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m^(6)A修饰调控的COL6A5对肺腺癌细胞侵袭能力的影响
1
作者
王馨
黄嘉星
+3 位作者
潘辉林
冯正富
汤锐明
邱惠思
《天津医药》
CAS
北大核心
2021年第12期1255-1260,共6页
目的明确6型胶原蛋白α5(COL6A5)在肺腺癌中的表达及意义。方法通过在线数据库及实时荧光定量PCR(qPCR)法检测COL6A5在肺腺癌细胞和组织中的表达。采用GEPIA数据库分析COL6A5的表达量与肺腺癌患者预后的相关性。生物信息学预测结合RNA...
目的明确6型胶原蛋白α5(COL6A5)在肺腺癌中的表达及意义。方法通过在线数据库及实时荧光定量PCR(qPCR)法检测COL6A5在肺腺癌细胞和组织中的表达。采用GEPIA数据库分析COL6A5的表达量与肺腺癌患者预后的相关性。生物信息学预测结合RNA甲基化免疫沉淀-实时荧光定量PCR(MeRIP-qPCR)实验检测COL6A5转录本上的m^(6)A位点。qPCR法检测RNA去甲基酶ALKBH5在肺腺癌组织中的表达量,并分析ALKBH5与COL6A5在27例肺腺癌组织中表达的相关性。qPCR和Western blot检测ALKBH5对COL6A5的抑制作用。生物信息学预测结合Transwell实验和Western blot验证COL6A5在肺腺癌中的作用。结果在线数据库Oncomine分析显示,COL6A5在肺癌中低表达,GEPIA数据库分析显示肺腺癌组织中COL6A5 m RNA表达水平显著低于正常组织(P<0.05)。qPCR结果显示,COL6A5 mRNA在27例肺腺癌组织中的表达量低于癌旁组织;与正常肺上皮细胞相比,COL6A5 mRNA在肺腺癌细胞中的表达量明显受到抑制(P<0.05)。生物信息学预测结合MeRIP-qPCR实验证实,COL6A5 mRNA上存在m^(6)A位点。肺腺癌组织中ALKBH5 mRNA的表达水平高于癌旁正常组织,且与COL6A5 m RNA表达呈负相关(r=-0.599,P<0.01)。在H1299细胞中敲低ALKBH5,可显著上调COL6A5的表达。分析与COL6A5共表达的基因,结果显示COL6A5可能参与调控肺腺癌细胞上皮间质转换、止血和细胞表面相互作用等生命活动。Transwell和Western blot证实,过表达COL6A5可显著抑制H1299细胞的侵袭转移能力。结论 ALKBH5在肺腺癌中下调COL6A5,过表达COL6A5可明显抑制肺腺癌细胞的侵袭转移能力。
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关键词
肺肿瘤
腺癌
肿瘤侵润
胶
原
Ⅵ
型
AlkB同源
蛋白
5
RNA脱甲基酶
计算生物学
6型胶原蛋白α5
m^(
6
)A
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职称材料
题名
m^(6)A修饰调控的COL6A5对肺腺癌细胞侵袭能力的影响
1
作者
王馨
黄嘉星
潘辉林
冯正富
汤锐明
邱惠思
机构
广州医科大学附属第六医院(清远市人民医院)放疗科
出处
《天津医药》
CAS
北大核心
2021年第12期1255-1260,共6页
文摘
目的明确6型胶原蛋白α5(COL6A5)在肺腺癌中的表达及意义。方法通过在线数据库及实时荧光定量PCR(qPCR)法检测COL6A5在肺腺癌细胞和组织中的表达。采用GEPIA数据库分析COL6A5的表达量与肺腺癌患者预后的相关性。生物信息学预测结合RNA甲基化免疫沉淀-实时荧光定量PCR(MeRIP-qPCR)实验检测COL6A5转录本上的m^(6)A位点。qPCR法检测RNA去甲基酶ALKBH5在肺腺癌组织中的表达量,并分析ALKBH5与COL6A5在27例肺腺癌组织中表达的相关性。qPCR和Western blot检测ALKBH5对COL6A5的抑制作用。生物信息学预测结合Transwell实验和Western blot验证COL6A5在肺腺癌中的作用。结果在线数据库Oncomine分析显示,COL6A5在肺癌中低表达,GEPIA数据库分析显示肺腺癌组织中COL6A5 m RNA表达水平显著低于正常组织(P<0.05)。qPCR结果显示,COL6A5 mRNA在27例肺腺癌组织中的表达量低于癌旁组织;与正常肺上皮细胞相比,COL6A5 mRNA在肺腺癌细胞中的表达量明显受到抑制(P<0.05)。生物信息学预测结合MeRIP-qPCR实验证实,COL6A5 mRNA上存在m^(6)A位点。肺腺癌组织中ALKBH5 mRNA的表达水平高于癌旁正常组织,且与COL6A5 m RNA表达呈负相关(r=-0.599,P<0.01)。在H1299细胞中敲低ALKBH5,可显著上调COL6A5的表达。分析与COL6A5共表达的基因,结果显示COL6A5可能参与调控肺腺癌细胞上皮间质转换、止血和细胞表面相互作用等生命活动。Transwell和Western blot证实,过表达COL6A5可显著抑制H1299细胞的侵袭转移能力。结论 ALKBH5在肺腺癌中下调COL6A5,过表达COL6A5可明显抑制肺腺癌细胞的侵袭转移能力。
关键词
肺肿瘤
腺癌
肿瘤侵润
胶
原
Ⅵ
型
AlkB同源
蛋白
5
RNA脱甲基酶
计算生物学
6型胶原蛋白α5
m^(
6
)A
Keywords
lung neoplasms
adenocarcinoma
neoplasm invasiveness
collagen typeⅥ
AlkB homolog
5
,RNA demethylas
computational biology
typeⅥcollagen alpha-
5
chain(COL
6
A
5
)
m^(
6
)A
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
m^(6)A修饰调控的COL6A5对肺腺癌细胞侵袭能力的影响
王馨
黄嘉星
潘辉林
冯正富
汤锐明
邱惠思
《天津医药》
CAS
北大核心
2021
0
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