2个4CL家族高度保守的结构域,保守基序数量为6~10个,且均定位在过氧化酶体上。系统进化分析显示,毛竹、水稻、二穗短柄草、拟南芥、大豆和毛果杨的4CL家族成员分为2个亚家族(A和B),其中亚家族A又分为3个类型(TypeⅠ~TypeⅢ)。基于转录组数据的基因组织特异性表达分析发现,15个Pe4CLs在毛竹不同组织和不同生长时期中的表达量均存在明显差异。qPCR结果显示,除Pe4CL6的表达下调外,其他基因均随着竹笋高度增加呈上调趋势。组织化学染色结果表明,随着笋高度的增加,其木质化程度加深,与大多数Pe4CLs表达上调相一致。本研究为进一步探究毛竹中4CL的功能提供了参考依据。 展开更多
关键词 毛竹 4-香豆酸:辅酶A连接酶基因 表达分析 木质素
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苦荞Ft4CL基因克隆、生物信息学及分子进化分析 被引量:8
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作者 侯思宇 赵盖超 +5 位作者 刘荣华 孙朝霞 令狐斌 韩渊怀 许冬梅 李红英 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 2015年第1期24-28,共5页
与其他作物相比,苦荞中含有较高含量的黄酮类物质-‘芦丁’。4-香豆酸-辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,EC 6.2.1.12)是植物苯丙烷代谢途径转向黄酮类物质代谢的关键酶之一。本研究利用已知的来源于‘九江苦荞’叶片的Ft4CL1(HQ6540... 与其他作物相比,苦荞中含有较高含量的黄酮类物质-‘芦丁’。4-香豆酸-辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,EC 6.2.1.12)是植物苯丙烷代谢途径转向黄酮类物质代谢的关键酶之一。本研究利用已知的来源于‘九江苦荞’叶片的Ft4CL1(HQ654088)基因片段为探针序列,从苦荞叶片转录组数据库中序列拼接得到一个苦荞Ft4CL全长基因,命名为Ft4CL(GenBank登录号:KM362863)。生物信息学分析结果表明:该cDNA长度为2 007bp,具有完整的ORF,共1 743bp,编码580个氨基酸,具备4CL所有活性位点。与已公布的部分Ft4CL基因及蒺藜苜蓿(Pb4CL)、甜瓜(Cm4CL)和黄瓜(Cs4CL)基因相似度为100%、73%、73%和72%。遗传聚类结果显示,该基因归类于双子叶植物。研究结果为深入探讨苦荞黄酮代谢途径提供了基础,也为提高苦荞黄酮含量提供了定向靶基因。 展开更多
关键词 苦荞 4-香豆酸辅酶A连接酶 电子克隆 生物信息学分析
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多穗柯4-香豆酸辅酶A连接酶基因的克隆和表达分析 被引量:5
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作者 邢朝斌 冯若宣 +4 位作者 王志焱 张妍彤 王卓 黄剑 龙月红 《经济林研究》 北大核心 2019年第3期16-21,共6页
为了克隆多穗柯4-香豆酸辅酶A连接酶(4-coumarate-CoAligase,4CL)基因,了解其表达情况,从而为深入研究4CL基因分子功能及黄酮类化合物生物合成奠定基础,依据多穗柯转录组测序结果,设计特异性引物,PCR扩增得到4CL基因cDNA全长序列,利用... 为了克隆多穗柯4-香豆酸辅酶A连接酶(4-coumarate-CoAligase,4CL)基因,了解其表达情况,从而为深入研究4CL基因分子功能及黄酮类化合物生物合成奠定基础,依据多穗柯转录组测序结果,设计特异性引物,PCR扩增得到4CL基因cDNA全长序列,利用相关软件进行生物信息学分析;采用qRT-PCR法检测4CL基因在不同器官中的表达情况,使用SPSS18.0软件分析其表达量与根皮苷含量间的关系。结果表明:多穗柯4CL基因cDNA全长1704bp,包含长1629bp的开放阅读框,编码含542个氨基酸的蛋白质。该蛋白定位于细胞质中,属亲水性蛋白。多穗柯4CL基因在除根以外的各个器官中均有表达,且表达量与根皮苷含量间呈极显著的正相关关系(P<0.01)。 展开更多
关键词 多穗柯 4-香豆酸辅酶A连接酶 根皮苷 QRT-PCR
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