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草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列克隆与分析
被引量:
3
1
作者
朱书礼
李新辉
+4 位作者
杨计平
李跃飞
李捷
帅方敏
李琳
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期87-93,共7页
应用PCR和Genome Walking技术克隆获得长度为168 bp的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列和2 063 bp的5'侧翼序列。将草鱼α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列与已知几种鱼类α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列比对,相似度为68%...
应用PCR和Genome Walking技术克隆获得长度为168 bp的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列和2 063 bp的5'侧翼序列。将草鱼α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列与已知几种鱼类α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列比对,相似度为68%~86%。将草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列进行生物信息学分析,确定了其转录起始区域及转录起始位点(TSS);在TSS上游30 bp处有1个TATA-box,-58 bp处有CCAAT-box;在5'侧翼序列中还发现有GATA-1、OCT-1、GR、HNF-3、AP1和SP1等转录因子结合位点。草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列的克隆,为进一步研究不同食性鱼类α-淀粉酶基因侧翼序列的差异、鱼类α-淀粉酶基因的表达、功能及调控机理奠定基础。
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关键词
草鱼
Α-淀粉酶基因
GENOME
WALKING
5'侧翼序
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职称材料
题名
草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列克隆与分析
被引量:
3
1
作者
朱书礼
李新辉
杨计平
李跃飞
李捷
帅方敏
李琳
机构
中国水产科学研究院珠江水产研究所
大连海洋大学
出处
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期87-93,共7页
基金
公益性行业(农业)科研专项经费项目(200903048-05)
广西区自然科学基金重大项目(2013GXNSFEA053003)
科技部社会公益项目(2005DIB3J023)
文摘
应用PCR和Genome Walking技术克隆获得长度为168 bp的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列和2 063 bp的5'侧翼序列。将草鱼α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列与已知几种鱼类α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列比对,相似度为68%~86%。将草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列进行生物信息学分析,确定了其转录起始区域及转录起始位点(TSS);在TSS上游30 bp处有1个TATA-box,-58 bp处有CCAAT-box;在5'侧翼序列中还发现有GATA-1、OCT-1、GR、HNF-3、AP1和SP1等转录因子结合位点。草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列的克隆,为进一步研究不同食性鱼类α-淀粉酶基因侧翼序列的差异、鱼类α-淀粉酶基因的表达、功能及调控机理奠定基础。
关键词
草鱼
Α-淀粉酶基因
GENOME
WALKING
5'侧翼序
Keywords
Ctenopharyngodon idellus
α-amylase gene
Genome Walking
5
' flanking sequence
分类号
Q953 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列克隆与分析
朱书礼
李新辉
杨计平
李跃飞
李捷
帅方敏
李琳
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
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