突触分化诱导基因SynDIG1的5′调控区序列的生物信息学分析

目的:研究突触分化诱导基因SynDIG1转录调控机制,并对潜在的转录因子结合位点进行分析。方法:利用BLAST比对获得SynDIG1基因5′调控区序列;利用模序识别分析TATA-box、GC-box和CAAT-box;利用在线分析软件Neural Network Promoter Prediction和PROMOTER 2.0分析SynDIG1基因5′调控区序列中启动子;利用在线分析软件CpG Island Searcher分析SynDIG1基因5′调控区序列中CpG岛位置;利用在线分析软件TFSEARCH分析SynDIG1基因5′调控区序列中潜在的转录因子结合位点。结果:SynDIG1基因5′调控区序列中存在1个CAAT-box,没有GC-box和TATA-box;SynDIG1基因可能存在5个启动子位点;CpG岛为516bp区间(1 686～2 201bp);结果显示评分在85分以上(Score Threshold:85.0)时,该区域具有406个潜在的转录因子结合位点;评分在90分以上(Score Threshold:90.0)时,该区域具有168个潜在的转录因子结合位点;评分在95分以上(Score Threshold:95.0)时,该区域具有72个潜在的转录因子结合位点;评分在99分以上(ScoreThreshold:99.0)时,该区域具有28个潜在的转录因子结合位点。结论:通过生物信息学的方法对于SynDIG1基因转录起始位点、启动子区域和潜在的转录因子结合位点进行预测,对于科研具有十分重要的指导意义。

3,4-亚甲二氧苯基甲酰哌啶的新合成方法及其晶体结构

采用胡椒酸与三氟乙酸N-琥珀酰亚胺酯反应,再与六氢吡啶反应的新方法合成了α-氨基羟甲基噁唑丙酸(AMPA)受体调节剂——3,4-亚甲二氧苯基甲酰哌啶(1),总产率73%,其结构经1H NMR,IR,MS,XRD和元素分析确证。1属正交晶系,Pnma空间群,晶胞参数a=1.463 6(6)nm,b=0.781 0(3)nm,c=2.014 7(8)nm,V=2.303 1(16)nm3,Z=2(296 K)。最终偏离因子R1=0.098 5,ωR2=0.300 4。