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胃癌临床诊断中血清外泌体长链非编码RNA?RN7SK的作用分析
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作者 张小冲 刘丹丹 +2 位作者 王丽 齐正 刘登湘 《中文科技期刊数据库(引文版)医药卫生》 2023年第9期56-59,共4页
围绕经确诊的胃癌患者,对其血清外泌体长链非编码RNA RN7SK(lnc RNA RN7SK)进行检测,评定其在诊断此病中的价值。方法 别对原发胃癌患者、健康对照者各10例进行选取,收集其血清,对外泌体展开相应提取。采用定量逆转录聚合酶链式反应(qRT... 围绕经确诊的胃癌患者,对其血清外泌体长链非编码RNA RN7SK(lnc RNA RN7SK)进行检测,评定其在诊断此病中的价值。方法 别对原发胃癌患者、健康对照者各10例进行选取,收集其血清,对外泌体展开相应提取。采用定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)法对lnc RNA RN7SK的表达实施检测,深入剖析其与胃癌病理学特征之间所存在的关系;用电化学发光法对癌胚抗原(CEA)水平进行测定,进行ROC曲线的绘制,探讨其实际诊断价值。结果 针对血清外泌体lnc RNA RN7SK,其在胃癌患者当中的表达,与健康对照者相比,明显偏高(P<0.05)。血清外泌体lnc RNA RN7SK的表达水平密切相关于胃癌患者的淋巴结转移、肿瘤直径、TNM分期、分化程度、远处转移。外泌体lnc RNA RN7SK相对应的ROC曲线下面积(AUCROC)是0.830,其在具体的检验效能上,较CEA(0.579)优。将两者进行联合的AUCROC是0.853,相比单纯CEA、lnc RNA RN7SK,明显偏优。结论 针对胃癌患者,在其血清外泌体当中,lnc RNA RN7SK存在高表达情况,且与TNM 分期、淋巴结转移、肿瘤直径、远处转移、浸润深度之间存在紧密的相关性,诊断效能突出,可当作诊断此病的潜在分子标志物。 展开更多
关键词 长链非编码RNA RN7sk 胃癌 外泌体
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血清外泌体长链非编码RNA RN7SK在胃癌中的诊断价值 被引量:3
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作者 刘敏 肖珂 +3 位作者 王玎 丁娟 张义 董召刚 《中国现代普通外科进展》 CAS 2021年第8期594-597,603,共5页
目的:检测胃癌患者血清外泌体长链非编码RNA RN7SK(lncRNA RN7SK)表达水平,探讨其对胃癌的诊断价值。方法:收集2016年12月至2017年12月山东大学齐鲁医院就诊的胃癌患者(116例)、不典型增生患者(43例)、慢性胃炎患者(48例)及健康对照受试... 目的:检测胃癌患者血清外泌体长链非编码RNA RN7SK(lncRNA RN7SK)表达水平,探讨其对胃癌的诊断价值。方法:收集2016年12月至2017年12月山东大学齐鲁医院就诊的胃癌患者(116例)、不典型增生患者(43例)、慢性胃炎患者(48例)及健康对照受试者(36例)血清,提取外泌体。q RT-PCR检测lncRNA RN7SK的表达,分析其与胃癌临床病理学特征的关系,电化学发光法检测血清CEA水平,绘制ROC曲线,分析其作为胃癌新型标志物的诊断价值。结果:血清外泌体lncRNA RN7SK在胃癌患者的表达[2.175(1.475,3.223)]高于不典型增生患者[1.300(0.980,1.610)]、慢性胃炎患者[1.030(0.560,1.358)]及健康对照受试者[1.005(0.650,1.478)](P值均<0.001);不典型增生患者高于慢性胃炎患者(P<0.001)及健康对照受试者(P=0.037)。血清外泌体lncRNA RN7SK表达水平与胃癌患者肿瘤直径、分化程度、淋巴结转移、远处转移及TNM分期显著相关,与患者性别、年龄、Bormann分型无关。外泌体lncRNA RN7SK的ROC曲线下面积(AUCROC)为0.84(95%CI:0.772~0.895),特异性和敏感性分别为88.9%、66.4%,其检验效能优于CEA 0.580(95%CI:0.497~0.659)。二者联合ROC曲线下面积(AUCROC)为0.854(95%CI:0.788~0.906),特异性和敏感性分别为83.3%、75.9%,优于lnc RNA RN7SK和CEA。结论:lncRNA RN7SK在胃癌患者血清外泌体中高表达,与肿瘤直径、浸润深度、淋巴结转移、远处转移、TNM分期具有高度相关性,且具有良好的诊断价值,可作为潜在的胃癌诊断分子标志物。 展开更多
关键词 胃肿瘤 外泌体 长链非编码RNA RN7sk 分子标志物 诊断
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小核非编码RNA 7SK 128-179截短体通过下调CDC6抑制胚胎干细胞的体外增殖
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作者 陈蕊 张玉荣 +6 位作者 陈鹏 庞依心 李宏宝 陈子溦 张小用 张鸿毅 李武军 《南方医科大学学报》 CSCD 北大核心 2021年第8期1125-1130,共6页
目的探讨小核非编码RNA 7SK在胚胎干细胞(ESCs)增殖中的作用,为原始侏儒症疾病的早期诊治提供靶点。方法利用CRISPR/Cas9系统转染ESCs,通过PCR产物测序和甘油梯度分析鉴定每个单克隆细胞系获得7SK 128-179突变体。使用慢病毒系统敲除CD... 目的探讨小核非编码RNA 7SK在胚胎干细胞(ESCs)增殖中的作用,为原始侏儒症疾病的早期诊治提供靶点。方法利用CRISPR/Cas9系统转染ESCs,通过PCR产物测序和甘油梯度分析鉴定每个单克隆细胞系获得7SK 128-179突变体。使用慢病毒系统敲除CDK9,然后通过Western blotting分析敲除效率和相关通路蛋白的变化。结果CRISPR/Cas9系统转染后,ESCs中出现128-179 nt缺失突变的7SK,该突变导致ESCs增殖缺陷。7SK 128-179 nt突变的ESCs中LARP7和CDC6的蛋白水平显著下调,通过干预CDK9的活性发现7SK对ESCs增殖的调控作用依赖于CDK9的活性。结论7SK 128-179 nt截短体可通过下调CDC6严重影响ESCs的增殖,且这一过程依赖于CDK9活性,提示7SK截短突变可作为侏儒症的早期筛查和治疗靶点。 展开更多
关键词 7sk截短体 胚胎干细胞 增殖 周期蛋白依赖激酶9 细胞分裂周期蛋白6
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胃癌组织标本中lncRNA RN7SK的表达及其筛查价值 被引量:2
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作者 李霞 梁照锋 +3 位作者 毛佳慧 王蓉蓉 钱晖 许文荣 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2018年第5期342-344,共3页
目的检测胃癌组织中长链非编码RNA(lnc RNA)RN7SK表达水平,并探讨其在临床筛查中的价值。方法 q RT-PCR检测lnc RNA RN7SK在胃癌细胞、胃癌组织中的表达水平;绘制ROC曲线,分析其用于筛查胃癌的效能。结果 lnc RNA RN7SK在人胃癌细胞系SG... 目的检测胃癌组织中长链非编码RNA(lnc RNA)RN7SK表达水平,并探讨其在临床筛查中的价值。方法 q RT-PCR检测lnc RNA RN7SK在胃癌细胞、胃癌组织中的表达水平;绘制ROC曲线,分析其用于筛查胃癌的效能。结果 lnc RNA RN7SK在人胃癌细胞系SGC-7901(3.91±0.53)、MGC-803(3.44±0.29)、HGC-27(4.04±0.87)和BGC-823(4.30±1.13)中的表达水平明显高于人胃粘膜上皮细胞系GES-1(1.02±0.27),差异具有统计学意义(t分别为12.33、7.48、7.20、4.90,P<0.05)。lnc RNA RN7SK在55例胃癌组织中有47例(85.5%)表达上调,8例(14.5%)表达下降。lnc RNA RN7SK筛查胃癌患者的ROC曲线下面积(AUCROC)为0.827,95%可信区间(CI)为0.746~0.907,当cut-off值为0.618时,敏感性为0.836,特异性为0.782。结论 lnc RNA RN7SK在胃癌组织中高表达,且具有较高的筛查效能,可作为潜在的胃癌诊断分子标志物。 展开更多
关键词 胃癌 长链非编码RNA RN7sk 组织 临床诊断
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Latent HIV-1 TAR Regulates 7SK-responsive P-TEFb Target Genes and Targets Cellular Immune Responses in the Absence of Tat
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作者 Sebastian Eilebrecht Bernd-Joachim Benecke Arndt G. Benecke 《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》 SCIE CAS CSCD 2017年第5期313-323,共11页
The transactivating response element (TAR) structure of the nascent HIV-1 transcript is critically involved in the recruitment of inactive positive transcription elongation factor b (P-TEFb) to the promoter proxim... The transactivating response element (TAR) structure of the nascent HIV-1 transcript is critically involved in the recruitment of inactive positive transcription elongation factor b (P-TEFb) to the promoter proximal paused RNA polymerase II. The viral transactivator Tat is responsible for subsequent P-TEFb activation in order to start efficient viral transcription elongation. In the absence of the viral transactivator of transcription (Tat), e.g., during latency or in early stages of HIV tran- scription, TAR mediates an interaction of P-TEFb with its inhibitor hexamethylene bis-aeetamide- inducible protein 1 (HEXIM1), keeping P-TEFb in its inactive form. In this study, we address the function of HIV-1 TAR in the absence of Tat by analyzing consequences of HIV-1 TAR overexpres- sion on host cellular gene expression. An RNA chimera consisting of Epstein-Barr virus-expressed RNA 2 (EBER2) and HIV-1 TAR was developed to assure robust overexpression of TAR in HEK293 cells. The overexpression results in differential expression of more than 800 human genes. A significant proportion of these genes is involved in the suppression of cellular immune responses, including a significant set of 7SK-responsive P-TEFb target genes. Our findings identify a novel role for HIV-1 TAR in the absence of Tat, involving the interference with host cellular immune responses by targeting 7SK RNA-mediated gene expression and P-TEFb inactivation. 展开更多
关键词 HIV-1 LATENCY TAR 7sk RNA Cellular immunity
原文传递
水牛RNA聚合酶III启动子的克隆与鉴定 被引量:1
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作者 张晓溪 刘庆友 +3 位作者 邓彦飞 罗婵 崔奎青 石德顺 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期858-863,共6页
【目的】获得有效的水牛RNA聚合酶III启动子序列,为开展水牛源细胞的基因特异沉默研究奠定基础。【方法】通过启动子上、下游保守序列对水牛源启动子7SK、U6进行克隆和启动子关键顺式作用元件识别,利用一段针对EGFP的shRNA片段(shEGFP)... 【目的】获得有效的水牛RNA聚合酶III启动子序列,为开展水牛源细胞的基因特异沉默研究奠定基础。【方法】通过启动子上、下游保守序列对水牛源启动子7SK、U6进行克隆和启动子关键顺式作用元件识别,利用一段针对EGFP的shRNA片段(shEGFP)对水牛7SK、U6启动子进行功能性分析,然后分别在水牛源及鼠源细胞中与pEGFP-N1共转染,转染48h后用荧光显微镜检测EGFP的表达情况,并用流式细胞仪和荧光实时定量PCR检测EGFP沉默表达情况。【结果】克隆获得水牛7SK、U6启动子序列分别为430和357bp,其OCT-1(或CACCC盒)及TATA盒高度保守。连接shEGFP后与pEGFP-N1共转染细胞,通过荧光显微镜可观察到细胞发生了明显的荧光表达沉默现象;通过流式细胞分析,发现水牛7SK和U6启动子引导的shEGFP在水牛源细胞中沉默效率高达93.82%和87.45%;荧光实时定量PCR检测结果显示,在转染bu7SK-shEGFP和buU6-shEGFP的水牛源BFF细胞中,EGFP表达水平均显著低于其他物种启动子的细胞转染组(P<0.05),而在鼠源PT67细胞中,水牛启动子的启动效率与其他物种启动子差异不显著(P>0.05)。【结论】水牛7SK和U6启动子可高效启动shRNA表达,且具有一定的物种特异性。 展开更多
关键词 水牛 RNA聚合酶Ⅲ启动子 7sk U6 克隆 鉴定 基因沉默
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P-TEFb在转录延伸中的作用及其与人类疾病的关系
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作者 郭明日 曾卫民 李莉萍 《生命的化学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期200-203,共4页
正性转录延伸因子b(positive transcription elongation factor b,P-TEFb)由CDK9和cyclinT1(或cyclinT2a、cyclinT2b、cyclinK)组成,对真核生物RNA-polyⅡ所介导的转录延伸具有正性调节作用。体内P-TEFb存在活性型(P-TEFb-Brd4)和非活性... 正性转录延伸因子b(positive transcription elongation factor b,P-TEFb)由CDK9和cyclinT1(或cyclinT2a、cyclinT2b、cyclinK)组成,对真核生物RNA-polyⅡ所介导的转录延伸具有正性调节作用。体内P-TEFb存在活性型(P-TEFb-Brd4)和非活性型(P-TEFb-7SKsnRNA-HEXIM1)两种形式,二者间的转变是调节转录延伸的关键。近年来发现P-TEFb与HIV-1感染和心肌肥大等疾病密切相关。 展开更多
关键词 P-TEFb(CDK9-cyclin T1) HEXIMl 7sk SNRNA 转录延伸 Brd4
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