5-甲酰基胞嘧啶修复机理的理论探究

5-甲酰基胞嘧啶(5-formylcytosine,5-fC)是胞嘧啶的主要氧化损伤之一,其形成对基因的表达具有显著影响.本文采用量子化学密度泛函理论(DFT)对5-fC的修复机理进行了理论研究.所有反应物、中间体、产物和过渡态的构型均采用B3LYP/6-311++G(d,p)方法进行全优化.该修复机理分为六步:首先,咪唑提供质子使5-fC的N_3原子质子化,随后为巯基乙醇对C_6原子的亲核加成和水分子对C_5-甲酰基C=O的亲核加成,然后依次为C_5-脱甲酸,C_6-脱巯基乙醇和N_3-去质子化反应.计算结果表明:咪唑对5-fC上N_3原子的质子化破坏了嘧啶环上的共轭,增大了C_6原子的电荷密度,有利于随后巯基乙醇的亲核进攻;巯基乙醇的亲核加成为无能垒的自发放热过程,而脱巯基乙醇为吸热反应; C_5-脱甲酸反应为整个反应的决速步骤,活化能为47. 7 kcalmol^(-1).该研究从电子水平上解释了5-fC修复的本质,完善了DNA碱基氧化损伤的修复机理.

DNA甲基化标志物在结肠癌中的表达及其意义研究

目的探讨DNA甲基化标志物5mC、5hmC、5fC和5caC在结肠癌中的表达及临床意义。方法在包括100例结肠癌组织和60例癌旁正常组织的结肠癌组织芯片上进行5m C、5hm C、5f C、5ca C免疫组化检测,比较上述4种指标在结肠癌与癌旁正常组织中的表达。结果结肠癌组织5m C、5hm C、5f C、5ca C表达均明显低于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05)。结论DNA甲基化标记物5m C、5hm C、5f C、5ca C可能成为结肠癌诊断的新型标记物。

DNA的新四大碱基简介

本文简要地介绍了DNA的新四大碱基，即5-甲基胞嘧啶、5-羟甲基胞嘧啶、5-甲酰基胞嘧啶和5-羧基胞嘧啶的特点和作用。