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杂质5-羟甲基糠醛及其二聚体和代谢产物遗传毒性研究
被引量:
2
1
作者
林铌
叶倩
+3 位作者
耿兴超
王雪
靳洪涛
文海若
《中国药物警戒》
2023年第2期157-162,共6页
目的 评价杂质单体5-羟甲基糠醛(5-hydroxymethylfurfural,5-HMF)、其二聚体5,5’-二甲酰基呋喃二甲醚[5,5’-oxydimethylenebis(2-furfural),OMBF]及单体代谢产物5-磺基氧甲基糠醛(5-sulfooxymethylfurfural,5-SMF)的潜在遗传毒性。方...
目的 评价杂质单体5-羟甲基糠醛(5-hydroxymethylfurfural,5-HMF)、其二聚体5,5’-二甲酰基呋喃二甲醚[5,5’-oxydimethylenebis(2-furfural),OMBF]及单体代谢产物5-磺基氧甲基糠醛(5-sulfooxymethylfurfural,5-SMF)的潜在遗传毒性。方法 采用定量构效关系计算机模型(Q)SAR技术(包括Derek和Sarah模型)预测杂质5-HMF、OMBF和5-SMF的遗传毒性,进一步采用细菌回复突变试验(Ames试验)进行验证。在Ames试验中,用6种组氨酸营养缺陷型(his-)鼠伤寒沙门氏菌分别与不同浓度的5-HMF、OMBF和5-SMF在有/无代谢活化系统混合液(小鼠、大鼠和人S9 mix)条件下孵育48 h,通过比较不同菌株实验组与溶媒对照组相比回复菌落数的倍数关系,来判定结果。结果 Derek预测5-HMF和5-SMF致突变风险为可疑阳性,OMBF为阴性;Sarah预测5-HMF和5-SMF致突变风险均为阳性,OMBF为可疑阳性。Ames试验结果表明,5-HMF和OMBF仅在大鼠肝S9代谢活化后,导致回复突变菌落数呈弱阳性。5-SMF在非代谢活化及在小鼠、大鼠和人肝S9代谢活化后回复突变菌落数呈阳性。结论 5-HMF和OMBF仅在大鼠肝酶代谢活化系统条件下,具有潜在致突变性;5-SMF在有/无代谢活化系统条件下,均具有潜在致突变性。因此,杂质单体5-HMF、二聚体OMBF及单体代谢产物5-SMF均具有潜在遗传毒性,为2类遗传毒性杂质,对于可能长期暴露的人群,为保障用药安全,建议对3种杂质进行限量。
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关键词
5
-
羟
甲基
糠
醛
5
5
’
-
二甲酰
基
呋喃二甲醚
5-磺基氧甲基糠醛
遗传毒性杂质
定量构效关系
致突变性
AMES试验
下载PDF
职称材料
基于QSAR模型、紫外光谱法和分子对接技术研究杂质5-羟甲基糠醛及其二聚体和代谢产物与DNA的相互作用
2
作者
林铌
张佳宁
+3 位作者
刘丽
靳洪涛
王三龙
刘颖
《药物分析杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期1221-1228,共8页
目的:研究杂质单体5-羟甲基糠醛(5-hydroxymethylfurfural, 5-HMF)及其二聚体5,5’-二甲酰基呋喃二甲醚[5,5’-oxydimethylenebis(2-furfural),OMBF]、单体代谢产物5-磺基氧甲基糠醛(5-sulfooxymethylfurfural, 5-SMF)与DNA的相互作用方...
目的:研究杂质单体5-羟甲基糠醛(5-hydroxymethylfurfural, 5-HMF)及其二聚体5,5’-二甲酰基呋喃二甲醚[5,5’-oxydimethylenebis(2-furfural),OMBF]、单体代谢产物5-磺基氧甲基糠醛(5-sulfooxymethylfurfural, 5-SMF)与DNA的相互作用方式,为3种杂质潜在的DNA损伤风险和遗传毒性机制研究提供理论基础。方法:采用QSAR模型预测5-HMF、OMBF和5-SMF与DNA结合的可能性及遗传毒性警示结构,然后采用紫外光谱法对3种杂质与小牛胸腺DNA(ctDNA)相互作用后的光谱学变化评估可能的作用方式,最后用分子对接技术将3种杂质与双链DNA分子模拟对接,直观地呈现三者与DNA的作用方式,并比较3种杂质与DNA结合的稳定性。结果:4种QSAR模型预测结果提示5-HMF、OMBF和5-SMF 3种杂质均可能与DNA结合,且均具有潜在致突变或致癌性。5-HMF、OMBF和5-SMF均能使ctDNA的紫外吸收光谱发生减色效应(减色程度分别为8.2%、22.6%和8.7%)和蓝移(位移距离分别为1.2、3.5和1.0 nm),说明3种杂质均可能以小沟槽结合的方式与ctDNA发生相互作用,且均可能与碱基对发生π-π相互作用。通过分子对接模拟验证了3种杂质与DNA均可能发生小沟槽结合,并与碱基对产生氢键作用,OMBF和5-SMF还可能与碱基发生π-π相互作用。通过比较杂质小分子与DNA的平均结合能,结果证明OMBF最强,5-SMF次之,5-HMF最弱。结论:3种杂质均可能与DNA分子相互作用产生范德华力(小沟槽结合方式)、氢键和π-π相互作用,且均可能与DNA以非共价结合方式形成杂质-DNA复合物,从而对DNA结构造成一定的损伤。本研究从分子水平对5-HMF、OMBF和5-SMF与DNA可能的相互作用方式及其潜在致DNA损伤和遗传毒性的机制进行了探索性研究,为杂质小分子的遗传毒性研究提供了新思路。
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关键词
5
-
羟
甲基
糠
醛
5
5
’
-
二甲酰
基
呋喃二甲醚
5-磺基氧甲基糠醛
DNA
定量构效关系
分子对接
紫外光谱法
原文传递
题名
杂质5-羟甲基糠醛及其二聚体和代谢产物遗传毒性研究
被引量:
2
1
作者
林铌
叶倩
耿兴超
王雪
靳洪涛
文海若
机构
中国食品药品检定研究院国家药物安全评价监测中心药物非临床安全评价研究北京市重点实验室
中国药科大学药物科学研究院
中国医学科学院药物研究所新药安全评价研究中心
北京协和建昊医药技术开发有限责任公司
出处
《中国药物警戒》
2023年第2期157-162,共6页
基金
中国食品药品检定研究院中青年发展研究基金(2022C1)
中国食品药品检定研究院学科带头人培养基金(2019X4)
国家自然科学基金资助项目(81773996)。
文摘
目的 评价杂质单体5-羟甲基糠醛(5-hydroxymethylfurfural,5-HMF)、其二聚体5,5’-二甲酰基呋喃二甲醚[5,5’-oxydimethylenebis(2-furfural),OMBF]及单体代谢产物5-磺基氧甲基糠醛(5-sulfooxymethylfurfural,5-SMF)的潜在遗传毒性。方法 采用定量构效关系计算机模型(Q)SAR技术(包括Derek和Sarah模型)预测杂质5-HMF、OMBF和5-SMF的遗传毒性,进一步采用细菌回复突变试验(Ames试验)进行验证。在Ames试验中,用6种组氨酸营养缺陷型(his-)鼠伤寒沙门氏菌分别与不同浓度的5-HMF、OMBF和5-SMF在有/无代谢活化系统混合液(小鼠、大鼠和人S9 mix)条件下孵育48 h,通过比较不同菌株实验组与溶媒对照组相比回复菌落数的倍数关系,来判定结果。结果 Derek预测5-HMF和5-SMF致突变风险为可疑阳性,OMBF为阴性;Sarah预测5-HMF和5-SMF致突变风险均为阳性,OMBF为可疑阳性。Ames试验结果表明,5-HMF和OMBF仅在大鼠肝S9代谢活化后,导致回复突变菌落数呈弱阳性。5-SMF在非代谢活化及在小鼠、大鼠和人肝S9代谢活化后回复突变菌落数呈阳性。结论 5-HMF和OMBF仅在大鼠肝酶代谢活化系统条件下,具有潜在致突变性;5-SMF在有/无代谢活化系统条件下,均具有潜在致突变性。因此,杂质单体5-HMF、二聚体OMBF及单体代谢产物5-SMF均具有潜在遗传毒性,为2类遗传毒性杂质,对于可能长期暴露的人群,为保障用药安全,建议对3种杂质进行限量。
关键词
5
-
羟
甲基
糠
醛
5
5
’
-
二甲酰
基
呋喃二甲醚
5-磺基氧甲基糠醛
遗传毒性杂质
定量构效关系
致突变性
AMES试验
Keywords
5
-
hydroxymethylfurfural
5
,
5
’
-
oxydimethylenebis(2
-
furfural)
5
-
sulfooxymethylfurfural
genotoxic impurity
(quantitative)structure
-
activity relationship
mutagenicity
Ames test
分类号
R991 [医药卫生—毒理学]
R994.11 [医药卫生—毒理学]
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职称材料
题名
基于QSAR模型、紫外光谱法和分子对接技术研究杂质5-羟甲基糠醛及其二聚体和代谢产物与DNA的相互作用
2
作者
林铌
张佳宁
刘丽
靳洪涛
王三龙
刘颖
机构
中国食品药品检定研究院、国家药物安全评价监测中心、药物非临床安全评价研究北京市重点实验室
中国医学科学院药物研究所新药安全评价研究中心
北京协和建昊医药技术开发有限责任公司
出处
《药物分析杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期1221-1228,共8页
基金
中国食品药品检定研究院关键技术研究基金(GJJS-2022-9-1)
中国食品药品检定研究院中青年发展研究基金(2022C1)。
文摘
目的:研究杂质单体5-羟甲基糠醛(5-hydroxymethylfurfural, 5-HMF)及其二聚体5,5’-二甲酰基呋喃二甲醚[5,5’-oxydimethylenebis(2-furfural),OMBF]、单体代谢产物5-磺基氧甲基糠醛(5-sulfooxymethylfurfural, 5-SMF)与DNA的相互作用方式,为3种杂质潜在的DNA损伤风险和遗传毒性机制研究提供理论基础。方法:采用QSAR模型预测5-HMF、OMBF和5-SMF与DNA结合的可能性及遗传毒性警示结构,然后采用紫外光谱法对3种杂质与小牛胸腺DNA(ctDNA)相互作用后的光谱学变化评估可能的作用方式,最后用分子对接技术将3种杂质与双链DNA分子模拟对接,直观地呈现三者与DNA的作用方式,并比较3种杂质与DNA结合的稳定性。结果:4种QSAR模型预测结果提示5-HMF、OMBF和5-SMF 3种杂质均可能与DNA结合,且均具有潜在致突变或致癌性。5-HMF、OMBF和5-SMF均能使ctDNA的紫外吸收光谱发生减色效应(减色程度分别为8.2%、22.6%和8.7%)和蓝移(位移距离分别为1.2、3.5和1.0 nm),说明3种杂质均可能以小沟槽结合的方式与ctDNA发生相互作用,且均可能与碱基对发生π-π相互作用。通过分子对接模拟验证了3种杂质与DNA均可能发生小沟槽结合,并与碱基对产生氢键作用,OMBF和5-SMF还可能与碱基发生π-π相互作用。通过比较杂质小分子与DNA的平均结合能,结果证明OMBF最强,5-SMF次之,5-HMF最弱。结论:3种杂质均可能与DNA分子相互作用产生范德华力(小沟槽结合方式)、氢键和π-π相互作用,且均可能与DNA以非共价结合方式形成杂质-DNA复合物,从而对DNA结构造成一定的损伤。本研究从分子水平对5-HMF、OMBF和5-SMF与DNA可能的相互作用方式及其潜在致DNA损伤和遗传毒性的机制进行了探索性研究,为杂质小分子的遗传毒性研究提供了新思路。
关键词
5
-
羟
甲基
糠
醛
5
5
’
-
二甲酰
基
呋喃二甲醚
5-磺基氧甲基糠醛
DNA
定量构效关系
分子对接
紫外光谱法
Keywords
5
-
hydroxymethylfurfural
5
,
5
'
-
oxydimethylenebis(2
-
furfural)
5
-
sulfooxymethylfurfural
DNA
(quantitative)structure
-
activity relationship
molecular docking
ultraviolet spectroscopy
分类号
R917 [医药卫生—药物分析学]
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1
杂质5-羟甲基糠醛及其二聚体和代谢产物遗传毒性研究
林铌
叶倩
耿兴超
王雪
靳洪涛
文海若
《中国药物警戒》
2023
2
下载PDF
职称材料
2
基于QSAR模型、紫外光谱法和分子对接技术研究杂质5-羟甲基糠醛及其二聚体和代谢产物与DNA的相互作用
林铌
张佳宁
刘丽
靳洪涛
王三龙
刘颖
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