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狐狸MC1R基因编码区c. 40A>C和c. 41C>T相邻变异研究
被引量:
2
1
作者
徐桂利
张文香
+6 位作者
段玲欣
巩元芳
葛慕湘
刘谢荣
王书朋
果新苓
刘铮铸
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期2020-2026,共7页
为了检测狐狸MC1R基因多态性及其与毛色表型的相关性,本研究采集两个狐属12种毛色共计163只狐狸的皮肤组织样,利用PCR扩增和产物直接测序的方法获得狐狸MC1R基因1 054bp长的核苷酸序列,并进行了SNPs筛查。用PopGen32和SHEsis软件对突变...
为了检测狐狸MC1R基因多态性及其与毛色表型的相关性,本研究采集两个狐属12种毛色共计163只狐狸的皮肤组织样,利用PCR扩增和产物直接测序的方法获得狐狸MC1R基因1 054bp长的核苷酸序列,并进行了SNPs筛查。用PopGen32和SHEsis软件对突变位点进行了群体遗传学分析,用PANTHER软件评估了突变对基因产生的功能影响,用SPSS二元变量相关统计方法分析了多态位点与毛色表型间的相关性。结果表明,狐狸MC1R基因编码区40(c.40A>C)和41位点(c.41C>T)存在2个相邻错义突变,导致其编码的第14位氨基酸发生了变异:当第40位点为A时,氨基酸由苏氨酸(Thr)转变为异亮氨酸(Ile);当第40位点为C时,氨基酸由脯氨酸(Pro)转变为亮氨酸(Leu)。北极狐属狐在41位点基因型全部为TT型,而狐属狐大部分个体均为CC型,不存在TT型,推测该位点可能是区分狐狸属间的一个重要功能位点。PANTHER预测获知第41位点突变导致的氨基酸替换(p.Pro14Leu)对MC1R功能有显著影响。SPSS二元变量相关分析结果表明,41位点多态性与狐狸毛色表型存在显著低度相关性,推测狐狸MC1R基因编码区第41位点可能是参与其毛色形成的一个相对重要功能位点。
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关键词
狐狸
MC1R基因
40和41位点
多态性
毛色
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职称材料
题名
狐狸MC1R基因编码区c. 40A>C和c. 41C>T相邻变异研究
被引量:
2
1
作者
徐桂利
张文香
段玲欣
巩元芳
葛慕湘
刘谢荣
王书朋
果新苓
刘铮铸
机构
河北科技师范学院动物科技学院
河北东光县农业局
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期2020-2026,共7页
基金
国家自然科学基金(31272412)
河北省自然科学基金(C2013407101
+2 种基金
C2016407114)
河北省高等学校创新团队领军人才培育计划(LJRC004)
河北科技师范学院科学研究基金(1)
文摘
为了检测狐狸MC1R基因多态性及其与毛色表型的相关性,本研究采集两个狐属12种毛色共计163只狐狸的皮肤组织样,利用PCR扩增和产物直接测序的方法获得狐狸MC1R基因1 054bp长的核苷酸序列,并进行了SNPs筛查。用PopGen32和SHEsis软件对突变位点进行了群体遗传学分析,用PANTHER软件评估了突变对基因产生的功能影响,用SPSS二元变量相关统计方法分析了多态位点与毛色表型间的相关性。结果表明,狐狸MC1R基因编码区40(c.40A>C)和41位点(c.41C>T)存在2个相邻错义突变,导致其编码的第14位氨基酸发生了变异:当第40位点为A时,氨基酸由苏氨酸(Thr)转变为异亮氨酸(Ile);当第40位点为C时,氨基酸由脯氨酸(Pro)转变为亮氨酸(Leu)。北极狐属狐在41位点基因型全部为TT型,而狐属狐大部分个体均为CC型,不存在TT型,推测该位点可能是区分狐狸属间的一个重要功能位点。PANTHER预测获知第41位点突变导致的氨基酸替换(p.Pro14Leu)对MC1R功能有显著影响。SPSS二元变量相关分析结果表明,41位点多态性与狐狸毛色表型存在显著低度相关性,推测狐狸MC1R基因编码区第41位点可能是参与其毛色形成的一个相对重要功能位点。
关键词
狐狸
MC1R基因
40和41位点
多态性
毛色
Keywords
fox
MC1R genes
40
and
41
sites
polymorphism
coat color
分类号
S829.9 [农业科学—畜牧学]
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
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被引量
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1
狐狸MC1R基因编码区c. 40A>C和c. 41C>T相邻变异研究
徐桂利
张文香
段玲欣
巩元芳
葛慕湘
刘谢荣
王书朋
果新苓
刘铮铸
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
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