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应用5.8S rDNA及ITS区序列分析链格孢种级分类 被引量:69
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作者 王洪凯 张天宇 张猛 《菌物系统》 CSCD 北大核心 2001年第2期168-173,共6页
对9个链格孢小孢子种和3个大孢子种共20个链格孢菌株的5.8S rDNA及其两侧的ITS1区和ITS2区进行了序列分析。聚类分析结果表明形态差异大的种可以明确加以区分,而供试的9个小孢子种之间差异很小,不能根据对所选区段的序列分析加以区分... 对9个链格孢小孢子种和3个大孢子种共20个链格孢菌株的5.8S rDNA及其两侧的ITS1区和ITS2区进行了序列分析。聚类分析结果表明形态差异大的种可以明确加以区分,而供试的9个小孢子种之间差异很小,不能根据对所选区段的序列分析加以区分。传统分类上的滨菊链格孢不属于Alternaria, 其分类地位需进一步研究。 展开更多
关键词 链格孢 序列分析 ITS区 rdna5.8s 分类地位
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5.8S rDNA-ITS区片段的序列分析在坛紫菜种质鉴定中的应用 被引量:9
2
作者 赵玲敏 谢潮添 +1 位作者 陈昌生 纪德华 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期940-948,共9页
为探讨DNA序列标记技术在坛紫菜种质鉴定中的应用,对10个野生坛紫菜种质材料的5.8S rDNA-ITS区进行PCR扩增和序列分析,结果发现扩增的片段长度在1208~1219bp之间,可以分为ITS1区,5.8S区和ITS2区3个部分,其中5.8S区片段的长度完全一致,... 为探讨DNA序列标记技术在坛紫菜种质鉴定中的应用,对10个野生坛紫菜种质材料的5.8S rDNA-ITS区进行PCR扩增和序列分析,结果发现扩增的片段长度在1208~1219bp之间,可以分为ITS1区,5.8S区和ITS2区3个部分,其中5.8S区片段的长度完全一致,均为160bp;ITS1区和ITS2区片段的长度也非常接近,只有几个碱基的差异。多重序列比对发现10个种质材料的ITS区(包括ITS1和ITS2)序列都存在一定差异,序列同源性在95.82%~99.73%之间,而5.8S区序列则完全一致,但与其它种紫菜的5.8S区序列有很大差异,序列同源性在79.7%~95.0%之间。由此认为5.8S rDNA-ITS区这种高度保守区和高变区交替排列的形式可以成为坛紫菜种质鉴定及系统进化分析的强有力工具。 展开更多
关键词 坛紫菜 5.8s rdna 转录单元内间隔区 序列分析
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烟台海域暴发浒苔ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析 被引量:3
3
作者 宁璇璇 纪灵 +5 位作者 王刚 刘艳 于道德 宋培高 唐海田 伯云台 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期91-95,共5页
以烟台海域引发"绿潮"的浒苔为研究对象,采用PCR技术扩增出浒苔的ITS-1、5.8SrDNA及ITS-2片段,将扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-TEasy载体,筛选阳性克隆进行序列测定。结果表明,浒苔的ITS-1序列长度为195bp,5.8S序列为155bp,I... 以烟台海域引发"绿潮"的浒苔为研究对象,采用PCR技术扩增出浒苔的ITS-1、5.8SrDNA及ITS-2片段,将扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-TEasy载体,筛选阳性克隆进行序列测定。结果表明,浒苔的ITS-1序列长度为195bp,5.8S序列为155bp,ITS-2序列为181bp,该序列与浒苔属的多种物种ITS序列具有很高的同源性,在ITS-1区、5.8SrDNA区和ITS-2区仅存在4个转换/颠换位点。结合GenBank注册序列和本研究的结果发现,单纯依靠ITS序列并不能对浒苔属种类进行有效的分类鉴定。 展开更多
关键词 浒苔 内转录间隔区(ITS) 5.8s rdna 序列分析
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大熊猫蛔虫ITS及5.8SrDNA序列的克隆与分析 被引量:3
4
作者 陈绚姣 唐志玲 +1 位作者 陈武 金超宇 《野生动物》 2011年第6期332-335,共4页
基于核糖体DNA第一与第二转录间隔序列以及5.8S序列,以分离自广州动物园大熊猫体内的蛔虫为研究对象,用保守引物NC_5和NC_2对核糖体DNA(rDNA)的内转录间隔区ITS-1,ITS-2及5.8S序列进行PCR扩增,扩增后的片段纯化后克隆至pGEM-Teasy载体,... 基于核糖体DNA第一与第二转录间隔序列以及5.8S序列,以分离自广州动物园大熊猫体内的蛔虫为研究对象,用保守引物NC_5和NC_2对核糖体DNA(rDNA)的内转录间隔区ITS-1,ITS-2及5.8S序列进行PCR扩增,扩增后的片段纯化后克隆至pGEM-Teasy载体,重组质粒通过菌液PCR鉴定后,对阳性菌落进行序列测定及分析,鉴定大熊猫蛔虫的种类。结果显示,目的片段总长为910 bp,2个不同样品之间的ITS及5.8S序列没有差异,与GenBank^(TM)中的拜林蛔线虫(Baylisascaris transfuga)、猪蛔虫(Ascaris suum)和人蛔虫(Ascaris lumbricoides)的ITS序列相似性分别为96.6%、82.9%和82.7%。结果表明,此次分离的大熊猫蛔线虫可能为拜林蛔线虫。 展开更多
关键词 大熊猫 蛔虫 内转录间隔区 5.8s核糖体DNA 序列分析
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小熊猫蛔虫ITS及5.8S rDNA序列的克隆与分析 被引量:1
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作者 彭仕明 李少基 +1 位作者 肖建雄 陈武 《野生动物》 2012年第2期91-96,共6页
以广州动物园小熊猫体内分离出的蛔虫为研究对象,运用PCR方法,以保守引物NC5和NC2扩增其核糖体DNA(rDNA)的内转录间隔区(ITS)和5.8S序列,并对扩增后的片段进行纯化、克隆至pGEM-Teasy载体、转化、测序和序列分析,以鉴定小熊猫蛔虫的种... 以广州动物园小熊猫体内分离出的蛔虫为研究对象,运用PCR方法,以保守引物NC5和NC2扩增其核糖体DNA(rDNA)的内转录间隔区(ITS)和5.8S序列,并对扩增后的片段进行纯化、克隆至pGEM-Teasy载体、转化、测序和序列分析,以鉴定小熊猫蛔虫的种类。结果显示2条蛔虫样品的ITS及5.8S rDNA序列基本一致,总长为913 bp,样品间序列相似性为99.7%。将序列与GenBank^(TM)公布的相关序列进行比较分析,结果显示2条蛔虫的ITS及5.8S序列与黑熊横走贝蛔虫(Baylisascaris transfuga注册号AB571304)相似性分别为98.1%、98.4%,与大熊猫西氏贝蛔虫(Baylisascaris schroederi注册号JN210912)相似性分别为96.9%、97.1%,与猪蛔虫(Ascaris suum注册号AB571302)相似性分别为89.9%、90.1%,与人蛔虫(Ascaris lumbricoides注册号AB571296)相似性分别为89.8%、90.1%,ITS-1序列与浣熊贝蛔虫(Baylisascaris procyonis注册号AB053230)相似性分别为92.0%、92.3%。研究结果表明小熊猫体内分离的蛔虫可能为贝蛔属蛔虫,从而为蛔虫的进一步分类、鉴定和遗传变异研究奠定了基础。 展开更多
关键词 小熊猫 蛔虫:内转录间隔区(ITS) 5.8s核糖体DNA PCR扩增 序列分析
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4株扁藻属微藻5.8S rDNA和转录间隔区(ITS)的序列分析 被引量:2
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作者 乔文文 姜玮 李赟 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第S2期81-85,共5页
为确定种质库4株微藻(库存号为C73、C74、C151、C152)的亲缘关系及确切种类,本研究采用PCR技术扩增其核糖体5.8S rDNA和转录间隔区(ITS)序列,结果在4株微藻上获得大小分别为593 bp、632 bp、596 bp、591 bp的序列。与GenBank中高相似度... 为确定种质库4株微藻(库存号为C73、C74、C151、C152)的亲缘关系及确切种类,本研究采用PCR技术扩增其核糖体5.8S rDNA和转录间隔区(ITS)序列,结果在4株微藻上获得大小分别为593 bp、632 bp、596 bp、591 bp的序列。与GenBank中高相似度的瑞典四爿藻(T.suecica)和另一四爿藻属的微藻T.stiata比较发现,4株微藻与瑞典四爿藻和T.stia-ta5.8S rDNA的碱基序列完全相同,而2个间隔区(ITS1和ITS2)碱基序列存在一定差异,其中4株微藻ITS1变异位点占到总位点数的26.7%,ITS2变异位点占到总位点数的28%。系统进化分析表明,4株微藻与瑞典四爿藻聚集为同一群,其中C73和C152与瑞典四爿藻完全聚为一支(获得100%的支持率),而C74和C151彼此间距离仅为0.074,而与瑞典四爿藻的距离在0.2以上,结果说明,C73和C152是瑞典四爿藻的不同株系,C74和C152可能属于同一个有待确认的种。 展开更多
关键词 扁藻 5.8srdna和ITS 序列分析 亲缘关系
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我国部分区域链格孢属rDNAITS区序列分析 被引量:5
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作者 何劲 康冀川 +2 位作者 谢红艳 雷帮星 文庭池 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第6期2425-2427,共3页
[目的]对我国部分区域链格孢属rDNA ITS序列进行分析,从而在分子水平上对其进行鉴定。[方法]使用通用引物ITS4和ITS5对分离自我国部分区域不同寄主链格孢属(AlternariaNees)34个菌株进行ITS基因(ITS1-5.8S-ITS2)的PCR扩增和测序。[结果... [目的]对我国部分区域链格孢属rDNA ITS序列进行分析,从而在分子水平上对其进行鉴定。[方法]使用通用引物ITS4和ITS5对分离自我国部分区域不同寄主链格孢属(AlternariaNees)34个菌株进行ITS基因(ITS1-5.8S-ITS2)的PCR扩增和测序。[结果]序列分析结果表明:5.8S rDNA全长为159 bp,保守程度高,参试的34株菌均一致;ITS区变化相对较大。与A.tenuissima或A.alternata100%同源的分离菌株均表现出对地域和基质的广适性;菌株在5.8S/ITS存在的差异,说明寄主本犀科的丁香叶、蔷薇科、茄科等部分植物的链格孢具有一定的多样性。但同时也发现ITS序列标记在链格孢属部分种间应用有一定的局限性;基于序列ITS1-5.8S-ITS2聚类关系与其地理来源和寄主相关性不大。[结论]ITS序列分析法可为链格孢属的分子鉴定提供理论依据。 展开更多
关键词 链格孢 序列分析 ITS 5.8srdna
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牛羊源土耳其斯坦东毕吸虫ITS和28S rDNA-LSU序列分析 被引量:1
8
作者 仇建华 李利 +3 位作者 王春仁 陈佳 陈爱华 翟延庆 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期183-186,190,共5页
目的探讨牛羊源土耳其斯坦东毕吸虫(Orientobilharzia turkestanicum)核糖体内转录间隔区(ITS)和28S核糖体大亚基序列(rDNA-LSU)的差异。方法粪便检查、剖杀自然感染东毕吸虫的绒山羊、山羊、绵羊和黄牛,收集虫体,形态学鉴定为土耳其斯... 目的探讨牛羊源土耳其斯坦东毕吸虫(Orientobilharzia turkestanicum)核糖体内转录间隔区(ITS)和28S核糖体大亚基序列(rDNA-LSU)的差异。方法粪便检查、剖杀自然感染东毕吸虫的绒山羊、山羊、绵羊和黄牛,收集虫体,形态学鉴定为土耳其斯坦东毕吸虫。抽提成虫基因组DNA,扩增其ITS(包括ITS-1、5.8S rDNA和ITS-2)和28S rDNA-LSU序列,测序并分析以上序列,以及28S rDNA-LSU序列RNA二级结构。结果牛、羊源土耳其斯坦东毕吸虫的ITS-1、5.8S rDNA、ITS-2和28S rDNA-LSU序列分别长384、159、331和1304bp。牛源和羊源的ITS-1和5.8S rDNA序列完全相同;黄牛源、绵羊源和绒山羊源的ITS-2序列完全相同,与山羊源存在1个碱基的差异;绵羊源和绒山羊源的28S rDNA-LSU序列完全相同,与牛源和山羊源分别有2个碱基的差异。绵羊源和绒山羊源的28S rDNA-LSU序列RNA二级结构相同,与山羊源存在微小差异,但牛源与羊源存在较大差异。结论不同终末宿主源土耳其斯坦东毕吸虫的核糖体序列存在不同程度的差异,羊源28S rDNA-LSU序列的RNA二级结构相同或相似,但与牛源存在较大差异。 展开更多
关键词 土耳其斯坦东毕吸虫 核糖体内转录间隔区 5.8s核糖体DNA 28S核糖体DNA大亚基序列 序列分析
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牦牛肠道与粪便乳酸菌的分离鉴定及PCR-16 S rDNA鉴定 被引量:8
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作者 张瑞强 王红宁 +2 位作者 黄勇 赵应望 段少军 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期381-385,共5页
以取自四川省不同地区的牦牛粪便、肠道内容物为材料,用MRS琼脂双层培养基进行厌氧培养,分离到50株乳酸菌,经生化鉴定为嗜热链球菌(2株)、乳酸乳球菌(1株)、保加利亚乳杆菌(5株)、嗜粪乳杆菌(10株)、嗜酸乳杆菌(8株)、乳酸乳杆菌(9株)... 以取自四川省不同地区的牦牛粪便、肠道内容物为材料,用MRS琼脂双层培养基进行厌氧培养,分离到50株乳酸菌,经生化鉴定为嗜热链球菌(2株)、乳酸乳球菌(1株)、保加利亚乳杆菌(5株)、嗜粪乳杆菌(10株)、嗜酸乳杆菌(8株)、乳酸乳杆菌(9株)、肠乳杆菌(10株)、弯曲乳杆菌(5株)。采用乳酸菌16 S rDNA通用引物,对分离的8种菌的16 S rDNA一段可变区序列进行扩增,均得到大小约470 bp的产物;扩增产物经纯化、测序后与GenBank中标准菌株的核甘酸序列比较,同源性均大于97.5%,同源性分析与生化试验的结果是一致的。证实,牦牛肠道和粪便的乳酸菌较为丰富,且乳杆菌的数量较多,这可能与牦牛复杂的生长环境有关。 展开更多
关键词 牦牛 乳酸菌 分离鉴定 16 S rdna 序列分析
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不同树龄葡萄自然发酵过程中酵母菌的研究 被引量:17
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作者 刘树文 常亚维 +2 位作者 胡廷 焦红茹 刘丽丽 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2008年第7期51-56,63,共7页
【目的】研究葡萄树龄与葡萄自然发酵过程中葡萄酒相关酵母菌之间的关系。【方法】利用WL营养培养基,对分离自华夏长城葡萄酒厂葡萄生产基地、不同树龄(2,3,5年)西拉葡萄自然发酵液的240株酵母菌进行了聚类分析。【结果】240株酵母菌共... 【目的】研究葡萄树龄与葡萄自然发酵过程中葡萄酒相关酵母菌之间的关系。【方法】利用WL营养培养基,对分离自华夏长城葡萄酒厂葡萄生产基地、不同树龄(2,3,5年)西拉葡萄自然发酵液的240株酵母菌进行了聚类分析。【结果】240株酵母菌共分为5个WL营养类型。结合酵母菌菌株5.8 S rDNA-ITS区基因序列分析,不同树龄西拉葡萄自然发酵液中的酵母菌共有5种,分别为酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、陆生伊萨酵母(Is-satchenkia terricola)、克鲁维毕赤酵母(Pichia kluyveri)、浅黄隐球酵母(Cryptococcus flavescens)、葡萄汁有孢汉逊酵母(Hanseniaspora uvarum)。不同树龄西拉葡萄自然发酵过程中酵母菌的种类及其比例是变化的。【结论】用树龄较高的葡萄发酵,可加速发酵的启动,缩短发酵周期,同时有利于性状优良野生酿酒酵母菌株的筛选。 展开更多
关键词 西托葡萄 树龄 酵母菌 自然发酵 5.8s rdna—ITS基因序列
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湖南省猬迭宫绦虫ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析 被引量:4
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作者 刘自逵 刘国华 +5 位作者 戴荣四 刘伟 李芬 徐平原 胡涛 刘毅 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期209-212,共4页
利用聚合酶链反应(PCR)扩增猬迭宫绦虫rDNA的ITS-1、5.8S及ITS-2片段,将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-T Easy载体,重组质粒通过菌落PCR鉴定后,对阳性菌落进行序列测定并进行序列分析。结果显示,所获得的ITS及5.8S rDNA序列总长存... 利用聚合酶链反应(PCR)扩增猬迭宫绦虫rDNA的ITS-1、5.8S及ITS-2片段,将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-T Easy载体,重组质粒通过菌落PCR鉴定后,对阳性菌落进行序列测定并进行序列分析。结果显示,所获得的ITS及5.8S rDNA序列总长存在一定差异,为1 369~1 393 bp,包含部分的18、28S及全部的ITS-1(662~687 bp)5、.8S(138 bp)及ITS-2(457~475 bp)序列。由于猬迭宫绦虫ITS序列种内相对保守,种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记。 展开更多
关键词 猬迭宫绦虫 内转录间隔区(ITS) 5.8s rdna 序列分析
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两株盐生海芦笋内生真菌的分离与鉴定 被引量:4
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作者 赵育卉 王晓敏 +3 位作者 王惠 彭洁 刘天行 辛志宏 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第15期148-153,共6页
对分离自江苏盐城大丰港盐碱地野生海芦笋的两株嗜盐内生真菌进行分离鉴定,提取基因组DNA后分别对18S rDNA和rDNA ITS1-5.8S-ITS4区域进行PCR扩增,基因测序并进行同源性分析,构建进化树并进行系统发育分析,结合形态学观察,将该两株菌分... 对分离自江苏盐城大丰港盐碱地野生海芦笋的两株嗜盐内生真菌进行分离鉴定,提取基因组DNA后分别对18S rDNA和rDNA ITS1-5.8S-ITS4区域进行PCR扩增,基因测序并进行同源性分析,构建进化树并进行系统发育分析,结合形态学观察,将该两株菌分别鉴定为维管束茎点霉(Phoma tracheiphila)与镰刀菌属(Fusarium sp.)。 展开更多
关键词 嗜盐真菌 形态学 18S rdna序列 rdna ITS1-5 8S-ITS4序列 系统发育分析
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几种云南野生石斛内生真菌的鉴定及分布 被引量:13
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作者 洪群艳 董文汉 +4 位作者 徐文婷 杨根华 梁泉 浦锦月 秦蔚 《生物技术进展》 2012年第3期190-194,共5页
采用组织分离法,从采自德宏州的8种野生石斛根、茎、叶中分离得到内生真菌43株,经分子生物学鉴定分别归属于13个属。Colletotrichum为茎和叶的优势种群,占总菌株数的39.5%。Hypocrea、Nectria、Gibberella三个属内生真菌首次从石斛植物... 采用组织分离法,从采自德宏州的8种野生石斛根、茎、叶中分离得到内生真菌43株,经分子生物学鉴定分别归属于13个属。Colletotrichum为茎和叶的优势种群,占总菌株数的39.5%。Hypocrea、Nectria、Gibberella三个属内生真菌首次从石斛植物体内分离得到。研究发现,不同石斛植物内生真菌的存在情况差别较大,具有一定的宿主差异性;根、茎、叶内生真菌分布存在差异,表明内生真菌定殖具有一定的组织差异性和组织专一性。本研究获得丰富的内生真菌资源,为石斛的人工栽培提供基础的理论依据。 展开更多
关键词 石斛 内生真菌 5.8srdna分子鉴定
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金沙江干热河谷区田菁根瘤菌多样性与系统发育 被引量:4
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作者 黄昌学 张小平 +1 位作者 彭贤超 K. Lindstrom 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期725-732,共8页
【目的】揭示金沙江干热河谷区这一特殊地理环境下田菁根瘤菌的多样性和系统发育地位。【方法】采用了数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析方法。【结果】数值分类结果表明:在93%的水平上,待测菌株分布于6个群,其中4... 【目的】揭示金沙江干热河谷区这一特殊地理环境下田菁根瘤菌的多样性和系统发育地位。【方法】采用了数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析方法。【结果】数值分类结果表明:在93%的水平上,待测菌株分布于6个群,其中4个群分别与R.tropici、R.etli、S.saheli、A.rubi的参比菌株聚在一起,两个群没有参比菌株与之聚群。16S rDNAPCR-RFLP结果与数值分类基本一致,只有两个独立群有所差异。16S rDNA序列分析表明:两独立群中心菌株SCAU176和SCAU144与R.huautlense聚在一起,与该种同源性分别为100%和98.9%。GSⅡ序列分析中SCAU176和SCAU144单独聚在一起,与最近的参比菌株R.tropici的同源性系数在90%以下。【结论】金沙江干热河谷区田菁根瘤菌具有较为丰富的多样性,在系统发育地位上分布于Sinorhizobium、Agrobacterium和Rhizobium三个属。 展开更多
关键词 田菁 根瘤菌 多样性 系统发育 数值分类 16S rdna GSⅡ 序列分析
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额尔齐斯河北方四钩虫的28S和ITS1 rDNA序列测定及其系统发育分析 被引量:2
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作者 赵江山 焦丽 +2 位作者 郝翠兰 贾舒安 岳城 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期668-671,共4页
首次对采自额尔齐斯河北极茴鱼鳃部北方四钩虫(Tetraonchus borealis)的部分rDNA基因进行了PCR扩增、序列测定分析。结果显示,北方四钩虫28S和ITS1rDNA基因序列大小分别为332bp和513bp。利用MEGA 4.0程序的NJ法构建北方四钩虫28S及ITS1r... 首次对采自额尔齐斯河北极茴鱼鳃部北方四钩虫(Tetraonchus borealis)的部分rDNA基因进行了PCR扩增、序列测定分析。结果显示,北方四钩虫28S和ITS1rDNA基因序列大小分别为332bp和513bp。利用MEGA 4.0程序的NJ法构建北方四钩虫28S及ITS1rDNA基因的系统进化树,结果显示北方四钩虫与同属的单肠四钩虫聚为一支,其支持率分别为83%和87%,为进一步研究四钩虫属虫种提供了分子生物学方面的资料。 展开更多
关键词 北方四钩虫 28S rdna ITS1 序列分析
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Bioleaching of spent Ni-Cd batteries and phylogenetic analysis of an acidophilic strain in acidified sludge 被引量:3
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作者 ZHAO Ling WANG Liang +1 位作者 YANG Dong ZHU Nanwen 《Frontiers of Environmental Science & Engineering》 SCIE EI CSCD 2007年第4期459-465,共7页
Biohydrometallurgy is a novel method to recycle discarded batteries,in which sewage sludge is used as microorganisms and culture due to the presence of indigenous Thiobacilli.A two-step continuous flow leaching system... Biohydrometallurgy is a novel method to recycle discarded batteries,in which sewage sludge is used as microorganisms and culture due to the presence of indigenous Thiobacilli.A two-step continuous flow leaching system consisting of an acidifying reactor and a leaching reactor was introduced to achieve the bioleaching of spent nickel-cadmium(Ni-Cd)batteries.The acid supernatant produced in the acidifying reactor by the microorganisms with ferrous ions as the substrate was conducted into the leaching reactor to dissolve electrode materials.The efficiency of a batch treatment of batteries was examined.The results showed that the complete dissolution of two AA-sized Ni-Cd batteries with 0.6 L/d acid supernatant took about 30,20,and 35 days for Ni,Cd,and Co,respectively.But the dissolution ability of the three metals was different.Cd and Co can be leached mostly for pH below 4.0 while the complete dissolution of Ni can be achieved for pH below 2.5.Meanwhile,a strain(named Thiooxidans.WL)accounting for the reduction of pH in the acidified sludge was isolated and sequenced.It was identified to be 100%similar to Acidithiobacillus ferrooxidans strain Tf-49 based on 16S rDNA sequence analysis.The relevant phylogenetic tree constructed indicates that the strain should be classified into genus Acidithiobacillus ferrooxidans. 展开更多
关键词 BIOHYDROMETALLURGY spent Ni-Cd batteries 16S rdna sequence analysis Acidithiobacillus ferrooxidans
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Association between childhood obesity and gut microbiota:16S rRNA gene sequencing-based cohort study
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作者 Xu-Ming Li Qing Lv +2 位作者 Ya-Jun Chen Lu-Biao Yan Xin Xiong 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2024年第16期2249-2257,共9页
BACKGROUND This study aimed to identify characteristic gut genera in obese and normal-weight children(8-12 years old)using 16S rDNA sequencing.The research aimed to provide insights for mechanistic studies and prevent... BACKGROUND This study aimed to identify characteristic gut genera in obese and normal-weight children(8-12 years old)using 16S rDNA sequencing.The research aimed to provide insights for mechanistic studies and prevention strategies for childhood obesity.Thirty normal-weight and thirty age-and sex-matched obese children were included.Questionnaires and body measurements were collected,and fecal samples underwent 16S rDNA sequencing.Significant differences in body mass index(BMI)and body-fat percentage were observed between the groups.Analysis of gut microbiota diversity revealed lowerα-diversity in obese children.Differences in gut microbiota composition were found between the two groups.Prevotella and Firmicutes were more abundant in the obese group,while Bacteroides and Sanguibacteroides were more prevalent in the control group.AIM To identify the characteristic gut genera in obese and normal-weight children(8-12-year-old)using 16S rDNA sequencing,and provide a basis for subsequent mechanistic studies and prevention strategies for childhood obesity.METHODS Thirty each normal-weight,1:1 matched for age and sex,and obese children,with an obese status from 2020 to 2022,were included in the control and obese groups,respectively.Basic information was collected through questionnaires and body measurements were obtained from both obese and normal-weight children.Fecal samples were collected from both groups and subjected to 16S rDNA sequencing using an Illumina MiSeq sequencing platform for gut microbiota diversity analysis.RESULTS Significant differences in BMI and body-fat percentage were observed between the two groups.The Ace and Chao1 indices were significantly lower in the obese group than those in the control group,whereas differences were not significant in the Shannon and Simpson indices.Kruskal-Wallis tests indicated significant differences in unweighted and weighted UniFrac distances between the gut microbiota of normal-weight and obese children(P<0.01),suggesting substantial disparities in both the species and quantity of gut microbiota between the two groups.Prevotella,Firmicutes,Bacteroides,and Sanguibacteroides were more abundant in the obese and control groups,respectively.Heatmap results demonstrated significant differences in the gut microbiota composition between obese and normal-weight children.CONCLUSION Obese children exhibited lowerα-diversity in their gut microbiota than did the normal-weight children.Significant differences were observed in the composition of gut microbiota between obese and normal-weight children. 展开更多
关键词 Childhood obesity Gut microbiota 16S rdna sequencing Diversity analysis Genus identification Body mass index
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冷冻鲣鱼中产组胺菌的分离筛选及其生物学特性研究 被引量:8
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作者 杨健 吴祖芳 +2 位作者 周秀锦 翁佩芳 沈飚 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第8期25-31,共7页
采用Actis’s鉴别培养基,初步筛选鲣鱼组织中的产组胺菌;结合高效液相色谱法分析初步分离菌株的产组胺能力。研究温度和pH因素对产组胺菌生长以及组胺产生的影响。通过生理生化、形态和16S rDNA基因序列分析鉴定产组胺菌。试验结果表明... 采用Actis’s鉴别培养基,初步筛选鲣鱼组织中的产组胺菌;结合高效液相色谱法分析初步分离菌株的产组胺能力。研究温度和pH因素对产组胺菌生长以及组胺产生的影响。通过生理生化、形态和16S rDNA基因序列分析鉴定产组胺菌。试验结果表明,分离得到两株产组胺菌,分别记为J2和J4。这两株菌在添加L-组氨酸的胰酶大豆肉汤里均能够产生组胺。菌株J2和J4最适生长温度均为30℃,最适pH分别为7和6。菌株J2和J4产组胺的最适温度分别为25℃和30℃,最适pH均为5,在适宜的实验条件下组胺产生量最大值为12.47mg/L。根据菌株的形态、生理生化、生长和产组胺特性以及16S rDNA基因序列分析,J2和J4均与蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus)的亲缘关系最近。 展开更多
关键词 鲣鱼 产组胺菌 生理生化特性 16S rdna序列分析
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Screening and Denitrification Characteristics of a Slight Halophilic Heterotrophic Nitrobacteria
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作者 GUO Shasha, ZHANG Peiyu, YU Deshuang, QU Yang College of Chemistry, Chemical Engineering and Environment, Qingdao University, Qingdao 266071, Shandong, China 《Wuhan University Journal of Natural Sciences》 CAS 2010年第4期363-368,共6页
A slight halophilic heterotrophic nitrobacteria named gs1 was separated from the matured activated sludge. According to the morphological observation,physiological biochemical tests and sequence analysis of the 16S rD... A slight halophilic heterotrophic nitrobacteria named gs1 was separated from the matured activated sludge. According to the morphological observation,physiological biochemical tests and sequence analysis of the 16S rDNA,strain gs1 was identified to be as Pseudomonas sp. Sodium acetate and ammonium chloride were used as carbon and nitrogen sources,respectively,to investi-gate the characteristics of the bacterium. When cultured for 24 h under aerobic conditions,with the removal rates of the NH4+-N and COD being 82.2% and 74.73%,respectively,strain gs1 will have a nitrification function of producing NO2--N. When cultured for 24 h under aerobic conditions in nitrite medium,the removal rate of the NO2--N became 100%,and when cultured for 24 h under aerobic conditions in nitrate medium,the removal rate of the NO3--N became 97%. The result shows that this strain functions for either nitrification or denitrification,i.e.,it can complete the full process of biological deoxidation. 展开更多
关键词 HALOPHILIC HETEROTROPHIC nitrobacteria AEROBIC deni- trification 16S rdna sequence analysis
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