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蓝舌病新疆分离株VP7蛋白编码基因序列分析及一步法RT-PCR方法的建立
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作者 马晓菁 谷文喜 +5 位作者 叶锋 刘帅 刘丽娅 谢彩云 钟旗 易新萍 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期253-259,共7页
【目的】分析蓝舌病新疆分离株编码VP7蛋白S7基因保守序列,建立蓝舌病新疆分离株一步法RT-PCR方法,为新疆BTV分子流行病学调查及防控提供技术支持。【方法】采用二代测序技术获得新疆分离株S7基因序列,登陆GenBank对序列进行同源性Blas... 【目的】分析蓝舌病新疆分离株编码VP7蛋白S7基因保守序列,建立蓝舌病新疆分离株一步法RT-PCR方法,为新疆BTV分子流行病学调查及防控提供技术支持。【方法】采用二代测序技术获得新疆分离株S7基因序列,登陆GenBank对序列进行同源性Blast比对,用软件MEGA 5.0分析序列差异,根据蓝舌病新疆分离株编码VP7蛋白S7基因保守序列,运用软件Oligo6.0设计引物,对蓝舌病新疆分离株S7基因进行RT-PCR扩增,并验证该方法的特异性及敏感性。【结果】蓝舌病中国新疆分离株编码VP7蛋白S7基因序列与哈尔滨报道BTV分离株S7基因片段相似度较高为89.64%,与中国云南报道BTV-29型分离株、蒙古国BTV分离株S7基因片段相似度分别为87.49%和87.39%;与德国BTV分离株S7基因片段相似度为80.70%,其余均无同源性序列。中国新疆分离株S7基因片段序列与4条同源序列间存在26处核苷酸差异,9处氨基酸差异。【结论】建立的蓝舌病中国新疆分离株S7基因片段一步法RT-PCR方法具有良好的特异性,仅BTV中国新疆分离株扩增获得目的条带,该方法的敏感性为4.0×10^(3)copies/mL。 展开更多
关键词 蓝舌病 VP7蛋白 RT-PCR
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HPV DNA、HPV E6/E7蛋白和TCT在宫颈上皮内瘤变及宫颈癌筛查中的价值
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作者 何立群 张舒云 +1 位作者 袁婧 吕艳婷 《中国现代医生》 2024年第10期28-31,共4页
目的 探讨人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)DNA、HPV E6/E7蛋白和液基薄层细胞学检查(thin-prep cytology test,TCT)在宫颈上皮内瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)及宫颈癌筛查中的价值。方法 选取2021年7月至2022... 目的 探讨人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)DNA、HPV E6/E7蛋白和液基薄层细胞学检查(thin-prep cytology test,TCT)在宫颈上皮内瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)及宫颈癌筛查中的价值。方法 选取2021年7月至2022年6月于诸暨市人民医院妇科接受早期宫颈癌筛查的成年女性190例为研究对象,分别进行HPV DNA、HPVE6/E7蛋白及TCT检测,并进一步行阴道镜活检检查。比较不同病变患者的HPVDNA、HPVE6/E7蛋白和TCT对高级别病变的诊断效能。结果 CIN3及宫颈癌患者的HPV DNA、HPV E6/E7蛋白、TCT检查及三者联合检测的阳性率均显著高于宫颈炎患者(P<0.05),宫颈癌患者的HPV DNA、HPV E6/E7蛋白、TCT检查及三者联合检测的阳性率均显著高于CIN1患者(P<0.05)。CIN2+患者的HPV DNA、HPV E6/E7蛋白、TCT及三者联合检测的阳性率显著高于CIN1-患者。HPVDNA、HPVE6/E7蛋白、TCT三者联合诊断高级别病变的敏感度、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别为90.80%、30.10%、52.32%、79.48%。结论 HPV DNA、HPV E6/E7蛋白及TCT可作为筛查宫颈癌和癌前病变的手段,且三者联合检测的敏感度最高。 展开更多
关键词 HPV DNA HPV E6/E7蛋白 液基薄层细胞学检查 上皮内瘤变 宫颈癌筛查
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结直肠癌组织中miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白的表达变化及其意义
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作者 周婵 冼丽英 +3 位作者 李娜 卢碧燕 袁锦玉 徐咏强 《山东医药》 CAS 2024年第9期82-85,共4页
目的观察结直肠癌(CRC)组织中miR-138-5p、miR-876-5p、DNA损伤结合蛋白1和CUL4相关因子7(DCAF7)蛋白的表达变化,并探讨其临床意义。方法CRC患者98例,均接受手术治疗,术中留取CRC组织和癌旁组织,采用Real-time PCR法检测CRC组织和癌旁... 目的观察结直肠癌(CRC)组织中miR-138-5p、miR-876-5p、DNA损伤结合蛋白1和CUL4相关因子7(DCAF7)蛋白的表达变化,并探讨其临床意义。方法CRC患者98例,均接受手术治疗,术中留取CRC组织和癌旁组织,采用Real-time PCR法检测CRC组织和癌旁组织中miR-138-5p、miR-876-5p,采用蛋白印迹法检测CRC组织和癌旁组织中DCAF7蛋白,分析miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量与CRC患者临床病理参数的关系。以CRC组织中miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量的中位数为临界值,将CRC患者分为miR-138-5p高表达组和miR-138-5p低表达组、miR-876-5p高表达组和miR-876-5p低表达组、DCAF7蛋白高表达组和DCAF7蛋白低表达组,并分析miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量与CRC患者预后的关系。结果CRC组织中miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量分别为1.36±0.29、1.41±0.36、0.59±0.19,癌旁组织中miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量分别为2.15±0.48、2.08±0.44、0.20±0.08,两者相比,P均<0.05。miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量与CRC患者是否合并淋巴结转移、TNM分期、浸润深度有关(P均<0.05)。miR-138-5p低表达组3年总体生存率为67.3%,miR-138-5p高表达组3年总体生存率为86.6%,两组相比,P<0.05。miR-876-5p低表达组3年总体生存率为66.7%,miR-876-5p高表达组3年总体生存率为85.1%,两组相比,P<0.05。DCAF7蛋白高表达组3年总体生存率为67.2%,DCAF7蛋白低表达组3年总体生存率为87.5%,两组相比,P<0.05。结论CRC组织中miR-138-5p低表达、miR-876-5p低表达、DCAF7蛋白高表达,miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量与CRC患者是否合并淋巴结转移、TNM分期、浸润深度有关。与miR-138-5p高表达、miR-876-5p高表达、DCAF7蛋白低表达的CRC患者相比,miR-138-5p低表达、miR-876-5p低表达、DCAF7蛋白高表达的CRC患者术后3年总体生存率低。 展开更多
关键词 微小RNA-138-5p 微小RNA-876-5p DNA损伤结合蛋白1和CUL4相关因子7 结直肠癌
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光化性角化病病人皮肤组织Toll样受体7蛋白表达及其临床意义
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作者 刘珈言 李二龙 +4 位作者 梅蓉 杨礼凤 赵文彬 韩成龙 周慧 《安徽医药》 CAS 2023年第11期2203-2206,共4页
目的探讨光化性角化病(AK)病人皮肤组织中Toll样受体7(TLR7)蛋白表达及其对AK病人预后的预测效能。方法选取2015年1月至2019年1月四川大学华西医院收集的134例AK病人的皮肤蜡块标本作为观察组,选取同时期收集的129例健康人员的皮肤蜡块... 目的探讨光化性角化病(AK)病人皮肤组织中Toll样受体7(TLR7)蛋白表达及其对AK病人预后的预测效能。方法选取2015年1月至2019年1月四川大学华西医院收集的134例AK病人的皮肤蜡块标本作为观察组,选取同时期收集的129例健康人员的皮肤蜡块标本作为对照组。采用免疫组化法测定两组皮肤组织的TLR7蛋白表达情况,比较两组皮肤组织TLR7蛋白表达水平。对观察组病人随访3年,根据是否发展为皮肤鳞状细胞癌(cSCC)分为癌变组和非癌变组,对比癌变组与非癌变组皮肤组织中TLR7蛋白表达水平,采用单因素分析和logistic回归模型分析AK病人进展为cSCC的影响因素,采用受试者操作特征(ROC)曲线分析皮肤组织TLR7蛋白表达水平对AK病人发生cSCC的预测效能。结果观察组皮肤组织中TLR7蛋白表达水平高于对照组(23.76±3.90比4.95±0.64)(P<0.05);AK病人cSCC发生率为15.67%;癌变组与非癌变组皮肤病史、病程、病理类型比较差异无统计学意义(P>0.05),癌变组年龄高于非癌变组(P<0.05),男性、Fitzpatrick皮肤分型为Ⅰ/Ⅱ型的比例及皮肤组织TLR7蛋白表达量高于非癌变组(P<0.05);高龄、男性、Fitzpatrick皮肤分型为Ⅰ/Ⅱ型、皮肤组织TLR7蛋白高表达均为AK病人癌变发生的独立危险因素(P<0.05),且该模型拟合效果良好(P>0.05);皮肤组织TLR7蛋白表达预测AK病人进展为cSCC的ROC曲线的截断值25.34,灵敏度80.95%,特异度81.42%,ROC曲线下面积0.81,95%CI:(0.74,0.88)。结论AK病人皮肤组织中TLR7蛋白的表达量升高,且是AK病人继发cSCC的独立危险因素,对AK病人的预后具有良好预测效能。 展开更多
关键词 角化病 光化性 Toll样受体7蛋白 危险因素 预测效能
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S100A7蛋白在宫颈鳞癌中的表达分析
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作者 傅宏 崔竹梅 《临床医学进展》 2023年第3期3402-3407,共6页
目的:分析S100A7蛋白的表达量与宫颈鳞癌患者各个临床病理指标之间的关系,探讨该蛋白在宫颈鳞癌中的表达与肿瘤分化、侵袭、转移之间的关系。方法:选取2016年5月至2021年4月因宫颈鳞癌在青岛大学附属医院妇科行手术切除的标本49例,采用... 目的:分析S100A7蛋白的表达量与宫颈鳞癌患者各个临床病理指标之间的关系,探讨该蛋白在宫颈鳞癌中的表达与肿瘤分化、侵袭、转移之间的关系。方法:选取2016年5月至2021年4月因宫颈鳞癌在青岛大学附属医院妇科行手术切除的标本49例,采用免疫组化的方法,对S100A7蛋白进行半定量分析,收集整理宫颈鳞癌患者的临床病理信息,运用统计学方法分析S100A7蛋白表达量与各临床病理参数之间的关系。结果:宫颈鳞癌中,S100A7蛋白的表达量与肿瘤分化、淋巴结转移有关,与发病年龄、肿瘤大小、FIGO分期、脉管转移无关。结论:S100A7蛋白与宫颈鳞癌分化、淋巴结转移有关,S100A7蛋白表达上调可能与宫颈鳞癌发生、进展、侵袭、转移有关。 展开更多
关键词 S100A7蛋白 HPV 宫颈鳞癌
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红嘴鸥TLR7蛋白多克隆抗体制备及在DF-1细胞中的表达特征分析
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作者 任胜杰 申宏利 +6 位作者 项勋 代飞燕 朱茂银 邬佳莉 胡志辉 段纲 常华 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期2865-2875,共11页
【目的】制备红嘴鸥Toll样受体7(Toll-like receptor 7,TLR7)蛋白多克隆抗体,分析红嘴鸥TLR7蛋白在DF-1细胞中的表达特征,为深入了解红嘴鸥TLR7蛋白功能及作用机制提供材料。【方法】设计引物扩增红嘴鸥TLR 7基因CDS区,并构建其原核表... 【目的】制备红嘴鸥Toll样受体7(Toll-like receptor 7,TLR7)蛋白多克隆抗体,分析红嘴鸥TLR7蛋白在DF-1细胞中的表达特征,为深入了解红嘴鸥TLR7蛋白功能及作用机制提供材料。【方法】设计引物扩增红嘴鸥TLR 7基因CDS区,并构建其原核表达载体与真核表达载体。将重组原核表达质粒pET32a-TLR7转化大肠杆菌Transetta(DE3)感受态细胞进行重组蛋白体外诱导表达,并对其诱导温度、诱导时间和IPTG浓度进行优化筛选。选用新西兰大白兔制备多克隆抗体,采用间接ELISA法检测血清抗体价效,利用Western blotting鉴定抗体特异性。将真核表达质粒pcDNA3.1-TLR7转染至DF-1细胞中过表达,利用间接免疫荧光技术检测红嘴鸥TLR7蛋白在转染DF-1细胞后不同时间点的表达特征。【结果】红嘴鸥TLR 7基因CDS区长约1182 bp,双酶切结果显示出2组大小不同的2条片段,分别为5900、1182 bp(原核表达载体)和5428和1182 bp(真核表达载体),测序后表明原核表达载体与真核表达载体构建成功。体外诱导温度为30℃、IPTG终浓度为1.0 mmol/L时培养5 h得到以包涵体形式大量表达的重组蛋白,蛋白大小为63 ku。间接ELISA法检测抗血清效价为1∶256000以上。Western blotting检测结果表明,制备的多克隆抗体具有较好的特异性。间接免疫荧光结果显示,转染DF-1细胞2 h后即可观察到绿色荧光,随着时间增加绿色荧光密度逐渐增加,且绿色荧光大部分聚集在细胞核及周围,少部分散布在细胞质中。【结论】原核表达的红嘴鸥TLR7蛋白具有良好的免疫原性,制备的多克隆抗体具有较高的反应性和特异性,TLR7蛋白可在DF-1细胞中成功表达。 展开更多
关键词 红嘴鸥 TLR7蛋白 多克隆抗体 DF-1细胞 表达
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猪δ冠状病毒NS7蛋白单克隆抗体制备及其抗原表位鉴定
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作者 谢思汉 马睿林 +2 位作者 牟春晓 施开创 陈振海 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS 北大核心 2023年第2期19-26,共8页
猪δ冠状病毒(PDCoV)是1种新型猪冠状病毒,该病毒对各年龄段的猪均易感,尤其是对新生仔猪具有较高的致病性,可引起严重腹泻和高病死率。为获得抗PDCoV NS7和NS7a蛋白的单克隆抗体,先以PDCoV-GX2021-1毒株为模板扩增目的基因并构建原核... 猪δ冠状病毒(PDCoV)是1种新型猪冠状病毒,该病毒对各年龄段的猪均易感,尤其是对新生仔猪具有较高的致病性,可引起严重腹泻和高病死率。为获得抗PDCoV NS7和NS7a蛋白的单克隆抗体,先以PDCoV-GX2021-1毒株为模板扩增目的基因并构建原核表达载体,经IPTG诱导表达和SDS-PAGE切胶洗脱方法纯化目的蛋白。再按照免疫程序免疫小鼠并运用间接免疫荧光试验检测小鼠血清中特异性抗体;将血清阳性的小鼠脾细胞与骨髓瘤细胞融合后进行亚克隆筛选,获得1株可持续传代并产生抗NS7和NS7a蛋白抗体的单克隆杂交瘤细胞(命名为1-A08)。运用间接免疫荧光试验鉴定该单抗可特异性标记PDCoV感染细胞,Western blot和IP试验发现该单抗可特异性结合NS7和NS7a蛋白。此外,通过Western blot试验鉴定出该单抗的B细胞线性表位为111PSTLEED117。将该单抗的抗原表位序列与NCBI中发布的168株PDCoV NS7蛋白这一区域的氨基酸序列进行比对分析,发现该单抗的抗原表位较为保守,与其中160株的氨基酸序列一致。 展开更多
关键词 猪δ冠状病毒 NS7蛋白 原核表达 单克隆抗体
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糖尿病大鼠肾小管上皮细胞转化与肝细胞生长因子和Smad7蛋白的表达 被引量:11
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作者 刘青娟 何宁 +3 位作者 刘淑霞 王丽晖 史永红 段惠军 《中国危重病急救医学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第11期675-678,F0005,共5页
目的探讨糖尿病肾病(DN)时肾小管上皮细胞转化以及肝细胞生长因子(HGF)、Smad7蛋白在其中可能发挥的作用。方法60只Wistar大鼠均行右肾切除术,伤口愈合后随机分为右肾切除对照组和糖尿病组。腹腔注射链脲佐菌素诱发大鼠糖尿病模型。采... 目的探讨糖尿病肾病(DN)时肾小管上皮细胞转化以及肝细胞生长因子(HGF)、Smad7蛋白在其中可能发挥的作用。方法60只Wistar大鼠均行右肾切除术,伤口愈合后随机分为右肾切除对照组和糖尿病组。腹腔注射链脲佐菌素诱发大鼠糖尿病模型。采用免疫组化法检测角蛋白18(CK18)、α平滑肌肌动蛋白(αSMA)、HGF和Smad7蛋白的表达;流式细胞术检测αSMA和HGF的表达;蛋白质免疫印迹法检测Smad7蛋白的表达。结果糖尿病组较对照组CK18的表达降低,αSMA的表达上升,HGF和Smad7蛋白的表达表现为先上升后下降。结论糖尿病时,肾小管上皮细胞可发生表型转化,转化为肌成纤维细胞。HGF和Smad7蛋白表达下降可能与该模型中肾小管上皮细胞转化有关。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 表型转化 肝细胞生长因子 SMAD7蛋白
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蓝舌病病毒重组VP7蛋白单克隆抗体制备及竞争ELISA检测方法的建立 被引量:9
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作者 耿宏伟 秦永丽 +11 位作者 李俊平 杨涛 孙恩成 刘霓红 白安斌 徐青元 王凌凤 赵晶 覃绍敏 林俊 郭怡璠 吴东来 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期388-392,共5页
为了建立蓝舌病(BT)的血清学诊断方法,本研究利用原核表达的蓝舌病病毒(BTV)血清型12型VP7纯化蛋白免疫BALB/c小鼠,制备2株单克隆抗体(MAb),分别命名为BTV-2D10和BTV-4H7。IFA试验表明,2株MAb均能与BTV 24个血清型发生特异性反应,而与... 为了建立蓝舌病(BT)的血清学诊断方法,本研究利用原核表达的蓝舌病病毒(BTV)血清型12型VP7纯化蛋白免疫BALB/c小鼠,制备2株单克隆抗体(MAb),分别命名为BTV-2D10和BTV-4H7。IFA试验表明,2株MAb均能与BTV 24个血清型发生特异性反应,而与茨城病病毒(IBAV)、中山病病毒(CV)、赤羽病病毒(AKAV)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)、牛轮状病毒(BRV)、牛肠道病毒(BEV)、牛呼肠孤病毒(RV)及口蹄疫病毒(FMDV)无交叉反应,表明2株MAb均为BTV群特异性抗体。采用重组表达的VP7蛋白作为包被抗原建立的竞争ELISA方法证明,BTV-4H7 MAb对不同血清型BTV阳性血清具有良好的阻断效果,而对AKAV、IBAV、BRV和FMDV阳性血清无阻断作用。本研究建立的竞争ELISA方法与IDEXX公司的试剂盒检测包括65份已知背景血清和322份采自广西省的山羊血清样品,检测结果符合率分别达100%和98%。该竞争ELISA方法的建立为BTV抗体的监测提供了安全、快速、准确的技术手段。 展开更多
关键词 蓝舌病病毒 重组VP7蛋白 群特异性单克隆抗体 竞争ELISA
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猪轮状病毒重组VP7蛋白抗原间接ELISA诊断方法的建立 被引量:5
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作者 时洪艳 冯力 +3 位作者 陈建飞 孙东波 崔晓臣 王承宝 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期233-237,共5页
本研究以纯化的原核表达的猪轮状病毒VP7抗原表位区域为抗原,建立了检测猪轮状病毒抗体的间接ELISA诊断方法。特异性试验表明,该抗原与其他7种常见猪病病毒(TGEV、PEDV、CSFV、PCV2、PRRSV、PPV、PrV)的阳性血清不发生交叉反应,批内和... 本研究以纯化的原核表达的猪轮状病毒VP7抗原表位区域为抗原,建立了检测猪轮状病毒抗体的间接ELISA诊断方法。特异性试验表明,该抗原与其他7种常见猪病病毒(TGEV、PEDV、CSFV、PCV2、PRRSV、PPV、PrV)的阳性血清不发生交叉反应,批内和批间重复性试验的变异系数均小于10%;对来自不同猪场的血清的检测结果表明,该ELISA方法与中和试验检测结果符合率达94.8%。本试验建立的ELISA诊断方法具有良好的重复性、敏感性和特异性,为PRV的快速诊断、免疫猪群抗体监测和轮状病毒流行病学调查提供了一种快速、简便的血清学诊断方法。 展开更多
关键词 猪轮状病毒 重组VP7蛋白 间接ELISA 诊断
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哮喘大鼠肺组织TGF-β1与Smad3、Smad7蛋白的变化及不同中医治法对其的影响 被引量:7
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作者 许朝霞 李学良 +5 位作者 钱鹏 李娜 燕海霞 郭睿 郝一鸣 陈理君 《环球中医药》 CAS 2012年第12期900-904,共5页
目的探讨转化生长因子-β1(TGF-β1)和Smads蛋白在哮喘大鼠肺组织中的变化及宣肺、固本、宣肺固本三种中医治法(宣肺方、固本方、宣肺固本方)对其的影响。方法以卵蛋白复制大鼠哮喘模型,并用不同中医治法(宣肺方、固本方、宣肺固本方)... 目的探讨转化生长因子-β1(TGF-β1)和Smads蛋白在哮喘大鼠肺组织中的变化及宣肺、固本、宣肺固本三种中医治法(宣肺方、固本方、宣肺固本方)对其的影响。方法以卵蛋白复制大鼠哮喘模型,并用不同中医治法(宣肺方、固本方、宣肺固本方)对其进行干预。在激发哮喘并治疗4周后处死,观察各组大鼠肺系数的变化,并用免疫组化法检测大鼠支气管肺组织中TGF-β1和Smad3、Smad7蛋白的表达。结果经治疗后,(1)哮喘大鼠的肺系数有不同程度的升高,中药治疗组与地塞米松组间的差异有统计学意义;(2)哮喘大鼠支气管肺组织TGF-β1、Smad3蛋白的表达水平升高,而Smad7蛋白的表达下降,三种中医治法对其均有影响,宣肺固本治法优于其他治法,有统计学意义。结论哮喘大鼠气道重建模型中TGF-β1、Smad3蛋白与气道重塑呈正相关,而Smad7蛋白则与气道重塑呈负相关;中医宣肺固本法治疗哮喘气道重建可能与调节TGF-β1和Smad3、Smad7蛋白的表达水平有关。 展开更多
关键词 哮喘 转化生长因子-β SMAD3蛋白 SMAD7蛋白 肺系数
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HCV p7蛋白反式调节基因p7TP2的克隆化及生物信息学分析 被引量:6
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作者 袁菊 郭江 +5 位作者 成军 陶明亮 蓝贤勇 洪源 靳亚平 毛羽 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2006年第6期581-587,共7页
目的:克隆HCV p7蛋白反式调节未知功能新基因p7TP2,构建其真核表达载体,并应用生物信息学初步探讨其结构及功能.方法:应用PCR技术从HepG2细胞提取的 cDNA扩增p7TP2基因,选用pGEM-T载体进行TA克隆,通过PCR,限制性酶切分析及测序进行鉴定... 目的:克隆HCV p7蛋白反式调节未知功能新基因p7TP2,构建其真核表达载体,并应用生物信息学初步探讨其结构及功能.方法:应用PCR技术从HepG2细胞提取的 cDNA扩增p7TP2基因,选用pGEM-T载体进行TA克隆,通过PCR,限制性酶切分析及测序进行鉴定,再将其亚克隆到真核表达载体 pcDNATM3.1/myc-His A,通过PCR,限制酶切分析进行鉴定,并应用生物信息学初步分析其物理化学性质、蛋白质结构域、功能及染色体定位.结果:成功从HepG2细胞提取的cDNA中扩增出p7TP2基因,编码区为495核苷酸(nt),编码产物为164氨基酸残基(aa),经核苷酸序列数据库(GenBank)同源序列的搜寻,与已知基因序列和蛋白序列之间没有显著同源性,属于未知功能新基因,并成功进行TA克隆,酶切、测序均正确,并进一步亚克隆至pcDNATM3.1/ myc-His A真核表达载体,生物信息学分析此基因位于8q24.3,Mr17 146.5,理论pI:9.26,半衰期为30 h(体外哺乳类网状细胞),属于不稳定蛋白,疏水指数较高,含有潜在的三个螺旋区域,四个β折叠,四个蛋白激酶C磷酸化位点, 一个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,5个N-肉豆蔻酰位点,预测可能为具有不紧密的球蛋白结构,具有信号肽及两个跨膜结构域.结论:发现了HCV p7反式调节新的靶基因, 构建了pcDNATM3.1/myc-HisA真核表达载体. 展开更多
关键词 HCV p7蛋白 反式调节基因 克隆化 生物 信息学分析
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E7蛋白在HPV16变异体持续感染患者宫颈组织中的表达 被引量:6
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作者 周爱枝 段迎春 +4 位作者 李进 张爱 戴晓莉 赵云燕 张蕾 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2017年第5期739-742,共4页
目的:探索HPV16亚洲变异体E6 T178G及欧洲变异体E6 T350G,A442C与其他变异体致宫颈病变及机制的异同。方法:选取浦东新区人民医院门诊或住院患者中HPV16型单一阳性、宫颈细胞学正常的300例研究对象,予宫颈液基薄层细胞学检查(Thinprep c... 目的:探索HPV16亚洲变异体E6 T178G及欧洲变异体E6 T350G,A442C与其他变异体致宫颈病变及机制的异同。方法:选取浦东新区人民医院门诊或住院患者中HPV16型单一阳性、宫颈细胞学正常的300例研究对象,予宫颈液基薄层细胞学检查(Thinprep cytologic test,TCT)采集宫颈脱落细胞,对其E2、E6、E7基因序列进行检测;1年后复查TCT、HPV,持续感染者再次基因测序明确HPV16变异体分型,并对持续感染者进行阴道镜活检后病理检查,对所有患者均用SP免疫组化法检测E7蛋白表达水平。结果:HPV16变异体持续感染1年后,292例成功测序的患者中,259例慢性宫颈炎,32例宫颈上皮内瘤变Ⅰ级(CINI),1例宫颈上皮内瘤变Ⅰ级(CINⅡ)。E7蛋白在各种变异体感染的患者宫颈组织中均有表达,其在亚洲变异体及欧洲变异体感染组与其他变异体感染组之间表达无明显差异(P>0.05)。结论:E7蛋白可能在HPV16变异体致宫颈病变的早期阶段即发挥作用,但E7蛋白可能并不是HPV16不同变异体致宫颈病变机制不同的参考指标。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 E7蛋白 变异体
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应用抑制性消减杂交技术克隆和筛选HCVp7蛋白的反式调节基因 被引量:6
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作者 郭江 成军 +4 位作者 纪冬 赵龙凤 王建军 刘妍 黄燕萍 《世界华人消化杂志》 CAS 2004年第11期2590-2593,共4页
目的:构建丙型肝炎病毒HCV p7蛋白反式激活相关基因差异表达的差异cDNA,克隆HCV p7蛋白反式激活相关基因. 方法:以HCV p7表达质粒pcDNA3.1(-)-p7转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后的细胞裂解液,从中提取mRNA并合成cD... 目的:构建丙型肝炎病毒HCV p7蛋白反式激活相关基因差异表达的差异cDNA,克隆HCV p7蛋白反式激活相关基因. 方法:以HCV p7表达质粒pcDNA3.1(-)-p7转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后的细胞裂解液,从中提取mRNA并合成cDNA,经Rsa Ⅰ酶切后将实验组cDNA分成两组,分别与两种不同的接头衔接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库,并转染大肠杆菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR后进行测序及同源性分析. 结果:成功构建人HCV p7蛋白反式激活相关基因差异表达的cDNA.扩增后得到56个200-1 000 bp插入片段的克隆, 随机挑选其中33个插入片段测序,并通过生物信息学分析获得其全长基因序列,结果共获得15种编码基因,其中1个为未知功能的新基因. 结论:筛选到的cDNA全长序列,包括与细胞生长调节、物质代谢、和细胞凋亡密切相关的一些蛋白编码基因. 展开更多
关键词 抑制性消减杂交技术 克隆 筛选 HCVp7蛋白 反式调节基因
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人乳头状瘤病毒持续感染状态下E6、E7蛋白mRNA在宫颈癌不同分期的表达结果 被引量:15
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作者 李玲 张秋莹 刘杨 《检验医学与临床》 CAS 2016年第4期514-516,共3页
目的探讨人乳头状瘤病毒(HPV)持续感染状态下E6、E7蛋白mRNA在宫颈癌不同分期的表达。方法选择2012年8月至2015年8月该院收治的宫颈癌患者91例。TNM分期为Ⅰ期32例,Ⅱ期29例,Ⅲ期30例。另选同期该院体检的42例宫颈慢性炎性患者进行对... 目的探讨人乳头状瘤病毒(HPV)持续感染状态下E6、E7蛋白mRNA在宫颈癌不同分期的表达。方法选择2012年8月至2015年8月该院收治的宫颈癌患者91例。TNM分期为Ⅰ期32例,Ⅱ期29例,Ⅲ期30例。另选同期该院体检的42例宫颈慢性炎性患者进行对照。所有患者宫颈组织标本实施超薄液基细胞学检查(TCT),并做HPV E6/E7mRNA及HPV DNA检测,比较各种方法的检测结果,分析HPV E6/E7mRNA与宫颈癌分期的相关性及与HPV DNA检测的一致性。结果慢性炎性HPV DNA阳性检出率较HPV E6/E7mRNA更高,而宫颈癌Ⅰ~Ⅲ期的HPV E6/E7mRNA阳性检出率更高,但差异无统计学意义(P〉0.05)。随着宫颈病变程度增加,HPV E6/E7mRNA及HPV DNA的相对拷贝值均逐渐增大,不同宫颈癌分期的患者HPV E6/E7mRNA及HPV DNA的相对拷贝值差异均有统计学意义(P〈0.05)。HPV E6/E7mRNA阳性检出率及相对拷贝值与宫颈癌分期均呈正相关,且与HPVDNA检测具有较好的一致性。结论HPV持续感染状态下E6、E7蛋白mRNA的表达与宫颈癌不同分期有关,HPV E6/E7mRNA检测有助于早期判断宫颈癌病情进展,具有临床价值。 展开更多
关键词 人乳头状瘤病毒 E6、E7蛋白mRNA 宫颈癌 不同分期
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猪传染性胃肠炎病毒ORF7蛋白在ST细胞中定位及其对病毒复制影响的研究 被引量:4
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作者 何雷 董玲娟 +6 位作者 张彦明 宋嘉兴 郁川 余祖华 张春杰 丁轲 赵战勤 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期543-548,共6页
为研究猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)ORF7蛋白的亚细胞定位及其在TGEV复制中的作用。本研究通过RT-PCR扩增TGEV ORF7基因,将其与真核表达载体pEGFP-C1和pEGFP-N1相连接,构建表达载体pGFP-ORF7(GFP融合在TGEV ORF7的-NH2端)和pORF7-GFP(GFP... 为研究猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)ORF7蛋白的亚细胞定位及其在TGEV复制中的作用。本研究通过RT-PCR扩增TGEV ORF7基因,将其与真核表达载体pEGFP-C1和pEGFP-N1相连接,构建表达载体pGFP-ORF7(GFP融合在TGEV ORF7的-NH2端)和pORF7-GFP(GFP融合在ORF7的-COOH端)。分别将这两个质粒转染至ST细胞,western blot检测融合蛋白GFP-ORF7和ORF7-GFP的表达。通过生物信息学分析和激光共聚焦确定TGEV ORF7蛋白的亚细胞定位。在此基础上,通过细胞病变观察和荧光定量PCR检测TGEV ORF7蛋白对TGEV复制的影响。结果显示,本研究正确构建了真核表达载体pGFP-ORF7和pORF7-GFP,western blot检测结果表明融合蛋白GFP-ORF7和ORF7-GFP均正确表达,TGEV ORF7蛋白大小约为9 ku;结合生物信息学分析和激光共聚焦共定位结果显示TGEV ORF7特异性的定位于ST细胞的内质网中,其定位和其N端的信号肽序列有关;荧光定量PCR检测结果显示,过表达ORF7蛋白后TGEV mRNA转录水平降低99%,表明ORF7蛋白参与调控TGEV的复制。本研究为TGEV ORF7蛋白功能的研究提供了参考依据。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 ORF7蛋白 亚细胞定位 过表达 病毒复制
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HPV16E7蛋白和Rb蛋白在人喉鳞状细胞癌中的表达及相关性研究 被引量:4
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作者 英信江 赵舒薇 +2 位作者 邱杰 叶青 孙爱华 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1364-1367,共4页
目的:探讨HPV16E7蛋白和Rb蛋白在人喉鳞状细胞癌(鳞癌)组织中的表达及其在喉鳞癌发生和发展过程中的相互关系.方法:用免疫组织化学方法检测78例喉鳞癌、26例喉癌前病变、24例声带息肉和10例癌周正常喉组织标本中HPV16E7蛋白和Rb蛋白的表... 目的:探讨HPV16E7蛋白和Rb蛋白在人喉鳞状细胞癌(鳞癌)组织中的表达及其在喉鳞癌发生和发展过程中的相互关系.方法:用免疫组织化学方法检测78例喉鳞癌、26例喉癌前病变、24例声带息肉和10例癌周正常喉组织标本中HPV16E7蛋白和Rb蛋白的表达.结果:癌周正常喉组织、声带息肉、喉癌前病变和喉鳞癌组织中HPV16E7蛋白的阳性表达率分别为0(0/10)、4.1%(1/24)、27.0%(7/26)和43.6%(34/78),Rb蛋白的阳性表达率分别为80.0%(8/10)、79.2%(19/24)、61.5%(16/26)和50.0%(39/78);HPV16E7蛋白和Rb蛋白的阳性表达率在癌周正常喉组织、声带息肉与喉鳞癌组之间均有显著性差异(P<0.05),HPV16E7蛋白表达呈明显升高趋势,而Rb蛋白表达呈明显下降趋势.HPV16E7蛋白的阳性表达率,喉鳞癌病理Ⅲ级明显高于Ⅰ级或Ⅱ级(P<0.05),临床Ⅲ~Ⅳ期明显高于Ⅰ~Ⅱ期(P<0.05);而Rb蛋白的表达正相反,肿瘤病理Ⅲ级明显低于Ⅰ级或Ⅱ级(P<0.05),临床Ⅲ~Ⅳ期明显低于Ⅰ~Ⅱ期(P<0.05).结论:HPV16E7蛋白的表达升高和Rb蛋白的表达下降可能会导致人喉鳞癌的发生和发展;检测HPV16E7蛋白和Rb蛋白的表达可用于喉鳞癌恶性程度的评定. 展开更多
关键词 喉肿瘤 鳞状细胞 HPV16E7蛋白 RB蛋白
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人乳头状瘤病毒E6、E7蛋白在维吾尔族及汉族宫颈癌发展中的表达及意义 被引量:10
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作者 王琳 韩莉莉 +1 位作者 玛依努尔.尼牙孜 隋霜 《中国医药导报》 CAS 2015年第21期75-78,共4页
目的 分析维吾尔族及汉族宫颈癌患者中人乳头状瘤病毒(HPV)E6、E7蛋白表达与宫颈癌癌前病变恶性进展的关系,进一步了解其在维吾尔族及汉族宫颈癌患者间是否存在差异。方法 选取2013年4月~2014年4月在新疆维吾尔自治区人民医院妇科门... 目的 分析维吾尔族及汉族宫颈癌患者中人乳头状瘤病毒(HPV)E6、E7蛋白表达与宫颈癌癌前病变恶性进展的关系,进一步了解其在维吾尔族及汉族宫颈癌患者间是否存在差异。方法 选取2013年4月~2014年4月在新疆维吾尔自治区人民医院妇科门诊行第二代杂交捕技术HPV DNA检测结果为阳性的133例维吾尔族(n=75)和汉族(n=58)患者宫颈不同病变程度的石蜡包埋宫颈组织。采用免疫组化法分别检测各组织中HPV E6、E7蛋白表达,使用Spearman等级相关分析HPV E6、E7蛋白表达与病变程度的相关性,并采用χ2检测比较维吾尔族及汉族宫颈癌患者HPV E6、E7蛋白表达的差异。结果 维吾尔族和汉族慢性宫颈炎、CIN 1、CIN 2~3、宫颈鳞癌组织中HPV E6的阳性率,随着病情的进展呈逐渐增高趋势,差异均有统计学意义(χ2=39.61,P=0.001;χ2=19.77,P=0.001);Spearman等级相关分析发现,维吾尔族及汉族宫颈癌患者HPV E6蛋白的表达与宫颈病变级别均呈显著正相关(r=0.708,P=0.001;r=0.729,P=0.001)、HPV E7在维吾尔族和汉族慢性宫颈炎、CIN 1、CIN 2~3、宫颈鳞癌组织中的阳性表达率,随着病情的进展呈逐渐增高,多组比较差异有统计学意义(χ2=32.48,P=0.001;χ2=24.16,P=0.001);Spearman等级相关分析发现,维吾尔族及汉族宫颈癌患者E6蛋白表达与宫颈病变级别均呈显著正相关(r=0.649,P=0.001;r=0.759,P=0.001);慢性宫颈炎、CIN 1、CIN 2~3维吾尔族患者HPV E6、E7蛋白的阳性表达率高于汉族,维吾尔族宫颈癌患者HPV E6、E7蛋白表达率低于汉族,但差异均无统计学意义(P〉0.05)。结论 HPV E6、E7蛋白是维吾尔族和汉族宫颈癌发展的重要因素,HPV E6、E7蛋白可能具有预测宫颈病变进展的价值。 展开更多
关键词 人乳头状瘤病毒 E6蛋白 E7蛋白 宫颈癌 维吾尔族 汉族
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HPV16E7蛋白在宫颈癌中的表达和意义 被引量:3
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作者 尹如铁 彭芝兰 +2 位作者 宗文军 姚远 王和 《现代预防医学》 CAS 2000年第4期477-477,573,共2页
目的 :探讨人乳头瘤病毒 16 E7蛋白 (HPV16 E7)与宫颈癌间的关系。方法 :采用免疫组化 SP法对 15例正常宫颈组织、 80例宫颈鳞癌、 17例腺癌组织进行了研究。结果 :1HPV16 E7蛋白在宫颈癌中的表达明显高于正常宫颈组织 ,且在鳞癌中的表... 目的 :探讨人乳头瘤病毒 16 E7蛋白 (HPV16 E7)与宫颈癌间的关系。方法 :采用免疫组化 SP法对 15例正常宫颈组织、 80例宫颈鳞癌、 17例腺癌组织进行了研究。结果 :1HPV16 E7蛋白在宫颈癌中的表达明显高于正常宫颈组织 ,且在鳞癌中的表达明显高于腺癌 ;2 HPV16 E7蛋白表达与宫颈癌的临床分期成负相关 ,与组织学分级、淋巴结转移无关。结论 :预防 HPV感染是防止宫颈癌发生的重要措施之一。 展开更多
关键词 宫颈癌 HPV16E7蛋白 表达 免疫组化
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蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞表位预测 被引量:6
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作者 杜杰 尹惠琼 +3 位作者 杨姝 马玉媛 韦平 章金刚 《中国动物传染病学报》 CAS 2013年第1期29-36,共8页
根据前期试验中测得的蓝舌病病毒VP7蛋白的基因序列和推导的氨基酸序列,利用DNAStar软件和Biosun软件进行生物信息学预测,以单参数(亲水性、可及性、柔韧性、抗原性)预测为基础,结合二级结构预测来综合分析蓝舌病病毒VP7蛋白的B细... 根据前期试验中测得的蓝舌病病毒VP7蛋白的基因序列和推导的氨基酸序列,利用DNAStar软件和Biosun软件进行生物信息学预测,以单参数(亲水性、可及性、柔韧性、抗原性)预测为基础,结合二级结构预测来综合分析蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞表位。比较两种软件的预测结果发现,在蓝舌病病毒VP7蛋白的381个氨基酸序列中,第81~85、198~202、235~239、253~257区域有较好的亲水性、表面可及性和较高的抗原指数,并且在二级结构上含有易形成抗原袁位的转角和无规则卷曲,最有可能为蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞线性优势表位。上述预测和判定结果表明,在蓝舌病病毒VP7蛋白序列中存在优势B细胞线型表位,为进一步合成多肽并分析已获得的VP7蛋白单抗的结合表位奠定了基础。 展开更多
关键词 蓝舌病毒VP7蛋白 B淋巴细胞表位 二级结构 预测
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