马铃薯卷叶病毒56kD蛋白基因及3'端非编码区克隆和序列分析

根据已报道的马铃薯卷叶病毒基因组序列，设计合成一对特异性引物。以马铃薯卷叶病毒中国分离株（ＰＬＲＶ－Ｃｈ）的ＲＮＡ为模板，反转录合成了ｃＤＮＡ第一条链，经ＰＣＲ扩增后克隆于ｐＵＣ１９质粒中。进一步用ＰＣＲ鉴定，限制酶切分析和序列分析。结果表明，ＰＬＲＶ－Ｃｈ５６ｋＤ蛋白基因由１５２７个核苷酸组成，编码５０８个氨基酸，３＇端非编码区由１４１个核苷酸组成，与国外报道的苏格兰ＰＬＲＶ－Ｓ、荷兰ＰＬＲＶ－Ｎ、加拿大ＰＬＲＶ－Ｃ、澳大利亚ＰＬＲＶ－Ａ各株系核苷酸序列和氨基酸序列有很高的同源性。５６ｋＤ蛋白基因核苷酸同源率分别为９７．１％、９７．８％、９７．１％和９３．９％，推测的氨基酸同源率分别为９６．２％、９６．４％、９５．８％和９４．６％，非编码区核苷酸同源率分别为９７．９％、９７．２％、９８．６％和９８．６％。