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5SrRNA基因间隔区DNA序列在穿心莲道地性中的可行性研究 被引量:2
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作者 李劲平 王培训 +2 位作者 曹柳英 梁瑞叶 张洪建 《中南药学》 CAS 2007年第5期438-440,共3页
目的探讨5SrRNA基因间隔区DNA序列在穿心莲道地性研究中的可行性。方法提取不同产地穿心莲总DNA后,PCR特异扩增5SrRNA基因间隔区,采用荧光标记末端终止子双脱氧末端终止法测序,对测序结果进行多序列联配分析。结果成功得到321bp的5SrRN... 目的探讨5SrRNA基因间隔区DNA序列在穿心莲道地性研究中的可行性。方法提取不同产地穿心莲总DNA后,PCR特异扩增5SrRNA基因间隔区,采用荧光标记末端终止子双脱氧末端终止法测序,对测序结果进行多序列联配分析。结果成功得到321bp的5SrRNA基因间隔区碱基序列,经过多序列联配分析发现,不同产地穿心莲的此段5SrRNA基因间隔区DNA序列之间没有差异。结论5SrRNA基因间隔区DNA序列不适合用于研究穿心莲药材的道地性。 展开更多
关键词 穿心莲 5srrna基因间隔区 DNA测序
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分子进化研究:Ⅱ.5SrRNA序列的分形与分子进化的关系 被引量:1
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作者 黄京飞 刘次全 王莹 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 1992年第3期334-338,共5页
本文根据分形理论的原理和方法,在对现行的计算核酸序列分维的方法进行修改的基础上,对各类生物的80余种5SrRNA序列的分维进行了计算,并结合耗散结构理论就其分维与分子进化的关系问题进行了研究和探讨。作者认为,5SrRNA序列的分维与其... 本文根据分形理论的原理和方法,在对现行的计算核酸序列分维的方法进行修改的基础上,对各类生物的80余种5SrRNA序列的分维进行了计算,并结合耗散结构理论就其分维与分子进化的关系问题进行了研究和探讨。作者认为,5SrRNA序列的分维与其分子进化间的关系是一种复杂的非线性关系,在分子进化的过程中,序列的分维表现为随机涨落。 展开更多
关键词 分子进化 5srrna 分形 分维
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青藏高原近缘野生大麦5SrRNA基因染色体原位杂交定位
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作者 闫玲 丁毅 +2 位作者 陈新平 宋运淳 方呈祥 《武汉植物学研究》 CSCD 2000年第6期443-448,T001,共7页
采用原位杂交技术 ,以 5S r RNA基因为探针 ,对产于青藏高原的 4份近缘野生大麦和栽培大麦 ,即 :二棱野生大麦 H ordeum vulgare L.ssp.spontaneum(Koch) Hsü,六棱野生大麦 H.vulgare L.ssp.agriocrithon(A○ berg) Hsü,六棱... 采用原位杂交技术 ,以 5S r RNA基因为探针 ,对产于青藏高原的 4份近缘野生大麦和栽培大麦 ,即 :二棱野生大麦 H ordeum vulgare L.ssp.spontaneum(Koch) Hsü,六棱野生大麦 H.vulgare L.ssp.agriocrithon(A○ berg) Hsü,六棱瓶形野生大麦 H.vulgare L.ssp.agriocrithon var.lagunculiform(Bakht) Hsü,栽培大麦 H.vulgare.L.进行了研究 ,将杂交结果进行观察与统计 ,并建立起 5S r RNA基因定位的模式图。结果表明 5S r RNA基因在染色体上的位点呈现动态变化 ,由二棱野生大麦、六棱瓶形野生大麦到六棱野生大麦、栽培大麦 ,位点数目有递增的趋势 ,而且位置也发生了某些改变。探讨了 5Sr RNA基因进化与大麦染色体进化间的关系以及原位杂交技术在系统进化研究中的应用。 展开更多
关键词 近缘野生大麦 5srrna基因 原位杂交 系统发育
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军团菌5SrRNA聚合酶链反应方法的建立及应用 被引量:3
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作者 白羽 孔繁学 +2 位作者 郭军巧 孙立华 邱琼 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期412-413,共2页
建立 5SrRNA基因检测军团菌的多聚酶链反应方法 ,扩增参考菌株的染色体DNA (L .Pneumophila1~ 14、L .boze manni、L .dumoffii、L .longbeachae、L .micdadei、L .jordanis) ,均可检出 10 4bp的基因片段 ,敏感性为 8 5 2 10 2 cfu/ml... 建立 5SrRNA基因检测军团菌的多聚酶链反应方法 ,扩增参考菌株的染色体DNA (L .Pneumophila1~ 14、L .boze manni、L .dumoffii、L .longbeachae、L .micdadei、L .jordanis) ,均可检出 10 4bp的基因片段 ,敏感性为 8 5 2 10 2 cfu/ml(平均值 ) ;而扩增 9株非军团菌均为阴性。对模似血标本的检测 ,其敏感性可达 10 3 cfu/ml。检测 17例血标本 ,阳性率为 5 8 8% ( 10 /17) ,与血清学检测和临床诊断治疗结果相符合。结果表明该方法敏感、特异、快速、简便。 展开更多
关键词 5srrna基因 军团菌 聚合酶链反应 军团病 诊断
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哺乳类动物红细胞发育分化过程中5srRNA相对量变化的研究
5
作者 徐炎 胡雪 +2 位作者 唐瑾 杨若明 薛社普 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 1992年第2期159-163,共5页
本文报道兔网织红细胞5srRNA进入小鼠骨髓瘤细胞SP2/0核内,明显地抑制了核内DNA的合成。进而从兔网织红细胞、大鼠胚肝及它们的成熟红细胞,分离提取rRNA,以琼脂糖电泳分析不同发育期红细胞5srRNA、18srRNA、28srRNA组分相对量的变化,又... 本文报道兔网织红细胞5srRNA进入小鼠骨髓瘤细胞SP2/0核内,明显地抑制了核内DNA的合成。进而从兔网织红细胞、大鼠胚肝及它们的成熟红细胞,分离提取rRNA,以琼脂糖电泳分析不同发育期红细胞5srRNA、18srRNA、28srRNA组分相对量的变化,又发现5srRNA量的变化与红细胞终末分化期排核过程呈相对应关系。这些结果表明,哺乳动物红细胞5srRNA可能具有抑制核内DNA合成、终止细胞增殖、导致红细胞进行终末分化和排核的作用。 展开更多
关键词 DNA合成 癌细胞逆转 红细胞 排核
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兔网织红细胞5srRNA对小鼠骨髓瘤细胞SP2/0DNA合成的影响
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作者 徐炎 胡雪 +1 位作者 张佩瑄 薛社普 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 1992年第2期164-168,共5页
本文报道以^(125)Ⅰ-兔网织红细胞5srRNA温育小鼠骨髓瘤细胞SP2/0后的放射自显影实验,及对宿主细胞DNA合成的影响。结果表明,进入小鼠骨髓瘤细胞中的兔网织红细胞5srRNA集中在核内,~3H-TdR参入实验表明,兔网织红细胞5srRNA进入SP2/O核内... 本文报道以^(125)Ⅰ-兔网织红细胞5srRNA温育小鼠骨髓瘤细胞SP2/0后的放射自显影实验,及对宿主细胞DNA合成的影响。结果表明,进入小鼠骨髓瘤细胞中的兔网织红细胞5srRNA集中在核内,~3H-TdR参入实验表明,兔网织红细胞5srRNA进入SP2/O核内后,显著抑制了核内DNA合成和肿瘤细胞的分裂活动。以上结果对哺乳类网织红细胞胞质中存在调控肿瘤细胞生长的负调节因子提供了实验依据。 展开更多
关键词 网织红细胞 DNA合成 肿瘤细胞
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橐吾属药用植物5S rRNA基因间隔区序列与含HPAs植物的鉴别 被引量:5
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作者 张勉 张达治 +2 位作者 许翔鸿 张婷 王峥涛 《中国天然药物》 SCIE CAS CSCD 2005年第1期38-40,共3页
目的对橐吾属Ligularia药用植物的5SrRNA基因间隔区序列进行测定,为含肝毒吡咯里西啶生物碱(HPAs)植物的鉴别提供分子依据。方法对12种橐吾属植物的5SrRNA区序列进行PCR扩增、测序,并运用CLUSTAL、MEGA等软件对所测序列进行了排序、对... 目的对橐吾属Ligularia药用植物的5SrRNA基因间隔区序列进行测定,为含肝毒吡咯里西啶生物碱(HPAs)植物的鉴别提供分子依据。方法对12种橐吾属植物的5SrRNA区序列进行PCR扩增、测序,并运用CLUSTAL、MEGA等软件对所测序列进行了排序、对比和分析。结果建立了12种橐吾属药用植物的5SrRNA区序列数据库,橐吾属植物在该区间具有显著的种间差异,替代数为3~53,变异位点数128个,信息位点数58个。结论含HPAs的橐吾属植物的5SrRNA区序列具有明显而稳定的特异性鉴别位点,可用作该类型植物鉴别的分子标记。 展开更多
关键词 橐吾属 5S rRNA区序列 含HPAs植物 分子鉴别 5srrna基因
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裸子植物5S rRNA基因序列变异及二级结构特征 被引量:4
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作者 刘占林 张大明 王晓茹 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第1期88-96,共9页
在高等植物中 ,5SrRNA基因一级结构是高度保守的 ,二级结构也相当一致。通过比较 18种裸子植物 5SrRNA基因序列和二级结构变异 ,发现 5 5 %的核苷酸位点是可变的 ,这种变异有 68%发生在干区 (双链区 ) ,其中一些变异 ,如双链的互补性核... 在高等植物中 ,5SrRNA基因一级结构是高度保守的 ,二级结构也相当一致。通过比较 18种裸子植物 5SrRNA基因序列和二级结构变异 ,发现 5 5 %的核苷酸位点是可变的 ,这种变异有 68%发生在干区 (双链区 ) ,其中一些变异 ,如双链的互补性核苷酸替代 ,GU配对等能够维系 5SrRNA二级结构的稳定性。环区相对保守 ,这与 5SrRNA三级结构折叠或在转录翻译过程中蛋白质、RNA的结合相关。另外 ,首次报道了松属环E区核苷酸的变异性 ,这可能与其他区域的变异一样 ,是假基因造成的结果。 5SrRNA基因信息可反映大分类群的系统进化关系 ,但由于基因长度短 ,信息量小 。 展开更多
关键词 裸子植物 5srrna基因序列变异 二级结构特征 松属 分子进化
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靶向哺乳动物细胞线粒体的核酸转运 被引量:2
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作者 付爱玲 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期1-4,共4页
线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)的遗传性突变和缺陷是多种线粒体功能失调相关疾病的根本原因。靶向线粒体递送核酸,可从根本上纠正mtDNA突变、挽救mtDNA损伤、阻断疾病进程。哺乳细胞内线粒体的核酸转运途径与细胞核的基因转染大... 线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)的遗传性突变和缺陷是多种线粒体功能失调相关疾病的根本原因。靶向线粒体递送核酸,可从根本上纠正mtDNA突变、挽救mtDNA损伤、阻断疾病进程。哺乳细胞内线粒体的核酸转运途径与细胞核的基因转染大不相同。该文综述了向哺乳动物细胞线粒体递送DNA和RNA(tRNA、rRNA、mRNA和反义RNA)的有效策略,并对其存在问题和发展趋势做一阐述。 展开更多
关键词 线粒体转导 靶向序列 核酸转运 线粒体相关疾病 tRNA载体 5srrna转导 穿梭蛋白
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香菇C91-3 cDNA文库的构建及鉴定
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作者 王晓丽 钟民涛 +3 位作者 李星云 曹婧 宁安红 黄敏 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期3162-3163,共2页
目的构建香菇C91-3 cDNA文库。方法低速离心法收集香菇C91-3菌丝体发酵液中的菌丝,提取总RNA,巢式PCR扩增5SrRNA非转录间隔区2片段并测序鉴定。纯化mRNA,以mRNA为模板进行反转录反应;产物与pBlue-Script II SK(+)载体连接,并转化E.coil ... 目的构建香菇C91-3 cDNA文库。方法低速离心法收集香菇C91-3菌丝体发酵液中的菌丝,提取总RNA,巢式PCR扩增5SrRNA非转录间隔区2片段并测序鉴定。纯化mRNA,以mRNA为模板进行反转录反应;产物与pBlue-Script II SK(+)载体连接,并转化E.coil DH10B,检测库容及插入片段。结果香菇C91-3cDNA文库初始库容为7.2×106cfu,插入片段长度0.4~3.4kb,平均1.5kb。结论成功构建香菇C91-3 cDNA文库,适合用于研究香菇蛋白的编码基因。 展开更多
关键词 香菇 CDNA文库 5srrna非转录间隔区2 距离树 库容
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5s-23srRNA基因间隔区RELP分析对莱姆病病例尿标本的检测 被引量:7
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作者 史翠霞 张哲夫 万康林 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2000年第2期21-23,共3页
作者对来自牡丹江市林业医院和海林林场的34份尿液标本进行了5s-23srRNA基因间隔区RFLP分析,并将PCR检测和血清学检测的结果进行比较。结果表明:8个病人PCR检测结果阳性,7个病人感染了B.garinii(第二基因种)、1个病人感染了B.afz... 作者对来自牡丹江市林业医院和海林林场的34份尿液标本进行了5s-23srRNA基因间隔区RFLP分析,并将PCR检测和血清学检测的结果进行比较。结果表明:8个病人PCR检测结果阳性,7个病人感染了B.garinii(第二基因种)、1个病人感染了B.afzelii(第三基因种),同当地媒介生物中的优势基因种相同;血清学和PCR检测在对病人进行诊断时有互相弥补的作用。5s-23srRNA基因间隔区RFLP分析方法有望在研究临床表现和基因种的关系及流行病学调查中得到广泛应用。 展开更多
关键词 5s-23srRNA基因 RFLP 莱姆病 基因间隔区
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5S rRNA互作蛋白组研究揭示5S rRNA参与mRNA剪接调控
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作者 周祥明 杨兵 +4 位作者 赖巧 李乐 董军 廖建友 朱爽 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期54-62,共9页
为系统揭示5SrRNA调控细胞进程的新功能和分子机制,合成了生物素标记探针,利用分子杂交技术特异捕获5SrRBP,并结合高灵敏度质谱技术和生物信息学分析共鉴定出162个5SrRNA互作蛋白。基于ConsensusPathDB和STRING数据库获取蛋白复合体富... 为系统揭示5SrRNA调控细胞进程的新功能和分子机制,合成了生物素标记探针,利用分子杂交技术特异捕获5SrRBP,并结合高灵敏度质谱技术和生物信息学分析共鉴定出162个5SrRNA互作蛋白。基于ConsensusPathDB和STRING数据库获取蛋白复合体富集信息和构建蛋白与蛋白互作网络,利用GO数据库获取互作蛋白的功能注释,利用KEGG数据库进行通路富集分析。分析结果显示5SrRNA除了与翻译相关蛋白发生互作外,还与大量来自microRNA加工通路、mRNA剪接通路和细胞信号调控通路蛋白有互作。这说明5SrRNA除了具有蛋白质翻译调控功能外,还参与mRNA剪接等过程的调控,为5SrRNA功能和调控机制研究指明了一个新的方向。 展开更多
关键词 5srrna ChIRP-MS 互作蛋白组 mRNA剪接
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Chemical and molecular characterization of Hong Dangshen,a unique medicinal material for diarrhea in Hong Kong
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作者 张艳波 江仁望 +6 位作者 李松林 乔春峰 韩全斌 徐宏喜 黄家乐 毕培曦 邵鹏柱 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS 2007年第3期202-207,共6页
Aim To investigate the plant origin and the identity of the red substance on the surface of Hong Dangshen, a unique medicinal material for diarrhea in Hong Kong. Methods The HPLC fingerprints and 5S rRNA gene spacer s... Aim To investigate the plant origin and the identity of the red substance on the surface of Hong Dangshen, a unique medicinal material for diarrhea in Hong Kong. Methods The HPLC fingerprints and 5S rRNA gene spacer sequences of Hong Dangshen were obtained and compared with those of genuine species of Radix Codonopsis. The X-ray diffraction spectrum of the red substance was analyzed and compared with that of Halloysitum fingerprints to the Codonopsis species and the highest similarity to Rubrum. Results Hong Dangshen showed very similar HPLC Codonopsis pilosula var. modesta in terms of 5S rRNA gene spacer sequences. The X-ray diffraction spectrum of the red substance was consistent with that of Halloysitum Rubrum. Conclusion The source plant of Hong Dangshen was suggested to be Codonopsis pilosula var. modesta, one of the genuine original plants of Radix Codonopsis (Dangshen) in the China Pharmacopoeia (2005 edition). The red substance on the surface of Hong Dangshen was indicated to be Halloysitum Rubrum, a traditional medicinal mineral for chronic diarrhea. Our data suggest that Hong Dangshen is derived from the roots of Codonopsis pilosula var. modesta which has been processed with Halloysitum Rubrum, and the name is suggested to be Radix Codonopsis Praeparata Halloysita Rubra. 展开更多
关键词 Radix Codonopsis Praeparata Halloysita Rubra Codonopsis pilosula var. modesta HPLC 5S rRNA gene spacer X- ray Halloysitum Rubrum LOBETYOLIN
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