中国儿童急性淋巴细胞性白血病染色体6q16.3～21区域候选肿瘤抑制基因的定位与鉴定

为了克隆儿童急性淋巴细胞性白血病(ALL)候选肿瘤抑制基因,首先选取分布于6q16.3～21上的11个多态性微卫星标记,对139例中国儿童ALL标本进行杂合性缺失(LOH)分析.分析显示32%的患者存在至少一个位点的LOH,且高频缺失区位于D6S1709～D6S301之间,大小为2cM.各位点LOH与白细胞总数、病态细胞数有显著性相关(P<0.05),与年龄、性别、形态学分型和免疫学分型无显著相关(P>0.05).进一步在高频缺失区域内,采用定位候选克隆策略、生物信息学技术及RT-PCR技术筛选、鉴定与儿童ALL相关的候选肿瘤抑制基因及其cDNA片段.在D6S1709～D6S301之间筛选到一个在儿童ALL细胞中低表达的EST(GenBank登录号:AA403058),与正常外周血单个核细胞比较,在15例ALL患者中有10例表达下调(P<0.05).采用数字化差异表达分析显示,位于6q16.3～21区域内的AMD1基因、PPIL6基因和WASF1基因在肿瘤组织中的表达丰度要低于正常组织(P<0.05).上述结果为进一步在6q16.3～21区域克隆肿瘤抑制基因提供了线索.

急性淋巴细胞白血病6q16.3微卫星DNA缺失及临床相关性研究

目的定位儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)杂合性缺失(LOH)的集中区,探讨新的肿瘤抑制基因及与临床相关性。方法取6q16.3的15个微卫星,利用聚合酶链反应-变性凝胶电泳-银染技术分析儿童ALL等位基因LOH的情况,进行生物信息学分析;探讨与临床预后因素的相关性。结果至少一个位点的LOH率为32.7%,D6S1709-D6S1028及D6S2160-D6S1580是集中高频缺失区,早期复发病例的LOH率高于无早期复发病例;谷氨酸受体6基因(GRIK2)为一有力的候选抑癌基因;两个区域有可能代表新基因的表达序列标签12个;LOH与白细胞总数、病态细胞数、核型分析、早期复发及免疫分型有相关性。结论D6S1709-D6S1028和D6S2160-D6S1580为目前国内外所确定的最精确缺失区,可能存在一个或数个肿瘤抑制基因,6q16.3LOH的发生与ALL预后有一定关系。

染色体6q16.3区域一个与儿童急性淋巴细胞白血病相关表达序列标记的鉴定

目的 寻找染色体6q16. 3区域与儿童急性淋巴细胞性白血病(ALL)相关的表达序列标记(EST),为筛选儿童ALL候选基因打下基础。方法 运用生物信息学同源性比较筛选EST的策略,结合逆转录PCR方法,检测6q16. 3区域的相关EST在儿童ALL淋巴细胞和正常淋巴细胞中的表达。结果 在6q16. 3区域筛选到一个在儿童ALL细胞中低表达的ESTAA403058,与正常淋巴细胞相比较,在10例儿童ALL淋巴细胞中的7例其表达下调(P<0. 001)。结论 染色体6q16. 3区域ESTAA403058在儿童ALL中表达下调,提示其可能参与儿童ALL癌变过程,为克隆儿童ALL相关基因提供了新线索。

儿童急性淋巴细胞白血病6q16.3微卫星DNA缺失及生物信息学分析

目的定位儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)杂合性缺失(LOH)的集中区域,探索新的肿瘤抑制基因。方法取6q16.3的15个微卫星标记,用聚合酶链反应-变性凝胶电泳-银染技术对165例 ALL 患儿等位基因 LOH 的情况进行生物信息学分析;同时分析其与临床预后因素的相关性。结果至少1个位点的 LOH 率为32.7%,D6S1709-D6S1028及 D6S2160-D6S1580是高频率集中缺失的区域,早期复发患儿的 LOH 率高于无早期复发患儿;谷氨酸受体6基因(GRIK2)可能为抑癌基因,2个区域存在可能代表新基因的表达序列标签12个。微卫星 LOH 与白细胞计数、病态细胞数、核型分析、早期复发均有相关性(P 值均<0.05)。结论 D6S1709-D6S1028和 D6S2160-D6S1580为目前国内外所确定的最精确缺失区,该区域可能存在1个或数个肿瘤抑制基因,6q16.3的 LOH 的发生与 ALL预后有一定关系。

6q14.1q16.3缺失致胎儿多发畸形一例

6号染色体长臂近端缺失是一种罕见的染色体疾病,常表现为智力低下、发育迟缓和特殊面容等异常。回顾性分析1例多发畸形胎儿的遗传学病因。该病例于2022年12月13日(孕21+1周)因超声提示胎儿多发畸形、无创产前筛查(noninvasive prenatal testing,NIPT)提示胎儿6号染色体异常高风险而行羊膜腔穿刺术,进行常规G显带染色体核型分析和拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq),同时对其父母的染色体核型进行检测。羊水常规G显带染色体核型分析示:46,XX,del(6)(q14q16);羊水CNV-seq结果示:6q14.1q16.3(80960000-104640000)区存在23.68 Mb的缺失。综合上述结果考虑该缺失是造成胎儿多发畸形的原因。CNV-seq有利于确定胎儿染色体异常的断裂点,为预测胎儿发生畸形的风险及后续的遗传咨询提供依据,同时丰富了6号染色体长臂近端缺失的产前临床表型谱。