聚合酶链反应检测日本血吸虫5D基因的实验研究

目的：寻找一种有效的日本血吸虫病诊断及疗效考核方法。方法：以血吸虫的成虫、虫卵、尾蚴ＤＮＡ为模板，利用聚合酶链反应（ＰＣＲ）对日本血吸虫编码免疫原性毛蚴抗原的５Ｄ基因进行扩增，检测其敏感性与特异性。结果：用ＰＣＲ检测日本血吸虫的成虫、虫卵、尾蚴ＤＮＡ，均出现明显特异性条带。通过引物１、引物２单扩增，即能检测到单个虫卵、单个尾蚴或针尖大小的成虫组织。采用Ｎｅｓｔ－ＰＣＲ和非同位素探针能将敏感性进一步提高。常见的肠道细菌及人基因组ＤＮＡ无交叉阳性出现。结论：ＰＣＲ方法检测日本血吸虫基因的敏感性与特异性均满意。

Unc5D基因在高、低危神经母细胞瘤中的表达及其意义

目的探讨膜蛋白受体Unc5D在高、低危神经母细胞瘤(NB)中表达模式与患儿生存期长短之间的关系。方法在118例NB标本cDNA中应用TaqMan探针实时PCR法检测Unc5D基因在高、低危NB中的表达,应用t检验及Kaplan-Meier生存分析法检测Unc5D表达水平与NB恶性程度及生存期长短的关系。结果Unc5D基因在低危NB中表达明显高于其在高危NB中的表达水平(P<0.01),且高Unc5D表达与NB患儿长期生存相关(P<0.01)。结论Unc5D基因可作为NB分子生物学预后标记物。

PPP2R5D基因突变相关性癫痫一例

1病例介绍患儿,男,9月6 d,间断抽搐2个月。发作形式以局灶性发作为主,表现为突发双眼发呆、左眼眼眶发红,流眼泪,流涎,伴(或不伴)左上肢抖动,伴(或不伴)意识丧失,严重时进展为全面性发作、丛集性发作(1天多至20余次,多数为每次数十秒)、2次癫痫持续状态发作(最长可达2 h),呕吐、腹泻或发热诱因时抽搐增多。既往史:出生后4个月抬头不稳,诊断“发育迟缓”,多次外院行康复锻炼。出生史:患儿系第4胎第2产,孕38周顺产,出生体重3400 g,Apgar评分不详,否认窒息抢救史。

PPP2R5D基因变异所致常染色体显性遗传性智力障碍35型1例并文献复习

目的通过分析常染色体显性遗传性智力障碍35型患儿的临床及遗传学特点以提高对该病的认识。方法报道北京儿童医院2018年7月收治的1例常染色体显性遗传性智力障碍35型患者的临床资料、遗传学特点, 并进行文献复习。结果先证者男性, 1岁3个月龄, 表现为发育落后, 低热, 患儿面容特殊(额部突出、鼻梁塌平), 张口呼吸, 肌张力减低。头颅磁共振成像示侧脑室增宽、透明隔间腔及Vergae腔形成、中间帆腔囊肿。基因检测结果示PPP2R5D基因位点新生突变(NM_006245:c.1258G>A, p.E420K)。检索到既往共10篇国外文献报道31例常染色体显性遗传性智力障碍35型患者, 包括本例共32例。32例中临床表现为智力发育迟缓(32例;100.0%)、运动发育迟缓(26例;81.3%)、巨头畸形(26例;81.3%)、癫痫(8例;25.0%), 此外有特殊面容、震颤、眼科异常、骨骼发育异常、心脏畸形等表现。PPP2R5D基因突变均为新生错义突变, 常染色体显性遗传。结论常染色体显性遗传性智力障碍35型主要临床表现为发育迟缓/智力障碍、严重的语言发育落后、巨头畸形、肌张力减低、特殊面容。PPP2R5D基因新生错义突变为本病的遗传学病因。

D5S818基因座等位基因丢失对亲子鉴定结果的影响

目的 分析PowerPlex21检测体系中D5S818基因座的等位基因丢失现象,探讨其对亲子鉴定结果的影响。方法 利用Chelex-100法提取样本的DNA。用PowerPlex21体系对3 248例家系研究对象进行20个常染色体STR基因座的复合扩增,分析毛细管电泳后STR基因座的等位基因分型。对发现的D5S818基因座可能存在的等位基因丢失情况,采用Identifiler体系扩增进行验证。结果 经过Identifiler检测体系验证,在5个家系中发现7名个体利用PowerPlex21体系检测存在D5S818基因座等位基因12的丢失情况。结论 等位基因丢失易被误判为发生了基因座的“突变”,对亲子鉴定的累积亲权指数结果有一定的影响。可采用具有相同STR基因座的不同检测体系验证解决,以保证得出正确的亲子鉴定结论。

5-HT_(1Dβ)受体基因T371G多态性与单相抑郁症及其症状表型的关联分析

目的探讨5-HT1Dβ受体基因T371G多态性与单相抑郁症的遗传关联性。方法应用PCR-RFLP分析技术,对132例单相抑郁症患者和180名正常对照者进行关联分析;采用HAMD评定病例组症状群,分析单相抑郁症症状群与基因型的关联性。结果病例组与对照组基因型(χ2=0.7478,df=2,P>0.05)和等位基因(χ2=0.2637,df=1,P>0.05)总体分布差异无统计学意义。在病例组HAMD各因子评分中,其中日夜变化症状中G/G基因型(1.74±1.25)和T/G基因型(1.61±1.06)分值均低于T/T基因型(2.44±1.19),在绝望感症状群中T/G基因型(7.09±1.93)分值低于G/G基因型(7.82±1.85)和T/T基因型(8.33±2.22)。结论5-HT1Dβ受体基因T371G多态性可能与单相抑郁症症状群中日夜变化和绝望感有关联。

一例由PPP2R5D基因变异引起的神经发育迟缓

目的使用全外显子组测序技术对一例发育迟缓的婴儿进行基因检测,查明该患儿致病原因。方法应用全外显子组测序技术对其进行致病基因筛查,结合临床表型资料,锁定候选基因致病位点,利用Sanger测序技术对先证者及其家系成员完成致病变异验证。结果发现先证者存在PPP2R5D基因c.592G>A(p.E198K)杂合变异,该变异为已知致病变异,根据相关文献报道及患儿临床症状,诊断该患儿的致病原因为PPP2R5D基因c.592G>A变异引起的。结论Jordan综合征是一种罕见的遗传疾病,应用全外显子组测序技术能够快速发现PPP2R5D基因变异,有助于该疾病的临床诊断和辅助治疗及该家系的遗传咨询及产前诊断。

多巴胺受体D5基因5’端单核苷酸多态性与偏执型精神分裂症的关联及对基因表达的影响

目的进一步探讨多巴胺受体D5(DRD5)基因在偏执型精神分裂症发病机制中的作用,分析rs77434921和rs2076907位点以及5’端序列对基因表达的影响。方法将不同单倍型分别转染HEK293细胞和SK-N-SH细胞,进行荧光素酶报告分析,并提取总细胞RNA,进行实时定量PCR分析。结果在HEK293和SK-N-SH细胞中,与其他3种单倍型相比,G-G单倍型的相对荧光素酶活性均无显著变化。然而在后续研究中发现,-1599^-934这段序列在维持转录水平中发挥作用,而+82^+564这段序列发挥下调转录水平的作用。结论未能证实位于DRD5基因上的rs2076907和rs77434921这2个单核苷酸多态性位点调控基因的表达,证实了其5’端的一部分区域对基因表达有显著影响。

高山被孢霉Δ5脱饱和酶基因的分离与验证

花生四烯酸(arachidonicacid)是人体的必需脂肪酸,具有独特的生物活性。Δ5脱饱和酶是花生四烯酸生物合成途径上的关键酶,以二高-γ-亚麻酸为底物,催化其第5位碳脱氢形成花生四烯酸。从花生四烯酸高产菌株高山被孢霉M6(Mortierellaalpina)中通过RT-PCR分离了可能的编码Δ5脱饱和酶完整的cDNA,其大小为1366bp,编码446个氨基酸。推导出的蛋白质含有Δ5脂酰脱饱和酶中保守的特征性结构域,包括该蛋白质N端典型的细胞色素b5结构域,以及3个保守的组氨酸盒。为验证该蛋白质的功能,将该基因片段克隆到穿梭表达载体pPIC9K中,获得的重组载体pPIC9K-D5通过电转化法转化到巴斯德毕赤酵母GS115中,利用G418耐受度筛选出高拷贝数的酵母转化子,在加入外源底物二高-γ-亚麻酸时,利用甲醇诱导酵母转化子表达外源基因。酵母转化子的油脂的气相色谱图谱中出现了一个花生四烯酸的特征峰,进一步对该峰进行气质联谱(GC-MS)分析,证实该峰是花生四烯酸。研究结果表明,从高山被孢霉M6中分离出Δ5脱饱和酶基因。

膀胱癌D17S5位点VNTR多态性研究

膀胱癌Ｄ１７Ｓ５位点ＶＮＴＲ多态性研究王德育袁春伟（东南大学国家教委分子与生物分子电子学实验室，南京２１００９６）可变数目串联重复序列（ＶａｒｉａｂｌｅＮｕｍｂｅｒＴａｎｄｅｍＲｅｐｅａｔｕｎｉｔｓ，ＶＮＴＲｓ）是广泛存在于人类基因组中的ＤＮＡ片段...

利用高通量测序技术鉴定棉纤维发育相关miRNAs及其靶基因

miRNA(microRNA)是一类21～24个核酸长度的非编码小分子RNA(sRNA),它主要通过抑制或降解靶基因来调控植物生长发育等过程。试验利用在纤维长度上有显著差异的2个回交自交系BILs(Backcrossinbred lines)的0 DPA(Days post anthesis)、3 DPA的胚珠和10 DPA的纤维构建6个sRNA文库并进行Solexa测序。以已公布的棉花D5基因组序列和棉属其他序列为参考,经分析共发现561个miRNAs,其中包括254个已知的miRNAs(属于40个miRNA家族),75个候选的miRNAs和232个新的miRNAs,研究结果极大地丰富了棉属miRNAs。通过miRNA靶基因预测分析发现多数miRNAs负调控其对应的靶基因,少数正调控。KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)注释结果表明miRNA的靶基因在植物激素代谢途径中显著富集。

花药特异性表达的类查尔酮合酶基因D5与水稻花粉发育相关

采用ＲＮＡ原位杂交技术对水稻类查尔酮合酶基因Ｄ５进行细胞定位，结果表明Ｄ５基因特异地在水稻花药的绒毡层及维管束周围细胞中大量表达．为了进一步研究其功能，将水稻肌动蛋白基因（Ａｃｔｉｎｌ）启动子驱动的Ｄ５正义及反义基因分别转入水稻中．对转基因水稻花粉不同发育时期进行观察，发现表达了反义Ｄ５基因的花粉其形态表现明显不正常，由此可以推测出Ｄ５基因对于花粉的发育起重要作用．

导致D5S818等位基因丢失的突变确认1例

1案例资料1.1简要案情在日常一例二联体父女鉴定的检案中,我们采用Power Plex?21试剂盒(Promega公司,美国)进行亲子鉴定过程中,发现D5S818基因座存在等位基因丢失情况。1.2实验方法采用常规Chelex-100法提取争议父和孩子的基因组DNA;分别使用Power Plex?21试剂盒、Golden EyeTM20A试剂盒(北京基点认知技术有限公司)和AGCU Expressmarker 22试剂盒(无锡中德美联公司)进行STR复合扩增;扩增产物通过3130型遗传分析仪(Applied Biosystems公司,美国)进行毛细管电泳,Gene Mapper ID v3.2.1软件分析各基因座的基因型。

氧化应激在多巴胺D5突变基因F173L小鼠血压升高中的作用与机制

目的利用特异表达人多巴胺D5突变基因F173L(D5F173L)的转基因小鼠,探讨多巴胺D5受体在高血压发生中的作用机制。方法采用鼠尾无创法测量野生型与D5F173L小鼠血压。使用代谢笼收集小鼠24h尿量并用电极法测定尿钠、尿钾水平。用哇巴因法检测小鼠近曲小管上皮细胞(mRPT)转染野生型、D5F173L质粒后Na+-K+-ATP酶活性。利用DHE试剂盒检测小鼠肾脏中超氧阴离子含量,观察氧化应激水平的变化。通过荧光定量PCR筛选出与氧化应激相关基因mRNA表达水平的变化。结果 D5F173L转基因小鼠收缩压、平均动脉压、肾脏尿钾、氧化应激水平、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)γmRNA的表达高于野生型小鼠[收缩压(121±5)比(98±4)mm Hg、平均动脉压(85±3)比(76±5)mm Hg,尿钾(0.60±0.09)比(0.46±0.05)mmol/d,氧化应激的荧光密度:0.076±0.006比0.051±0.009,PPARγmRNA:0.89±0.33比0.48±0.39,均P<0.05],24h尿量、尿钠、超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶1(GPX-1)、过氧化氢酶(CAT)mRNA的表达低于野生型小鼠[尿量(1.57±0.17)比(2.01±0.10)mL/d、尿钠(0.36±0.02)比(0.46±0.05)mmol/d,SOD mRNA 1.28±0.33比0.79±0.39、GPX-1mRNA 1.09±0.11比0.75±0.20、CAT mRNA 1.42±0.34比0.93±0.48,均P<0.05]。转染D5F173L质粒的近曲小管上皮细胞Na+-K+-ATP酶活性较野生型和空白对照组升高[(136.9±42.3)%比(88.6±23.9)%,(99.7±22.1)%,均P<0.05]。结论氧化应激水平通过增加肾脏Na+-K+-ATP酶活性使肾脏利尿排钠功能受损,可能是D5F173L转基因小鼠血压升高的原因之一。

D5S818基因座稀有等位基因5的确认

1案例资料1.1案情概述本鉴定所日常检案中的一起亲子鉴定案,鉴定案件两样本均为滤纸血斑(下文代称:被检父、孩子)。1.2初次检验采用chelex-100法提取血斑样品DNA,使用MicroreaderTM21 ID System身份鉴定试剂(苏州阅微基因技术有限公司)在K960型PCR仪(杭州晶格科学仪器有限公司)上扩增。

重组质粒pEGFP-mDlx5的构建及其在SVZa神经干细胞中的表达研究

目的构建真核表达重组质粒pEGFP-mDlx5,并了解它在室管膜前下区(SVZa)神经干细胞(NSCs)中的mRNA及融合蛋白表达情况。方法运用DNA重组技术自原核表达载体上将小鼠来源的mDlx5基因克隆到增强型绿色荧光蛋白(EGFP)载体上,并用双酶切、测序进行鉴定;将重组质粒用电穿孔的方法转染SVZa NSCs,荧光显微镜下动态观察荧光变化情况;培养24h后提取转染细胞的总RNA及总蛋白,通过逆转录-多聚酶链反应(RT-PCR)了解其mRNA表达情况,用Western blot 检测其蛋白表达情况。结果重组质粒通过双酶切产生了0．78 kb目的插入片段及4．68 kb载体片段;测序后证实0．78 kb片段碱基序列与mDlx5基因完全同源;重组质粒转染SVZa NSCs 8 h后在荧光显微镜下观察到绿色荧光,12 h后逐渐增多,24-48 h达高峰,且稳定表达较长时间;24 h后通过 RT-PCR检测到mRNA表达,Western blot检测到58 kD目的蛋白表达。结论新构建的真核表达重组质粒pEGFP-mDlx5通过鉴定,结构正确:转染到SVZa NSCs后能在其中表达、发挥功能,为后续研究奠定了基础。